#NEXUS [ Title : Endelig.fas] begin taxa; dimensions ntax= 38; taxlabels Nicotiana Grape Tomato Cucumis Eucalyptus Panax Atropa Potato Spinacia Arabidopsis Cotton Citrus Medicago Soybean Lotus Oenothera Ranunculus Calycanthus Drimys Piper Liriodendron Populus Nuphar Nymphaea Amborella Ginkgo Pinus Acorus Typha Phalaenopsis Yucca Saccharum Zea Oryza Triticum agrostis Sorghum Barley ; end; begin characters; dimensions nchar= 46188; format missing=? gap=- matchchar=. datatype=nucleotide interleave; matrix [!Domain=Data property=Coding CodonStart=1;] Nicotiana ATG GTA ACC ATT CGA GCT GAC GAA ATT AGT AAT ATT ATC CGT GAA CGT ATT GAA CAA TAT AAT AGA GAA GTA AAG ATT Grape ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... A.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... A.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... .C. ... ... ... ..A ..T ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... GG. ... ... C.. ... ... ... G.. Arabidopsis ... ... ... ... A.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... .C. ... Cotton ... ... ..T ... A.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... AC. ..A ... AA. ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... ... ... ..T ..A ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... C.G ... ... ... .CC ... ... ..A ... Soybean ... ... ... ... ..T ..A ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... .CG ... ... ..A ... Lotus ... ... ..T ... ..T ..A ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... .CC ... A.T ..A ... Oenothera ... .C. ... ... A.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... .C. ... C.. ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..C ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... Drimys ... ... ... C.. ... .TC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C .C. ... Piper ... .A. ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... Liriodendron ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C .C. ... Populus ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... Nuphar ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Amborella ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo ... ... ..T ... ... C.C ... ... ... ... .G. ... ... ..C A.. .AG ... ..G ... ... ... CA. ..G ... G.. G.. Pinus ... .G. .GT ... A.. CTC ... ... ... ... .G. ... ..A ..G A.. .AG ..C ... ... ... ..C .AC ... ... .GA G.. Acorus ... .C. ... C.. ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ..G ... G.. Typha ... ... ... C.. ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ..C ... ... Phalaenopsis ... .G. ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Yucca ... ... ..T C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. Saccharum ... .C. ... C.. ... .TC ... ... ... .A. ..A ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G A.. ... GG. ... Zea ... .C. ... C.. ... .TC ... ... ... .A. ..A ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G A.. ... GG. ... Oryza ... .C. ... C.. ... .TC ... ... ... CA. ..A ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... GG. ... Triticum ... .C. ... C.. ... .TC ... ... ... CA. ..A ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G A.. ... GG. ... agrostis ... .C. ... C.. ... .TC ... ... ... CA. ..A ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G A.. ... GG. ... Sorghum ... .C. ... C.. ... .TC ... ... ... .A. ..A ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G A.. ... GG. ... Barley ... .C. ... C.. ... .TC ... ... ... CA. ..A ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G A.. ... GG. ... Nicotiana GTA AAT ACC GGT ACC GTA CTT CAA GTA GGC GAC GGC ATT GCT CGT ATT CAC GGT CTT GAT GAA GTA ATG GCG GGT GAA Grape ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Tomato ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ..A ..G ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ..C ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Cotton ... ... ..T ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Citrus ... ... .TT ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Medicago ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Soybean ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ... ... ... Lotus ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Oenothera ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... Ranunculus ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Calycanthus ..G ... ..T ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... Drimys ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... ..A ..G ... Piper ..G ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... Liriodendron ..G ... ... ..C ..T ... ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... Populus ... ... ..T ..G ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Nuphar ..G ..C ..T ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Nymphaea ..G ..C ..T ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Amborella ..C ... ..T ..C ..T ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... Ginkgo .CT ... .TT ... ... ... ... .G. ... ..A ..T ... ... ... ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Pinus .GT ... CTT ..C ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... Acorus ..G ... ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Typha ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Phalaenopsis ..G ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Yucca ..G ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Saccharum .AG ... .T. ... CG. ... G.G ... ..G ..G ..T ..G ... ... ... ... ATA ... ... .G. ... A.. ... T.A ... ... Zea .AG ... .T. ... CG. ... G.G ... ..G ..G ..T ..G ... ... ... ... ATA ... ... .G. ... A.. ... T.A ... ... Oryza .AG ... .T. ... CG. ... G.. ... ..G ..G ..T ..G ... ... ... ... ATA ... ... .G. ... A.. ... T.A ..C ... Triticum .AG ... .TA ... CG. ... G.. ... ..G ..G ..T ..G ... ... ... ... ATA ... ... .G. ... A.. ... T.A ... ... agrostis .AG ... .TT ... CG. ... G.. ... ..G ..G ..T ..G ... ... ... ... ATA ... ... .G. ... A.. ... T.A ... ... Sorghum .AG ... .T. ... CG. ... G.G ... ..G ..G ..T ..G ... ... ... ... ATA ... ... .G. ... A.. ... T.A ... ... Barley .AG ... .TA ... CG. ... G.. ... ..G ..G ..T ..G ... ... ... ... ATA ... ... .G. ... A.. ... T.. ... ... Nicotiana TTA GTC GAA TTT GAA GAG GGT ACA ATA GGC ATT GCT CTG AAT TTG GAA TCA AAT AAT GTT GGT GTT GTA TTA ATG GGC Grape ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Tomato ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Eucalyptus ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Panax ... ..A ... ... ... ... ... ..G G.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Atropa ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ..A ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Arabidopsis ... ..A ... ... ..G ... ... ..T ... ..T ... ..C ..T ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Cotton ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Citrus ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ..T ... ... ..T Medicago ... ... ... ... ... ... ... ..T G.. ..G ... ... T.. ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T Soybean ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... T.. ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T Lotus ..G ..G ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... T.. ... ... ... ..C ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... Oenothera ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T Ranunculus ... ..A ... ... ... ... AAG ... G.. ..T ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T Calycanthus ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Drimys ... ..A ... ... ... ... ... ..C G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Piper ... ..A ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Liriodendron ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... ... ..T Populus ..G ..A ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Nuphar ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T Nymphaea ... ..A ..G ... .C. ... ... ..G ... ..T ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T Amborella ... ..A ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... .CA ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Ginkgo ... ..G ... ... .T. ..T ... ... G.. ... ... ... .CA ... C.A ... ..G ..C G.. ... ..A ... ... ... ... ..T Pinus ... ..G ... ... .G. ..T ... ... G.. ... ... ..C ..A ... ... .G. ..G G.. ... ... ..A .C. ... ... ... ... Acorus ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... C.. ... ..T Typha ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T Phalaenopsis ... A.A ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T Yucca ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Saccharum ... ... ... ... .C. ..A ..G ..G .G. ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..G A.. ... ... ... ... Zea ... ... ... ... .C. ..A ..G ..G .G. ..T ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ..G A.. ... ... ... ... Oryza ... ... ... ... .C. ..A ..G ..T .GG ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..G A.. ... ... ... ... Triticum ... ... ... ... .C. ..A ... ..T .GG ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..G A.. ... ... ... ... agrostis ... ... ... ... .C. ..A ..C ..T .GG ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..G A.. ... ... ... ... Sorghum ... ... ... ... .C. ..A ..G ..G .G. ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..G A.. ... ... ... ... Barley ... ... C.. ... .C. ..A ... ..T .GG ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..G A.. ... ... ... ... Nicotiana GAT GGT TTA TTG ATA CAA GAA GGA AGT TCT GTA AAA GCA ACG GGA AGA ATT GCT CAG ATA CCC GTG AGT GAG GCT TAT Grape ..C ... ..G A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... Tomato ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ..C ... ..G A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Eucalyptus ..C ... ..G A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Panax ... ... ..G C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... Atropa ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Potato ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ..C ..G ..G A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ..C ... ..G A.. ..C ... ... ... ... ..A ..C ... ..T ... ... .A. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Cotton ..C ... ..G A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... .A. ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Citrus ..C ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .A. ... ... ... ... ..A ..A ..C ... ... ... Medicago ... ... ..G C.. ... ... ..G ... ... ..G ... ... ... ..A ... .T. ... ... ... ... ..G ..A ... ... .G. ... Soybean ... ... ..G A.. ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... Lotus ... ... ..G A.. ... ... ..G ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... .G. ... Oenothera ..C ... ... C.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ..C ... ..G A.. ... ... ..G ..G ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... .A. ... Calycanthus ..C ... ..G AC. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... Drimys ..C ... ..G A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ..C ... ..G A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..A ... ..G ... ... ... ... ... Liriodendron ..C ... ..G C.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Populus ..C ..C ..G A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... .A. ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... Nuphar ..C ..C ..G A.. ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ..A ... C.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Nymphaea ..C ... ..G A.. ... ... ..G ..T ... ..C ..G ... ... ..A ... C.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Amborella ... ... ... A.. ... ... ..G ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Ginkgo ... ..C ..G A.. ... ... ... ..C ... ..C ... .GG ... ... ... .A. ... ... ... ... ..A ..A ... ..T ... ... Pinus ... ..C ..G A.. ... ... ... ..T ... ..C ..G .G. ... ..A ... .A. ... ... ... ... ..A ..A ... ..T ..G ... Acorus ..C ... ..G ACA ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Typha ... ..G ..G A.. ... ... ..G ... ..C ..C ... ... ... ..A ... ... ... ... ..A ... ..T ..A ... ..C ... ... Phalaenopsis ... ... ... A.. ... A.. ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..C ... ... .T. Yucca ... ... ..G A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... .GA ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... Saccharum ... ..G ..G A.. ... ... ..G ... ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C Zea ... ..G ..G A.. ... ... ..G ... ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C Oryza ... ..G ..G A.. ... ... ..G ..C ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C Triticum ... ..G ..G A.. ... ... ..G ... ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C agrostis ... ..G ..G A.. ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C Sorghum ... ..G ..G A.. ... ... ..G ... ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C Barley ... ..G ..G A.. ... ... ..G ..C ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C Nicotiana TTG GGT CGT GTT ATA AAT GCC CTG GCT AAA CCT ATT GAT GGT AGA GGT GAA ATT TCA GCT TCT GAA TTT CGA TTA ATC Grape ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ..G ... ..T Tomato ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... C.. ... ... ... .AC ... ... ... .C. ... ... ..T Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... C.. ... ... ... .AC ... ... ... .C. ... ... ..T Panax ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..G ... ..T Atropa ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Potato ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Spinacia ..A ..G ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... A.. ... ... ... .C. ..G ... ..T Arabidopsis ... ..G ... ... ... ..C ... T.. ... ..C ... ... ... ... C.. ... A.G ... ..C ... ... ... .C. ..G ... ..T Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... C.G ... ... ... ... ... ... ... .C. ..G ... ..T Citrus ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ..T Medicago ... ... ... ... G.. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... .C. ..G ... ... Soybean ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... C.. ..A ... ... ... ... ..G ... .C. ... ... ... Lotus ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... C.G ..A ... ... ... T.. ..A ... .C. ..G ... ... Oenothera ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T T.. ... ..G .C. ..G ... ..T Ranunculus ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... .C. ..G ... ..T Calycanthus ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... .CC ..G ... ..T Drimys ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ..G ... ..T Piper ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... .CC ..G ... ..T Liriodendron ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... .C. ..G ... ..T Populus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C ... C.. ... .C. ... ... T.. ... ... .C. ..G ... ..T Nuphar ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... .T. ... ..C ... .A. ..G ... ..T Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... .T. ... ..C ... .A. ..G ... ..T Amborella ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... T.. ..C ... .C. ..G ... ..T Ginkgo ... ..C ... ... G.. ... ..T ..A ..C C.. ... ... ... ..C ... ... C.. ... ... ... ..C ... .C. ... C.G ..T Pinus ... ... ... ... G.. ... ..T ..A ..C C.. ..C ... ... ... .AG ... A.. ... ... ... ..C ... ... ... C.G ..T Acorus ... ... ... ... G.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ..C ..G ... ... Typha ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... T.. ... ... .C. ..G ... ..T Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... T.. ... ... .C. ..G ... ..T Yucca ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... .C. ..G ... ..T Saccharum ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... GTC ... ..A ... .C. ..C ... ..T Zea ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... GTC ... ..A ... .C. ..C ... ..T Oryza ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... GT. ... ..G ... .C. ..C ... ..T Triticum ... ... ... ... G.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G .A. ..C ... ... AT. ... ..C ... .C. ..C ... ..T agrostis ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G .A. ..C ... ... AT. ... ..G ... .C. ..C ... ..T Sorghum ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... GTC ... ..A ... .C. ..C ... ..T Barley ... ... ... ... G.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G .A. ..C ... ... AT. ... ..C ... .C. ..C ... ..T Nicotiana GAA TCT GCC GCC CCG GGT ATT ATT TCG CGC CGT TCC GTA TAT GAG CCT CTT CAA ACC GGG CTT ATT GCT ATT GAT TCG Grape ... ... C.. ..T ..A ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... C.T ..T ..A ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... C.T ..T ..A ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... Panax ... ... C.. ..T ..A ... ... ... ..A ..A ... ..A ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T Atropa ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... C.. ..T ..T ... ... ..G ..C A.A ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... G.A Arabidopsis ... ... C.T ... ..A ... ... ... ... A.A ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... ..C Cotton ... ... C.T ... ..A ... ... ... ... A.A ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... ... Citrus ... ..C C.T ..T ... ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... C.. ..T ..C ... ... ... ..C A.A ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ..T Soybean ... ... C.T ..T ..C ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ..A ... ... ... ... ... ... Lotus ... ..C C.. ..T ..C ... ... ... ... A.A ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... ... Oenothera ... ... C.. ..T ... ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... G.A Ranunculus ... ..G C.. ... ... ... ... ... ..A A.A ... ... ... ... ... ..G A.G ... ... ..A ... ... ... ... ... G.. Calycanthus ... ... C.T ..T ..A ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... Drimys ... ... C.. ..T ... ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... Piper ... ... C.. ..T ..A ..C ... ... ..A A.A ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ..T ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... C.. ..T ..A ... ... ... ..T A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... C.. ..T ..A ..G ... ... ..T A.G ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..C ..A Nuphar ..G ... C.. ..T ..A ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ..G ... C.. ..T ..A ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Amborella ... ..C C.. ..A ..A ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ..C Ginkgo ... ... T.T ..T ..A ... ... ... .T. A.A ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T Pinus ... ... C.. ..T ..A ... ... ..A ..A A.A ... ... ... ... ..A ..C ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T Acorus ... ... C.T ... ..A ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ..T ... ..C ... ... ... ... Typha ... ..C C.T ... ..A ... ... ... ... A.A ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... G.A Phalaenopsis ... ... C.T ... ..A ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ..A Yucca ... ... C.T ... ..A ... ... ... ... A.A ..C ... ..G ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ... C.T ..T ... ... ..A ... ..T A.G ... ... ... ... ..A ..C ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... Zea ... ... C.T ..T ... ... ..A ... ..T A.G ... ... ... ... ..A ..C ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... Oryza ... ... C.T ..T ... ... ..A ... ..C A.G ... ..T ... ... ..A ..C ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... Triticum ... ... C.T ..T ..A A.. ..A ... ..C A.G ... ... ... ..C ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... agrostis ... ... ..T ..T ..A A.. ..A ... ..C A.A ... ..T ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... Sorghum ... ... C.T ..T ... ... ..A ... ..T A.G ... ... ... ... ..A ..C ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... Barley ... ... C.T ..T ..A A.. ..A ... ..C A.G ... ... ... ..C ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... Nicotiana ATG ATC CCT ATA GGA CGT GGT CAG CGA GAA TTA ATT ATT GGG GAC AGA CAG ACC GGT AAA ACA GCA GTA GCC ACA GAT Grape ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Atropa ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... G.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Citrus ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... Medicago ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... Soybean ... ... ..C ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Lotus ... ... ... ... ..G ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... Ranunculus ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... Calycanthus ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... G.. ... ... ... ... ... Drimys ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Piper ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Nymphaea ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Amborella ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... Ginkgo ... ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Pinus ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ..T ... ... Acorus ... ... ... G.. ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... Typha ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Yucca ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ... ..C ... ..G ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... Zea ... ... ..C ... ..G ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... Oryza ... ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... Triticum ... ... ... ... ..G ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... agrostis ... ... ... ... ..G ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... Sorghum ... ... ..C ... ..G ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... Barley ... ..T ... ... ..G ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ..T ... ... Nicotiana ACG ATC CTC AAT CAA CAA GGT CAA AAT GTA ATA TGT GTT TAT GTA GCT ATT GGG CAA AAA GCA TCT TCT GTG GCC CAG Grape ..T ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ..A ..T ... Tomato ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Cucumis ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... Eucalyptus ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... Panax ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... Atropa ... ..T ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Spinacia ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... Arabidopsis ..A ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ..C ... ..T ... Cotton ... ..T ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... Citrus ... ..T ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... Medicago ..A ..T ... ... ... ..G ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ..A Soybean ..T ..T ... ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ..A Lotus ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ..T ... ... ... ..G ... ..A ..T ..A Oenothera ... ..T ... ... ... ... ..G A.C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... ..T ... Ranunculus ... ..T ... ... ... A.. ... ... ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... Calycanthus ..T ..T ... ... ... A.G ..G ... ... ..G G.. ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ..A Drimys ..T ..T ... ... ... A.. ..G ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ..T ... Piper ..T ..T ..T ... ... A.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ..C ... ..T ... Liriodendron ..T ..T ... ... ... A.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... Populus ... ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... Nuphar ..T ..T ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ..T ... Nymphaea ..T ..T ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... Amborella ..T ..T ..G ... ... A.G ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ..T ... Ginkgo ..T ..T A.. ..C ... A.. ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ..C ... ..T ... Pinus ..T ..T ..T ... ... A.G A.. ... ... ... ..C ... ..C ... ... ..A ... ..T ... .G. ..T ... ..C ... ..T ... Acorus ..T ..T ... ..C ... A.. ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ..C ..G ... Typha ..A ..T ... ... ... A.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... Phalaenopsis ..A ..T ... ... ... A.. ..A ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... Yucca ... ..T ... ... ... A.. ..G A.. ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... Saccharum ..A ..T ... ... ... A.. ..G ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... .G. ... ..C ..C ... ..T ..A Zea ..A ..T ... ... ... A.. ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... .G. ... ..C ..C ... ..T ..A Oryza ..A ..T ... ... ... A.. ..G ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... .G. ... ..C ..C ..A ..T ..A Triticum ..A ..T ... ... ... A.. ..G ... GG. ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... .G. ... ..C ..C ..A ..T ..A agrostis ..A ..T ... ... ... A.. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... .G. ... ..C ... ... ..T ..A Sorghum ..A ..T ... ... ... A.. ..G ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... .G. ... ..C ..C ... ..T ..A Barley ..A ..T ... ... ... A.. ..G ... GG. ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... .G. ... ..C ..C ..A ..T ..A Nicotiana GTC GTA ACT ACT TTA CAG GAA AGG GGA GCG ATG GAA TAC ACT ATT GTG GTA GCC GAA ACG GCA GAT TCC CCT GCT ACA Grape ..A ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ..C ..G ... ... ... Tomato ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Cucumis ..A ..G .A. ... C.C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ..A ... ..G Eucalyptus ..A ..G .A. ... C.C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ..A ... ..G Panax ..A ..G ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... .T. ..G ... ... ... ... ... Atropa ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Spinacia ..A ..T ... .AC ..C ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ..C ... ... Arabidopsis ..A ..G ..C .G. ... ... ... C.A ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... ..A ... ..G Cotton ..A ..G ..C ... ..C ..A ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... Citrus ..A ..G .A. ... ..C ... ..G ... ..G ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ..G Medicago ..G ... ... ... ... ..A ... ..A ..G ..A ... ..G ... ... ... A.A ..G ..T ... ..A ... A.. ..T ..A ... ... Soybean ..G ..G .A. ..C ... ..A ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ..A ..G ... ..T ..A ... ... Lotus ..G ..G .A. ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ..T ..A ... ... Oenothera ..A ..G .A. G.. C.C ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..G ... G.. ..C ... ... ..A ... ... Ranunculus ..A ..G ... ... ..C ... ... CA. ..G .TA ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ..C G.G ... ... ... Calycanthus ..A ..G ..C ... ..C ... ... C.A ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... Drimys ..A ..G ... ... ..C ..A ... C.A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ..G ... ..A ... Piper ..A ..G ... ... ..C ... ..G CAA ..G ..A ... ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... Liriodendron ..A ..G ... ... ..C ... ... CA. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... Populus ..A ... .A. G.. ... ... ... ..A ... ..A ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ... ... Nuphar ..A ..G ... ... ..C ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ... ..G ... ... ... Nymphaea ..A ..G ... ... ..C ... ... C.. ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ..A ..G ... ..G ... ... ... Amborella ..A ..G ... ... ..C ... ... CAA ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ..A ... ... ... Ginkgo ..A ..T .A. ... .CC ..A ... C.T ..C ..A ... ... ... ..C ..C ... ..G ..A ... ..T ... ... ... ..C ... ... Pinus ..A ..T .A. ..A ..C .GA ... C.T ..C ..A ... .C. ..T ..C ... ... ... ..G ... ..T ..G ... ..T ..C ... ... Acorus ..A ..G ... .A. ..C ... ..G C.A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... Typha ..A ..G ... ... ..C ... ..G CAA ..G ..T ... ... ..T ... ... ..C ... ..T ... ... ..G ... ..A ... ... ... Phalaenopsis ..A ..G ... ... ..C ... ... G.A ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... ... Yucca ..A ..G ..C ... ..C ..A ..G C.A ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ..G ... ... ... ... ... Saccharum ..A ... ... ... ..C ..C ... GA. ..G ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... .T. ..G ... ..A ..C ... ... Zea ..A ... ... ... ..C ..C ... GA. ..G ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... .T. ..G ... ..A ..C ... ... Oryza ..A ... ... ... ..C ..T ... GA. ..G ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... .T. ..G ... ... ... ... ... Triticum ..A ... ... ... ..C ..T ..G GA. ..G ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... .T. ..G ... ..A ... ... ... agrostis ..A ... ... ... ..C ..T ..G GA. ..G ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... .T. ..G ... ..G ... ... ... Sorghum ..A ... ..A ... ..C ..C ... GA. ..G ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... .T. ..G ... ..A ..C ... ... Barley ..A ... ... ... ..C ..T ..G GA. ..G ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... .T. ..G ... ..A ... ... ... Nicotiana TTA CAA TAC CTT GCT CCT TAT ACA GGA GCA GCT CTG GCT GAA TAT TTT ATG TAT CGT GAA CGA CAC ACT TTA ATC ATT Grape ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... A.. ... ... ... ... ..T ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... .C. ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ..G ..T ..C ... ... ... ..C ... ..G ..G ... ..G ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ..C T.. ... ... ... ... ... ..C ... ... .A. ... ... ... ..A ... Cotton ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... Citrus ... ... ... ..C ... ... ... ..G ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... ... ..C ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... Soybean ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... Lotus ..G ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... .T. ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... T.. ..C ... ... ... ... ..C ... ... ..G ..T ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... .C. ..A ... Drimys ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... .C. ..A ... Piper ... ... ... ..C ..G ... ... ... ..G ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... .A. ..T ... .C. ..A ... Liriodendron ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... .C. ..A ... Populus C.. ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... Nuphar ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ..C ... ..A ... Nymphaea ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... C.. ... ..T ..C ... ..A ... Amborella ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C T.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ..A ... Ginkgo ... ... ..T ..C ... ... ... ... ..G ..G ... T.. ..C ... ..C ..C ... ..C .AG ... .A. ..T ... CC. ..A ... Pinus ... ... ..T ..C ..C ... ... ... ... ... A.. T.. ... ... ..C ..C ... ... AAA A.. .A. ... ..A .C. ... ... Acorus ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... T.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... .C. ..A ... Typha ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... C.. ... ... ... ... .G. AA. ..T ... ... ..A ... Phalaenopsis ... ... ..T ..C ... ... ... ..G ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... .C. ..A ... Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... .C. ..A ... Saccharum ... ... ..T ..C ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ..C ..C ... ..G ..T ... ... ..A ... Zea ... ... ..T ..C ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ..C ..C ... ..G ..T ..C ... ..A ... Oryza ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ..C ..C ... ..G ..T ... ... ..A ... Triticum ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ..C ..C ... ..G ..T ... ... ..A ... agrostis ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ..C ..C ... ..G ..T ... ... ..A ... Sorghum ... ... ..T ..C ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ..G ..T ... ... ..A ... Barley ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ..C ..C ... ..G ..T ... ... ..A ... Nicotiana TAT GAT GAT CCC TCC AAA CAA GCG CAA GCT TAT CGC CAA ATG TCT CTT CTA TTA CGA AGA CCG CCC GGT CGT GAA GCT Grape ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ..C ... ... Tomato ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... .T. ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ... ... Eucalyptus ... ... ... .T. ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Atropa ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... .TT ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ..A ... ... ... Arabidopsis ... ... ... .TT ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... Cotton ... ... ... .TT ... ..G ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ..C ... ... Medicago ... ..C ... ... ..A ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ..C ... ..G Soybean ... ..C ... .T. ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ..C ... ... Lotus ... ... ... .T. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ... ... Oenothera ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... Ranunculus ... ... ... .TG ... ... ..G ..A ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ..C ... ... Drimys ... ..C ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... ... ..C ... ... Piper ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..G ..A ..G ..G ..C ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... ... ... ... ... Populus ... ... ... .TT ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... Nuphar ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... ... ..C ... ... Nymphaea ... ... ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.. ... ..A ... ... ..C ... ... Amborella C.. ... ... ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ..T ... ..C ... ... Ginkgo ... ... ... ... ... ... ..G ... .G. ... ... A.A ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ..T ... ..G ... ... Pinus ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ..T ..C ..A ... ... Acorus ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... Typha ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... A.. ... ..T ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... .TT ... ... ..G ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C ..T ... ... ... ... Yucca ... ... ... .T. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... A.. ... ..C ..T ... ... ..G ... Saccharum ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.. ... ..T ... ..C ..C ... ... Zea ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.. ... ..T ... ..C ..C ... ... Oryza ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.. ... ..C ... ..C ..C ... ... Triticum ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.. ... ..T ... ..C ... ..G ... agrostis ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.. ... ..C ... ..C ... ... ... Sorghum ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.. ... ..T ... ..C ..C ... ... Barley ... ... ... .T. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.. ... ..T ... ..C ... ..G ... Nicotiana TAT CTA GGA GAT GTT TTT TAT TTG CAT TCA CGC CTT TTG GAA AGA GCC GCT AAA TTA AGT TCT AGT TTA GGT GAA GGA Grape ... .C. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... TC. ... ... ... ... Tomato ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Cucumis ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... CT. ... ... ... ... Eucalyptus ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... CT. ... ... ... ... Panax ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... C.. ..G ... ... ... Atropa ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... .CG ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... CT. ... ... ... ... Arabidopsis ... .C. ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... CAA ... ... ... ..G Cotton ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... .C. ... ... CAG ... ... ... ... Citrus ... .CC ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..G ... ... G.. ..G CAG ... ..C ... ... Medicago ... .CC ... ... ... ... ... ..A ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... CAG ... ... ... ... Soybean ... .C. ..G ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... CAG ... ..C ... ... Lotus ... .CG ... ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... C.. ..T ... ... ... ... ... CAG ... ... ... ..G Oenothera ... .CG ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... Ranunculus ... .CG ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... C.. ... ... ... ... Calycanthus ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... CC. ... ... ... ... Drimys ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... CA. ... ... ... ... Piper ... .C. ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... .A. ... ... ... ..C ... ... Liriodendron ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .C. ... ... C.. ... ... ... ... Populus ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... CC. ... ... TC. ... ... ... ... Nuphar ... .C. ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... CC. ... ... C.. ... ..C ... ... Nymphaea ... .C. ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... CC. ... ... C.. ... ..C ... ... Amborella ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... C.. ... ..C ... ... Ginkgo ... .CG ... ... ... ..C ..C ... ... ..C ..T ... C.. ... ... ..A ... ... ... ... ... CAG ... ... ... ..G Pinus ... .CG ... ... ... ..C ... ... ... ..C ..T ..C ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C CAG ... ... ..G ..G Acorus ..C .C. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... C.. ... ... ... ... Typha ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C C.. ... ... ... ... Yucca ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ..C .AA ... ... ... ..G Saccharum ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C .A. ... CT. ... ..C ... ..G Zea ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ... CT. ... ..C ... ..G Oryza ..C .C. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ... CT. ... ..G ... ... Triticum ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ... CT. ... ..C ... ... agrostis ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ... CT. ... ..C ... ... Sorghum ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ... CT. ... ..C ... ..G Barley ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ... CT. ... ..C ... ... Nicotiana AGT ATG ACC GCC TTA CCA ATA GTT GAA ACC CAA TCG GGA GAT GTT TCG GCT TAT ATT CCT ACT AAT GTA ATT TCC ATT Grape ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... Tomato ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ..T ... ... ... ... ..G ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ..T ... ... ... ... ..G ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ..T ..T ..G ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ..T ... ... ... ..C ..G ... ... G.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ..T ... ... ... ..C ..C ..G ... ..G ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Citrus ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Soybean ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Lotus ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ..T ... ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ..T ..G ... ... ... ... ..G ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C Calycanthus ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ..G ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... Drimys ... ... ... ..T ... ..C ... ... ..G ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Piper ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..C ..G ..C ... ... ... ..C ... ..C ... ... ..G ... ..G ... Liriodendron ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Populus ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..C ..G ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Amborella ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Ginkgo ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ..T ... G.T ..G ... ... ... ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... ... Pinus ... G.T ..T ..T C.. ... ... ... ..G ..T ... G.T ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... .C. ... ... ... Acorus ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Typha ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ... ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ... ..T ..T ... ... ... ..G ..G ..T ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Yucca ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ... ... ..T ... ... ... ..G ..G ..T ... ..T ... ..C ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... Zea ... ... ... ..T ... ... ... ..G ..G ..T ... ..T ... ..C ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ..A ... Oryza ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ... ..C ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Triticum ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ... ..C ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... agrostis ... ... ... ..T ... ... ... ..C ..G ..T ... ..T ... ..C ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Sorghum ... ... ... ..T ... ... ... ..G ..G ..T ... ..T ... ..C ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... Barley ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ... ..C ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Nicotiana ACT GAT GGA CAA ATC TTC TTA TCC GCC GAC CTA TTC AAT TCT GGA ATC AGA CCT GCT ATT AAT GTG GGT ATC TCC GTT Grape ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T T.. ... ... G.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ..A ... ... ... ..A ... ... ..A ... ..T ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... Eucalyptus ..A ... ... ... ..A ... ... ..A ... ..T ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... Panax ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ..T ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... G.. ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..T ..T ... Arabidopsis ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ..T ..T ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ..T ..T ..C Cotton ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ..C Citrus ..A ..C ..G ... ..A ... ... ... ..G ..T T.. ... ... G.. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... ..C Medicago ..A ... ..C ... ..A ..T ... ..T ... ..T ... ... ... G.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... Soybean ..A ... ..C ... ..A ... ... ..T ... ..T ... ... ... G.. ... ... ... ..C ... ... ... ..A ... ..T ... ... Lotus ..G ... ..C ... ..A ..T ... ..T ... ..T ... ... ..C G.. ..G ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..T ..T ... Oenothera ..A ..C ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ... ... G.. ... ... ... ..C ..G ... ... ... ..C ..T ..T .GC Ranunculus ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T C.C ..C ..G ... ... ..A ... ..T ..T ..C Calycanthus ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... G.C ... ... C.T ... ..C ... ... ... ... ..T ..T ..C Drimys ..A ... ... ..G ..A ... ... ..T T.. ..T ... ... ... G.. ... ... C.C ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C Piper ..A ... ... ... ..A ... ... ... T.G ..T ... ... ... G.. ... ..T C.T ..G ... ... ..C ... ..C ..T ..G ..C Liriodendron ..A ... ... ... ..A ... ... ..T ... ..T ... ... ... G.. ... ... C.T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C Populus ..A ..C ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... G.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ..G ..C Nuphar ..A ... ..G ... ... ... ..G ... ..G ..T T.. ... ... G.. ... ... C.T ..A ... ... ... ... ... ..T ... ..C Nymphaea ..A ... ..G ... ... ... ... ... ..G ..T T.. ... ... G.. ... ... C.T ..A ... ... ... ... ... ..T ... ..C Amborella ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... G.. ... ... C.G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Ginkgo ..C ... ... ... ... ... ... ..G ..T ..T ... ... ... G.C ..G ... CA. ... ..C ... G.. ... ... ..T ..T ..A Pinus ..C ... ... ... ..A ..T .C. ..G ... ..T ... ... ... G.C ..G ... C.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C Acorus ..A ... ..G ... ..A ... ... ... ... ..T T.. ... ... G.C ... ..A C.. ... ... ... ... ... ... ..T ..T ..C Typha ..A ... ... ... ..A ... ... ..T ..T ..T ... ... ... G.. ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... Phalaenopsis ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... G.. ... ..A ..G ... ... ... ... ..A ... ..T ..T ... Yucca ..A ... ... ... ..A ... C.. ... ... ..T ... ... ... G.G ... ... C.. ..C ... ... ... ..A ... ..T ..T ... Saccharum ..A ... ... ... ..A ... ... ... ..G ..T ... ... ... G.C ... ..T C.. ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... Zea ..A ... ... ... ..A ... ... ... ..G ..T ... ... ... G.C ... ..T C.. ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... Oryza ..A ... ... ... ..A ... ... ... ..A ..T ... ... ... G.C ... ..T C.G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Triticum ..A ... ... ... ..A ... ... ..T ..G ..T ... ... ... G.C ... ..T C.. ..C ... ... ... ... ... ..T ..T ... agrostis ..A ... ... ... ..A ... ... ..T ..G ..T ... ... ... G.C ... ..T C.. ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... Sorghum ..A ... ... ... ..A ... ... ... ..G ..T ... ... ... G.C ... ..T C.. ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... Barley ..A ... ... ... ..A ... ... ..G ..G ..T ... ... ... G.C ... ..T C.. ..C ... ... ... ... ... ..T ..T ... Nicotiana TCC AGA GTG GGG TCC GCA GCT CAA ATA AAA GCC ATG AAA CAA GTA GCT GGT AAA TTA AAA TTA GAA CTA GCA CAA TTC Grape ... ... ..A ..A ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ..G ..G ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Cucumis ... ... ..A ..A ..T ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... T.. ..G ... ... Eucalyptus ... ... ..A ..A ..T ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... T.. ..G ... ... Panax ... ... ... ..A ..T ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ..G ... ..G ..G ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Spinacia ..T C.G ..A ..A ..T ..G ... ... ..T ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G ..G ... ..T Arabidopsis ..G ... ..A ..A ... ..C ... ... ..T ... ..T ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... T.G ..T ... ... Cotton ... ... ..A ..A ..G ..G ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... .C. ... ..G ... T.G ..C ... ... Citrus ..T C.. ..A ..A ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..G ... T.G ... ... ... Medicago ... ... ..T ..A ..G ..G ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..G ... T.G ... ... ... Soybean ... ... ..T ..A ..G ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... T.. ... ... ... Lotus ... ... ..T ..A ..G ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... T.G ... ... ... Oenothera ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... T.G ..G ... ... Ranunculus ..G ... ..A ..A ... ..G ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..T ... ..C ... ... ... ..G ... T.G ..T ... ... Calycanthus ..G ... ..A ..A ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ..G ..C ... ... Drimys ... ... ..A ..A ..T ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... .C. ... ..G ... ..G ..T ... ... Piper ... ... ..A ..A ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... Liriodendron ... ... ..A ..A ..T ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ..G ..T ... ... Populus ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..T ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... T.G ..G ... ... Nuphar ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... .C. ... ... ... T.G ..T ... ..T Nymphaea ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... T.G ..T ... ..T Amborella ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ..G ..T ... ..T Ginkgo ..T ... ..A ..A ... ... ... ..G ..T ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ..G T.. ..T ... ..T Pinus ..T ... ..A ..A ..T ..G ... ..G ... ... ..T ... ... A.G ... ... ..A ..G ..G ... ... ..G T.. ..T ... ..T Acorus ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ... ..T ... ... Typha ..T ... ..A ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ... ..G ... ... Phalaenopsis ..A ... ..C ..A ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ... ..T ... ..T Yucca ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... Saccharum ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ... ..T ... ... Zea ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ... ..T ... ... Oryza ... ... ..A ..A ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... T.. ..T ... ... Triticum ... ... ..A ..A ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ... ..T ... ... agrostis ... ... ..A ..A ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ... ..T ... ... Sorghum ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ... ..T ... ... Barley ... ... ..A ..A ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ..G ... ... ..T ... ... Nicotiana GCA GAA TTA GAA GCC TTT GCA CAA TTT GCT TCT GAT CTC GAT AAA GCT ACT CAG AAT CAA TTG GCA AGA GGT CAA CGA Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ..C T.. ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Arabidopsis ..T ... ... ... ... ... T.C ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cotton ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ..C Medicago ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... .G. ... Soybean ... ... ... ... ..T ... ..C ... ..C T.. ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... ... ... ... Lotus ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ... ... ... ... ..C T.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ..G ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... Calycanthus ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ..C ..C ... ..A ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ... ..G C.. ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ..C ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ..G ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ..G ... ... ... ... ..G ... ..C ... ..C ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Amborella ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo ... ..G ... ... ... ..C ..G ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Pinus ... ..G ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ... ..A G.. ... ... ..G ..G ... ... ... Acorus ..G ..G ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... Typha ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Yucca ... ..G ... ..G ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ... ... C.. ... ... ... ... ..C ..C ... .C. ..G ... ... A.A .G. ... ... ... ... ... ..G ... .G. ... Zea ... ... ... C.. ... ... ... ... ..C ..C ..C .C. ..G ... ... A.A .G. ... ... ... ... ... ..G ... .G. ... Oryza ..G ..G ... C.. ... ... ... ... ..C ..C ... .C. ... ... ... A.A .G. ... ... ... ... ... ..G ..C .G. ... Triticum ... ..G ... C.. ... ... ... ... ..C ..C ... .C. ... ... ... A.A .G. ... ... ... ... ... ..G ... .G. ... agrostis ... ..G ... C.. ... ... ... ... ..C ..C ... .C. ... ... ... A.A .G. ... ... ... ... ... ..G ... .G. ... Sorghum ... ... ... C.. ... ... ... ... ..C ..C ... .C. ..G ... ... A.A .G. ... ... ... ... ... ..G ... .G. ... Barley ... ..G ... C.. ... ... ... ... ..C ..C ... .C. ... ... ... A.A .G. ... ... ... ... ... ..G ... .G. ... Nicotiana TTA CGT GAA TTG CTT AAA CAA TCC CAA TCA GCT CCT CTC ACG GTA GAA GAG CAG ATA ATG ACT ATT TAT ACC GGA ACA Grape ... ... ... ... ..C ... ... ... ... G.. ..C ... ..T ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ..C ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ..C ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G Panax ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ..C ... ... ... ... ... C.. ... ..C ..C ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ..C ... ... ... ..G Arabidopsis ..G ... ..G ..A ..G ... ... ... ... ... ..C ..C ... ..A ..G ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Cotton ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G .C. ..A ... ... .GT ... ... ... ... ... ..G Citrus ... ... ..G ... ..C ... ..G G.. ... G.. ..C ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G Medicago ..G ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ..A ... ... ..A ... G.. ... ..T ... ..G Soybean ..G ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ..G ... ..A ... ... ..A ... ... ... ..T ... ..G Lotus ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ..G ... ..A ... G.. ..A ... ... ... ... ... ..T Oenothera ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... G.. AAA ... ... ..C ..G .C. ..A ... ... C.. ... ... ... ..T ..G ..G Ranunculus ..G ... ..G ... ..C ... ... ..T ... G.. ..C ... ..A ... ..G ... ..A ... G.. G.. ..G ... ... ... ... ... Calycanthus ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... G.. ..C ... ... ..C ..G ... ..A ... ... G.T ... ... ... ... ... G.G Drimys ... ..C ..G ... ..C ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... ..G ... ..A ..A ... C.T ... ... ... ..T ..G G.G Piper ... ..C ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T G.. ..C ... ..A ..A ... G.T ... ... ... ..T ... G.G Liriodendron ... ..C ..G ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ..G ... ..C ... ... G.T ... ... ... ... ... G.G Populus ..G ... ..G ... ..C ... ... ... ... G.C ..C ... T.. ... ..G .C. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G Nuphar ... ..G ..G ... ..C ... ... ... ... ... T.C ... ... G.. ..G ..C ..A ... ... G.T ... ... ... ... ... ..G Nymphaea ... ..G ..G ... ..C ... ... ... ... ... T.C ... ... G.. ..G ..T ..A ... ... G.T ... ... ... ... ... ..G Amborella ..G ..C ..G ... ..C ... ... ... ... G.. ..C ... ... G.. ..G ... ..A ... G.. G.T ... ... ... ..A ... G.G Ginkgo ... ... ..G ... ..C ... ..G ..T ... ... ... ... T.G ..A ..G ..G ..A ..A ... GCT ... ... ... ..T ... G.G Pinus ... ... ..G ... ..C ... ... ..T ..G ..G ... ... T.G ..T ... ... ..A ..A ... GCT ... ... ... ... ... ... Acorus ..G ..C ..G ..A ... ... ... ... ... ... .AA ... ... G.. ..G ..C ..A ..A G.G G.T ... ... ... ... ... ..G Typha ... ..C ..G ... ... ... ... ..T ... ..T ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... GCT ... ... ... ... ... G.G Phalaenopsis ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... .AC ... ... G.. ... ... ..C ... ... GCT ... ... ... ... ... ... Yucca ..G ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... .AC ... ..T ... ..G ... ..A ... G.. GCT ... ... ... ..T ... ... Saccharum ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... AAC ... ... C.A ..G ... ... ... G.. GCT ... ... ... ... ... ..G Zea ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... AAC ... ... C.A ..G ... ... ... G.. GCT ... ... ... ... ... ..G Oryza ... ..A ... ... ... ... ... ... ... G.. AA. ... ..T C.A ..G ... ... ... ... GCT ... ... ... .T. ... ... Triticum ... A.G ... ... ... ... ... ... ..G G.. AA. ... ... C.A ..G ... ... ... ... GCT ... ... ... ... ... ... agrostis ... A.G ... ... ... ... ... ... ..G G.. AAC ... ... C.A ..G ... ... ... ... GCT ... ... ... ... ... ..G Sorghum ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... AAC ... ... C.A ..G ... ... ... G.. GCT ... ... ... ... ... ..G Barley ... A.G ... ... ... ... ... ... ..G G.. AA. ... ... C.A ..G ... ... ... ... GCT ... ... ... ... ... ... Nicotiana AAC GGC TAT CTT GAT TCA TTA GAA GTT GGA CAG GTA AGG AAA TTT CTT GTT GAG CTA CGT ACT TAC TTA AAA ACT AAT Grape ..T ..T ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... .C. ... T.. ... .A. ... ... ... ..G ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. Cucumis ..T ..T ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... T.. ... ... ... G.. ... ..G ... Eucalyptus ..T ..T ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... T.. ... ... ... G.. ... ..G ... Panax ..T ..T ... ... ... .T. ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... C.. ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. Spinacia ..T ..T ... ... ... ... ... ... C.. .AT ..A ... ..A ... .A. ... ... ..A T.. ... ... ..T G.. ... ..G ... Arabidopsis ..T ..T ... ..G ... GG. ... ... A.. ... ..A ... ..A ... ... ..C ... C.A T.. ..C ... ... ... ... ..G ... Cotton ..T ..T ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... T.. ... ... ... ... ... ..G ... Citrus ..T ..T ... ... ... ... ... ... A.. ..T ..A ... ..A ... ... ..C ... ... T.. ... ... ... ... ... ..G ... Medicago ..T ..T ... ... ... ... ... ... A.. TAT .TC ... C.. ... ... ..C ... ... T.. A.G G.. ..T ... ... ..G ... Soybean ..T ..T ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... G.. ... ... ..C ..G ... Lotus ..T ..T ... ... ... ... ... ... A.. A.. ... ... C.. ... ... ..C ... ... T.. ... G.. ... ... ... ..G ... Oenothera ..T ..T ... ... ... ... ..C ... A.. .C. ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... GA. ... G.. ... ..G .GG Ranunculus ..T ..G ... ... ... ..G ... ... A.. ... ..A ... .A. ... ... ..C ... C.A T.. ... ... ... ... ... .G. .G. Calycanthus ..T ..G ... ... ... C.G ... ... A.. ..C ... ... .A. ... ... ..C ... C.. T.. ... ..C ... ... ... ..A ... Drimys ..T ..G ... ... ... C.G ... ..T A.. ... ... ... .A. ... ... ..C ... C.. T.. ... ..C C.. ... ... ..A ... Piper ..T ..G ... ... ... C.C ... ... AC. ..G ... ... .A. ... ... ..A ... C.A T.. ... ... ... ... ... ..A ... Liriodendron ..T ..G ... ... ... C.G ... ... A.. ..G ... ... .A. ... ... ..C ... C.. T.. ... ..C ... ... ... ..A ... Populus ..T ..T ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... T.. ... ..C ... ... ... ..G .G. Nuphar ..T ..A ... ... ... CA. ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... C.. T.. ... ..C ..T ... .G. ..G ... Nymphaea ..T ..A ... ... ... CA. ... ... A.. ... ... ... .A. ... ... A.. ... C.. T.. ... ..C C.T ... .G. ..G ... Amborella ..T ..G ... ... ... C.. ... ... A.. ... ... ..G .A. ... ... ..C ... C.. T.. ... ... ..T ... .G. ..A ... Ginkgo ..T ..A ... ..A ... AT. .C. ..G A.C .T. ... ..G ..A ... ... ..C ... C.. T.. ..C GAA ..T ... .T. ... ... Pinus ... ..A ..C ..G ... AT. ..C ... A.A .C. ... ..G ..A ... ... ..C C.. .G. T.. ... TT. ..T ..G .T. .AA ... Acorus ..T ..A ... ... ... A.G ... ... A.. ..G ... ... .A. G.. ... ..C ... A.. T.. ... ..C ... ... ... .AG ... Typha ..T ..G ... ... ... ..G ... ... A.. ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. T.. ... ..C ... ... ... .AG ... Phalaenopsis ..T ..A ... ... ... G.G ... ... A.. ... ... ... .A. ... ... ... ... .G. T.. ... ..C ... ... .C. .AG ..G Yucca ..T ..A .T. ... ... ..G ..C ... A.C ... ... ... .A. ... ... ..C A.. C.. T.. ... ..C ... ... ... .AG ... Saccharum .GA ..A ... ... ... ..G ... ... A.. .A. ... ... .A. ... ... ..G .A. ... T.. ... .AA C.. C.. ... GA. .C. Zea .GA ..A ... ... ... ..G ... ... A.. .A. ... ... .A. ... ... ..G .A. ... T.. ... .AA C.. C.. ... GA. .C. Oryza .GA ..A ... ... ... ..C ... ... A.. ... ... ... .A. ... ... ..G .A. ... T.. ... .AA C.. C.. ... GA. .C. Triticum .GA ..A ... ... ... ..G ... ... A.. .A. ... ... .AT ... ... ..G .A. ... T.. ... .AA C.T C.. ... GA. .C. agrostis .GA ..A ... ... ... ..G ... ..G A.. .A. ... ... .AT ... ... ..G .A. ... T.. ... .AA C.. C.. ... GA. .C. Sorghum .GA ..A ... ... ... ..G ... ... A.. .A. ... ... .A. ... ... ..G .A. ... T.. ... .AA C.. C.. ... GA. .C. Barley .GA ..A ... ... ... ..G ... ... A.C .A. ... ... .AT ... ... ..G .A. ... T.. ... .AA C.. C.. ... GA. .C. Nicotiana AAA CCT CAG TTC CAA GAA ATC ATA TCT TCT ACC AAG ACA TTT ACC GAG GAA GCA GAA GCC CTT TTG AAA GAA GCT ATT Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... A.. ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Cucumis ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ..T ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C Eucalyptus ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ..T ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C Panax ... ..G A.. ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Spinacia ... ..G G.. ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ..T ... ... ... ... G.C ... ... ... ... ..A ... .CT ... ... ... AG. T.. ... ... ... .G. ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ... ..G ... A.G ... ... ... ..C ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... .T. ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... Medicago ... ... A.A ..T A.C ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T .G. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Soybean ... ... ..A ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T .G. ... ... ... .T. ... ... ..G ... ... ... Lotus ... ... ..A ... A.C ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T .G. ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Oenothera ... ..G ... ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... .T. ..C ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..C ... ... Ranunculus ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... ... ... .T. ... ... ..G ... ... ... Calycanthus ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... .TG ... ... ... ... ..G ... ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... C.. ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Piper ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..G ... ... .T. ..C ... A.A ..C ..G ... ..T A.. ..A ..G ... .TA ... Liriodendron ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... C.. ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Populus ... A.. ... ..T ... ... ..T ... ... ... ..A ..A ... ... ..T ..A ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... Nuphar ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... GT. ..C ... ... C.. ... ... ... A.. ... ..G ..G ... ... Nymphaea ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... GT. ..C ... ... C.. ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... Amborella ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... CG. ..G ..C ... ... ... ... ... ... A.. C.. ... ... ... ... Ginkgo ... ..G ... ... GG. ... ..T ... CG. ... ..T .G. ... ..C ..T ..A C.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Pinus ... ... ... ... GG. ... ..T ... CG. ... ..T GGT ... ... ..A ..A ... ..G A.. ... ... C.. G.. ..G ... C.. Acorus ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... Typha ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C .A. C.A C.. ... ... ... A.. ... ..G ... ... ... Phalaenopsis ... ... A.A ... ... ... ..T C.. ... ... ... ... .T. ..C ... ..A ... ..T ... A.. ... ... .G. ... ... ... Yucca ... ... ..A ... ... ... ..T C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... A.. ... ... ..G ... ... ... Saccharum ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... .GT ... ... ..C ... ... C.. ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... Zea ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... .GT ... ... ..C ... ... C.. ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... Oryza ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... .G. ... ... ..C ... ... ... ..G ... AT. ... ... ..G ... ... ... Triticum ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... .G. ... ... ..C ... ... C.. ..G ... AT. ... ... ..G ... ... ... agrostis ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... .G. ... ... ..C ... ... C.. ..G ... AT. ... ... ..G ... ... ... Sorghum ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... .GT ... ... ..C ... ... C.. ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... Barley ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... .G. ... ... ..C ... ... C.. ..G ... AT. ... ... ..G ... ... ... Nicotiana CAG GAA CAA ATG GAC CGT TTT ATA CTT CAG GAA CAA GCA --- --- --- --- ATG AGA ATC AAT CCT ACT ACT TCT GGT Grape ... ... ..G ... ..A ..C ... C.. ... ... ... ... ... --- --- --- --- ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ..G .A. ..A ..C ... C.. ... ... ... ... .G. --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Eucalyptus ... ... ..G .A. ..A ..C ... C.. ... ... ... ... .G. --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Panax ... ... ..G .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- ... ... ..A ... ... ... ... ..A ... Atropa ... ... ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ..A ... ..G ... ..A ..C ... C.. ... ... ... ... ... --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... .A. Arabidopsis ..A ..G ... C.A ..A ... ..C C.. ... ... ..G A.. .T. --- --- --- --- ... ... .CA ... ... ... ... ..A AA. Cotton ... ..C ... ... ..A ... ... CG. ... ... ... ... TT. --- --- --- --- ... .A. ..A ... ... ... ... ... .T. Citrus ... ... ... .A. ..A ... ... C.. ... ... ... ... TTC --- --- --- --- ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... Medicago ... ... ..G ... ..A .TC ... T.. ... ... ... ..G .T. GAA AAA ATT AAT ... ... C.A .C. ... ..C ... ..G .A. Soybean ..A ... ..G ... ..A .TC ... T.. ..A ... ... ..G .T. GAA AAA AAT --- ... C.. ... ... ... ... ... ... ... Lotus ... ... ..G ... ..A .TC ... T.. ..C ..A ... ... .T. GAA AAG AAT --- ... .T. ..A ... ... ..C ... ... .A. Oenothera ..T ... ..G .A. ..A .TC ... C.. G.. ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ..A ... Ranunculus ... ... ..G ... ..G ..A ... C.. ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... .G. ... ... ... ... ... ... Calycanthus .CA ... ..G ..A ..A .TC ... C.. ... ... ... ... A.. --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys .C. ... ..G ... ..A .TG ... ... ... ... ... ... A.. --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Piper .CA ... ..G ..A ..A .TG ... C.. ... ..A ... ... A.. --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron .C. ... ..G ..A ..A .TG ... C.. ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... A.. Populus ... ... ..G ... ..A ... ... C.. ... ... ... ..G .T. --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ..G ..G ..C ..A .TA ... C.. ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ..G ..G ... ..A .TA ... C.. ... ... ... ... A.. --- --- --- --- ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Amborella ... ... ..G ..A ..A .TG ... C.. T.. ... ... ... A.. --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo A.. ... ..T ..C ..A AT. ... T.G AC. TC. AG. AC. .A. GAG AAT ATT --- ... ... .C. ... .T. .T. G.. CT. ..A Pinus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... .AA ... ... CT. GT. CT. ..G Acorus ... ..G ..G C.C ..A .TC ... C.. ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ..A .C. ... ... ... ... ... Typha ... ... ..G ..C ..A .TG ... T.. ..G ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... A.. Phalaenopsis ... ... ..G ..T ..A .TC ... C.. ... ... ... ... A.. --- --- --- --- ... ... .A. ... ..C .T. ... ... .A. Yucca ..A ... ..G .CC ..A .TG ... C.. ... G.. ... A.G --- --- --- --- --- ... .A. ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ... ..G C.T ..A ..G ... TCC ... ... ... ... A.. --- --- --- --- ... ... .C. ... ... ... ... ..G C.. Zea ... ... ..G C.T ..A ..G ... TCC ... ... ... ... A.. --- --- --- --- ... ... .C. ... ... ... ... ..G C.. Oryza ... ... ... C.C ..A ..G ... TCC ... ... ... ... A.. --- --- --- --- ... ... .C. ... ... ... ... ... C.. Triticum ... ... ..G C.. ..A ..G ... TCT ... ... --- --- --- --- --- --- --- ... ... .C. ... ... ... ... ... CC. agrostis ... ... ..G C.. ..A ..A ... TCT ... ... --- --- --- --- --- --- --- ... ..T .C. ... ... ... .G. ... C.. Sorghum ... ... ..G C.T ..A ..G ... TCC ... ... ... ... A-- --- --- --- --- ... ... .C. ... ... ... ... ..G C.. Barley ... ... ..G C.. ..A ..G ... TCC ... ... --- --- --- --- --- --- --- ... ... .C. ... ... ... ... ... C.. Nicotiana TCT GGG --- --- GTT TCC ACG CTT GAA AAA AAA AAC CCG GGG CGT GTC GTC CAA ATC ATC GGT CCG GTA CTA GAT GTA Grape C.. ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... A.. .CT ... ... ..T ... ... ..C ..G ... ... Tomato ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis C.. ..A --- --- ... ... ..A ... ... ... ... ... .T. ..A ... A.. TCT ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... Eucalyptus C.. ..A --- --- ... ... ..A ... ... ... ... ... .T. ..A ... A.. TCT ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... Panax ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... AA. A.. AC. ... ... ..T ... ... ... ..G ... A.. Atropa ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia C.. ... --- --- ... ... ..A ... ... ... ... ... .T. ... ... A.. .CT ... ..T ..T ... ... ... ..G ..C ... Arabidopsis C.A .A. --- --- ... ..G .TA .G. ... ... ... ... .T. ..A ... A.. .C. ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... Cotton C.. ..A --- --- ... ... ... ... ... ... G.. ..T .T. ... ... A.T TCT ... ... ... ... ..A ... ..G ... ... Citrus C.. ... --- --- ... ... G.. T.. .C. ..C ... ... .TA ..A .A. A.. .CT ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... Medicago A.. .A. --- --- ... ..T GGA ... ... ... ... ..T ATA ..A ... A.. ACG ... ..A ..T ... ... ... ..C ... ... Soybean C.. .A. --- --- ... ..T G.. ... ... ... ... ..T .T. ..A ... A.. .C. ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... Lotus C.. .AA --- --- ... ..T G.T ... ... ... ... ..T A.. ..A ... A.. .C. ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... Oenothera C.. ..A --- --- ... ... ..A ... ... ... ... ..A T.. ..C ... A.. .CT ... ... ..T ... ..A ... ..G ... ... Ranunculus C.. ... --- --- ... C.. G.. ... ... G.. ... ... .T. ..A ... A.A .CT ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... Calycanthus C.. ... --- --- ... ... ..A ... ... G.. ... ... .T. ... ... A.T .CT ... ... ..T ... ..A ... ..G ... ... Drimys C.. ... --- --- ... ... ..A ... ... G.. ... ... .T. ... ... A.T .CT ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... Piper C.. ... --- --- ... ..T ..A ..C ... G.. ... ..T .A. ... ... A.T ..T ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... Liriodendron C.. ... --- --- ... ... ..A ... ... G.. ... ... .T. ... ... A.T ..T ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... Populus C.. ..A --- --- ... ... G.. ... ... ... ..G ... .T. ..A .A. A.. .CT ... ... ..T ..C ..A ..G ... ... ... Nuphar C.C ..T --- --- ... ..A ..A --- --- --- ... ..T .T. ..A ... A.. .CT ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... Nymphaea CTC ..A --- --- ... ..A ..A ... .TG G.. ... ..T .A. ..A ... A.. .CT ... ... ... ... ..A ... ..G ... ... Amborella ... ..T TCC GGG .C. ..T ..A ... .CG G.. ... .G. GT. ..A ... A.. .CT ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... Ginkgo GT. TCC --- --- --- --- ..A ... .TG G.. ..G ..T GT. ..A ... A.T .CT ... ... ..T ..C ... ... ..G ... ... Pinus GT. TCC --- --- --- --- G.A AG. .T. G.. .C. ..T GT. ..A ... A.T .CT ... ... ..T ..C ..A ... ..G ... ..C Acorus ... .C. --- --- ... C.. T.A ... ..C G.G ... ... TTA ... ... A.. ... ... ... ..T ..C ..A ... ..G ... ..C Typha C.. ... --- --- .G. ... ..A ... ... G.. ... ... .TA ... ... A.. .CT ... ..T ..T ..C ..A ..G ..G ... .CC Phalaenopsis C.. .T. --- --- ... ..T ..A ... A.. G.. C.. ... .AA ... ... A.. .CT ... ..T ..T ..C ..A ... ..G ... ..C Yucca C.. .C. --- --- ... ... ..A ... ... G.. ... ... .TA ... ... A.. .CT ... ..T ..T ..C ..A ... ... ... ..T Saccharum C.C ... --- --- ... ... ..A A.. ... G.. ... .G. GTA ... ... A.T .AT ... ..T ..T ..A ..C ..G ..G ... A.C Zea C.C ... --- --- A.. ... ..A A.. ... G.. ... .G. GTA ... ... A.T .AT ... ..T ..T ..A ..C ..G ..G ... A.C Oryza C.C ... --- --- ... ..T ..A A.. ... G.. ... .GT A.A ... ... A.. .AT ... ..T ..T ..A ..C ..G ..G ... ..C Triticum C.C ... --- --- .C. ... ..A A.. ... G.. ... .GT A.A ..T ... A.. .AT ... ..T ..T ..A ..C ..G ..G ... ..C agrostis C.C ... --- --- ... ..A ..A A.. ..T G.. ... ..T A.A ..T ... A.. .AT ... ..T ..T ..A ..T ..G ..G ... ..C Sorghum C.C ... --- --- ... ... ..A A.. ... G.. ... .G. GTA ... ... A.T .AT ... ..T ..T ..A ..C ..G ..G ... A.C Barley C.C ... --- --- ... ... ..A AG. ... G.. ... .GT A.A ..T ... A.. .AT ... ..T ..T ..A ..C ..G ..G ... ..C Nicotiana GCC TTT CCC CCG GGC AAG ATG CCG AAT ATT TAT AAC GCT CTG GTA GTT CAA GGT CGA GAT AGT GTT GGT CAA CCA ATT Grape ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ..T ..G ... ... ... A.G ... ... ... .C. ..C ... ... .A. ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... .C. A.C ... ... GA. ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... .C. A.C ... ... GA. ... Panax ..T ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ..T ... ... ... ... A.G .A. ... ... .C. ..C ... ... .A. ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ..T ..A ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ..A A.. ... A.. ... ... ... .C. .C. ... ... ... ..G Arabidopsis ... ..C ... ... ... ..A ... ..T ... ... ..C ..T ... ... ..G ... A.G ... ... ... .C. C.. ... ... GA. ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ..C ..A ... ... A.G ... .A. ... .CC .CC ... ... .A. ... Citrus ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ..C ..T ... ... ... ... A.G ... ... ... .C. ..C .A. ... ... ... Medicago .TT ... ..A ..A ..G ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... A.. ... ... ... ... ... .C. ... ..C ... GA. ... Soybean ..T ... ... ..A ..T ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... A.. ... A.G ... ... ... .C. ... ... ... .A. ... Lotus A.T ... ... ..A ..G ... ... ..C ... ... ..C ... ... ..A A.. ... A.. ... ... ... .C. ... ... ... .A. ... Oenothera A.. ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... A.. ... ... ... .C. .GC ..C ... GA. ... Ranunculus T.. ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... T.. ..T ... A.. ... .A. ... GC. ... ..C ..G .A. ... Calycanthus ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ..C T.. ... ... A.G ... ... ... .C. ..C ... ... .A. ... Drimys .TT ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... T.. ..G ... A.G ... ... ... .C. ..C ... ... .A. ... Piper ... ... T.. ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... T.. A.. ... A.G ... .AG ... .CC ..C ... ..G .A. ... Liriodendron ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... T.. ... ... A.G ... ... ... .C. ..C ... ..G .A. ... Populus .TT ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... A.G ... ... ... .C. ..C A.. ... .A. ... Nuphar ..T ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... ..C ... T.. T.. ... ... A.G ... ... ... .CC .CA ... ..G GA. ... Nymphaea ..T ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... ..C ... T.. T.. ... ... A.G ... ... ... .CC .CA ... ..G GA. ... Amborella ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... T.. T.. ... ... A.G ... ... ... .C. .CC ... ..G .A. ... Ginkgo A.T ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... .TC ..T T.. T.. A.. ..G A.G ... .A. ... .CA .C. ... ..G GA. ... Pinus T.T ... ..T ..A ..T ..T ... ..T ... ... ..C ..T T.A T.. A.. ... A.G ... .A. .G. .CA .CC ... ... GA. ... Acorus ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ... ..C ... ... T.. ..G ... A.G ... ... ... .C. .CC ... ..G ... ... Typha .TT ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... T.. ... ... A.G ... ... ... .C. C.C ... ..G .A. ... Phalaenopsis ATT ... ..A T.. ... ... ... ..T ... ... ... ..T ... T.. A.. A.. A.. ... ... ... .C. ... ... ..T .A. ... Yucca .TT ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... T.. ... ... A.. ... ..C ... .C. ..C ... ..G .A. ... Saccharum A.T ... ... ... ... ... T.. ..T ... ... ... ..T ... T.. A.. ..C A.G A.. ... ..C .C. .CC .A. A.G .A. ... Zea A.T ... ... ... ... ... T.. ..T T.. ... ... ..T ... T.. A.. ..C A.G A.. ... ..C .C. .CC .A. A.G .A. ... Oryza A.T ... ... .G. ... ... T.A ..T T.. ... ... ..T ... T.. ... ..C A.G A.. ... ..C .C. .AC ... A.G .A. ... Triticum A.T ... ... ..A ... ... T.A ..T T.. ... ... ... ... T.. ... ..C ..G A.. A.. ..C .C. .AC .A. A.G .A. ... agrostis A.T ... ... ... ... ... T.A ..T T.. ... ... ... ... T.. ... ..C ..G A.. A.. ..C .C. .CC .A. A.G .A. ... Sorghum A.T ... ... ... ... ... T.. ..T T.. ... ... ..T ... T.. A.. ..C A.G A.. ... ..C .C. .CC .A. A.G .A. ... Barley A.T ... ... ... ... ... T.A ..T T.. ... ... ... ... T.A ... ..C ..G A.. A.. ..C .C. .CC .A. A.G .A. ... Nicotiana AAT GTG GCT TGT GAG GTA CAG CAA TTA TTA GGA AAT AAT CGA GTT AGG GCT ATA GCT ATG AGT GCT ACA GAG GGT CTA Grape ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.G ... ... ... ... ... ..T ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ..A ... ... Cucumis ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ... Eucalyptus ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ... Panax ... ..T A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ..C ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ..C ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ..C ... ... Spinacia ... ... A.. ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ... Arabidopsis ... ... A.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ..G ... ... ... T.. Cotton ... ..A A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ..C ... ... ..T ... ... Citrus ... ... A.. ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..A ... G.. ..C ... ... ... ... ..T ... ... Medicago ..C ..A A.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ... Soybean ... ... A.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..A ... G.. ... ... ... ..G ... ..A ... ... Lotus ..C ... A.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... G.. ... ... ... ... ..G ..T ... ... Oenothera ... ..C A.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... G.C ..C ... ... ... ... ..T ... ... Ranunculus ... ..A A.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..A ... G.. ... ... ... ... ..G ..T ... ..G Calycanthus ... ... A.. ... ..A ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ..G Drimys ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ..G Piper ... ..A A.C ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..C ... ..G Liriodendron ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ..G Populus ... ..C A.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ... Nuphar ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ..G ..G Nymphaea ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ..G ..G Amborella ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A A.G G.. ... ... ... ... ... ..T ... ... Ginkgo C.. ..T A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... G.. ... ... .A. ... ... ..T ... ..G Pinus C.G ..T A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... C.. AAG ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... T.G Acorus ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... C.A ... G.G ... ... ... ... ... ..T ... T.G Typha ... ..T A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ..G Phalaenopsis ... ..A A.. ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ..G Yucca ... ... A.. ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..C ... ..G Saccharum ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.G ... ... ... ... ... ..C ..G T.G Zea ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.G ... ... ... ... ... ... ..G T.G Oryza ... ..A A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..T ..G T.G Triticum ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ..G ..C ..G T.G agrostis ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ..C ..G T.G Sorghum ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.G ... ... ... ... ... ..C ..G T.G Barley ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ..G ..C ..G T.G Nicotiana ACG AGA GGA ATG GAA GTG ATT GAC ACA GGA GCT CCT ATA AGT GTT CCG GTC GGG GGA GCG ACT CTG GGA CGA ATT TTT Grape .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ..C Tomato ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ..A ... ..C ... ... ... ..C ..C ... ... ..C Eucalyptus .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ..A ... ..C ... ... ... ..C ..C ... ... ..C Panax ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... C.. ... ... ... ... ..T ... A.. ... ..T ... ... ... ..C Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... C.. ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... T.. ..C ... ..A ... ..T ... ... ... ..T ... ... ... ... Arabidopsis .A. ... ... ... ..C ... G.. ..T .TG ... AA. ... C.. ... ... ..A ... ..C ... ... ... ..A ... ... ... ..C Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... G.. C.. ... ... ..A ... ..C ... ... ..C ..A ... ... ... ... Citrus ... ..G ..T ... ... ..A ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ..A ... ..C ... .T. ... ..A ... ... ... ..C Medicago .A. ... ... ... .TT ... ... A.. ..G ... ... ..C C.. ... ... ..A ... ..C ... ..A ..C ..A ..T ... ... ..C Soybean .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.C C.. ... ... ..A ..A ..T ... ..A ... ..A ... ... ... ..C Lotus ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... G.. C.. ... ... ... ..G ..T ... .TA ... ..A ... ... ... ..C Oenothera ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ..A ... ..C .A. ... ... ..A ... ... ... ..C Ranunculus .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C Calycanthus .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ..C ... ..C ... ..T ... ..T ..G ..T ... ... ... ..C Drimys .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... C.. ... ... ..A ... ..T ..G ..T ..A ..C ... ... ... ..C Piper ... ... ... ... ... ..A ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ..C Liriodendron .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ..C ... ... ... ..C Populus .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C C.. ... ... ..A ..A ..C ..G ... ... ..A ... ... ... ..C Nuphar .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ..A ... ..T ... ..C ... ..A ... ... ... ..C Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ..A ... ..T ... ..C ... ..A ... ... ... ..C Amborella .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..C .A. ..T ... ..C ... ... ... ..C Ginkgo .T. ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... C.G ... ... ..A ..T ..T ... ..T ... ..T ... ... ... ..C Pinus ... ... ... ... AG. ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ..A ..T ..T ... ..T ... ..C ... ... ... ..C Acorus ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... G.. C.. ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ..C ... A.. ... ..C Typha .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... T.. ... ..G ..A ... ..C ... A.T ... ..C ... ... ... ..C Phalaenopsis .T. ... ... ... A.. ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ..A ... ... ... ..T ... ..C ... ... ... ..C Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... G.. C.. ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..C ..G ... ... ..C Saccharum .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... A.. ... C.C ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ..C ... ... ... ... Zea .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... A.. ... C.C ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ..C ... ... ... ... Oryza .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.C ... ... ..T ... ..T ... ..T ... ..T ... ... ... ..C Triticum .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.C ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..T ... ... ... ..C agrostis .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G C.C ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..C ... ... ... ..C Sorghum .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... A.. ... C.C ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ..C ... ... ... ... Barley .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.C ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..C ... ... ... ..C Nicotiana AAC GTG CTC GGA GAA CCT GTT GAT AAT TTA GGG CCT GTA GAT ACT AGT ACA ACG TCT CCT ATT CAT AGA TCT GCG CCC Grape ... ... ..T ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ..T ... ... ... ... ... G.. ... ..A ... ... ... ... C.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ..T ... ... ... ... ... G.. ... ..A ... ... ... ... C.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ..T ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ..T ..G ..G ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ..A C.C ... ..A ... ... ... ... ... ..G ... ... Arabidopsis ... ... ..T ..G ... ..C ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... C.C ... ..A ... ... ..C ... .A. ..C ... ..T Cotton ... ... ..T ..G ..G ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ..C ... ... ... .A. ..C ... ... Citrus ... ... ..T ... ..G ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ..C ... ... ... .A. ..C ... ..T Medicago ... ... ..T ... ..G ... A.. ... ... ... ..T ... ... ... ... G.G ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ..T Soybean ... ... ..T ... ..G ..C A.. ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ..T Lotus ... ..A ..T ..C ..G ... A.. ... ... ..G ..T ..C ... ... ... C.. ... ..A ... ... ... ..C ... ..C ... ..T Oenothera ... ... ... ... ..G .T. ... ... G.A ... ..A ..C ... ... ... C.. ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... A.. Ranunculus ... ..T ..T ... ..G ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ..T Calycanthus ... ..T ..T ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T Drimys ..T ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ..T Piper ... ..T ..T ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.. ... ..A ... ..C ... ... C.. ... ... ... Liriodendron ... ..T ..T ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T Populus ... ... ..T ... ... ... ... ... G.. ... ..T ... ... ... ... CAG .T. ..A ..C ... ... ... ... ... ... ..T Nuphar ..T ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... ..C ..A ... Nymphaea ..T ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... G.C ..A ... Amborella ... ..T ..T ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T Ginkgo ..T ..T ..T ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... G.. C.C ... ..A ..C ... ... ... ... C.. ..T ..T Pinus ..T ..T ..T ... ... ... ..C ... ... ..G ..T ... ... ... G.. G.C .T. ..A ... ... ... ... ... C.. ..T ... Acorus ... ..T ..T ..G ..G ..C ... ... ... ... ..C ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T Typha ..T ..T ..T ..G ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ..C ..T ... ..G ..C ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... C.C ... ..A .T. ... ... ... ... ... ..A ... Yucca ..T ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T Saccharum ... ..T ..T ..G ..G ... A.. ..C ... ..G ..T ... ..G ... ... ... G.. ..A .TC ... ... ... ... ... ... ..T Zea ... ..T ..T ..G ..G ... A.. ..C ... ..G ..T ... ..G ... ... ... G.. ..A .T. ... ... ... ... ... ... ..T Oryza ... ..T ..T ..G ..G ... ... ..C ... ..G ..T ... ... ... ... ... G.. ..A .TC ... ... ... ... ..C ... ... Triticum ... ..T ..T ..G ..G ... ... ..C ... ..G ..T ... ... ... .G. ... G.. ... .TC ... ... ... ... ... ... ..T agrostis ... ..T ..T ..G ..G ... ... ..C ... ..G ..T ... ... ... .G. ... G.G ... .TC ... ... ... ... ... ... ..T Sorghum ... ..T ..T ..G ..G ... A.. ..C ... ..G ..T ... ..G ... ... ... G.. ..A .TC ... ... ... ... ... ... ..T Barley ... ..T ..T ..G ..G ... ... ..C ... ..G ..T ... ... ... .G. ... G.. ... .TC ... ... ... ... ... ... ..T Nicotiana GCC TTT ATA CAG TTG GAT ACA AAA TTA TCT ATT TTT GAA ACA GGA ATT GAA GTA GTA GAT CTT TTA GCC CCT TAT CGC Grape ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... A.. ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G Eucalyptus ... ... ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G Panax ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... Atropa ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Spinacia ... ... .C. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ..T ... ... G.A ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ..T Cotton ..T ..C ... ..A ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C ... ... ... ..T ... ... ..T Citrus ..T ... ... ... ..A ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T Medicago ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... A.. ..T ... ... ... ... ..T ... ... ... Soybean ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... G.C ... ... ... ... ... ..A A.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T Lotus ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ..A ... .TC G.. ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C ... ... ... ... ..A A.. ... Ranunculus ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... A.G ... ..G ... ... ... ..T ... ... ..T Calycanthus ..T ... ..C ... ..A ... ..C ... ... ..A ..C ... ... ... ..G ... A.. ..G ..G ... ... ... ..T ... ... ..T Drimys ..T ... ..C ... ..A ... ... .G. ... ..C ..C ... ... ... ..G ... A.. ..G ..G ... ... ... ..T ... ... ... Piper ..T ... ..C ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G ... A.. ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... Liriodendron ..T ... ..C ... ..A ... ..C ... ... ..A ..C ... ... ... ..G ... A.. ..G ..G ... ... ... ..T ... ... ... Populus ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ..T ... ... ... ..A ... ..C ... ... ..A ..C ... ... ..G ..C ... A.. ..G ..G ... ... ... ..G ... ... ..G Nymphaea ..T ... .C. ..A ..A ... ..C ... ... ..A ..C ... ... ..G ..C ... A.. ..G ..G ... ... ... ..G ... ... ..G Amborella ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... ..A ..C ... ... ... ..C ... A.. ..G ..G ... ... ... ..T ... ... ..T Ginkgo ... ... .CG ... ... ... ..C ... ... ..A ..C ..C ... ... ..C ... A.. ..G ..G ... ... ... ..T ... ... ..A Pinus ... ... .C. G.. ... ... ... ... ... ..C ..C ..C ... ... ..C ... A.. ... ... ... ... ..G ..T ... ..C ... Acorus ..A ... ... ... ..A ... ..G ... ... ..A ..C ... ... ... ..C ... A.. ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... Typha ..T ... ... ... ..A ... ..G ... ... ..A ..C ... ... ... ..T ... A.. ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... Phalaenopsis ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..G ... A.. ..T ..G ... ... ... ... ..C ... ... Yucca ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..G ... A.. ..G ..G ... ... ... ..T ..G ... ... Saccharum ... ... ..C G.. ..A ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... A.G ..G ..C ... ... ... ..T ..C ... ..A Zea ... ... ..C G.. ..A ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... A.G ..G ..C ... ... ... ..T ..C ... ..A Oryza ... ... ..C G.. ..A ... ..G ... ... ..C ..C ... ... ..T ..T ... A.G ..G ..C ... ... ... ..T ... ... ..G Triticum ... ... ..C G.. ..A ... ..G ... ... ..C ..C ... ... ... ..T ... A.G ..C ..C ... ... ... ..T ... ... ..A agrostis ... ... ..C G.. ..A ... ..G ... ... ..C ..C ... ... ... ..T ... A.G ..C ..C ... ... ... ..T ... ... ..A Sorghum ... ... ..C G.. ..A ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... A.G ..G ..C ... ... ... ..T ..C ... ..A Barley ... ... ..C G.. ..A ... ..G ... ... ..C ..C ... ... ... ..T ... A.G ..C ..C ... ... ... ..T ... ... ..A Nicotiana CGT GGA GGA AAA ATC GGA CTA TTC GGG GGA GCT GGA GTG GGT AAA ACA GTA CTT ATT ATG GAA TTG ATT AAC AAT ATT Grape ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ..C ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ..C ... Eucalyptus ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ..C ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ..G ... ... ..T ... ... ... ..T ..G ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ..C ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ..G ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ..C ... Citrus ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ..C ... Medicago ... ..C ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ... ..G ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ..T ..C ... Soybean ... ... ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ..C ..T ..C ... Lotus ... ... ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..A ..C ..T ..C ... Oenothera ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..G ... ..G ..A ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ..C ... ..C ... Ranunculus ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..C ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ..C ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ..G ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..A ..C ... ..C ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ..C ... Piper ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ..C ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ..C ... Populus ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ..C ... ..C ... Nuphar ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..A ..C ... ..C ... Nymphaea ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ..C ..C ... ... ..A ..C ... ..C ... Amborella ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ..T ..C ... Ginkgo ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ..G ..A ..C ... ..C ... Pinus ... ..G ... ... ..T ..T T.. ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ..C ... ..C ... Acorus ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ..C ... Typha ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ..T ..C ... Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ..C ... Yucca ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ..C ... Saccharum ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ..G ..A ... ..A ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..A ..C ..T ..C ... Zea ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ..G ..A ... ..A ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..A ..C ..T ..C ... Oryza ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..A ..C ... ... ... Triticum ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ..G ..C ... ... ..A ..C ..T ..C ... agrostis ... ... ... ... ..A ..C ... ..T ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..A ..C ..T ..C ... Sorghum ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ..G ..A ... ..A ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..A ..C ..T ..C ... Barley ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ..G ..C ... ... ..A ..C ..T ..C ... Nicotiana GCT AAA GCT CAC GGG GGC GTA TCC GTA TTT GGC GGA GTG GGT GAA CGT ACT CGG GAA GGA AAT GAT CTT TAC ATG GAA Grape ..C ... ... ..T ... ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ..T ... ..G ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ..T ... ..G ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ..C ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T .G. ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ..T ..T ..T ... ... ... ... ..T ... ..A ..C ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Cotton ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Citrus ..C ... ..C ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ..C ... ... ..T ..A ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... ... ..T ..G ... ... ... ... ..T ... ... Soybean ..C ... ... ..T ..A ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ..T ... ... Lotus ..C ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... ... ..T ..G ... ..C ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ..C ... ... ..T ..A ..T ... ... ... ... ..A ..G ... ..C ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Calycanthus ..C ..G ... ..T ..A ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys ..C ... ... ..T ..A ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ..C ..G ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... Liriodendron ..C ... ... ..T ..A ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Populus ..G ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... Nuphar ..C ... ... ..T ... ..T ... ..T ... ..C ... ... ..A ..A ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ..C ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ..A ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Amborella ..C ... ... ... ..A ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo ... ..G ... ..T ..A ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ..T ... ..G ... ... ... ... G.. ... Pinus ... ..G ... ..T ..A ..G ... ..T ... ... ..A ... ..A ..A ... ... ..C ..T ... ..G ... ... ... ... ... ... Acorus ..C ... ..G ..T ..A ..T ... ... ... ... ... ... ..A ..C ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Typha ..C ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ..C ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... Yucca ..C ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... Saccharum ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... Zea ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... Oryza ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... Triticum ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..A ..G ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... agrostis ... ... ... ..T ... ..T ... ..T ... ... ..T ... ..A ..G ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... Sorghum ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... Barley ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..A ..G ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... Nicotiana ATG AAA GAA TCT GGA GTA ATT AAT GAA GAA AAT ATT GCA GAA TCA AAA GTA GCC CTA GTT TAT GGT CAG ATG AAT GAA Grape ... ... ... ... ... ..G ... ... ... A.. ... ... T.. ... ... ... ..G ..T ... ..C ..C ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ..G ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..T ..G ..C ..T ... ..C ..C ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..T ..G ..C ..T ... ..C ..C ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... C.. ... ... ... ... ..G ... ..G ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ..G ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ..C ... ..T ..C ... ... C.. ... ..C ... ... ... ..G ..G ..T T.. ... ... ..G ..A ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ... ..C ... ... ... C.. ... C.. ..G ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... C.. ..G ... ... ... ..G ..T T.. ..C ..C ... ... ... ... ... Citrus ... ... ..G ... ... ... ... ... ..C C.. ... C.. T.G ... ... ... ..G ..T ... ..C ..C ... ... ... ... ... Medicago ... ... ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ..C ..C ..G ..A ... ... ... Soybean ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ... Lotus ... ... ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ..C ... ..A ... ... ... Oenothera ... ..G ... ..C ..C ..C ... ..C ... C.. ... ... ... ... ..G ..G ..G ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... ..C ..G ..G ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C C.. ..C ... ... ... ... Drimys ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C C.. ... ... ... ... ... Piper ... ..G ... ..C ... ..T ... ..C ... C.. ... C.. ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.. ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... Nuphar ... ... ... ..C ..G ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ..A ... ..A ... ... ... ... Nymphaea ... ... ... ..C ..G ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ..A ... ..A ... ... ... ... Amborella ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... Ginkgo ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G C.. ..C ..C T.. ... ... ... ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ... Pinus ... ... ... ..G ... ... ... G.. ... C.. ..A ..A T.. ... ... ... ..G ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ... Acorus ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... .A. ... ..T ... ... ..T ... ..G ... ... ... ... ... ... Typha ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... A.. ... C.. ... ... ... ... ... ..T ... ..C ..C ... ..A ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... ..C ..G ..T ... ... ... A.. ... ... ... ... ..C ... ..G ..T ... ..C ... ... ..A ... ... ... Yucca ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ..C ... ... ..A ... ... ... Saccharum ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... .AG ... ... ..G ... ..T ... ..C ... ..C ..A ... ... ... Zea ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... .AG ... ... ..G ... ..T ... ..C ... ..C ..A ... ... ... Oryza ... ..G ... ... ... ... ... ... ... A.. ... C.. .AG ... ... ..G ... ..T ... ..C ... ..C ..A ... ... ... Triticum ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... .AG ... ... ..G ... ..T ... ..C ... ..C ..A ... ... ... agrostis ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... .AG ... ... ..G ... ..T ... ..C ... ..C ..A ... ... ... Sorghum ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... .AG ... ... ..G ... ..T ... ..C ... ..C ..A ... ... ... Barley ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... .A. ... ... ..G ... ..T ... ..C ... ..C ..A ... ... ... Nicotiana CCG CCG GGA GCT CGT ATG AGA GTT GGT TTG ACT GCC CTA ACT ATG GCG GAA TAT TTC CGA GAT GTT AAT GAG CAA GAC Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Eucalyptus ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Panax ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ..A ... ..G ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Arabidopsis ... ..A ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... T.. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cotton ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Citrus ..A ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Medicago ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ..A ..G ... Soybean ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ..A ... ..T Lotus ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ..A ... ... Oenothera ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G G.T CG. G.. ... ..C ... ... ... ... ... ... A.A ... A.T Ranunculus ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... A.. ... ..A ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... Piper ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... Populus ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Nuphar ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..A ... ... Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..A ... ... Amborella ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Ginkgo ..A ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... T.. ..C ... ..T ... ... .C. ... ... ..C ... ... ... ... Pinus ..A ... ... ... ..C ... ... ..C ... ..A ... ..T ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Acorus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..A ..G ..T Typha ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... ..T Phalaenopsis ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... Zea ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... Oryza ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... Triticum ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... agrostis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... Sorghum ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... Barley ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... Nicotiana GTA CTT CTT TTT ATT GAC AAT ATC TTC CGT TTC GTC CAA GCA GGA TCC GAA GTA TCG GCC TTA TTG GGT AGA ATG CCT Grape ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... Tomato ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... Atropa ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... ... ... C.. ... ... Arabidopsis ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Medicago ..C ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... C.. ... ..C C.. ... ... Soybean ... ... ..A ... ..C ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... ... ... C.. ... ... Lotus ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..A ... C.. ... ... Oenothera ... ... ..A ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C C.. ... ... Ranunculus ... ... ..A ... ..C ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..A ..A ... ... ... Calycanthus ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... Drimys ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ... ..G ..A ... ... ... ... Piper ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... C.. ..A ... ... ... ..C Liriodendron ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... Populus ... ... ..A ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C Nuphar ... ... ..A ... ..C ... ... ... ..T ..C ... ... ... ..G ..G ..A ... ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... Nymphaea ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T ..C ... ..T ... ..G ..G ..A ... ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... Amborella ... ... ..A ... ... ... ... ... .CT ..C ... ..T ... ... ... ..A ... ..C ..T ... ... ..A ..C ... ... ... Ginkgo ... ..C T.A ... ..C ... ... ... ... ..C ..T ... ... ... ... ..A ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... Pinus ... ..A T.A ... ... ..T ..C ... ... ... ..T ... ... ..G ... ..A ..G ... ..C ... C.. ..A ..C ... ... ... Acorus ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ..G ... ..A ... ..G ... ..A ... ... ..T ... ... ..A ..G C.G ... ... Typha ..G ... ..A ..C ..C ... ... ... ..T ... ... ..A ... ..C ... ..A ... ... ..T ... ... ..A ..G ... ... ..C Phalaenopsis ... ... T.A ..C ... ... ... ..A ..T ... ... ..T ... ... ..G ... ... ..C ..T ... ... ..A ... ... ... ... Yucca ..G ... T.A ..C ..C ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..G ..A ... ... ..C ..T ... ..A ..G ... ... ..C Saccharum ..G ... T.A ..C ..C ..T ... ... ..T ... ..T ..T ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ..A ..C ... ... ..C Zea ..G ... T.A ..C ..C ..T ... ... ..T ... ..T ..T ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ..A ..C ... ... ..C Oryza ..G ... ..A ..C ..C ..T ... ... ..T ... ..T ..T ... ... ... ..G ..G ... ..T ... ... ..A ..G ... ... ..C Triticum ..G ... T.A ... ..C ..T ... ... ..T ... ..T ..T ... ... ... ..A ..G ... ..C ..T ... ..A ..G ... ... ..C agrostis ..G ... T.A ..C ..C ..T ... ... ..T ... ..T ..T ... ... ... ..G ..G ... ..C ..T ... ..A ..G ... ... ..C Sorghum ..G ... T.A ..C ..C ..T ... ... ..T ... ..T ..T ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ..A ..C ... ... ..C Barley ..G ... T.A ... ..C ..T ... ... ..T ... ..T ..T ... ... ... ..A ..G ... ..C ..T ... ..A ..G ... ... ..C Nicotiana TCC GCT GTG GGT TAT CAA CCC ACC CTG AGT ACC GAA ATG GGT TCT TTA CAA GAA AGA ATT ACT TCT ACC AAA GAA GGG Grape ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... Tomato ... ... ... ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A Eucalyptus ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... A.. ... ..G ... ... ... ... ..G ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... Spinacia ... ... ... ... ... ... ..T ..T ..T ... ... ... ... ..C ..G ... ..G ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Arabidopsis ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... A.G ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ..A Citrus ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Medicago ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ..T ... ... ... A.. ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... Soybean ..T ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... Lotus ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... .CG ..A Ranunculus ... ... ..A ... ... ... ..T ..T ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A Calycanthus ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Drimys ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A Piper ..T ... ... ... ... ... ..T ..T ..T ... ..G ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A Liriodendron ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A Populus ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ..C ... ... ... ..G ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..A Nymphaea ... ..C ... ... ... ..G ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ..T ... ..G ..A Amborella ..T ..C ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ..A Ginkgo ..T ... ... ... ... ..G ..A ..T ..T ..C ..G ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ..T ... ..G ..A Pinus ... ..C ... ... ... ..G ..A ..T ..T ..C ..G ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... ..C ..A ... A.G ..A Acorus ... ..C ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G ..A Typha ..T ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A Phalaenopsis ..T ..A ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..G ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..A Yucca ... ..A ..A ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ..A Saccharum ... ..A ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... A.G ..A Zea ... ..A ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... A.G ..A Oryza ..T ..A ... ... ... ... ..T ..T ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... A.G ..A Triticum ... ..A ... ... ... ... ..T ..T ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... G.. ... ..T ... A.G ..A agrostis ..T ..A ... ... ... ... ..T ..T ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... G.. ..C ..T ... A.G ..A Sorghum ... ..A ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... A.G ..A Barley ... ..A ... ... ... ... ..T ..T ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... G.. ... ..T ... A.G ..A Nicotiana TCC ATA ACC TCT ATT CAA GCA GTT TAT GTA CCC GCA GAC GAT TTG ACC GAC CCT GCT CCT GCT ACG ACA TTT GCA CAT Grape ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C ..A ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Panax ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ..T ... ..C ..A ... ..C ..C ... ... ... ... Cotton ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ..T ... ... ... ... ... ..C ... ..C ..A ... ... ..G ... Citrus ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ... ..T ..T ..C ... ... ..C ... ... ... ..C ... Medicago ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Soybean ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Lotus ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..T ..C ..C ..C ..C ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... Ranunculus ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C ..A ... ... ..G ... Calycanthus ..T ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ..T ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... Liriodendron ..T ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... Nuphar ..T ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Nymphaea ..T ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..T ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Amborella ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Ginkgo ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Pinus ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Acorus ..T ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ..T ..G ..T ... ... ..T ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... Typha ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... Phalaenopsis ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ..T ..G ..T ... ... ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... Yucca ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... Saccharum ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... Zea ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... Oryza ..T ... ..T ..G ..C ... ..G ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... Triticum ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C ..A ... ... ... ... agrostis ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ... ... ... ... Sorghum ..T ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... Barley ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C ..A ... ... ... ... Nicotiana TTA GAT GCT ACT ACC GTA CTA TCA AGA GGA TTG GCT GCC AAA GGT ATT TAT CCA GCA GTA GAT CCT TTA GAT TCA ACG Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..A Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ..C ... ... ... ... ... ..G C.. ... ... ... Arabidopsis ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... Medicago ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... T.. ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Soybean ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C Lotus ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ..G ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ..G ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..A ..C ..G ... ..A ..C ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..A ... ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ..C ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ..A Nuphar ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Amborella ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... T.. ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Pinus .C. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ..G ..G ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..A Acorus ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Typha ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... Yucca ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ..G ..C ... ... ... ... ..T ..C ... ... ..A ... T.. ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C Zea ..G ..C ... ... ... ... ..T ..C ... ... ..A ... T.. ..G ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ..C Oryza ..G ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ..A ... T.. ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C Triticum ..G ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ..A ... T.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C agrostis ..G ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ..A ... T.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C Sorghum ..G ..C ... ... ... ... ..T ..C ... ... ..A ... T.. ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C Barley ..G ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ..A ... T.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A Nicotiana TCA ACC ATG CTT CAA CCT CGG ATC GTT GGT GAG GAA CAT TAC GAA ACC GCC CAA AGA GTT AAG CAA ACT TTA CAA CGT Grape ... ..T ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ..T ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ..T ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ..T ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ..T ... ..C ... ... A.. ... ... ..C ... ... ... ..T ... .TT ..G ... ... ... ... G.. ..C ... ... ... Arabidopsis ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ..C ... ... ... ..T ... ..T ..G ... CA. ..A ..A ... ... ... ... ... Cotton ..C ..T ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ..G ... ... ... ..C ... ..G ... Citrus ... ..T ... ..G ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ..G ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ..T ..G ... ..G ... ..A ... ..G ... ... ... Soybean ... ..T ... ..C ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ..T ..G ..T ..G ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Lotus ... ..T ... ..C ... ..C ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Oenothera ... ..T ... ..C ... ... ..A ... ... ..C ..C ... ... ..T ... ..T ..A ... ... ..A ... G.. ..C ... ... ... Ranunculus ... ..T ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... .C. ... ... Calycanthus ... ..T ... ..C ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T ... .TT ..G ... ... ... ... ... ... .C. ... ... Drimys ... ..T ... ..C ... ... A.. ... ... ..C ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... .C. ... ... Piper ... ..T ... ..C ... ..C A.. ... ... ..A ... ... ... ..T ... ..T ..A ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ..C ..T ... ..C ... ... A.. ... ... ..C ... ... ... ..T ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... .C. ... ... Populus ... ..T ... ..C ... ... .A. ... ... ..C ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ..T ... ..C ... ... ... ..T ... ..C ..A ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Amborella ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo ..G ..T ... ..C ... ... T.. ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... .C. ... ... Pinus ..G ..T ... ..C ... ... T.. ... ..A ..C ..A ... ... ... ... ..T ..A ... G.G ... ... ... ... ... ... ... Acorus ... ..T ... ..C ... ... A.. ... ... ..C ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Typha ... ..T ... T.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..T ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ... Phalaenopsis ... ..T ... T.A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ..G ... ... ... ... .C. ... ... Yucca ... ..T ... T.A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ... Saccharum ... ..T ... T.A ..G ... ... ... ... ..C A.C ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ... Zea ... ..T ... T.A ..G ... ... ..T ... ..C A.C ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ... Oryza ... ..T ... T.A ... ... ... ... ... ..C A.C ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Triticum ..G ..T ... T.A ..G ... ... ... ... ..C A.C ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ... agrostis ... ..T ... T.G ..G ... ... ... ... ..G A.C ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ... Sorghum ... ..T ... T.A ..G ... ... ... ... ..C A.C ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ... Barley ... ..T ... T.A ..G ... ... ... ... ..C A.C ... ... ..T ... ..T ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ... Nicotiana TAC AAA GAA CTT CAG GAC ATT ATA GCT ATC CTT GGA TTG GAC GAA TTA TCC GAA GAG GAT CGT TTA CTC GTA GCA AGA Grape ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... AC. ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... AC. ... ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ACT ... ... ... Arabidopsis ... ..G ..G ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... AC. ... ... ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... AC. ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... C.G ... ... ... ... ... ... ACT ... ... ..G Medicago ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Soybean ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ... AC. ... ... ... Lotus ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ... ..T ... ... ..C ... ..G AC. ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ACT ... ... C.. Ranunculus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ACA ... ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G .C. ... ... ... ... ... ..A ... ... ... AC. ... ... ... Piper ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ... ..T ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Populus ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ACT ... ... ... Nuphar ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Amborella ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... CCA ..T ... ... ... ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Ginkgo ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... AC. ... ... ... Pinus ..T ..G ... ... ..A ... ... ... ... ..T .C. ... C.. ..T ... ... ..G ..G ..A ... ... ... A.. ..G ... ... Acorus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... AC. ... ... ... Typha ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... ... ACT ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ACT ... ... ... Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ... C.. ACT ... ... ... Saccharum ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ..T ... ... ... ..T ... ... ..G ..G ... ... ... ... ACT ... ... ... Zea ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ..T ... ... ... ..T ... ... ..G ..G ... ... ... ... ACT ... ... ... Oryza ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ..T ... ..G ... ..T ... ... ..G ..G ... ... ... ... ACT ... ... ... Triticum ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A ..T ... ..C ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ACT ... ... ... agrostis ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ..G ... ..T ... ... ..T ..G ... ... ... ... ACT ... ... ... Sorghum ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ..T ... ... ... ..T ... ... ..G ..G ... ... ... ... ACT ... ... ... Barley ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ..T ... ..C ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ACT ... ... ... Nicotiana GCG CGA AAA ATT GAG CGT TTC TTA TCA CAA CCC TTT TTC GTA GCA GAA GTA TTT ACC GGT TCT CCA GGT AAA TAT GTT Grape ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Cucumis ..A ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ..G ... ... ... Eucalyptus ..A ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ..G ... ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Spinacia ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... ..A ... ... ... Arabidopsis ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..G ..A ... ... ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..C ..G ..G ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ..G ..G ... ... ... Medicago ..A ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ... ..G ... ... ... Soybean ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..G ..G ..G ... ... ... Lotus ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ..G ... ... ... Oenothera ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ..G ..G ... ..C ... Ranunculus ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... Calycanthus ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ..G ... ..C ... Drimys ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... Piper ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ..C ..C ..G ..G ... ..C ..C Liriodendron ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..A ... ... ... Populus ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ..G ..A ... ... ..C Nuphar ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... Nymphaea ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... Amborella ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... ... ..A ... ... ... Ginkgo ..A ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ..C ... ... ..C ..G ..C ... ... ..C Pinus ..A A.. ... ... ..A ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ..A ... ..C ..G ..C ... ... ..G Acorus ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... Typha ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ..A ... ... ... Phalaenopsis ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ..G ... ... ..C ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... Yucca ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Saccharum ..A ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ..G ..C ..T ..G ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..A ..G ... ... Zea ..A ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ..G ..C ..T ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... Oryza ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ..T ..G ... ... ..T ... ... ... ... ..G ..A ..G ... ... Triticum ..A A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ..T ..G ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..A ..G ... ... agrostis ..A A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ..T ..G ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..A ..G ... ... Sorghum ..A ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ..G ..C ..T ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... Barley ..A A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ..T ..G ... ... ..T ... ..T ... ... ... ..A ..G ... ... Nicotiana GGT CTA GCA GAA ACA ATT CGA GGA TTT CAA TTG ATC CTT TCC GGA GAA TTA GAT GGT CTT CCT GAA CAG GCC TTT TAT Grape ... ... ... ... ... ... A.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... A.. ..G ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... A.. ..G ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Panax ... T.. ... ... ... ... A.G ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... A.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ... ... Arabidopsis ... ... ..G ... ... ... A.. ..G ... A.T ... ... ... ... ... ... ..T ... TC. ... ..C ... ... ... ... ..C Cotton ... ... ... ... ... ... A.. ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ..C ... ..T ... A.. ..G ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... Medicago ... ... ... ... ... ... A.. ..G ... A.. ... ..T ... ..T ... ... ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... Soybean A.. ... ... ... ... ... A.. ..G ... A.. ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Lotus ... ... ... ... ... ... A.. ..G ... A.. ... ..T ... ..T ..T ... ... ... A.. ... ..C ... ..A ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ..C ... A.. ..G ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Ranunculus ... ... A.. ... ... ... A.G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Calycanthus ... ..T ..G ... ... ... A.G ..G ... ... C.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Drimys ... ..C ... ... ... ... A.G ..G ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Piper ... ..C C.. ... ..T ... A.G ..G ... .G. ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... Liriodendron ... ..C ... ... ..C ... A.G ..G ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... Populus ... ... ... ... ... ... A.. ..G ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... Nuphar ... ..C ... ... ... ... A.G ..G ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... A.. T.. ..C ..G ... ... ... ... Nymphaea ... ..C ... ... ... ... A.G ..G ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... A.. T.. ..C ..G ... ... ... ... Amborella ... ..C ... ... ... ... A.G ..G ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Ginkgo A.. ..C .T. ... ... ... A.. ..T ... A.. A.. ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..T ... ... Pinus ... ..C ATG ... ... ... A.. ..T ... ... A.. ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ATC ... ... T.T ... ... Acorus ... ..C ..G ... ..G ... A.G ..G ... ... C.. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... Typha ... ..T ..G ... ... ... A.G ..G ... ... C.. ..A ... ... ... ... ... ..C A.. ..G ..C ..G ... ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... Yucca ... ..C ... ... ... ... A.G ..G ... ... C.. ..A ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C ..G ... ... ... ... Saccharum ... ..T ... ... ... ... A.G ... ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ..C ... ... ..T ... ... Zea ... ..T ... ... ... ... A.G ... ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ..C ... ... ..T ... ... Oryza ... ..T ... ... ..T ... A.G ... ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ..C ... ... ..T ... ... Triticum .C. ..T ..G ... ..T ... A.G ... ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ... ... ... ..T ... ... agrostis ... ..T ..C ... ..T ... A.G ... ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ..C ... ..A ..T ... ... Sorghum ... ..T ... ... ... ... A.G ... ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ..C ... ... ..T ... ... Barley .C. ..T ..G ... ..T ... A.G ... ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ... ... ... ..T ... ... Nicotiana TTG GTA GGT AAT ATC GAT GAA GCT ACC GCG AAG GCT ATG AAC TTA GAA ATG GAG AGC AAT TTG AAG AAA ATG ACC TTA Grape ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... Arabidopsis ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ... ..C ... ..C ... ... ..T ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ... ..C ..A ... ... .T. ..T ... ... ... .CA ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... GC. ... ..G --- ... ... .A. ..A ..C ... ... ... ..T ... Soybean ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Lotus ... ..G ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... .C. ..T ... ... .A. ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... Oenothera ... ..C ... .CC ... ... ... ... ... ... ... ... GC. ... ... ... ... ... ..T G.. ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T GA. ... ... ..A .C. ... ... ... ... ... Calycanthus ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.A ... ... ..A ... ... ... ... ... C.. Drimys ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T G.. ... ... ..A ... ... --- ... ... ... Piper ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T GA. ... ... ..A ..A ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... Populus ... ... ... ..C ..T ... ... ... ..T ... ... ... .C. ... ... ... ... ... .A. ..C ... ... ... ... .T. ... Nuphar ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.A ... ... ..A ... ... ... ... ... C.. Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.A ... ... ..A ... ... ... ... ... C.. Amborella C.. ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... G.A ... ... ..A ..A ... ... ... ... C.. Ginkgo ... ... ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C A.. G.. ... ..T --- --- --- --- ... ... C.. Pinus ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... .CC AGC ... ..A ..T --- --- --- --- ... ... C.. Acorus ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... G.. ... ... ..A ... ... ... ... .A. ... Typha ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... G.. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... GA. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Yucca ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... GG. ... .AG ..A --- --- --- ... ... ... Saccharum ..A ..G ..G ..C ... ... ... ... .G. A.. ..A ... ..A ... ... ... GA. ... ... ..A ... ... ... ... .AA ... Zea ..A ..G ..G ..C ... ... ... ... .G. A.. ..A ... ..A ... ... ... GA. ... ... ..A ... ... ... ... .AA ... Oryza ... ..G ... ..C ... ... ... ... .G. A.. ..A ... ..A ... ... ... GA. ... .A. ..A ... ... ... ... .AA ... Triticum ... ..G ... ..C ... ... ... ... .G. A.. ..A ... ..A .C. ... ... GA. ... .A. ..A .C. C.. ... ... .AA ... agrostis ... ..G ... ..C ... ... ... ... .G. A.. ..A ... ..A .C. ... ... GA. ... .A. ..A .C. ... ... ... .AA ... Sorghum ..A ..G ..G ..C ... ... ... ... .G. A.. ..A ... ..A ... ... ... GA. ... ... ..A ... ... ... ... .AA ... Barley ... ..G ... ..C ... ... ... ... .G. A.. ..A ... ..A .C. ... ... GA. ... .A. ..A .C. C.. ... ... .AA ... Nicotiana AAT CTT AGT GTA CTG ACC CCT AAT CGA ATT GTT TGG GAT TCA GAA GTG GAA GAA ATT GTT TTA TCT ACT AAT AGC GGT Grape ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..A A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..A Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Cucumis ... ... T.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... .CT ..A Eucalyptus ... ... T.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... .CT ..A Panax ... ... T.. ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... A.. ... A.C ... ..C A.. ... ... ... ... .AT ..C Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Spinacia ... ... T.. ... ... ..T ..G ... ... .G. A.. ... A.. ... ... ..A A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Arabidopsis ... ... T.. ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..A A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..A Cotton ... ... T.C ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ... ..A Citrus ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..A Medicago ... ... T.. ... ... ... ..C ... ... .C. ... ... ... ... ... ... A.G ... ... A.. ... ... ... ... ..T ..A Soybean ... ... T.. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... ... A.G ... ..C A.. ... ... ... ... ... ..A Lotus ... ... T.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... A.G ... ... A.. ... ... ..A ... ..T ..A Oenothera ... ... T.. ... T.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..A Ranunculus ... ..A T.. ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ..G ... ... ... ... Calycanthus ... ... T.. ... ... ..T ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Drimys ... ... T.. ... ... ..T ... ... ... ... A.. ... ... ... ..G ... A.. ... ... A.. ... ... ..G ... ..T ..C Piper ... ... T.. ... ... ..T ... ... ... ... A.. ... ..C ... ... ... A.. ... ... A.. ... C.. ..G ... ..T ..C Liriodendron ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... A.. ... ... A.. ... ... ... ... ..T ..C Populus .G. ... T.. ... T.. ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..G Nuphar ... ... ... ... ... ..T ... ... A.. ... A.. ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Nymphaea ... ... T.. ... ... ..T ... ... A.. ... A.. ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Amborella ... ... T.. ... ... ..T ... ... ... ..C A.. ... ... ... ... ... A.. ... ... A.. ... ..C ... ... ..T ..C Ginkgo ... ... C.. ... ... ..T ... ... ... G.. ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C A.C .C. ... ..C ... ..T ... Pinus ... ... C.. ... ... T.T ... ... ... G.C A.. ... ... ... ... ..T A.. ... ..A A.. C.. ... ... ... ..T ... Acorus ..G ... T.. T.. ... ..T ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... C.. ... ..C A.. C.. ... ... ... ..T ..A Typha ... ... T.. ... ... ..T ... ... ... ... A.. ... ... ... A.. ..A A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Phalaenopsis ... ... T.. ... ... ..T ..A ... ... ..G A.. ... ... ..T ... ... A.. ..G ... A.. ... ... ... ... ..T ..A Yucca ... ... T.. ... ... ..T ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Saccharum ... ... TA. ... ... ..T ... ..A ... ... A.. ... ... .GT ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Zea ... ... TA. ... ... ..T ... ..A ... ... A.. ... ... .GT ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Oryza ... ... TA. ... ... ..T ... ..G ... ... A.. ... ... .GT ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Triticum ... ... TA. ... ... ..T ... ..G ... ... A.. ... ... .GT ..G ... A.. ... ..C A.. ... ..C ... ... ..T ..C agrostis ... ... TA. ... ... ..T ... ..G ... ... A.. ... ... .GT ... ... A.. ... ..C A.. ... ..C ... ... ..T ..C Sorghum ... ... TA. ... ... ..T ... ..A ... ... A.. ... ... .GT ... ... A.. ... ..C A.. ... ... ... ... ..T ..C Barley ... ... TA. ... ... ..T ... ..G ... ... A.. ... ... .GT ... ... A.. ... ..C A.. ... ..C ..G ... ..T ..C Nicotiana CAA ATT GGC ATA TTA CCA AAT CAC GCC CCT ATT GCC ACA GCT GTA GAT ATA GGG ATT TTG AGA ATA CGT --- CTT AAC Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C --- ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C --- ... ... Cucumis ... ... ... G.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C --- ... ... Eucalyptus ... ... ... G.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C --- ... ... Panax ... ... ... G.. ... ..G G.. ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C --- ... ... Atropa ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C --- ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C --- ... ... Spinacia ... ... ... G.. ... ... ..C ..T ... ... .C. ... ... ..G ... ... ... ..A ... ..A ... ... ..C --- ... ... Arabidopsis ... ... ..T G.. ... G.. ..C ... ..G ..G ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... .A. ... ..C --- ... GCT Cotton ... ... ... G.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C --- ... ... Citrus ... ..C ... G.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ..C ..C --- T.. ... Medicago ... ... ..G G.. ... AA. ... ..T ..G ... ... ... ... ... T.. ... ... ..T ... ... .A. ... ..C --- ... ... Soybean ... ... ..A G.. ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... CTT ... ..A Lotus ... G.. ..A ... ... ..C ... ... ..G ... C.G ..T .TG ... T.. ... ... ..T ... ... ... ... ..C --- ... ... Oenothera ... ... ... G.. ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..C --- .AA ... Ranunculus ... ... ..T G.. ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... --- ... ... Calycanthus ... ... ... G.. ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C --- ..C ... Drimys ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C --- ..C ... Piper ... ... ... G.. ... ... ..C ... ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C --- ..C G.T Liriodendron ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... G.. ..C --- ..C ... Populus ... ... ..T G.. ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ..C ..T ... ..C ..T ... ... ... ... ..C --- ... ..T Nuphar ... ..C ... G.. ... ... ..C ... ... ..C G.. ... ..G ..C ..G ... ..C ..T ... ..A ... ... ..C --- ..C G.. Nymphaea ... ..C ... G.. ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ..C A.. ... ..T ..T ... ..A ... ... ..C --- ..C G.. Amborella ... ... ..T G.. ... ... ... ... ..A ... ... ..A ..G ... ... ... ... ..T ... C.C .A. ... ..C --- ..C C.G Ginkgo ... ... ... G.. ... ... ..C ... A.T A.A C.. .TT ... ... ... ... ... ..A ... A.. .A. ... ... --- ..C ..T Pinus ... ... ... G.. ... ..C ... ..T ..T T.A C.. .TG G.. ... ... ... ... ..A G.. A.. .A. ... ... --- ..C ..T Acorus ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ..C ..T C.. ... ... ... ..C --- .GC G.. Typha ... ... ..T G.. ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ..T C.. ... ... ... ..C --- .GC G.. Phalaenopsis ... ... ..G G.. ... ... ... ..T ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ..T C.. ... ... ... ..G --- ..A ..A Yucca ... ... ... G.. ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ..G ..G ... ... ..T C.. ... ... ... ..C --- ..C ..T Saccharum ... ... ..T G.. ... ... ..C ... ... ..C ... AA. ... ... ... ... ..G ..T CC. ... ... ... ..C CTC ..C ... Zea ... ... ..T G.. ... ... ..C ... ... ..C ... AA. ... ... ... ... ..G ..T CC. ... ... ... ..C CTC ..G ... Oryza ... ... ... G.. ... ... ..C ... ... ..C ... AA. ... ... ... ... ..G ..T CCC ... ... ... ..C CTC ..C ... Triticum ... ... ... G.. ... ... ..C ... ... ..C ... AA. ... ..A ... ... ..G ..T CC. ... ... ... ..C CTC ..C ... agrostis ... ... ... G.. ... ... ..C ... ... ..C ... AA. ... ..A ... ... ..G ..T CC. ... ... ... ..C CTC ..C ... Sorghum ... ... ..T G.. ... ... ..C ... ... ..C ... AA. ... ... ... ... ..G ..T CC. ... ... ... ..C CTC ..C ... Barley ... ... ... G.. ... ... ..C ... ... ... ... AA. ... ..A ... ... ..G ..T CC. ... ... ... ..C CTC ..C ... Nicotiana GAC --- --- --- CAA TGG TTA ACG ATG GCT CTG ATG GGT GGT TTT GCT AGA ATA GGC AAT AAT GAG ATC ACT GTT TTA Grape ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... --- --- --- ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... Eucalyptus ... --- --- --- ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... Panax ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... Potato ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... --- --- --- ... ... ... ..A T.. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... A.. ... Arabidopsis A.. --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... A.. ... Cotton ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... ... A.. ... Citrus ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... A.. ... Medicago A.T AAC AAC CGA ... ... G.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... A.. ... Soybean ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... AA. ... ... ... ... ... ... ... Lotus ... --- --- --- ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... C.. ... ... ... ... ..A ... ... ... ... Oenothera .GA --- --- --- ..G ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... A.. ... Ranunculus ... --- --- --- ... ... ... ..C G.A ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ..T ... ... ..A ..A ..C A.. ... Calycanthus .G. --- --- --- ... ... ... .T. ... ... G.A ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C A.. ... Drimys ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..C A.. ... Piper ... --- --- --- ... ... G.. ... ... ... T.. ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C A.. ..G Liriodendron ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C A.. ... Populus ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.T ... ... ... Nuphar ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..C A.A ... Nymphaea ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..C A.A ... Amborella ..G --- --- --- ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ..A ..A ..C A.A ... Ginkgo .GG --- --- --- ..G ... .C. ..T ... ... T.. ... ..C ... ... ..C ..G ... ... ..C G.. C.A ..T ..C ..A ..G Pinus .GG --- --- --- ..G ... .CC ..T ... ... A.. ... ..C ... ..C ..C .AG ... .A. .G. G.. AGA ..A ... A.A ..G Acorus ... --- --- --- .G. ... ... G.. G.. ... ... ... ..G ..G ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C A.. ... Typha ... --- --- --- ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C A.. ... Phalaenopsis ..T --- --- --- .G. ... ... ... G.A ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... A.T ... ... ... ... ... A.. ... Yucca ... --- --- --- ... ... ... ... G.. ..C ... ... ..C ... ..C ... ... ... A.T ... ... ... ... ..C A.. ... Saccharum ... --- --- --- ... ... ... ... GC. .T. ... TG. A.. ... ... ..G ... ... .TT ... ... ... ... .TC A.. ... Zea ... --- --- --- ... ... ... ... GC. .T. ... TG. A.. ... ... ..A ... ... .TT ... ... ... ... .TC A.. ... Oryza ..T --- --- --- ... ... ... ... GC. .T. ... TG. A.C ... ... ..C ... ... .TT ... ... ... ... .TC A.. ... Triticum ... --- --- --- ... ... ... ..A GC. .T. ... TG. A.C ... ... ..G ... ... .TT ... ... ... ... .TC A.. ... agrostis ... --- --- --- ... ... ... ..C GC. .T. ... TG. A.C ... ... ..G ... ... .TT ... ... ... ... .TC A.. ... Sorghum ... --- --- --- ... ... ... ... GC. .T. ... TG. A.. ... ... ..G ... ... .TT ... ... ... ... .TC A.. ... Barley ... --- --- --- ... ... ... ... GC. .T. ... TG. A.C ... ... ..G ... ... .TT ... ... ... ... .TC A.. ... Nicotiana GTA AAT GAT GCG GAG AAG GGT AGT GAC ATT GAT CCA CAA GAA GCT CAG CAA ACT CTT GAA CTA GCG GAA GCT AAT GTG Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ..C T.. Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ..C ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C T.A Eucalyptus ... ... ..C ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C T.A Panax ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ..C ... T.. ... ... ..C ... ... ..G ... ... A.. ... ... ... ... T.A Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ..T ... .G. ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ..A ... ... ... ... A.. ..A ... ... ..C T.. Arabidopsis ... ... ... ..A ... ... AA. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..A ... ... ..C T.. Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... A.. ... ... ... ..C T.. Citrus ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... A.. ..A ... ... ... T.. Medicago ... ... ... ... ..A ... A.. .T. ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ..A A.. A.. ..A ... ... ..C T.. Soybean ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... A.. ..A ... ... ... T.. Lotus ... ... ... ... ..A ..A ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... A.. ..A ... ... ... T.A Oenothera ... ... ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... G.. ... ... .G. ... ... ... ... ..C T.T Ranunculus ... ... ... ..A ... .G. ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..T C.. ... ..C T.. Calycanthus ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... A.. ..T ... ... ..C T.. Drimys ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... .G. ... ... ... A.. ..C ... ... .GC T.. Piper ... ... ... ..A ... .G. ... ... ... ... ... .TG ... ... ... ... GG. ... ... ... A.. ..T ... ... ... T.. Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... A.. ..T ... ... ..C T.. Populus ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..A ... ... ..C T.. Nuphar ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..T ... ... ..C C.. Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... .G. ... ... ... A.. ..T ..G ... ..C T.. Amborella ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..T ... ... ..C C.. Ginkgo ... ... A.. ..A ... ..A ... .TC ... ..C ... ..T .G. ..G ... .G. G.. G.. T.. C.. A.. ..T ... ... G.C C.A Pinus ... ... A.. ..A ... .GA .A. GT. ... ..C ... ..C .G. ... ..C ... G.. .A. T.. CG. A.. ..T A.. ... G.C T.A Acorus .G. ... ... ..C ... .T. ... .C. ... ... ... ..G ... ... ... ..A .G. G.. ... ... A.. ..T ... ... ..C T.. Typha .G. ... ... ... ... .T. A.. .C. ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... G.. ... ... A.. ..T ... ... ..C T.. Phalaenopsis .G. ... .G. ... ..A .TT A.. .C. ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... A.. ..T ... ... ..C T.. Yucca .G. ... ... ... ... .T. A.. .C. ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... G.. ... ... A.. ..T ... ... ..C T.. Saccharum .G. ... ... ..A ..A CT. ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ..A ..G G.A ... ... A.. ..C ... ... ..C T.. Zea .G. ... ... ..A ..A CT. ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ..A ..G G.A ... ... A.. ..C ... ... ..C T.. Oryza .G. ... ... ... ..A CT. ... ... ... ... ... ..G G.. ... ... ..A ..G G.A ... ... A.. ..C ... ... ..C ... Triticum .G. ... ... ... ..A CT. ... ... ..T ... ... ..G G.. ... ... ..A A.G G.A ... ... A.. ..C ... ... ..C T.. agrostis .G. ... ... ... ..A CT. ... ... ..T ... ... ..G A.C ... ... ..A ..G G.A ... ... A.. ..C ... ... ..C T.. Sorghum .G. ... ... ..A ..A CT. ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ..A ..G G.A ... ... A.. ..C ... ... ..C T.. Barley .G. ... ... ... ..A CT. ... ... ..T ... ... ..G G.. ... ... ..A A.G G.A ... ... A.. ..C ... ... ..C T.. Nicotiana AAA AAG GCT GAA GGA AGG AGA CAA AAA ATT GAG GCA AAT CTA GCT CTC CGA CGA GCT AGA ACA CGG GTG GAG GCT ATC Grape .GG ..A ... ... ..C .A. ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ..T A.. ... ... ..G ... ..A ..A ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. Cucumis .G. ..A ... ... ..T .A. ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... ..A ..C ... ... ... Eucalyptus .G. ..A ... ... ..T .A. ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... ..A ..C ... ... ... Panax .G. ..A ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ..G ... ..A ..A ... A.G ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. Spinacia .GG ..A ..G ... ... .A. ... ... ... ... ..A ... ... T.. ... ... A.. ... ... ..G ... ..A ..C ... ... .G. Arabidopsis .G. ..A ... ... ..T .A. ... ..G .C. ... ... ..T ... ... ... ... A.. ... ... C.G ... ..A ..C ... ... C.. Cotton .GG ..A ... ... ..C .A. ..G ... .C. ... ... ... ... ... ... ... A.. ..G ... ..G ... ..A ..C ... ... ... Citrus .GG ..A ... ... A.C .A. ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... ..A ..A ... .T. ... Medicago ..T ... ... ... ..G .AA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..A ..A ... ... ... Soybean ..T ... ..G ... ..C .A. ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ..T A.. ... ... ..G ... ..A ..A ... ... ... Lotus ..G G.. ... A.G ..C .A. ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ..A ..A ... T.. ... Oenothera .GG ..A ..G ... ..C .A. ... ... .C. ... ..A ... ... ..G ... ... A.. ... ... ..G ... ..C ..T ... ... ... Ranunculus .GT .GC ..G ... ..C .A. ... ... .C. ..C ... ... ... T.. ... ... A.. ... ... ..G ..G ... ..A ... ... ... Calycanthus .GT ..A ... ... ..C .A. ... ... GTC ... ... ..G ... ... ... ..T A.. ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... Drimys .GT .GA ... ... ..C .A. ... ... G.. ... ... ..G ... ... ... ... ... A.. ... ..G ... ..A ..A ... ... ... Piper ..T ..A ... ..G ..C .A. ... ... GT. ... ... ..C ... ..T ... ..T A.G ... ... ..G ... ..A ... ... ... G.. Liriodendron .GT .GA ... ... ..C .A. ... ... GC. ... ... ..G ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... ..A ..A ... ... ... Populus .GG ..A ..G ... ..C .A. ... ... .T. ..C ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... G.. ..A ..A ... ... ... Nuphar .GG ..A ..G ... ..C .A. ... ... GT. ... ... ..G ... T.. ... ... A.. ... ... ..G G.. ..A ..A ... ... ... Nymphaea .GT ..A ..A ... ..C .A. ... ... GT. ... ... ..G ... T.. ... ... A.. ... ... ..G G.. ..A ..A ... ... ... Amborella .GT .GA ... ..G ..C .A. ... ... .C. ... ... ..G ... T.. ... ..T A.. ... ... ..G ... ..A ..A ... ... ... Ginkgo GCT CGA ... ... ..C .A. ... ... GCG ... ... ..T ... G.. ... ... AA. A.. ... ... ... ..A T.A ... ... G.. Pinus GCT CGA ..C ... ..C .AA ... ... GC. ... ... ..T G.. T.. ... ..G AA. A.G ... ... ..C ..A T.A ... ... ... Acorus .GT ..A ... ... ..T .A. ... ... GC. ... ... ... ... T.. ..G ..A A.. ... ... ..G ... ... .C. ... ... ..T Typha .GT ..A ... ... ..T .AA C.. ... GT. ... ..A ... ... T.. ... ... A.. ..G ... ..G ... ..A ..A ... ... G.. Phalaenopsis .GT ..A ... ..G ..T .A. ... ... GC. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... ..A ..A ..A ... ... Yucca .GT .GA ... C.G ..T .A. ... ... GC. ... ... ..G ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... ..A ..A ... ... C.G Saccharum .GT ..A ... ..G ..T .C. .A. G.. TTG G.. ..A ..G ..G ... ... ... A.. ... ... ..G .T. ..A ..C ... ... G.. Zea .GT ..A ... ... ..T .C. .A. G.. TTG G.. ..A ..G ..G ... ... ... A.. ... ... ..G .T. ..A ..C ... ... G.. Oryza .GT .GA ... ..G ..T .C. .A. G.. TTG G.. ..A ..G ..G G.. ... ... A.. ... ... ..G .T. ..A ..C ... ... G.T Triticum .GT ..A ... ..G ..T .C. .A. G.T TTG G.. ..A ..G ..G ..C ... ... A.. ... ... ..G .T. ..A A.C ... ... G.. agrostis .GT ..A ... ..G ..T .C. .A. G.. TT. G.. ..A ... ..G ... ... ..T A.. ... ... ..G .T. ..A A.C ... ... G.. Sorghum .GT ..A ... ..G ..T .C. .A. G.. TTG G.. ..A ..G ..G ... ... ... A.. ... ... ..G .T. ..A ..C ... ... G.. Barley .GT ..A ... ..G ..T .C. .A. G.T TTG G.. ..A ..G ..G ..C ... ... A.. ... ... ..G .T. ..A A.C ... ... G.. Nicotiana AAT CCG ATT TCA --- --- --- --- --- --- ATG AAA AAC GTA ACC GAT TCT TTC GTT TCT TTG GGC CAC TGG CCA TCT Grape ... GT. .C. ..G --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ..C Tomato ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... G.A ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ..G Eucalyptus ... G.A ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ..G Panax ... G.. ... ..G GAA CTA GTC GGT GTG CCC ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C Atropa ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... A.. ... ..T TCG --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... .TC ... ..T ... ... ... ..C Arabidopsis ... A.. ... --- --- --- --- --- --- --- ... ... ..T T.. ... ... ... ... ... .AC ... ..T ... ... ... ..C Cotton ..C G.. ... ..G --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ..C Citrus ... G.. ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... .TT A.. ... ... .TC Medicago ... AG. ..C ..G --- --- --- --- --- --- ... ... ..T A.. ... ... ... ..T C.. .GC ..C ATT T.. ... ... ..C Soybean ... GT. ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ..T A.. ... ... ... ... C.. .G. ... ... T.. ... ... ..C Lotus ... AT. ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ..T A.. ... ... C.. ... CC. .GC ... ..T T.. ... ... ... Oenothera ... GT. ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... .TT ... ... ... ..C Ranunculus ... G.A ... --- --- --- --- --- --- --- ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ..C Calycanthus ... GTT ... --- --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... .TC Drimys ... GTT ... ..G TAC --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... T.. ..C Piper ... A.. ... ..G --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..A ..T ... ... ... .AC Liriodendron ... GTT ... ..G --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T T.. ... ... ..C Populus ... GT. ... ..G --- --- --- --- --- --- ... ... ..T A.. ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... T.. ..C Nuphar ... G.T ... ..G TAC --- --- --- --- --- ... ... ..T C.. ... ... ... ... ... .T. ... ..T ... ... ... ..C Nymphaea ... G.T ... ..G TAC --- --- --- --- --- ... ... ..T C.. ... ... ... ... ... .T. ... ..T ... ... ... ..C Amborella ... G.T ... ..G TCC --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Ginkgo .G. G.T .C. ..G ACT TCC GTC TCT AAT --- ... G.. ..T .G. .TT ... ... .CT A.C .TC ... A.T T.T ... ..T ... Pinus ... G.T .GC C.C CCC --- GTC TCT AAT --- ... ... ..T ... .TT ... C.. ... A.. ..C ... A.T T.T ... ..T ..C Acorus ... GTT ... ..C --- --- --- --- --- --- ... ... ..T A.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... .TC Typha ... GTT ... ..C --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... .TC ... ... ... ... ... ..C Phalaenopsis ..A GTA ... ..C TCT --- --- --- --- --- ... ... ..T A.. ... ... ... ..T ... ..C G.. ..G ... ... ... ..C Yucca ... GTT ... ..G --- --- --- --- --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ..T ... ... ..C Saccharum ... TG. ... C.C CCA TCC AAT --- --- --- ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... .T. ..A .CT ... ... ... .TC Zea ... TG. ... C.C CCA TCC AAT --- --- --- ... ... ..T ... ... C.. ... ..T ... .T. ..A .CT ... ... ... .TC Oryza ... TG. ... C.C CCA TCT AAT --- --- --- ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... .T. ..A .CT ... ... ... ..C Triticum ... TG. ... C.C CCA TCC AAT --- --- --- ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... .T. ..A .CT ... ... ... ..C agrostis ... TG. ... C.C CCC TCC AAT --- --- --- ... G.. ..T ... ... C.. ... ... ... .T. ..A .CT ... ... ... ..C Sorghum ... TG. ... C.C CCA TCC AAT --- --- --- ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... .T. ..A .CT ... ... ... .TC Barley ... TG. ... C.C CCA --- --- TCC AAT --- ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... .T. ..A .CT ... ... ... ..C Nicotiana GCC GGG AGT TTC GGG --- TTT AAT ACC GAT ATT TTA GCA ACA AAT CCA ATA AAT CTA AGT GTA GTG CTT GGT GTA TTG Grape ... ... G.. ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Atropa ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.C ... ... ... Cotton ... ... ... ... ... --- G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ..A ... ... ... --- ... G.. ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A Soybean ... ..A ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... T.A ... ... ... Lotus ... ..A ... ... ..A --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... A.A ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Calycanthus ..T ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys ... ... ... ... ... --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... Populus ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Nuphar ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Amborella ... ..A ... ... ..A --- ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... Ginkgo ..T ..A G.. ... ..T --- ... ... ... A.. ... ... .G. ... ... .T. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... C.. Pinus ..T ... G.. ... ..A --- .CA ... ... A.. ... ... .A. ... ... AT. ... ... TC. ... ..G ... ... A.. ... C.. Acorus ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Typha ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... Phalaenopsis ..T ... ... ... .A. --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... Yucca ... ... ... ..T ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ..T ... ... ... ... --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... .C. ... ... G.. ... ... ... Zea ..T ... ... ... ... --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... .C. ... ... G.. ... ... ... Oryza ..T ... ... ... ... --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... .C. ... ... G.. ... ... ... Triticum ..T ..C ... ... ... --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... .C. ... ... G.. ... ..T ... agrostis ..T ..C ... ... ... --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... .C. ... ... G.. ... ..T ... Sorghum ..T ... ... ... ... --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... .C. ... ... G.. ... ... ... Barley ..T ..C ... ... ... --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... .C. ... ... G.. ... ..T ... Nicotiana ATT TTT TTT GGA AAG GGA GTG --- --- --- --- --- TTA AGT GAT TTA TTA GAT AAT CGA AAA CAG AGG ATC TTG AAT Grape ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... .A. ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ..A ..A ... Cotton ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... Citrus ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .T. ... ..T ... ... Medicago ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- .GT GCG AG. .GT ... TT. C.A A.. .CT A.A T.C .AA GA. ... Soybean G.. ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .AA ... ... .GA Lotus ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .GA Oenothera ..C .G. ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .G. Calycanthus ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. .G. Drimys ..C ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. Piper ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .GC Liriodendron ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. .G. Populus ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... Nuphar ..C ... ..C ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... .G. Nymphaea ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..T ... .G. Amborella ... ... ..C ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .G. Ginkgo ..C .A. ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..C ..C ..G ... .AA ..A ... ... Pinus ..C .A. ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... A.. C.. ... ... ..C ..T ... ... .AA ..A ... G.G Acorus ..C ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... .G. Typha ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... .AA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. Phalaenopsis ... ..C ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... .A. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... .G. Yucca ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... GG. Saccharum ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... .AA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .G. Zea ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... .AA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A .G. Oryza ... .A. ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... .AA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. Triticum ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- ... .AA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. agrostis ... ... ... ..G ... ... ... TGT GCG AGT TGT CTA ... .AA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. Sorghum ... ... ... ... ... ... ... TGT GCG AGT TGT CTA ... .AA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .G. Barley ... ... ... ... ... ... ... TGT GCG AGT TGT CTA ... .AA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. Nicotiana ACT ATT CGA AAT TCA GAA GAA CTG CGT GGA GGG GCT ATT GAA CAA CTC GAA AAA GCT CGT TCT CGC TTA CGG AAA GTC Grape ... ... ... ... ... ... ... ..A ... .AG ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ..G G.C ... ... ... ... ..G Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..A Cucumis ... ... ... ... ... ... ... T.A ..C ..C ... ..C ... ... ..G ..G ... ... ..C ..G G.C ..T ... ... ... ..G Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... T.A ..C ..C ... ..C ... ... ..G ..G ... ... ..C ..G G.C ..T ... ... ... ..G Panax ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .A. ... ..C ... ... ..G ..G ... ... ..C ..G G.G ... ... ..A ... ..G Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..A Spinacia ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... AA. ..C ... ... ..G ..G ... ... ..C ..G G.. ... ... AA. ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..A ... ... C.. ... T.A ... ..T ..C ..G G.G ... ..G ..T ..C ..A Cotton ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ..G ... ... ... ... .GG ..G ... ..G ..C ..G G.C ... ... ... ... ..A Citrus .G. ... ... ... ... ... ... ... .AG A.. ... ..C ... ... .GG ..G ... ... ..C ..G G.C ..G ... ..A ... A.A Medicago CTA C.. TC. TTA AGT ..T TT. T.A GA. AAT C.A AAA CAG AG. ATC T.G AG. .CT AT. ..A AA. TCA GA. GAA CT. CGG Soybean ... ... ... ..C ... ... ... T.A ..G .A. ... ..C ... ... ..G ..G ... ... ..C .AA G.C ... ... A.. ... ... Lotus ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G .A. ... ..G ... ... ..G ..G ... ... ..C .AG G.C ... ... AA. ... ..A Oenothera ... ... ..T ... ... ... ... T.A ..C .AG ... ..C ..C ... ..G ..G ... ... ..C ..G G.C ..T ... .A. G.C ..G Ranunculus ... ... ... ... ..C ... ..G ... ..C ... ... ..C ... ... A.G ..G ... ... ..C AAG G.C ... ... ..A ... ..A Calycanthus ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... .AG .TA ..C ... ..G ..G ... ... ... ..C ..G G.. ... ... ... ... ..G Drimys ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... A.A ..C ... ..G ..G ... ... ... ..C ..G G.. ... ... ... ... A.A Piper ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... .CA ..C ... ... ..G ... ... ... ..C ..A A.. ... ..G ... ... ..A Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ..A ... .A. ..A ... ... ..G ..G ... ... ... ..C ..G G.. ... ... ... ... ..G Populus ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... ..A ..C ... ... ..G T.G ... ... ..C ..G G.C ... ... ... ... ..G Nuphar ... ... ..C ... ... ... ... ..A TC. ... ..A ..C G.. ..G ..G ..T ... ... ..A ..G G.. ... ... ... ... ..G Nymphaea ... ... ..C ... ... ... ... ..A T.C ... ..A ..C G.. ..G ..G ..T ... ... ..A ..G G.. ... ... ... ... ..G Amborella ..G ... ..C ... ... ... ... ..A ... ..G ..A ..C ... ..G ..G ..T ... ... ..C ..G G.. ... ... ... ... ..G Ginkgo ... ... ..C ... ..G ... ... ..A T.. AA. ..A ... .CC ..T ..G ... ... ... ... A.G A.. ... ... ..C G.. ..A Pinus ... ... ..G ... ..G ... ... ..A T.. AA. ..A ... ..C ..T ..G ... ..G ... ... ..G G.. T.. ... A.. ..C ..G Acorus ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ..A ..C C.. ..G ..G ... ... ... ..C ..G G.. ... ... ... ... ..A Typha ... ... ..C ... ..G ... ... T.A ... AA. ... ..C ... ..G ... ... ... ... ..C ..G GT. ... ... ... ... ..G Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... ... T.A ... A.. ..A ..C ... ... ..G ... ... .G. ... ..G GT. A.A ... ..C ... ..A Yucca ... ... ... ... ..G ... ... T.A ... A.. ... ..C ... ..G ..G ... ... CG. ..C ..G G.. ..T ... A.. ... ..G Saccharum ... ... ... ... ..G ... ... T.. ... A.. ... A.C C.. ... ... ... ... ... ... ... AT. ..A ... .A. ... ... Zea ... ... ... ... ..G ... ... T.. ... AA. ... A.C C.. ... ... ... ... ... ... ... AT. ..A ... .A. ... ... Oryza ... ... ... ... ..G ... ... T.. ... A.. ..A A.C ... ..G ..G ... ... ... ... ..A AT. ..A ... .A. ... ... Triticum ... ... ... ... ... ... ... T.. ... A.. ... A.C ... ..G ... ... ... ... ... ..G AT. ..A ... .A. ... ... agrostis ... ... ... ... ..G ... ... T.. ... A.. ... A.C ... ..G ... ... ... ... ... ..G AT. ..A ... .A. ... ..T Sorghum ... ... ... ... ..G ... ... T.. ... A.. ... A.C C.. ... ... ... ... ... ... ... AT. ..A ... .A. ... ... Barley ... ... ... ... ... ... ... T.. ... A.. ... A.C ... ..G ... ... ... ... ... ..G AT. ..A ... .A. ... ... Nicotiana GAA AGC GAA GCC GAG CAG TTT CGA GTG AAT GGA TAC TCT GAA ATA GAA CGA GAA AAA TTG AAT TTG ATT AAT TCA ACT Grape ... .TG ... ..A ..T ... .A. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... .TG ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... .A. ... ..G ... ... C.. ... ... ... ... Eucalyptus ... .TG ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... .A. ... ..G ... ... C.. ... ... ... ... Panax ... .TG ... ..A ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ..G .G. ... ..T ... ... ... ... Atropa ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... .TG ..C ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G A.. ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... .CG ... ..G ..T A.. ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cotton ... .TG ..G ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... .TA ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Medicago ... GCA .CC .TT ..A ... C.G GAG AAA GCC C.G GC. CGC TT. .GG A.. GT. ... .CG GAA GCG GAT CGG TT. CG. GTG Soybean ... .CG ... ..A ..T .GT ... ..G ... ... ..C ..T ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... .T. Lotus ... .CA ... ..A ..T .G. ... A.. ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... .T. Oenothera C.. .T. ... ..G ..A GG. .A. ... .C. T.C ..G ... .T. .GG ... ..C GAG C.. .GG CAC G.G .C. ... ... ... ... Ranunculus A.. GCG ... ..G ..T G.. ... ... AC. ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... .GT ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ..A ... ..A ..T G.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... G.C ... Drimys .G. .TG ... ..A ..T G.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... GA. ... ... ... ... G.T ... Piper ... .T. ..G ..A ..T G.. ... ... ... ..C ..G ... ... ..G ... ... ..C ... ... .CA ... ... ... ... G.C G.. Liriodendron ... .TG ... ..G ..T G.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... CA. ... ... ... ... G.C ... Populus ... .TA ... ..G ..T ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ..G ... ..G ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... .A. ... ..G G.. ... ... ... ... G.C G.. Nymphaea ... ..G ... ..G ..A G.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... .A. ... ..G A.. ... ... ... ... G.C G.. Amborella ... .TT ... ..A ..T G.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... AGT ... ... ... ... G.T G.. Ginkgo ... ..A AG. ..G .GC G.. A.C ... ..C ... ... ... ..C C.. ... ... ... ... ... GA. G.. C.. ..C ... G.T G.. Pinus ... .TG AT. ..G ..C G.A A.C .AG ..A ... ... A.. ..C C.. ... ... ... ..G ... GA. G.. C.C C.C ... A.T G.. Acorus ... .TG ... ..A ..T G.. .A. ... ... ..C ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..G A.. ... ... ... ... G.C ... Typha ... CTA ... ..A ..T G.. .A. ... AC. ... ..G ..T ... ..G ... ... ... ... ... GAA ... ... ... ... G.C ... Phalaenopsis ... .T. ... ..A ..T G.. .A. ... AC. ... ... ... .A. ..G ... ... ... ... ... GGA ... ... ... ... G.T ... Yucca ... .TG ... ..A ..T G.. .A. ... A.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... GCC ... ... ... ... G.T ... Saccharum ... CTA ... ..A ..T G.. .A. ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... GAA ... ... ... ... G.T ... Zea ... CTG ... ..A ..T G.. .A. ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... GAA ... ... ... ... G.T ... Oryza ... CTA ... ..G ..T G.. .A. ... A.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... GCA ... ... ... ... G.C ... Triticum ... CTA ... ..G ..T G.. .A. ... A.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... GCA ... ... ... ... G.T ... agrostis ... CTA ... ..G ..T G.. .A. ... A.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... GCA ... ... ... ... G.T ... Sorghum ... CTA ... ..A ..T G.. .A. ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... GAA ... ... ... ... G.T ... Barley ... CTA ... ..G ..T G.. .A. ... A.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... GCA ... ... ... ... G.T ... Nicotiana TAT AAG ACT TTG GAA CAA TTA GAA AAT TAC AAA AAC GAA ACG ATT CAG TTT GAA CAG CAA AGG GCG ATT AAT CAA GTC Grape ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ..T ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... Tomato ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... Cucumis ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Panax .C. ... ... ... ..C ... C.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ..A ... ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..A ... .AA ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ..A ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... .TT ... ..G ..A ... ..A A.A ... ... ... ... Cotton ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... T.T ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ..T ... ... ..A ... ..A ..A ... ... ... ... Medicago A.. GGT TA. .CC ..G AT. GA. CG. G.A A.A TTG ..T TT. .TT .A. TCA A.. T.T ACA ACT TT. .AA CAA TTC G.. AAT Soybean ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.C ... ..T ... ... ..A ... ..A .T. ... ... ... ... Lotus ... .CA ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ..C ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... .GC ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... C.. .A. ... ... .G. ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ..T Calycanthus ... G.. .A. ... ... .G. ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ..T ... ... ..A ... ..A ..A ... ... ..G ... Drimys ... ..T .A. ... ... .G. ... ... ... .T. ... ..T ... ..C ... .GT ... ... G.A ... C.A ..A ... ... ..G ..A Piper .C. G.. .A. ... ... .G. ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... .GT ... ... ..A ... .AA ..A ... ... ..G ... Liriodendron ... G.. .A. ... ... .G. ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ..T ... ... G.A ... ..A ..A ... ... ..G ... Populus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ..T Nuphar ... C.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ..C ... ..A ... ..A ... ... ... ..G ... Nymphaea ... C.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ..C ... ..A ... ..A ... ... ... ..G ... Amborella ... G.A .A. ..A ... .G. ... ... ... ... ... ..T ... .GC ... ..T ... ... ..A ... ..A ... ..G ... ..G ... Ginkgo ... G.A .A. ... ... .G. ... ..G G.. CCT ... ..T ..G ..C G.. ..C ... ... ..A ... ..A ..A ... G.C ..G ... Pinus .C. G.T .A. ... ... ... ... ..G G.. CC. ..G ..T ..G ... ... T.C .CC ... ... ... ..A ..A T.. G.C ..G A.. Acorus ... G.A .A. ... ... .G. ... ... ... ... ... ..T ... ..C C.. ..T ... ... ..A ... ..A ..A ... ... ..G ... Typha .G. G.T .G. ... ... .G. ... ... ... ... ... ..T ... ..C C.. G.T ... ... A.A ... ..A ..A ..G ... ..G ... Phalaenopsis .GC ..T .G. ... ... .G. ... ... ... ... ... ..T ... ..T C.. TTT ... ... A.A ... ..A ..A ... ... A.G ... Yucca .C. G.T .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C C.. ..T ... ... ..A ... ..A ... ... ... ..G ... Saccharum .C. .TT .G. ... ... ... ... ... ..G .CT ... ... ... ..C C.. T.T ... ... A.A ... ... ... ..G ... ..G ... Zea .C. .TT .G. ... ... ... ... ... ..G .CT ... ... ... ..C C.. T.T ... ... A.A ... ... ... ..G ... ..G ... Oryza .C. .TT .G. ... ... ... ... ... ..G .CT ... ... ... ..C C.. T.T ... ... A.A ... ... ... ..G ... ..G ... Triticum .C. .TT .G. ... ... ... ..G ... ..G .CT ... ... ... ..C C.. T.T ... ... A.A ... ... ..A ..G ... ..G ... agrostis .C. .TT .G. ... ... ... ... ... ..G .CT ... ..T ... ..C C.. T.T ... ... A.A ... ... ..A ..G ... ..G ... Sorghum .C. .TT .G. ... ... ... ... ... ..G .CT ... ... ... ..C C.. TTT .A. ... A.A ... ... ... ..G ... ..G ... Barley .C. .TT .G. ... ... ... ... ... ..G .CT ... ... ... ..C C.. T.T ... ... A.A ... ... ..A ..G ... ..G ... Nicotiana CGA CAA CGG GTT TTC CAA CAA GCC TTA CGA GGA GCT CTA GGA ACT CTG AAT AGT TGT TTG --- --- AAC AAC GAG TTA Grape ... ... ... ... ..G ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... A.C ... ... ... ... --- --- ... ..G ..A ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..G ... ... ... ... ... .G. G.. ... ... --- --- ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... Spinacia ... ..G ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ..T ... ... Arabidopsis ..C G.. ... ... ... ... ... ..T ... .A. ... ... A.. ... ..C ..A ... ... ... ... --- --- .GT ..T ... ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ..T ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ..A --- --- ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... ... ..T ... .A. ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ..G ... ... Medicago TAC A.. AAC .AA ACG ATT ..T TTT GA. .A. CA. AGG GCG ATT .A. .AA GTG CAA CAG AC. --- --- GTT TTA C.A CA. Soybean ... ... ... ... ..A ... ... ... ... .AG ... ... ... ... ... ..A ..G ... ..C ... --- --- ... ... ... ... Lotus ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A --- --- ..T ..T ... ... Oenothera ... ..G .A. A.. ... ... ... ... ... .A. ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... Ranunculus A.. ... ..C A.. ..T ... ... ..T C.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... Calycanthus ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... C.. .C. --- --- ... .G. ... ... Drimys ... ... ..A ..G ... ..G ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... .GT ... ... Piper ... ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ..C T.. ... ... ... ... --- --- ... ..A ... ... Liriodendron ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... .AG ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. --- --- ... .G. ... ... Populus ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ..G ... T.. ... ... ... ... --- --- .C. ... ... ... Nuphar .A. ... ..A ... ... ..G ... ... ... .A. ..G ... ... ... ... ... ... .A. ... ... --- --- ... GG. ... ... Nymphaea .A. ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ..G ... ... ... ... ... ... .A. ... ... --- --- ... GG. ... ... Amborella ... ..G ..A ... ... ... ... ... ..G .A. ... ... ... .A. ... ... ... ... .A. ... --- --- ... .G. ... ... Ginkgo ... ... .A. ... .CT .GT ... ..T ..G ... A.. ... ... ... ... ... ... ... C.. ... --- --- ..T .G. ... ... Pinus ... ... .AA ... .CT .GC ... ..T ... ... A.. ... A.. ... ... T.. ... ... C.. ... --- --- ..T .CT ... ... Acorus ..G ... ..A ... ... ... ... ..G ... .A. ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... --- --- ..T .GT ..A ... Typha ... ... ..A ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... AAT ATG ..T .C. ... ... Phalaenopsis ... ... GAA ... ..G ... ... ... ... .A. C.. ... ... ... ... T.. ... ... ... ... --- --- ..T .T. ..A G.. Yucca ... ... .AA ... ... ... ... ... ... .AG ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..T .G. ... ... Saccharum ... ... ... ... ... ... ... ..T G.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..T .C. ... ... Zea ... ... .A. .G. ... ... ... ..T G.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..T .C. ... ... Oryza ... ... ... ... ... ... ... ... G.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..T .C. ... ... Triticum ... ..G ... ... ... ... ..G ... G.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..T .C. ... ... agrostis ... ... ... ... ... ... ..G ... G.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..T .C. ... ... Sorghum ... ... ... ... ... ... ... ..T G.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..T .C. ... ... Barley ... ..G ... ... ... ... ..G ... G.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..T .C. ... ... Nicotiana CAT TTA CGT ACC ATT AGG TCC AAT ATT GGC ATG TTG GGA ACA ATG AAA GAA ATA ACT GAT --- ATG AAT CCA CTG ATT Grape ... ... ... ..T ..C ..T G.T ... ... ... ... ..T ..G T.G ... ... ... ... .GA A.. AAC ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ..T G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ..T ..C ..T G.T ... ... ... ... ..T ..G G.G ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ..T ..C ..T G.T ... ... ... ... ..T ..G G.G ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ..C ..T G.. ... ... ... ..C ... ..G G.G ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ..T G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... G.. Potato ... ... ... ... ... ..T G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ..G ... ..C .AT G.T ... ... ... ... ..T ..T G.G ... ..C ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ..T ... .AT G.A ... ... ..G ... ..T ..T ..G ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... G.. Cotton ... ... ..C ... ... ..C G.T ... ... ... T.. ..T ..G GTG ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ..T G.. ... ... ... ... ..T ... G.G ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Medicago GCA ... .AA GGA GC. CT. GGA .C. C.G AAT .GT .GC TT. .AC .AT G.G TT. CAT TTA CG. ACG ... G.. ... ... ... Soybean ... ... ... ..T G.C ..T G.T ... ... ... ... ..T ..G ..G ... ... ... .A. .TA AC. GAT ... ... ... A.T ... Lotus ... ..C ... ... ..C GCC G.T ... ... ..T ... ..T ..G G.G ... ... ... .A. .A. A.. --- ... ... ... A.A ... Oenothera ... ... ..G ... ..C ..T G.T ... ... ... C.. ..T ..G T.G ... ... ... C.C ... ... --- ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ..C ... ..C ..C G.G ... ... ..T ... ..T ..G G.G ... ... ... ... ..G --- --- ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ..C ..T ..C ..C G.T ... ... ... ... C.C ..G G.C ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Drimys ... ... ..C ... ..C ..T G.T ... ... ... ... C.C ..G ..C ..C ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Piper ... C.. ..A G.T ..C ..T ..T ... ... A.. ..T C.C ..T G.C ... ... ... ... .TG ... --- ... ... ... T.. ... Liriodendron ... ... ..C ... ..C ..T G.T ... ... ... G.. C.C ..G G.C ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Populus ... ... ... ..T ... ..T G.. ... ... ... ... ..T ..G G.. ... ... ... ... ... A.. --- ... ... ... T.. ... Nuphar ... ... ..C ... ..C G.T G.T ... ... ... ..A C.C ..G G.C ... ... ... ... ..C ... --- ... ... ..C ..A ... Nymphaea ... ... ..C ... ..C G.T G.T ... ... ... ..A C.T ..G G.C ... ... ... ... ..C ... --- ... ... ..C ..A ... Amborella ... ... ..C ... ..C ..T G.T ... ... ... ... C.C ..G ..C ... ... A.T ... ... ... --- ... ... ..C ... ... Ginkgo ..C C.. ... ..G ..C .AT CAT .G. ..C ... T.. C.C A.. G.C ... .G. A.C .C. ... ... --- ... ... ..C T.. ... Pinus ... ... ... ..G ..C GAT CA. ... ... ... C.. C.T A.. ..C ... .TG A.C .C. .A. ... --- ... G.. ..C T.A ... Acorus ... ..C ... ... ..C ..T G.T ... ... ... ... C.T ..G G.C ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Typha ... ..C ... ..T ..C C.T G.G ... ... ... ..T C.C ..G G.G ... G.. ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ..T ... ..T ..C ..T G.T ... ... .AT ..T C.C ..G T.C ... G.. ... ... ... ... --- ... ... ... ..T ... Yucca ... ..C ... ... ..C .AT G.T ... ... ..A ..C C.C ..G G.C ... G.. ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... Saccharum ... ..C ... ..G ... C.T G.T ... ... ... ..T C.C ..G G.C ..A G.. TGG .AG .GA --- --- ... ... ... ..A ... Zea ... ..C ... ..G ... C.T G.T ... ... ... ..T C.C ..G G.C ..A G.. TGG .AG .GA --- --- ... ... ... ..A ... Oryza ... ..C ... ..G ... C.T G.T ... ... A.. ..T C.C ..G G.C ... G.. --- --- --- --- --- ... ... ... ..A ... Triticum ... ..C ... ..G ... C.T G.T ... ... ... ..T C.C ..G T.C C.. G.. TGG .AG .GA --- --- ... ... ... ..A ... agrostis ... ..C ... ..G ... C.T G.T ... ... ... ..T C.C ..G T.C ... G.. TGG .AG .GA --- --- ... ... ... ..A ... Sorghum ... ..C ... ..G ... C.T G.T ... ... ... ..T C.C ..G G.C ..A G.. TGG .AG .GA --- --- ... ... ... ..A ... Barley ... ..C ... ..G ... C.T G.T ... ... ... ..T C.C ..G T.C C.. G.. TGG .AG .GA --- --- ... ... ... ..A ... Nicotiana TCT GCC GCT TCC GTT ATT GCT GCT GGA TTG GCC GTA GGG CTT GCT TCT ATT GGA CCC GGA GTT GGT CAA GGG ACT GCT Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ..T ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Atropa .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... Potato G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... Spinacia G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Arabidopsis ... ..T ... ..G ... ... ... ... ..G ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ..T ..A ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Medicago ... ..T ... ..T ... ..C ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ..A ... Soybean ... ..T ... ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..C ... ... Lotus ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..C ... ... Oenothera ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... A.. ... ... ..T ... ... Ranunculus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... ..T ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ..G ... ... ... ..T ... ... Piper ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... A.C ... ... ..T ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Populus ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..T ... ... Nuphar ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Nymphaea ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Amborella ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Ginkgo ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ..C ... ... ..C ... ..T ..T ... ... ... ..C ... ... Pinus ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A T.T ... ... ... ... ..C ... ... ..T ..C ... ..C ..G ..C ... ... Acorus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..T ... ... Typha ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Phalaenopsis ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... ..T ..G ... ... ... ..T ... ... Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Saccharum G.. ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... Zea G.. ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... Oryza G.. ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... ..T ... ... Triticum G.. ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... agrostis G.. ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... ..T ... ... Sorghum G.. ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... Barley G.. ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... ... Nicotiana GCG GGT CAA GCT GTA GAG GGT ATC GCG AGA CAG CCT GAG GCA GAG GGA AAA ATA CGA GGT ACG CTA TTG CTT AGT CTA Grape ... ..C ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ..C ... ... ... ..A ... ..T ..A ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Eucalyptus ... ..C ... ... ... ..A ... ..T ..A ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Panax ... ..C ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ..A ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..C ..A ... ..A ... ... ... ... ... ..T T.. ..A ... ... T.. Arabidopsis ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... T.G Cotton ... ..C ... ... ... ..A ... ... ... ... ..A ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... T.G Citrus ... ..C ..G ..A ... ..A ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Medicago ..A ..G ... ... ... ..A ..G ..T ... C.. ..A ..G ..A ... ... .AC ... ... A.G ... ..T T.. ..A ... ... ..G Soybean ..A ..G ... ... ... ..A ..G ..T ..A C.. ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... T.G Lotus ..A ... ... ... ... ..A ..A ..T ... C.. ..A ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ..A ... ... ..G Oenothera ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Ranunculus ... ..A ... ..C ... ..A ... ..T ... ... ..A ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Calycanthus ..A ..C ... ..C ... ..A ... ... ..A ... ..A ..A ..A ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ..C ... ..G Drimys ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ..A ..A ..A ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Piper ..A ..C ..G ... ... ..A ... ... ... ... ..A ..A ..A ... ..A ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Liriodendron ... ..C ... ..C ... ..A ... ... ... ... ..A ..A ..A ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Populus ... ..C ... ... ... ..A ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Nuphar ... ..C ... ..C ... ..A ... ... ..T ... ..A ..A ..A ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Nymphaea ... ..C ... ..C ... ..A ... ..T ..T ... ..A ..A ..A ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Amborella ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ..A ..A ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ..C ..G Ginkgo ... ..C ... ... ... ..A ... ..T ..A ... ..A ..A ..A ... ... ..T ... ... ... ... ..C T.. C.. ..A ... ... Pinus ... ..C ... ... ... ..A ... ..T ... ... ..A ..A ..A ... ..A ..T ... ... ... ... ..C T.. C.. ..A ... T.. Acorus ..A ..C ... ..C ... ..A ... ..T ... ... ..A ..A ..A ... ..A ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Typha ..A ..C ... ... ... ..A ... ..T ... ... ..A ..A ..A ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ..G ... ... Phalaenopsis ... ..C ... ..C ... ..A ... ..T ... ... ..A ..A ..A ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ..G Yucca ..A ..C ... ..C ... ..A ... ..T ... ... ..A ..A ..A ... ..A ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ... Saccharum ..A ..A ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..A ..A ... ..A ..T ... ... A.. ... ..T T.. ... ... ... ... Zea ..A ..A ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..A ..A ... ..A ..T ... ... A.. ... ..T T.. ... ... ... ... Oryza ..A ..A ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..A ..A ... ..A ..T ... ... ..C ... ..T T.. ... ... ... ... Triticum ..A ..A ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..A ..A ... ..A ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ... agrostis ..A ..A ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..A ..A ... ..A ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ... Sorghum ..A ..A ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..A ..A ... ..A ..T ... ... A.. ... ..T T.. ... ... ... ... Barley ..A ..A ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..A ..A ... ..A ..T ... ... ... ... ..T T.. ... ... ... ... Nicotiana GCT TTT ATG GAA GCT TTA ACA ATT TAT GGA CTG GTT GTA GCA TTA GCA CTT TTA TTT GCG AAT CCT TTT GTT ATG AAT Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... T.. ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... T.. ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Spinacia ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Soybean ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Lotus ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... T.. ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... G.. Ranunculus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ..G ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... ... ..C ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ..G ... ... Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ..G ... ... Amborella ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ..C ... ... ... .G. Ginkgo ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..A ... ... ..G C.. ... ... ... ... ..A ... ..C ..C ... ... G.. Pinus ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..A ... ..G ..C C.. ..G ... C.. ... ... ... ..C ... ... ... G.. Acorus ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Typha ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... C.. ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Zea ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... C.. ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Oryza ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... C.G ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Triticum ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... C.. ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... agrostis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... C.. ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Sorghum ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... C.. ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Barley ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... C.. ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Nicotiana GTT CTA TCA TGT TCC ATC AAT ACT CTA --- AAG --- --- GGG TTA TAC GAT ATA TCC GGT GTG GAA GTA GGC CAA CAT Grape ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... --- ..A --- --- ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... T.. ... ... ... .C. ..C ..A ... --- ..A --- --- ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... T.. ... ... ... .C. ..C ..A ... --- ..A --- --- ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ..C ... ... ... ..C ..A ... --- ..A --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ..T ... ... ... ... --- ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... .A. ..A ... ..C C.G ... --- ... --- --- ... ... ..T .C. ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... Arabidopsis ... T.. ... ... ... ... ..C ..A ... --- .TA AAA GAA ... ... ..T ..G ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... Cotton .G. A.. ... --- --- --- ..C G.A ... --- ..C --- --- ... ... ... ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ..G ... ..A ... --- .G. --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... .T. ... .A. ... ..C ..A T.. --- --- --- --- --- A.C ..T ... ... ..T .C. ..C ... ... ..T ... ... Soybean ... T.. .T. ..C ..T ... ..C ..A T.. --- ..A --- --- A.A ... ..T ... ... ..T .C. ... ... ... ..T ... ... Lotus ... ... CT. ... ... ... ..C ..A T.C --- ..A --- --- A.A ... ... ... ..T ..T .CC ... ... ... ..T ... ... Oenothera ... ... ... ... ... .A. ..C ..A ... --- ..A --- --- ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ..T ... ... ... Ranunculus ... ... C.. ... ... G.. ..C ..A ... --- ..A --- --- ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... C.C ... ..T ... ..C ..A ... --- ..A --- --- ... ... ... ... ... ... .AA ... ... ... ..T ... ... Drimys ... ... C.. ... ... ..T ..C ..A ..C --- ..A --- --- ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ... ... C.. ... ... ... ..C ..A ... --- ... --- --- ... C.G ... ... ... ..T ... ... ... ..G ..T ... ..C Liriodendron ... ... C.. ... ... ... ..C ..A ... --- ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... .A. ... ..T ..C ..A T.. --- ..A --- --- ... ... ..T ..A ... ..T ... ... ... ... ... ..G ... Nuphar ... ... C.. ... ... ... ..C ..A ... --- ... --- --- ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ... C.. ... ... ... ..C ..A ... --- ... --- --- ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Amborella ... ... C.. ... ... ... ..C ..A ... --- ..A --- --- ... A.. ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo A.. G.. CA. .C. C.T ..T .GC ..A ... --- ..T --- --- CAT ..C ... ..G .A. ..T ..C ... ... ..G ..T ... ... Pinus A.C G.. CG. .C. C.T ..T .GC ..A ..G --- ..T --- --- CAT A.C ..T ..G ... ... ... ... ..G ..G ..T ... ... Acorus ... A.. CT. ... ... .G. ..C .TG ..C --- ..A --- --- ... ... ..T ... ... ..T ... ..A ... ..G ... ... ... Typha ... A.. C.. ... ... ..T ..A ..A ..C --- ... --- --- ... C.. ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... A.. C.. ... ... ..T ..A ..A ..C --- ..A --- --- ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... Yucca ... A.. C.. ... ... ..T ..A ..A ..C --- ..A --- --- ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... Saccharum A.. AC. C.. ... ... ..T ..A ..A ..C --- ... --- --- ... ... ..T ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ..C Zea A.. AC. C.. ... ... ..T ..A ..A ..C --- ... --- --- ... ... ..T ... ... ..G ... ..A ... ... ..G ... ..C Oryza A.. A.. C.G ... ... ..T ..A ..A ..C --- ... --- --- ... ... ... ... ... ..G ..C ..A ... ... ... ... ..C Triticum A.. A.. C.T ... ... ..T ..A ..A ..C --- ... --- --- ... ... ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ..C agrostis A.. A.. C.T ... ... ..T ..A ..A ..C --- ... --- --- ... ... ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ..C Sorghum A.. AC. C.. ... ... ..T ..A ..A ..C --- ... --- --- ... ... ..T ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ..C Barley A.. A.. C.T ... ... ..T ..A ..A ..C --- ... --- --- ... ... ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ..C Nicotiana TTC TAT TGG CAA ATA GGG GGT TTC CAA GTA CAT GGC CAA GTA CTT ATT ACT TCT TGG GTT GTA ATT GCT ATC TTA TTA Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... A.. ... ..A ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... A.C ... ... ..G ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ... .C. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ... ... ... .CA ... ... ... ..C ... .C. ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ..T ..G ... ..G ..C ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... ... ... ... ... .A. ..T ... ..G ... .CT ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... Soybean ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ..G Lotus ... ..C ... ... ..G ..A .A. ... ... ..G ... .C. ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ... ... ... ... ... ... T.C ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Piper C.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... A.. ... ..C ... ... ... ..C ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... Nuphar ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... .C. ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... .C. ... ... ... ..A ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... Amborella ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... .C. ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Ginkgo ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ... .CA ..G ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... .C. ... Pinus ..T ... ... ... ... ... ..G ..T ... ..T ... ..A ..G ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... Acorus ..A ... ... ... ... ..A ..G ... ... ..C ... .C. ... ... ..A ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Typha ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... A.C ... .C. ... ... ... ..C ... ... ... T.C ... ... ... ... ..G ... Phalaenopsis ..A ... ... ... ... ..A ... ..A ... A.T ... .C. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Yucca ..A ... ... ... ... ..A ... ..A ... A.T ... .C. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ... ... ... ... ..A ... ... ... A.T ... .C. ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ..T ..G C.. Zea ... ... ... ... ... ..A ... ... ... A.T ... .C. ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ..T ..G C.. Oryza ... ... ... ... ... ..A ... ... ... A.T ... .C. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ... ..G C.. Triticum ... ... ... ... ... ..A ... ... ... A.T ... .C. ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ... ..G C.. agrostis ... ... ... ... ... ..A ... ... ... A.T ... .C. ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ... ..G C.. Sorghum ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.T ... .C. ... ... ..C ..C ... ... ... T.C ... ... A.. ..T ..G C.. Barley ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... A.T ... .C. ..G ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ... ..G C.. Nicotiana GGT TCA GCC ACT ATA GCT GTT CGG AAC CCA CAA ACC ATT CCG ACC GGG GGT CAG AAT TTC TTC GAA TAT GTT CTT GAA Grape ... ... ..T ... C.. ... ... ..A ..T ... ... ... ... ..T ..T .AC ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ..C ... .G. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... .AT .AC A.. ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... Eucalyptus ... ..C ... .G. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... .AT .AC A.. ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... Panax ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ..T G.. ... ... ... ... .GT ..G ... ..A ... ... ..T ..T ... ..A ... ..T ..T ... ... ..C ... ... Arabidopsis ... ..C ..A GT. C.. ..G A.. ..C ..T ... ... ..A ... ..A ..T .AC ..C ..A ... ... ..T ... .T. ..C ... ... Cotton ... ..C ... GT. ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... .CC ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ... TT. ... ..C ... ... ..T ... ... ... G.. ... ..T .CC AC. ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... Medicago AT. ... A.. .T. C.. .T. ... A.A ..T ..G ... ..T ... ..A ..G TCC ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... Soybean .T. ... ... .T. C.. AT. A.. ..A ..T .TG ... ... ... ..C G.T TTC ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... Lotus ... ... A.. .T. C.. .T. ... ..A ..T ... ... ... ... ..C .AT TTT ... ..A ... ... ..T ... ... ..C ... ... Oenothera ... ... ... .G. ... ... ... ... ..T ... ... ..A ... ..A .AT .AC A.. ... ... ... ... ... ... A.C ... ... Ranunculus ... ..C ..T .T. ... ... ... ..C ..T ... ... ... ... ..A ... .AC ... ... ... ..T ..T ... ... ..C ... ... Calycanthus ..C ..G ... G.. ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..A ... .AC ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T AA. A.. ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Piper ... ... .T. ... ... ..G ... ..A ..T ... ... ..A ... ..A ... AAT A.C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... .AC ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Populus ... ... ... .T. G.. A.. ... ... ..T ... ... ... ... ..T ..T .AC ... ... ... ... ... ... ... A.C ... ... Nuphar ... ... ... G.. ... ..C ... ... ..T ... ... ..T ... ... ... .AC ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ... ... G.. ... ..C ... ... ..T ... ... ..T ..C ... ... .AC ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... Amborella ... ... ... ... ... .T. ... ... ..T ... ... ... ... ... ... .AC ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Ginkgo ... ..G ..T ... ... ... ... ... G.T ... ... ... ... ... ... .AT ... ..A ... ..T G.. ... ... ... ..C ... Pinus ... ... ..T ..C ... ... ... ..A G.T ... ... ... ... ..T ... ..T ... ..A ... ..T G.T ... ... A.. ..C ... Acorus ... ... .T. ... G.C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... AAC ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... Typha ... ... ... .TC ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... ... .AC ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Phalaenopsis ... ... .T. .TC ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..A ... AAC ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Yucca ... ... .T. .TC C.. ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... .AC ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Saccharum ... ... .TT .TC ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... .AT ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G Zea ... ... .TT .TC ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... .AT ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G Oryza ... ... .TT .TC ... ... ... ..C ..T ... ... ... ..C ..A ... .AT ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G Triticum ... ... .TT GTC ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... .AC ... ... ... ..T ..T ... ... ..C ... ..G agrostis ... ... .TT GT. ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... .AC ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ..G Sorghum ... ... .TT .TC ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... .AT ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G Barley ... ... .TT GTC ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... .AC ..G ... ... ..T ..T ... ... ..C ... ..G Nicotiana TTT ATT CGA GAT GTG AGT AAA ACT CAA ATT GGC --- GAA GAA TAT GGG CCC TGG GTT CCT TTT ATT GGC ACT ATG TTT Grape ..C ... ... ..C ... ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T T.T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Tomato ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ..C ... ... ..C ..T ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C Eucalyptus ..C ... ... ..C ..T ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C Panax ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Atropa ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ..C ..C ... ..C ... ..C ... ... ... ... ... --- ... ... ... C.C ..G ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... Arabidopsis ..C ... ... ..C ... ... ... ..C ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ..A ... ... ..C ... ... ..A ..C C.. ... Cotton ..C ... ... ..C ..A ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ..A ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... Citrus ..C ... ... ..C ... ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..C ..A ... ... ..C ... ... ..A ... C.. ... Medicago ..C ..C ... ..C ... ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ..G ... ... ..G ... ... ..A ... T.. ..C Soybean ..C ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ..A ... T.. ... Lotus ... ... ... ..C ..A ..C ... ... ... ... ..A --- ... ... ... ..T ..T ... ... ..A ... ..C ..A ... C.A ... Oenothera ..C ... ... ... ..T ... ... ..C ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Ranunculus ..C ... ... ... T.. ..C ... ..C ... ... ..A --- ... ..G ... ..T ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C Calycanthus ..C ... ... ..C T.. .CC ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ..T ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Drimys ..C ... ... ..C T.. ..C ... ..C ..G ... ..A --- ... ..T ... ..T ..T ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Piper ..C ... ... ... T.. ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ..T ... ..C ..T ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... Liriodendron ..C ... ... ..C T.. ..C ... ..C ..G ... ..A --- ... ... ... ..C ..T ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Populus ... ... ... ... ... ..C ... ..C ..G ... ..A --- ..G ... ... ..T ..A ... ... ..C ... ... ..A ... T.. ... Nuphar ..C ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ..A GAA ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ..A ... C.. ..C Nymphaea ..C ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ..A GAA ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ..A ... C.. ..C Amborella ..C ... ... ..C T.. .CC ... ... ..G ... ..A GAA ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Ginkgo ..C G.. ..G ..C T.. .CC .G. ... ..G ... ..G GAA ... ... ... ..T ... ... ... T.. ... ..C ..A ... ... ..C Pinus ... T.. ..G ..C T.. .CC .G. ... ..G ... ..G GAG ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... Acorus ..C ... ... ..C T.. ..C ... ..A ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ..T ... ... ..C ... ... ..A ..A ... ..C Typha ... ..C ... ..C T.. ..C ... ..C ... ... ..A --- ... ... ... ..T ..T ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Phalaenopsis ... ... .A. ..C T.. ..C ... ... ..G ... ..A --- ..G ..G ... ..T ..T ... ... ... ... ..A ..A ..G ... ..C Yucca ... ... ... ..C T.. ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ..T ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Saccharum ... ... ... ..C T.. ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Zea ... ... ... ..C T.. ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Oryza ... ... ... ..C T.A ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ..C ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Triticum ... ... ... ..C T.. ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C agrostis ... ... ... ..C T.. ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Sorghum ... ... ... ..C T.. ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Barley ... ... ... ..C T.. ..C ... ... ..G ... ..A --- ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..C Nicotiana TTA TTT ATT TTT GTT TCT AAT TGG TCA GGA GCT CTT TTA CCT TGG AAA ATC ATA CAA TTA CCT CAT GGG GAG TTA GCC Grape C.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis C.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus C.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... Panax C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... ..T ..C ..G ... ... ..A ... ... ... ..A Cotton C.. ... ... ... ... ... ..C ... ..G ..T ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Citrus C.T ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... G.G ... ... ... ... ... ... ... Medicago C.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ..G ... ... ... ..T ... A.G ... ... ... ..A ..A ... ..T Soybean C.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T Lotus C.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T Oenothera C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... C.. G.. G.G ... ... ..C ... ... ... ..T Ranunculus ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Calycanthus C.. ... ... ... ... ... ..C ... ..G ..T ... ... ... ..C C.. ... ... ... ..G ... ..G ... ..A ... ... ... Drimys C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... C.. ... ... G.. ..G ... ... ..C ... ... ... ..T Piper C.. ..C ... ... ... ..G ..C ... ..G ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ..A ... ... ..T Liriodendron C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... C.. ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T Populus C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... ... ... ... ... G.G ... ... ... ... ... ... ... Nuphar C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... .G. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T Nymphaea C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... .G. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T Amborella C.. ... ... ... ... ... ..C ... ..C ..C ... ... ... ... C.. ... ... ... G.G ... ... ..G ... ... ... ..T Ginkgo C.. ... ... C.. A.. ... ..C ... ... ..T ..C ..C C.C ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T Pinus C.. ... ..C ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... C.T ... ... GG. ..T C.. A.. ... ... ..G ... ... ... ... Acorus C.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... C.. ... G.G ... ... ..C ... ... ... ... Typha C.. ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... G.G ... ... ... ... ... ... ..T Phalaenopsis C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T Yucca C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Saccharum C.T ... ... ... ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... G.G ... ..C ... ... ..A ... ..A Zea C.T ... ... ... ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... G.G ... ..C ... ... ..A ... ..A Oryza C.T ... ... ... ... ..G ..C ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ..C ... ..A ..A ... ..A Triticum C.T ... ... ... ... ..G ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... G.G ... ..C ... ... ..A ... ..A agrostis C.T ... ... ... ... ..G ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... G.G ... ..C ... ... ..A ... ..A Sorghum C.T ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... G.G ... ..C ... ... ..A ... ..A Barley C.T ... ... ... ... ..A ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... G.G ... ..C ... ... ..A ... ..A Nicotiana GCA CCC ACG AAT GAT ATA AAT ACT ACT GTT GCT TTG GCT TTA CTC ACA TCA GTG GCA TAT TTC TAT GCG GGT CTT ACA Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ..A ... ... ..C Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ..A ... ... ..C Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ..A ..C ... ... ... ..A ... ... ... Arabidopsis ... ..A ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ..C ... ..T ... ... ..G ... .GC Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ... T.. Citrus ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ..G ... ..G ... A.A ... ..C ... ... ... ... ... T.C Medicago ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ..T ..G ... ..A ..C ... ... ... ... ... A.. T.. Soybean ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..T ... ... A.T ... ... ... ... ... ... ... T.. Lotus ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ..T ..G ... ..A ... ... ... ... ... ..G A.. T.. Oenothera ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... .GC Ranunculus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .CT ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Piper ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .C. ..G ... A.. ... ... ... ... ... ... T.. ..C Populus ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..T ..G ... A.A ... ... ..T ... ... ..C ... .GC Nuphar ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... ..T Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... ..T Amborella ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... A.. .GC Ginkgo ... ..T ..A ... ... ..T ... ... ... .C. ..C C.A ... ..G ... ..G ... ..A ... ... ... ..C ..A ... ... G.. Pinus ... ..T ..A ... ... ..T ... ... ..G ... ... C.A ... ... ..T ..G ... ..A ... ... ... ... ..A ... ... ... Acorus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .C. ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ..C Typha ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T Phalaenopsis ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .CT ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C .GG Yucca ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C Saccharum ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... .C. ... ... ..T ... ..A ... ... .GC Zea ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... .C. ... ... ..T ... ... ... ... .GC Oryza ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... .C. ... ... ..T ... ... ... ... .GC Triticum ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... .C. ... ... ..T ... ..T ... ... .GC agrostis ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... .CA ... ... ..T ... ... ... ... .GC Sorghum ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... .C. ... ... ..T ... ... ... ... .GC Barley ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... .C. ... ... ..T ... ..T ... ... .GC Nicotiana AAA AAA GGA TTA GGT TAT TTC GGA AAA TAT ATT CAA CCA ACC CCA ATC CTT TTA CCC ATT AAC ATC TTA GAA GAT TTC Grape ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ..G ..T ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T Tomato ... .GG ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... A.. ... ... A.T ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... A.. ... ... A.T ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... ..C ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ..G ... ... A.T ... ..C ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Cotton ... ... ... ..G ..G ... ... A.T ... ..C ... ... ..C ..T ... ..T ... ... ..T ... ... ..T ... ..G ... ... Citrus ... ..G ... ... ..C ... ... A.T ... ..C ... ... ..G ..T ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... Medicago ... ... ... ..G .C. ... ..T ..T ... ..C ..C ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T Soybean ... ... ... ... .C. ... ..T AAT ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Lotus ... ... ... ... .C. ... ..T ..T ... ... ..A ... ..T ..T ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ..G ... ..T Oenothera ... ..G ..G ... ... ... ... A.T ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ... C.. ... ... ... Calycanthus ... ... ... ..G ... ... ..T ..T ... ..C ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ... C.. ... ... ... Drimys ... ... ... ..G ..C ... ... ..T ... ..C ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ... C.. ... ... ... Piper ... ... ... ..G ... ... ..T A.T ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... G.T C.. ... ... ... Liriodendron ... ... ... ..G A.. ... ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... ... C.. ... ... ..T Populus ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... Nuphar ... ..G ... ..G ... ... ... ..T ... ..C ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ..T G.. ... ... ... ... Nymphaea ... ..G ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ..T G.. ... ... ... ... Amborella ..G ... ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ..C ..A ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... Ginkgo ..G .GG ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... G.A ... ... ..A ... ... ..A ... ..G ... ..T Pinus ..G ..G ..G ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T Acorus ..G ... ... ..G ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ..T ..G ... ... ... ..A ... ..T ... C.. ... ... ... Typha ... ... ... ..G ... ... ... .AG ... ..C ... A.. ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... ..G ..A ... ... ..G ... ..C ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ..T ..T C.. ... ... ... Yucca ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... C.. ... ... ... Saccharum ... ... ... ..G A.. ... ... .A. ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... ... Zea ... ... ... ..G A.. ... ... .A. ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... ... Oryza ... ... ... ..G A.. ... ... .AG ... ... ... A.. ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... ... ... Triticum ... ... ... ..G A.C ... ... .AG ... ... ... A.. ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... C.. ... ... ... agrostis ... ... ... ..G A.C ... ... .AG ... ... ... A.. ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... C.. ..G ... ... Sorghum ... ... ... ..G A.. ... ... .A. ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... ... Barley ... ... ... ..G A.C ... ... .AG ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... C.. ... ... ... Nicotiana ACA AAA CCT TTA TCA CTT AGT TTT CGA CTT TTC GGG AAT ATC TTA GCT GAT GAA TTA GTA GTT GTT GTT CTT GTT TCT Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..A G.. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ..G C.. ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ..C C.. ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G Soybean ... ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Lotus ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ..C ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T ..A ... ..A ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Amborella ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..A ... ..C ... ... C.G ... ... .CC ... ... ... ... Pinus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ..A ... ... ..C ... ..G ... ... .C. ... ... ... ... Acorus ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..A ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Typha ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ..G ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Yucca ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ..G ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Zea ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ..G ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Oryza ... ... ..A ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Triticum ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ..G ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... agrostis ... ... ..A ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Sorghum ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ..G ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Barley ... ... ..A ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ..G ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... Nicotiana TTA GTA CCT TTA GTA GTT CCT ATA CCT GTC ATG CTC CTT GGA TTA TTT ACA AGT GGT ATT CAA GCT CTT ATT TTT GCA Grape ... ... ... .C. A.T ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... T.T ... ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ..C ... ... ..C Cotton ... ... ... .C. ..C ..C ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... T.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... T.T ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T Soybean ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... ..T Lotus ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Oenothera ... ... ... .C. ..C ... ... ... ... ... ... T.. ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ..G ..G ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ..C ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... Drimys ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ..C ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ..G Piper ... ... ... .C. ..G ... ..C ... ... ... ... T.T ... ... ... ..C ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... .C. ... ..C ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ..C ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... .C. ..G ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ... ... ... ..G A.. ... ... ... ..G ... T.. ..C ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... Nymphaea ... ... ... ... ..G A.. ... ... ... ..G ... T.. ..C ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... ... Amborella ... ..C ... .C. T.G ... ... ... ... ... ... T.. ..C ... ... ..C ... ..C ... ... ... ... T.G ... ... ... Ginkgo C.. ... ... ..G ..G A.. ... ... ... ..A ... T.T ..A ... ... ... ... ..C .C. ... ... ... ..G ..C ... ... Pinus C.G ... ... ... A.. ... ... ... ... ..A ... T.. ..G ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... ..G ..C ... ... Acorus ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ..C ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... Typha ... ..C ... .C. ... ... ... ... ... ..T ... T.T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ..G ... .C. ... ... ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ..C ..C ... ... ..C ... ... ..G ... ... T.T ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Zea ... ..C ..C ... ... ..C ... ... ..G ... ... T.T ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Oryza ... ..C ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... T.T ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Triticum ... ..C ..C ... ... A.C ... ... ..G ... ... T.T ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... agrostis ... ..C ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Sorghum ... ..C ..C ... ... ..C ... ... ..G ... ... T.T ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Barley ... ..C ..C ... ... A.C ... ... ..G ... ... T.T ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Nicotiana ACT TTA GCC GCG GCT TAT ATA GGT GAA TCC ATG GAG GGC CAT CAT ATG ATA TTT TCA ACC TTA GAG CAT ATA TTA ACT Grape ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... C.. ..A ..T ... ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ..T ... ... Arabidopsis ... ... ..T ... ... ... ... ... ..G ..T ... ..A ..T ... ... ... ..T ... ... .TT ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... .G. ... ... ..G Medicago ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Soybean ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... G.. ... G.. .GT ... ..A ... ... ... ... Lotus ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Oenothera ..G G.. ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... .AT ..T C.. ..A ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... .TT ..T ... ..A ..C G.. ... ... Calycanthus ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ..C ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C G.G ..T ... ..A ... ... ... ... Piper ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... .C. ATC G.T ... ..A ... G.. ... ... Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... ... ... ... G.G ..T ... ..A ... ... ... ... Populus ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ... .TG ..T ... ..A ... ... ... ... Nuphar ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... G.. ..T ... ..A ... ... ... ... Nymphaea ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... G.. ..T ... ..A ... ... ... ... Amborella ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C G.G ..T ... ..A ... ... ... ... Ginkgo ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ..T ... ... ..T ... ... ... ... ..C A.. ..T ... ..A ... ... .C. G.. Pinus ... C.. ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C AT. ..T ... ..A ... ... ..G G.. Acorus ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... Typha ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... G.G ..T ... ..A ... ... ... .G. Phalaenopsis ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... G.G ... ... ... ... ... ... ... Yucca ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ... --- --- --- --- ..T ... ..A ... ... ... ... Saccharum ..G ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... C.. ... G.. ..T ... ..A ... ... C.. ... Zea ..G ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... C.. ... G.. ..T ... ..A ... ... C.. ... Oryza ..G ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... G.. ..T ... ..A ... ... C.. ... Triticum ..A ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... G.. ..T ... ..A ... ... C.. ... agrostis ..A ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... G.. ..T ... ..A ... ... C.. ... Sorghum ..G ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... C.. ... G.. ..T ... ..A ... ... C.. ... Barley ..A ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... G.. ..T ... ..A ... ... C.. ... Nicotiana CAC ATT TCC TTT TCG ATC GTT TCA ATT GTA ATT ACA ATT CAT TTG ATA ACC --- --- TTT TTA GTC --- --- GAT GAA Grape ..T ..C ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ... --- --- ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... --- --- ... ... Cucumis ..T ..A ... ... ... ... A.. ... ..A ... ... ..T ... TT. ... ... .G. --- --- ..A .CG ... --- --- ... ... Eucalyptus ..T ..A ... ... ... ... A.. ... ..A ... ... ..T ... TT. ... ... .G. --- --- ..A .CG ... --- --- ... ... Panax ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ... --- --- ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... --- --- ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ..T --- --- ... ... Spinacia ..T ... ..T ... ..A .CG ... ..C G.. ... ... ... C.C ... ... ... ..T --- --- ..A ... ... --- --- A.. ... Arabidopsis ..T ..A ..T ... ... G.. ... ... ... ..G C.G ... ... T.. ..T T.. ..T TTA TTA G.. AAT T.A --- --- ... ... Cotton ..T ..A ..T ... ..A G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... TTA TTC ..A ... ..A --- --- ... ... Citrus ..T ..A ... ... ... G.. ... ... ... .G. ... ... ... T.. ..A ... ... --- --- ..C ... ... --- --- ... ... Medicago ..T ..A ..G ... ..C G.. A.A ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ... --- --- A.. ... Soybean ..T ..A ..G ... ... G.. ..A ..T ... T.. ... T.. ... ... ... ... ... TTA --- ..A ..T ... --- --- A.A ... Lotus ..T ..A ..G ... ... G.. ..A ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... --- --- ..A ..T ... --- --- A.C C.. Oenothera ..T ..A ... ... ... C.. ... ... ... .G. ... ... ... TT. ... ... ... --- --- ..A .C. ... --- --- ... ... Ranunculus ... ... ..T ..A ... ..T A.. .T. ... ... ... ... ... TT. ... ..G .A. --- --- ..A ... ... --- --- T.C ... Calycanthus ..T ..C ..T ... ..T ... A.. ... ... ..C ... ..G ... ... ... C.G .A. --- --- ..A ... ... --- --- C.. ..T Drimys ... ..A ..T ... ... ... A.. ... ... ..T ... ..G ... ..A ... ... GA. --- --- ..A ... ... --- --- T.. C.. Piper ... ..C ..T ... ... ..T A.. ... ... ..G ... T.G G.. ... ..A ..C .AA --- --- ... ... ..T --- --- CC. ... Liriodendron ... ..C ..T ... ... ... A.. ... ... ..C ... ..G ... ... ... G.G ..T --- --- ..A ... ... --- --- C.. ... Populus ..T ..A ..T ... ... G.. ... ... ... ... ... .T. ... ... ..T C.. ... --- --- ..A ... ... --- --- A.. ... Nuphar ... ..A ..T ... ... ... A.. ... ... ..G ... C.T .C. ... C.. ..G ... --- --- .GC .CG ... --- --- T.. ... Nymphaea ... ..A ..T ... ... ... A.. ... ... ..G ... C.T .C. ... C.. ..G ... --- --- --- ..G ... --- --- T.. ... Amborella ... ..C ..T ... ..A ..A A.. ... ... ..C ... ..G .C. ... ... ..G ... --- --- --- ..C .C. --- --- CG. ... Ginkgo ... ..C ..T ... ..T C.. ..G ..T G.. ..C .C. CTC GC. T.. .G. GG. ... --- --- --- ..G ... --- --- T.. C.. Pinus ... ..C ..T ... ..T C.. A.. .TG G.. ..C .C. CTC ... T.. .G. GG. ... --- --- --- ... ..T --- --- T.. CG. Acorus ... ..A ..T ... ... ..T A.. ... G.. ..G ... ... ... ..G ... ..G .A. --- --- ..A ... ... --- --- C.C ... Typha ..T ... ..T ... ... ... A.. .T. ... ..G ... C.G ... ... ... ..G ... --- --- ..A ... ... --- --- C.C ... Phalaenopsis ..T ... ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... .T. ... ... ... ..G .A. --- --- ..A ... ... --- --- T.C ... Yucca ..T C.C ..T ... ... ... A.. ... ... ..G ... ..G ... ... ..A ..G ... --- --- C.A ... A.. --- --- C.C ... Saccharum ..T ..C ..T ..C ..A .C. A.. ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ..T --- --- CG. ... Zea ..T ..C ..T ..C ..A .C. A.. ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ..T --- --- CG. ... Oryza ..T ... ..T ..C ..A .CA A.. ... ... ..G ... ..G ... ... ..A ... ... --- --- ..A ... ..T --- --- CG. ... Triticum ..T ..C ..T ..C ..A .CG A.. ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ..T --- --- CG. ... agrostis ..T ..C ..T ..C ..A .C. A.. ..T ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ..T --- --- CG. ... Sorghum ..T ..C ..T ..C ..A .C. A.. ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ..T --- --- CG. ... Barley ..T ..C ..T ..C ..A .CG A.. ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ..T --- --- CG. ... Nicotiana ATC GTA AAA CTA TAC GAT TCA TCA GAA AAG GGC ATA ATA GTT ACT TTT TTC TGT ATA ACA GGA TTA TTA GTT ACT CGT Grape ... ... GG. ..T .CT ... ..G ... ... ... ... ..G ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Tomato ..T ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... GG. ... ..T ... ..G ... ... ..A ... ..G .C. .C. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... Eucalyptus ... ... GG. ... ..T ... ..G ... ... ..A ... ..G .C. .C. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... Panax ... A.. ... ... ..T ... ..G ... ... ... ..A ..G ... .C. .T. ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ..T ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ..A ..G GG. ... ..T A.. ... .T. ... ..A ... ..G C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... A.. GG. T.T .TT ... ... ... ..T ..A ..A ..C ... A.. ..G ... ..T G.. ... ... ... ... ... T.A ... ... Cotton G.. ... GG. ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Citrus ... AG. GGG ... ..T .C. ... ... ... .G. ..G ..G .C. .C. ..C GC. ... ... C.. ... ... ... ... A.C ..C ... Medicago ..T ... GG. T.. ..T ... .TG ..C A.. ..A .C. ..G ... A.A ... ... ... ... G.. ..G ... ..G ... A.. ... ... Soybean ... A.. GG. T.. .CT ... ..G ..C A.. ..A ... ..G ... A.A ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... Lotus ..T ... GG. T.C ..T ... ..G ..C A.. ..A ... ..G ... A.A ... ... ..G ... ... ... ... ... ... A.. ... ... Oenothera ... A.. GG. ... ..T ... ..G ... ... ..A ... G.G ... .GA ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Ranunculus ..T .A. GGG ... .C. T.. ..G ..G ... ..A ..A ..G G.. .C. T.. ... ..A ... ... ..G ... ..G ... ... .T. ... Calycanthus .C. ... GG. ... .GT ... ..G ... ... ..A ... ..G ..G .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys ... ... GG. A.. .GT ... ... ... ... ..A ... ..T ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.A ... ... Piper ... A.. GG. ... .GT ..C ..G .T. ... ... ... ... ... AC. ..C .C. ..T ..C ... ... ..T ... ... A.. .T. ... Liriodendron ... ... GG. ... .GT ... C.G ..C ... ..A ... ..G ... .CC G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Populus T.. ..G GG. ..C ..T ... ..G ... ... ..A ... ..G T.. AC. ... ... ... ..C C.. ... ... ... C.. A.. ... ... Nuphar ..T ... GG. ... .GT ... .TG ..G ... ..A ... ..G ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea ..T ... GG. ... .GT ... ..G ... ... ..A ... ..G ... AC. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Amborella ... .C. GG. ... .CT ... .TG ... ... ..A ... ..G ... .C. GT. ... ..G C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... Ginkgo ..T .A. GC. ... AGT CG. ..G GG. .G. .GA ... ..G ... ..G .T. .C. G.. ... ... ..G ... ..G ... A.. ... ... Pinus ..T .A. GG. ... AGT AG. ..G GG. .G. ... ... ..G ... ... ... ... C.T ... .C. ..G ... ... ... A.. .A. ... Acorus C.G ... C.. ... GGT ... G.G ... ... ..A ... ..G ... .C. ..C ... ... .C. ..C ..G ... ... ..G ... ... ... Typha ..T AGC GG. T.. CGT ... ..G ... ... ... ..G ..G ... .C. ... ... ..A .CG ... ..T ... ... ... ... T.. ... Phalaenopsis ... .A. G.. T.. CGT A.. ... .T. ... ..A ..A ..G ... .C. ... ... .C. .C. ... ... ..G ..T ... ... ... ... Yucca ... AGG GGG T.. CGT ... ... ... ... ... ..A ..G ... .C. ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... .T. ... Saccharum C.T AGG GG. T.. CGT ... ..G ... ... ..A ..A ..G ... .C. ... ... ... .C. ... ... ... ..T ... ..C T.. ... Zea C.T AGG GG. T.. CGT ... ..G ... ... ..A ..A ..G ... .C. ... ... ... .C. ... ... ... ..T ... ..C T.. ... Oryza C.T .GG GG. T.G CGT ... ..G ... ... ..A ..A ..G ... .CC ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... T.. ... Triticum C.T .G. GG. T.. CGT ... ..G ... ... ..A ..A ..G ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ..C ... ... T.. ... agrostis C.T .GG GG. T.. CGT ... ..G ... ... ..A ..A ..G ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ..C C.. ... T.. ... Sorghum C.T AGG GG. T.. CGT ... ..G ... ... ..A ..A ..G ... .C. ... ... ... .C. ... ... ... ..T ... ..C T.. ... Barley C.T .GG .G. T.. CGT ... ..G ... ... ..A ..A ..G ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ..C ... ... T.. ... Nicotiana TGG ATT TCT TCT GGA CAT TTC CCA CTA AGC GAT TTA TAT GAA TCA TTA ATT TTC CTT TCA TGG AGT TTC TCC CTT ATT Grape ... ... .A. .TG ... ... ... ... T.. ..T ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... Tomato ... G.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... .A. ..G ... ... ... ..G T.. ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... G.. ... Eucalyptus ... ... .A. ..G ... ... ... ..G T.. ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... G.. ... Panax ... ... .A. ..G A.. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ... ... ... ..A ..A G.. ... Atropa ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... G.. .A. .GG AAG ... ... ... T.. ..T ... C.. ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... .A. ... ... Arabidopsis ... ... .A. ..A ... ... ..T ... T.. ..T A.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... GC. ..T ..A A.. ... Cotton ... ... .A. ..A ... ... ... ... T.. ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ... ... G.. ... ... ... ... Citrus ... G.. .AC ..G A.. ... ... ... T.. ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ... ... ... ..A ..T A.. ... Medicago ... T.. .T. ..G ..C ... ..A ... T.T ..T ... ... ... ... ... C.. ..C ..T ... ... ... G.. ..T ... A.. T.. Soybean ... G.. .T. ..A ..C ... ..A ..G T.T ..T ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... .C. ..T ... A.. T.. Lotus ... T.. .T. ..A ..C ... ..A ... T.T ..T ... ... ... ... ..C ... ..C ..T ... ... ... G.. ..T ..G A.. T.. Oenothera ... GCG .A. ..G ... ... ..T ... T.. ..T A.. ... ... ... ... ... C.. ..T ..G ... ... ... ... G.G A.. ... Ranunculus ... ... .A. ..G ... ... ..A ..C T.. ..T ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ..A A.. T.. Calycanthus ... ... .A. ... A.G ... ..T ..G T.. ..T ... ... ..C ... ..C ..G ..G ... ... ... ... ... ... ..T A.. ... Drimys ... ... .A. ..G A.. ... ... ..G T.. ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... A.. ... Piper ... G.. .A. ..A A.. ... ..A ..G T.. ..T A.. ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ... G.. ... ... AC. ... Liriodendron ... ... .A. ..G A.. ... ... ..G T.. ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... A.. ... Populus ... ... .A. ..G ... ... ..A ... A.. ..T ... ... ..C ... ... ... ..A ..T ... ... ... .T. ... ..T A.. ... Nuphar ... ... .A. ..G ... ... G.A ... T.. ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... Nymphaea ... ... .A. ..G ... ... G.A ... T.. ..T ..C C.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Amborella ... ... .A. ..A ... ... ..A ... T.. ..T A.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... G.. ... ..T ... ... Ginkgo ... C.. ... ..G ... ... ..A ..G T.. ..T A.. ..G ... ... ..C ..C ..G ... ... ..G ... ... .CA ..T G.G ... Pinus ... C.. .A. ..A ... ... ..A ..G T.G ..T A.. ..G ... ... ... ..C ..G ... ... ..C ... ... .CA ... G.G T.C Acorus ... ..C .A. ..G ..T ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ... Typha ... ... ... ..G ... ... ..T ..G T.. ..T A.. ... ..C ..G ... G.. ..C ... ... ..G ..T G.. ... ... A.. ... Phalaenopsis ... ... ... ..G ... ... ..T ..T T.. ..T A.. ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... A.. ... Yucca ... ... ... ..A A.. ... ..T ... T.. ..T A.. ... ..C ..G ... ... ..C ... ... ..G ... ... ..T ... A.. ... Saccharum ... G.. ... ..G ... ... ..T ... T.. ..T A.. ... ... ..G ... ..G ..C ... ... ... ... .C. C.G .AT A.. C.. Zea ... G.. ... ..G ... ... ..T ... T.. ..T A.. ... ... ..G ... ..G ..C ... ... ... ... .C. C.G .AT A.. C.. Oryza ... GC. ... ..G ... ... ..T ... T.. ..T A.. ... ... ..G ... ..G ..C ... ... ... ... GC. C.G .AT A.. C.. Triticum ... GC. ..C ..G ... ... ..T ... T.. ..T A.. ... ... ..G ... ..G ..C .C. ... ... ... GCC C.G .AT A.. C.. agrostis ... GC. ... ..G ... ... ..T ... T.. ..T A.. ... ... ..G ... ..G ..C ... ... ... ... GC. C.G .AT A.. C.. Sorghum ... G.. ... ..G ... ... ..T ... T.. ..T A.. ... ... ..G ... ..G ..C ... ... ... ... .C. C.G .AT A.. C.. Barley ... G.. ... ..G ... ... ..T ... T.. ..T A.. ... ... ..G ... ..G ..C ... ... ... ... GC. C.G .AT A.. C.. Nicotiana CAT ATA ATT CCG --- --- TAT TTC AAA AAA AAT GTT TTA ATT --- TTA AGT AAA ATA ACT GGC CCT AGT GCT ATT TTT Grape ... ... G.. ..A --- --- ... ..T ... ... C.. AAA AAT CA. --- ... ..C GC. C.. ..C .CG ..A ... ... ... ... Tomato ... ... ... ..A --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ..G Cucumis ... ..G G.. ... --- --- ... ..T ... ... C.. AAA AAT TA. --- ... ..C .C. ... ..C .CG ..A ... A.. ... ... Eucalyptus ... ..G G.. ... --- --- ... ..T ... ... C.. AAA AAT TA. --- ... ..C .C. ... ..C .CG ..A ... A.. ... ... Panax ... ... G.. ... --- --- ... ... ... ... ..G AAA AA. .A. --- ... ..C .C. ... ... .CG T.A ... .T. ... ... Atropa ... ... ... ... --- --- ... ..T ... ..C ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... Potato ... ... ... ..A --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ..G Spinacia ... ..G ... ..A TCT --- .T. ..A ... ... G.G AAA AAT TC. --- ... .A. GT. ... ... .CA ..A ... ... ... ... Arabidopsis ... ..G G.. T.C --- --- ... ..T ..T ... ..A CAA CA. .A. AAG ... .AC .C. ... ... .CG ..A ... .T. ... ... Cotton ... ..G G.. T.C TAT TTA A.A ..T ... ..G CGC AAA AAT .A. --- ... ... GC. ... ..C .CA ..A ... ... ... ... Citrus ... .AG ... TTT --- --- G.. ..T ... ..T ... CAA AAT CA. --- ... ..C GCT ... ..G .CA ..A ... ... T.. ... Medicago ... ..G G.. ... --- --- .G. ..T ... ..G G.G AAA AAC C.. --- ... ... .C. ... .TC .CA ..A ... .T. ... ... Soybean T.. ..G G.. ..T --- --- ..C ... ... ... TC. AAA AAC TAC TAT ... .A. .C. ... .TA ACA ..A ... .T. ... ... Lotus T.. ..G G.. ... --- --- CG. ..T ... ... C.A AAA AAC GA. --- ... ... .C. ... .T. .CA ... ... .T. ... ... Oenothera ... ..G T.. ..A --- --- ... ..T ... ... C.G AAA AGT TA. --- G.. ..G .C. ... ..C TCG T.A ... A.. ... ... Ranunculus T.. ..G ... ..T --- --- ... ..T .G. ..T ..A AAA AGT .A. --- ... .A. GT. T.. ..A .CG ..C G.. A.. ... ... Calycanthus ... ..G G.. ..A --- --- ... ..T .GG ..C C.. AAA AAT TC. --- ... ..C GC. ... ..C .CG ..A ... ... ... ... Drimys ... ..G G.. ..T --- --- A.A GCG GGG ..C C.. AAA AAT GA. --- ... ..C GC. ... ... ..G ..A ... ... ... ... Piper ... ... T.. T.C --- --- A.A A.A TGG ..C C.. CAA AAT GA. --- ... ..C .C. ..T ..G .CT A.A G.. ... ... .A. Liriodendron ... ..G G.. ..T --- --- A.A A.A TGG ..T C.. AAA AAT GA. --- ... ..C GC. ... ..C .CG ..A ..C ... ... ... Populus ... ..G G.. ..A --- --- ... ..T ... ... C.. AAA AAT TA. --- ... ..C .C. ... ..C .CA ..A ... A.. T.. ... Nuphar ... ... G.. ..A --- --- ... ..T .G. ..C T.. AAG AAT TA. --- ..C ... .C. ... ..C .C. ..A ..C ... ... ..A Nymphaea ... ... G.. ..A --- --- ... ..T .G. ..C T.. AAG AAT T.. --- ..C ... ... ... ..C .C. ..A ..C ... ... ..A Amborella ... ..G ... T.T --- --- A.A A.A C.G ..C C.. AAG AAT T.. --- ... ... TC. ... ..C .CG ..A ... ... ... ..A Ginkgo ... ... G.. .TA --- --- G.A G.A CGG .GC C.A AA. AAT CGG TGG ... G.C GC. ..C ... .CA ..A ... ... ..G ..A Pinus ... ... C.. .TA --- --- G.A G.A CGG .GT CGA .A. GAT CGG TGG ... G.. GC. ..C ..C .CG ..A ... ... ..G ..A Acorus ... ..G G.. ..A --- --- ... ..T .GG ..C C.C AGA AAT CA. --- ..C ... GC. ... ... .CG ..A ... ..C ... ... Typha T.. ..G ... ..A --- --- A.A A.A CGG ..C C.. AAA AAT GA. --- ... ..C .C. ... ... .CA ..A ... A.. ... ... Phalaenopsis ... ... ... .T. --- --- ... A.T .GG ..T T.. AAA AAT GA. --- ... .AC GC. ... ... .CA ..A ... ..C ... ... Yucca ... ..G ... T.C --- --- A.G A.A TGG ..T C.. AAA AAT GA. --- ... ..C GC. ... ..C .C. ..A ... ... ... ... Saccharum ... .CT ... ..T --- --- A.G A.A C.G ..C TCG AAA AAT GA. --- ... ..C .C. ... ... ACG ..A ... A.. ... ..A Zea ... .CT ... ..T --- --- A.G A.A C.G ..C TCG AAA AAT GA. --- ... ..C .C. ... ... ACG ..A ... A.. ... ..A Oryza ... ..G ... ..T --- --- A.G A.A C.G ..C TC. AAA AAT GA. --- ... ..C .C. ... ... ACG ..G ... A.. ... ..A Triticum ... .CC ... ..T --- --- A.A A.A C.G ..C TC. AAA AAT GA. --- ... ..C .C. ... ... ACG ..A ... A.. ... ..A agrostis ... .CC ... ..T --- --- A.G A.A C.G ..C TC. AAA AAT GA. --- ... ..C .C. ... ... ACG ..A ... A.. ... ..A Sorghum ... .CT ... ..T --- --- A.G A.A C.G ..C TCG AAA AAC GA. --- ... ..C .C. ... ... ACG ..A ... A.. ... ..A Barley ... .CC ... ..T --- --- A.A A.A C.G ..C TC. AAA AAT GA. --- ... ..C .C. ... ... ACG ..A ... A.. ... ..A Nicotiana ACC CAA GGC TTT GCT ACG TCA GGT ATT TTA ACT GAA ATA CAC CAA TCT GTA ATA TTA GTA CCT GCT CTT CAA TCC GAG Grape ... ... ..A ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C .A. ... ... ... ..C ... ..C ... ... C.. Tomato ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... Cucumis ... ... ... ... ... ..T ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C .A. ... G.. ... ... ... ..C ... ... C.A Eucalyptus ... ... ... ... ... ..T ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C .A. ... G.. ... ... ... ..C ... ... C.A Panax ... ..G ... ... ... ..T ... ... C.. ... ... ... ... ..T ... ..C .C. ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Spinacia ... ... ..A ... ... ..A ..G ..C C.A ... ... ... ..G ..T ... ..C .G. ... ... ... ..C ..C ..A ... ..A C.. Arabidopsis .TT ..G ..T ... ... ..T ... ... C.. ... .AC A.. ..G .CT ..G ... .C. ... ... ... ..A ... ..C ..G ... C.. Cotton ... ... ... ... ..C ..T ..G ... C.. ... ..C A.. ..G ..T ... ... .C. ... ... .C. ... ... ..C ... ... C.. Citrus ... ... ... ... ..G ..T ..G ... T.. ... ..C A.. ..G ..T ... ..C AG. ... ... ... ..C ... ..C ... GT. C.. Medicago ... ... ... ... ..G ..T ..G ... C.. ... ..C A.. ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... ... C.T Soybean ... ... ... ... ... ..T ..G ..G C.. ... ..G A.. ..G ..T G.. ..G T.. ... ... ... ... ... T.A ..G ... C.T Lotus ... ... ... ... ... ..T ..G ... C.. ... ..C ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... T.A ... ... C.T Oenothera ... ..G ... C.. .T. ..T ... ... C.. ... .G. ... ..G ..G ... ..A .A. ... ... ... ... ..G ..C ... ... C.A Ranunculus ... ... ..G ... ..A ..T ... ... G.. ... .GA ... ... ..T ... ... AC. ... ... ... ... ... ..A ... ..A C.. Calycanthus ... ... ... ... ..C ..T ... ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ... .C. ... ... ... ..C ... ..A ... ... C.. Drimys ... ... ... ... ..C ..T ... .A. C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C .C. ... ... ... ..C ..C ..A ... ... C.. Piper TG. ... .C. ... ..A ..T ... ... ... ... .A. ... ..G ..T ... ..C .C. ... C.. ... ... ... ..A ... ..T C.A Liriodendron ... ... ... ... ..C ..T ..G ... C.. .C. ... ... ..G ..T ... ..C .C. ... ... ..G ... ... ..A ... ... C.. Populus ... ... ... ... ... ..T .GG ... C.. ... ..C ..C ..G ..T ... ... AA. ..C ... ... ... ... ..C ... ... C.. Nuphar ... ..G ... ... ..C ..T ..G ... C.. ... ... A.. ..G ..T ... ... .C. ... ... ..G ... ... ..C ... ... CGT Nymphaea ... ... ... ... ..C ..T ..G ... C.. ... ... A.. ..G ..T ... ..C .C. ... ... ... ... ... ..C ... ... CGT Amborella ... ... ... ... .TC ..T ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C .C. ... C.. ... ... ... ..A ... ... C.T Ginkgo ..T ..T ..T ... ... ..T .TG ... C.. CCG GAG ... ..G ..A ... ... AC. ..G ... ... ... ... ..A ... ..T C.T Pinus ..T ..T ..G ... ... ..T .T. ... C.. CCG GAG ... ..G ..A .G. ..C .G. ..G ... ... ..C ..G ..A ... ..T C.T Acorus ... ... ... ... ... ..T ..G ... C.. ... ..G ... ..G ..T ... ..C A.. ... ... ... ..C ... ..A ... ... C.. Typha ..T ... ... ... ..C ... ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C .C. ... ... ... ... ... ..A ... ..T C.. Phalaenopsis ... ... ..T ..C ..C ... ... ... C.. .C. ... ... ..G ..T ... C.C .C. ... ... ... ... ... ..A ... ..T C.. Yucca ... ... ..T ..C ..C ..A ..G ... C.. .C. .G. ... ..G ..T ... ..G TC. ... ... ... ... ... ..A ... ..T C.. Saccharum ..G ... ... ... ..C ... ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C AC. ... C.. ... ... ... ..A ... ..T C.. Zea ..G ... ... ... ..C ... ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C AC. ... C.. ... ... ... ..A ... ..T C.. Oryza ..G ... ... ... ..C ... ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C AC. ... C.. ... ... ... ..A ... ..T C.. Triticum ..G ... ... ... ..C ..A ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C ACG ... C.. ... ... ... ..A ... ..T C.. agrostis ..G ... ... ... ..C ..A ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C AC. ... C.. ... ... ... ..A ... ..T C.. Sorghum ..G ... ... ... ..C ... ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C AC. ... C.. ... ... ... ..A ... ..T C.. Barley ..G ... ... ... ..C ... ..G ... C.. ... ... ... ..G ..T ... ..C ACG ... C.. ... ... ... ..A ... ..T C.. Nicotiana TGG TTA ATA ATG CAC GTA AGT ATG ATG ATA TTG GGC TAT GCA GCT CTT TTA TGT GGA TCA TTA TTA TCA GTA GCA CTT Grape ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... G.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C Eucalyptus ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... G.. ... ..T ... ... ... ... ... G.C ... ... ... ... ..T ... A.. ... Arabidopsis ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .GC ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... A.. ..T ... Cotton ... ... ..G ... ... ... ... ... ... G.. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Citrus ... ... ..G ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ACG ..T ... Medicago ... C.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T A.. Soybean ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... A.. ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ..T A.. Lotus ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T A.. Oenothera ... ... ..G ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C Ranunculus ... ... ..G ... ... ... ... ... ... G.. ... A.T ... ..G ..G ... C.G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... Calycanthus ... ... ..G ... ... ... ... ... ... T.. ... ..T ... ... T.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... Drimys ... ... ..G ... ... ... ... ... ... T.. ... A.. ... ... ... ... ... ... ... G.G ... ... ... ... ..T T.. Piper ... C.. ..G ... ... ... ... ... ... T.. ..A A.T ... .G. ..C ... ..G ..C ... ..C ... ... ... ... T.T ... Liriodendron ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... T.. ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... Populus ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. .C. ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..G ... .C. ... ... Nuphar ... ... ..G ... ... ... ... ... ... C.G ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C A.. A.T ..C Nymphaea ... ... ..G ... ... ... ... ... ... T.G ... A.T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C A.. A.T ..C Amborella ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.G ... A.. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... A.. ..T ... Ginkgo ... .C. ..G ... ..T ... ... ... ..A T.G C.T ... ... ... A.C ... ... ..C ... ..C C.. ... ... A.. ..T T.. Pinus ... .C. ..G ... ..T ... ... ... ..A T.G ..C A.. ... ... A.C ... ... ... ... ..C C.. GC. ..C A.. ..T ... Acorus ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... T.. ... A.. ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..T ..T ... Typha ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... T.. ... A.. ... ..C ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ..C ..T ... Phalaenopsis ... ... ..G ... ..T ..C ... ... ... T.. ... A.. ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ..T ..T ... Yucca ... ... ..G ... ... ... ... ... ... T.. ... A.T ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... ..T ..T T.. Saccharum ... ... ..G ... ..T ..C ... ... ... T.. C.A A.. ... ... A.. ... ..G ..C ... ..C ... ... ..C .CC ..T ... Zea ... ... ..G ... ..T ..C ... ... ... T.. C.A A.. ... ... A.. ... ..G ... ... ..C ... ... ..C .CC ..T ... Oryza ... ... ..G ... ..T ..C ... ... ... T.. C.A A.. ... ..G A.. ... ..G ..C ... ..C ... ... ..C .CC ..T ... Triticum ... ... ..G ... ..T ..C ... ... ... T.. ..A A.. ... ... A.. ... ..G G.C ... C.C CC. ... ..C .CC ..T A.. agrostis ... ... ..G ... ..T ..C ... ... ... T.. C.A A.. ... ... A.. ... ..G ..C ... ..C ... ... ..T .CC ..T A.. Sorghum ... ... ..G ... ..T ..C ... ... ... T.. C.A A.. ... ... A.. ... ..G ..C ... ..C ... ... ..C .CC ..T ... Barley ... ... ..G ... ..T ..C ... ... ... T.. ..A A.T ... ... A.. ... ..G ..C ... ..C ... ... ..T .CC ..T A.. Nicotiana CTA GTG ATT ACA TTT CGA AAA AAC --- AGA CAG CTT TTT TAT --- --- --- AAG AGC AAT GGT TTT TTA AAC --- --- Grape T.. ..C ... ... ... ... C.. G.. ATA ..G ATT ... .G. --- --- --- --- ..A .A. ... CA. ... ... ..T --- --- Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... A.. ... ... .C. --- --- --- ... ... ... .T. ... ... ... --- --- Cucumis T.. ..C ... ... ..G ... ... GC. ATA ..G GTT T.. AG. --- --- --- --- ..A .AA ..C AA. ... ... ..T --- --- Eucalyptus T.. ..C ... ... ..G ... ... GC. ATA ..G GTT T.. AG. --- --- --- --- ..A .AA ..C AA. ... ... ..T --- --- Panax ... ..C ... ... ... ... ... ... --- ... A.T A.. ... .G. --- --- --- ..A ..G ... CC. ..A ... ..T --- --- Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... A.. ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ... G.. ... --- --- Potato ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... A.. ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... --- --- Spinacia ... A.T ... .T. ... .A. ... G.T TTA .T. ..A G.. ... G.. --- --- --- ..A C.A ..A CA. ..A ... ..T --- --- Arabidopsis ... ... ... ... ... ..C ... GT. GGA CCT ACT T.. .GG A.A AAG AAT ATA ..A .AA ... TT. ..A ... ..T --- --- Cotton ... ..C ... ... ... ... ..G GC. ATA .AG ATT A.. GG. G.A --- --- --- ..C .AT ... TT. --- --- --- --- --- Citrus ... ..C ... ... ... ... ... GTG ATA ..G .TT T.. ..G A.A AGA --- --- ..A .AT TT. .TA CA. G.. ..T --- --- Medicago T.. ..C ... ..G ... .A. G.. GC. ATC CA. ATT ... GC. .T. ACC --- --- ... .AT TTG .A. ... ... ..T --- --- Soybean T.. ..C ... ... ... .A. G.. CT. ATA CA. ATT A.. GG. A.A AGC --- --- ... .AT TTC TA. ... ... ..T --- --- Lotus T.. ..C ... ... ... .A. G.. TTA ATA CC. ATT T.G GG. A.A AGC --- --- ..A ..A TTG A.. ... ... T.T --- --- Oenothera T.. ..C ... ... ... ... ... GCT CTA ... ATT T.. AG. --- --- --- --- ..A .AG ..A .CA ... ... ..A --- --- Ranunculus ... ..C ... CT. ... ... ... .GT AGT TTT ACT T.. .CG A.A --- --- --- T.T .AG GGC TA. .A. ... CCG --- --- Calycanthus T.. ..C ... ... ... ... ... .C. TTA G.T ATT .C. GG. A.A --- --- --- ..C .AT C.. TTC ..A A.T GGG --- --- Drimys ... ..C ..C ... ... ... ... ... ACA GAT ATT GC. G.. A.A --- --- --- .GC .AT T.. TTA ..A A.T GGG --- --- Piper T.. ..T ... ... ... ... ... ... ATA GA. ATC T.G GAG A.A --- --- ATG ..T CAA TT. TC. ... ... .TT --- --- Liriodendron T.. ..C ... ... ... ... ... ... ATA G.T ATT G.. GGC A.A --- --- --- .GC .AT C.. TTA C.A A.T GGG --- --- Populus ... ..A ... ... ... ... ... GT. ATA ... ATT G.. GG. --- --- --- --- ..A .A. ... AA. ..A ... ..T --- --- Nuphar ..G ..C ... ... ... A.. .G. ... ATA GAT ATT A.C GG. A.A --- --- --- .CC .AT C.. TTA ..A A.T .GT --- --- Nymphaea ..G ..C ... ..G ... A.. .G. ..G ATA GAT ATT T.C GG. A.G --- --- --- .CC .AT C.. TTA ..A A.T .GT --- --- Amborella ... ..C ... ... ... A.. ... ..G CTA GAT ATT A.. --- --- --- --- --- TTC TTA TTA AT. AGG ... TT. --- --- Ginkgo T.G ..C ... ... ... ... .TT ..T AGG ..G ATT A.. CCC CCC CCT AGT GCG .T. GA. ... TCA ..C A.T TGG --- --- Pinus ... ... ... .TG .CC G.. GT. ..T AGA CAG GTT A.. ... GG. --- --- GCG .T. GA. ... TTA ... .CC CGA --- --- Acorus ... ..T ... ..G ... ... ... ... AGC GAT ATT T.. GA. --- --- --- --- ..A ..A ... AA. ..C ... .TT --- --- Typha ... ..C ... ... ... ... ... ... ACC .CT ATT T.. .G. --- --- --- --- --- .AA ..C .A. AA. ..C TT. --- --- Phalaenopsis A.. ... ... ... ... .A. ... ..A ACC GAT TTT T.. ..G --- --- --- --- ..A .A. ..G AA. ... .AC .GT --- TTA Yucca ... ..C ... ... ... ... ... ... ATC GAT ATT T.. .G. --- --- --- --- ..A .A. ..A AT. ..C ... .TT --- --- Saccharum ... A.C ... .G. ... ... ..T TCT TTC GAT TTC T.. .CA --- --- --- --- CTA .AG ..A AA. G.. ... .GA --- --- Zea ... A.C ... .G. ... ... ..G ..T TTC GAT TTC T.. .CA --- --- --- --- CTA .AG ..A AA. G.. ..T CTT --- --- Oryza ... A.. ... .G. ... ... ..G ..T TTA GAT TTC T.. .CG A.A --- --- --- ... .AG ..A AA. G.. ... .G. --- --- Triticum ... A.C ... .G. ... ... ..T ..T TTC CAT TTC T.. .C. A.A --- --- --- ... .AA ..A AA. G.. ... ..T --- --- agrostis ... A.C ... .G. ... ... ..T ..T TTC CAT TTC T.. .C. A.A --- --- --- ... .AG ..A AA. G.. ... C.T --- --- Sorghum ... A.C ... .G. ... ... ..T TCT TTC GAT TTC T.. .CA CTA --- --- --- ... .AA ... .T. ... C.T ..A --- --- Barley ... A.C ... .G. ... ... ..T ..T TTC CAT TTC T.. .C. A.A --- --- --- ... .AA ..A AA. G.. ... ..T --- --- Nicotiana --- GAG TCA TTT TTC TTG GGT --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- GAA AAT GTT TTA --- --- --- CAA Grape --- A.. ... ... .C. ..T .A. GAG ATC CAA TAT ATG AAT --- --- AAA GG- --A A.C ... ... ... --- --- --- ... Tomato --- ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... G.C --- --- --- G.. Cucumis --- ... ... ... .C. ..T .TC GAG ATC CAA TAC ATG AAT --- --- GAA AG- --A AGC ... ... ... --- --- --- .T. Eucalyptus --- ... ... ... .C. ..T .TC GAG ATC CAA TAC ATG AAT --- --- GAA AG- --A AGC ... ... ... --- --- --- .T. Panax --- ... .T. ... .C. ..T ... GAA ATC CAA TAC ATG AAT --- --- GAA AG- --A A.C ... ... ... --- --- --- AG. Atropa --- ... ... ... ..A ... ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... --- --- --- G.. Potato --- ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... G.C --- --- --- G.. Spinacia --- ... ... ... ... ..C ... GAG ATT CAA TAC ATA AAT --- --- GAA AA- --A AGC ... A.A G.. --- --- --- ... Arabidopsis --- ..A .T. ... .CT ..T .A. GTA CTT TAC TAC ATA AAT --- --- GAA AG- --A A.T TC. A.. ... CTA CAA --- ... Cotton --- --- ... ... .CG ..T ..G AAA ATC CAA TAC ATG AAT --- --- GAA AG- --A AGC ... ... ... --- --- --- .T. Citrus --- .G. ... ... .GT ..C A.. GAA ATC CAA TAC ATG AAC --- --- GAA AA- --A A.G ... ... ..T --- --- --- .T. Medicago --- A.A ... G.. GAT ..T .TC GAA ATA AAA TAC ATG AAT ATG AAT GAA AG- --A A.C ... ... ... --- --- --- .G. Soybean --- ..A ... ... .CT ..T .C. GAA ATC AAA TAC ATG AAT ATG ACT GAT AA- --A A.T ... ... ... --- --- --- ... Lotus --- ..A ... ... GAT .AT .C. GAA ATC AAA TAC ATA AAT ATG AAT GAA AG- --A A.C ... ... ... --- --- --- .G. Oenothera --- ..T ... ... .C. ..T .TG GAG ATC CAA TAT AGG AAT --- --- GAA CC- --A AGC ... ... ... --- --- --- .T. Ranunculus ATT .G. C.G C.. .A. ..T A.. GAA ATC CAA TAT GTG AAT --- --- GAA AA- --A A.. ... A.. ..T --- --- --- --- Calycanthus --- --- ... ... CC. ..T ..C GAG ATA CGC TAC TTC AAT --- --- GAA AA- --A AG. ..A AGA AGT GTT TTA --- A.. Drimys --- --- A.. ... .C. ..T ... GAG ATC CAA TAC TTG AAT --- --- GAG AA- --A AG. .G. ... ... --- --- --- ... Piper --- ... ... ... ..A C.T A.C GAA GTA CGT CCT TTA --- --- --- AAA AA- --G A.. ..A AG. ..T TTA --- --- ... Liriodendron --- --- ... ... .C. ..T .A. GAG ATC CAC TAC TTG AAT --- --- GAA AA- --A AG. ... ... ... --- --- --- ... Populus --- ..T ... ... CC. G.T .A. GAG ATC CAA TAC ATG ATG --- --- GAA AA- --A A.. .G. A.. ... --- --- --- A.. Nuphar --- --- ... ... .CT ..T .A. GAG ATC CAA TAC TTG AAT --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Nymphaea --- --- ... ... .CT ..T .A. GAG ACC CAA TAC GTG AAT --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Amborella --- --- ..T ... GGT GA. ATC --- --- CAA TAT TTG AAT --- --- GAA AA- --A AG. .G. A.. ..G --- --- --- --- Ginkgo --- --- .TC ... CAT .AT A.A AAT AGT TGG TAT TTA CAC GAA CAA AAA AA- --A ATT G.. T.G CA. --- --- --- --- Pinus --- --- G.C A.. C.T CCC AA. GAA AAT TTT TAT TCA CAT GAA AAG CAA AA- --A AGT G.. T.G CA. --- --- --- --- Acorus --- AG. ... ... ... ..T ... GAG ATT GAA TAC TTG AAT --- --- GAA AA- --A CGC .G. ... ... --- --- --- ... Typha --- ATT AAG .CA ..T ..C TT. GGA GAG ATT GAA TCT TTG --- --- AAT GA- --A A.. .GA AG. G.T --- TTT --- A.. Phalaenopsis AGG A.A ..G ... ... ..T ... AAT ATG GAA TAT TTG AAC --- --- GAA AA- --A .G. .G. A.. ... --- --- --- A.. Yucca --- A.. ... ... ... ..T ..C AAG ATC GAA TAC GGG AAC --- --- GAA AA- --A A.. .G. ... ..T AAT --- --- A.. Saccharum --- A.A A.. ... ... ..T A.. GAG ATT GAA TAT TTA TAT --- --- GCA AA- --A AG. .G. .C. ... --- --- --- A.. Zea --- A.A A.. ... ... ..T A.. GAG ATT GAA TAT TTA TAT --- --- GCA AA- --A AG. .G. .C. ... --- --- --- A.. Oryza --- A.A A.. ... ... ..T AA. GAG ATT GAA TAT TTC TAT --- --- GCA AA- --A AG. .G. .C. ... --- --- --- A.. Triticum --- A.A A.. ... C.. ..T A.. GAT ATT AAA TAT TTT TAT --- --- GCA AA- --A AG. .G. .C. ... --- --- --- A.. agrostis --- A.A A.. ... ..G ..T A.. GA- --- --- --- TTT TAT --- --- GCA AA- --A AG. .G. .C. ... --- --- --- A.. Sorghum --- --- A.. ... ... ..T A.. GAG ATT GAA TAT TTA TAT --- --- GCA AA- --A AG. .G. .C. ... --- --- --- A.. Barley --- A.A A.. ... ... ..T A.. GAG ATT GCA TTT TTT TAT --- --- GCA AA- --A AG. .G. .C. ... --- --- --- A.. Nicotiana AAT ACT TCT TTT TTT TCT GCT AAA AAT TAT TAC AGG TCC CAA TTG ATT CAA CAA TTG GAT TAT TGG AGT TAT CGG GTT Grape ..C ... ... ... C.. ... .T. .GG ... ... ... ... G.. ... ..T ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ... Tomato ... ... ..G ... ... .G. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis .CC ... ... ... .G. ... T.. CG. ... ... ... ... G.T ... C.. ... ... ... C.A ... C.G ... ... ... ..T A.. Eucalyptus .CC ... ... ... .G. ... T.. CG. ... ... ... ... G.T ... C.. ... ... ... C.A ... C.G ... ... ... ..T A.. Panax --- ... A.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ..C Atropa ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ..G ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... G.. ..G CCC .C. .A. .T. CG. ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... C.. ... C.. ... ... ... ... ... Arabidopsis ..C .T. AA. ... AG. .T. T.. .G. ... ... ..T ... .AT ... C.. ... ... ... ..A ... .T. ... ... .T. ..T A.. Cotton ..C ... .A. ... C.. ... T.. ... ... ... ... ..A .AT ... ... .C. ... ... ... ... CG. ... ... ... ..T A.. Citrus ... .G. --- --- C.. ..C ... .G. ... ... ... ... .AT ... G.. ... ... ... ... ... CG. ... ... ... ..T A.. Medicago ..A ..A ... ... .A. ... T.. CG. ... ... ..T ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... CG. ... G.. ... ..T A.. Soybean ..A ... ... ... ..G ... TA. .G. ... ... ..T ..A ..T ... ..T C.. ... ... ... ... CG. ... G.. ..C ..T AC. Lotus ..A ... ... ... .CA ... TA. .G. ... ... ... ... .AT ... ..T ... ... ... ... ... CG. ... G.. ... ..T A.. Oenothera .GC ..C ... ... A.. ... T.. ... ..C ... ... ... G.T ... C.. ... ... ... ..A ... CG. ... ... .C. ..T A.. Ranunculus --- --- --- --- C.. ..G TT. .G. ... ... C.. ... .AT ... ..A ... ..G ... ... ... .G. ... ... .CA ..T ... Calycanthus ..A ..A ... ... ... ..A TT. .G. ... ... C.. ... .AT ... ... .C. ..G .G. ... ... C.. ..T ... ... ..T A.C Drimys ..C ... ... ... CC. ..A TT. .G. ... ... C.. ... .AT .G. ... .C. ..G .G. ... ... C.. ... ... ... ..T ..C Piper ... .T. ... ... C.. ..A TT. ... ... ... C.T .AA .AT ... ..T .C. ... ..G ... ... C.. ... ... ... ... A.. Liriodendron ..C ... ... ... C.. ..A TT. .G. ... ... C.. ... .AT ... ... .C. ..G .G. ... ... ... ... ... ... ..T ..C Populus ... ... .T. ... CC. ... T.. .GG ... ... ... ... .TT ... ... ... ... ... ..A ... C.. ... G.. .T. ..T A.. Nuphar --- --- --- --- G.. ..G TT. .G. ... ... C.. ..A .AT ... ... .C. ..G .G. ... ... C.. ... ... ... ..T ..C Nymphaea --- --- --- --- ... ..G TT. .G. ... ... C.. ..A .AT ... ... .C. ..G .G. ... ... ... ... ... ... ..T ..C Amborella C.A .AC A.. .C. ... ..A TT. .G. ... ..C C.. .AA .AT ... C.T .C. ..G ... ..A ... C.. ... ... ... ..T ... Ginkgo G.C ... .T. .CC ..G .TA TTC .TG ... ... CGT ... .GT ... ... .C. ... ... ..A ... C.. ... ... ... ..T .C. Pinus T.C ... GT. .A. ... ..A T.A .CG ... ... CGT .AA .GT ... ... ... A.. ... ..A ... C.. ... ... ... ..T .CG Acorus ..C ... ..G ... GA. ..A TT. .C. ... ... C.. .AA .AT ... ... .C. ... .G. ..A ... .T. ... ... ... ... ..C Typha ..C ... ... ... C.. ..A TT. ... ... ... ... .AA .AT ... ..A .C. G.. .GT ... ... ... ... ... ... ..T ..A Phalaenopsis ..G ... ... ..A C.A ..A TT. ... ... .T. ... .AA .AT ... ..A ... ... ..T ... ... .C. ... ... ... ..T ..C Yucca C.C ..C ... C.. C.. ..A TTC CG. ... ... ... .AA .AT ... ..A .C. ... GGT ... ... ... ... G.. ... ..T ..C Saccharum ..C ..C ... ... CCC GTA TT. CC. ... ... ... .AA .AT ... ..A .C. G.G .GT ... ... .C. ... ... ... ..T ..C Zea ..C ..C ... ... CCC GTA TT. CC. ... ... ... .AA .AT ... ..A .C. G.G .GT ... ... .C. ... ... ... ..T ..C Oryza .GC ..C .T. ... CC. .TA TT. CC. ... ... ... .AA .AT ... ..A ... G.G .GT ... ... .C. ... ... ... ..T ..C Triticum .GA ..C ... G.C CC. ..A TT. CC. ... ... ... .AA .AT ... ..A .CG G.G .GT ... ... .C. ... ... ... ..T ..C agrostis .GC ..C ... G.. CC. ..A TT. CCG ... ... ... .AA .AT ... ..A .CG G.G .GT ... ... .C. ... ... ... ..T ..C Sorghum ..C ..C ... ... CCC GTA TT. CC. ... ... ... .AA .AT ... ..A .C. G.G .GT ... ... .C. ... ... ... ..T ..C Barley .GC G.C C.. G.C CC. ..A TT. CC. ... ... ... .AA .AT ... ..A .CG G.G .GT ... ... .C. ... ... ... ..T A.C Nicotiana ATT AGT TTA GGA TTT ACT TTT TTA ACC ATA GGA ATC CTT TCG GGA GCG GTA TGG GCT AAT GAA GCG TGG GGG TCG TAT Grape ... ... ... ..G ... CT. ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ..A ..G ... ... ... ..G ..A ... ..A ..A ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... Cucumis ... ... C.. ..G ... CTC ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ... ..A ... Eucalyptus ... ... C.. ..G ... CTC ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ... ..A ... Panax ... ... C.. ..G ... .TC ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ..A ..A ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... Spinacia ... ... C.. ... ... .TC ... ... ... ... ..T ..T ... ..A ..G ..A ... ... ..C ... ..G ..A ... ... ..A ... Arabidopsis ... ... C.T ... ... .TC ... ... ... G.C ..C ..T ... ..A ... ..T ..C ... ... ... ..G A.A ... ..T ..A ... Cotton ... ... C.C ..G ... .TC ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ..A ..A ... Citrus ... ... ... ... ... .TC ... ... ... .C. ..T ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ..T ... Medicago ... ... C.G ..T ... CTG ... ... ..G ... ..T ..T ... ..A ..G ..A ... ... ... ..C ..G ..A ... ... ..C ... Soybean ... ... C.. ..T ... .TC ... ... ..G ... ..T ..T A.. ..A ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ..A ..A ... Lotus ... ... C.. ..T ... .TC ... ... ..G ..C ..T ..T ... ..A ... ..A ... ... ... ..C ..G ..A ... ..A ..T ... Oenothera ... ... C.. ... ... .TC ... ... ... ... ..T ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ..A ..C ... Ranunculus ... ... C.C ..C ... TTA ... ... ... ... ..T ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... A.A ... ... ... ... Calycanthus ... ... C.. ..G ... ... ... .C. ... ... ..T ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ... ..T ... Drimys ... ... C.. ..G ... .TC ... .C. ... ... ..T ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ..A ..T ... Piper ..A .A. C.. ... ... ... ..G ... ... ... ..C ..T ..A ..A ... ..A ... ... ..G ..C ..G ... ... ..A ..T ... Liriodendron ... ... C.. ..G ... ..C ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ..A ..T ... Populus C.. ... A.. ..G ... CT. ... ... ... ... ..T ..T ... ..A ... ..A ..C ... ... ... ... ..A ... ..A ..A ... Nuphar ... G.C ..G ..T ... ..C C.. ... ..T ... ..T ..T ... ..A ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ..A ..T ... Nymphaea ... G.C ..G ..T ... ..C C.. ... ..T ... ..T ..T ... ..A ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ..A ..T ... Amborella ... G.. A.. ... ... ..C C.. ... ..T T.. ..T ..T ... ..A ..G ... ... ... ... ... ..G ..A ... ..A ..C ... Ginkgo ... G.. C.. ..T ... CT. C.. ... ..T ... ..T ..T ... C.T ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ..A ..T ... Pinus ... G.. C.C ..T ... T.. C.. .C. ... ... ..T .CT ... ..T ... ..A A.. ... ..C ... ... ..A ... ..A ..T ... Acorus ... ... C.. ..G ... .TC ... ... ... ... ..T ..T ..A ... ..G ..A ..G ... ... ... ..G ..A ... ..A ..T ... Typha ... ... C.. ... ..C ..C ... ... ... ... ..T ..T ... .GT ... ..A ... ... ..A ... ..G ..A ... ..A ..C ... Phalaenopsis ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ..T ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ..T ..A ... Yucca ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ..T ... ..T ... ..A ... ... ... ..C ... ..A ... ..A ..T ... Saccharum ... ... C.. ..G ... ... C.. ... ... G.G ..T ..T ... .GT ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ..A ..C ... Zea ... ... C.. ..G ... ... C.. ... ... G.G ..T ..T ... .GT ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ..A ..C ... Oryza ... ... C.. ..G ... ..C C.. ... ... ... ..T ..T ... .GT ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ..A ..C ..C Triticum ... ..C C.. ... ... ..C C.. ... ... GG. ..G ..T ... GGT ... ..A ... ... ... ... ..G ..C ... ..A G.C ... agrostis ... ... C.. ... ... ..C C.. ... ... ... ..T ..T ... .GT ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ..A ..C ... Sorghum ... ... C.. ..G ... ... C.. ... ... G.G ..T ..T ... .GT ... ..A ... ... ... ... ..G ..A ... ..A ..C ... Barley ... ..C C.. ... ... ..C C.. ... ... ... ..T ..T ... .GT ... ..A ... ... ... ... ..G ..C ... ..A ..C ... Nicotiana TGG AAT TGG GAC CCA AAA GAA ACT TGG GCA TTT ATT ACT TGG ATC GTA TTT GCA ATT TAT TTA CAT ACT CGA ACA --- Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... --- Tomato ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... --- Cucumis ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. C.. ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- Eucalyptus ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. C.. ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- Panax ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ..C --- Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- Potato ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- Spinacia ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... .C. A.. ... ... ... ... ... ... .T. ... ... --- Arabidopsis ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .CT A.. ..C ... ... ... ... ... .T. AA. ... --- Cotton ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... .C. ... ..C ..G ... ... ..C ... ..C ... ... --- Citrus ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .CG A.. ..C .GG ... ... ... ... ... ... ... --- Medicago ... ... ... ..T ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... .C. A.. ..C ..T ... ... ... ... ... ... .A. --- Soybean ... ... ... ..T ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... .CT A.. ..C ..G ... ... ... ... ... A.. .A. --- Lotus ... ... ... ..T ..C ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... .CA A.. ..C ..G ... ... ... ... .G. A.. .A. --- Oenothera ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.G ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- Ranunculus ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .CA A.. ..C ... ... ... ... ... ..C A.. ... --- Calycanthus ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ..C ... ... ... ... ... ... A.. ... --- Drimys ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ..C ... ... ... ... ... ... A.. ... --- Piper ... ... ... ... ..C ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... .CT A.. ..C ..T .C. ... ... ... ..G A.. ... --- Liriodendron ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ... ..G ... ... ... ... ... A.. ... --- Populus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ..C ..G ... ... ..C ... ... ... ... --- Nuphar ... ... ... ... ..C ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... .C. ... ..C ..G ... ... .C. ... ... A.. ... --- Nymphaea ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ..C ..G ... ... ... ... ... A.. ... --- Amborella ... ... ... ... ..C ..G ..G ... ... ..T ... ... ... ... .CT A.. .C. ..G ... ... ... ... ... A.. ... --- Ginkgo C.. .GC ... ... ... ... ..G ..C ... T.. ..A ... ... ... .CT A.. ... ... ... ... C.G ... T.. A.. .TG --- Pinus ... .GC ... ..T ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... ... .C. A.. ..C ... ..C ... C.G ... ... A.. .TG --- Acorus ... ... ... ... ... ..G ... .T. ... ... ... ... ..C ... GCT A.. ..C ... ... ... ... ... ... A.. ..G --- Typha ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ..C ... ... ... ... ... ... A.. ... --- Phalaenopsis ... ... ... ..T ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ... ... ... ... ... ... ... A.. .A. --- Yucca ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ..C ..G ... ... .C. ... ... A.. ... --- Saccharum ... ... ... ..T ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. A.. ... ... ..A ... ... ... .G. A.. ... --- Zea ... ... ... ..T ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. A.. ... ... ..A ... ... ... .G. A.. .A. --- Oryza ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ... ... ... ... ... ... .G. A.. ... --- Triticum ... ... ... ..T ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ..C ... ... ... ... ... .G. A.. ... --- agrostis ... ... ... ..T ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ... ... ... ... ... ... .G. A.. ... --- Sorghum ... ... ... ..T ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... .C. A.. ... ... ..A ... ... ... .G. A.. ... --- Barley ... ... ... ..T ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... .C. A.. ..C ... ... ... ... ... .G. A.. ... --- Nicotiana --- --- --- --- --- --- --- AAT AGA AAT TTG CGG GGT --- --- GCA AAT TCT GCA ATT GTA GCG TCT ATA GGC TTT Grape --- --- --- --- --- --- --- ... .A. ... ... .AA .TC --- --- ... ... ... ... ... ..G ..T ... ..G ... ... Tomato --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... --- --- C.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... Cucumis --- --- --- --- --- --- --- ... .A. ... .G. GAA A.. --- --- TTT ... .GC ... ... ..G ..T ... ... ... ... Eucalyptus --- --- --- --- --- --- --- ... .A. ... .G. GAA A.. --- --- TTT ... .GC ... ... ..G ..T ... ... ... ... Panax --- --- --- --- --- --- --- ... .T. ..A ..A ... ... --- --- ... ... ..C ... ... ..G ... ... ... ... ... Atropa --- --- --- --- --- --- --- ... .T. ... ..A ... ... --- --- ... ... ... ... ... A.. ..A A.. ... ..T ... Potato --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... --- --- C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Spinacia --- --- --- --- --- --- --- ... .A. ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ..G ..T .T. ... ... ... Arabidopsis --- --- --- --- --- --- --- ... ..G ... G.T A.. ... --- --- AT. ... ... ... ... ..G ..T .TG ..C ..T ... Cotton --- --- --- --- --- --- --- ... .C. ... ... GAA ... --- --- .T. ... ..C ... C.. ..G ..T ... ..G ..A ... Citrus --- --- --- --- --- --- --- ... .C. ..A .G. GAA ... --- --- .T. ... ..C ... ... ..G ..T ... ..G ... ... Medicago --- --- --- --- --- --- --- .C. .A. ..A ..T GAA ... --- --- .T. ... ... T.. ..A ..G ..C ... ..C ..A ... Soybean --- --- --- --- --- --- --- ... .A. ..A ... GAA .A. --- --- CT. ... ... T.. ..A ..C ..C ..C ... ..T ... Lotus --- --- --- --- --- --- --- ... .A. ..A C.. GAA ... --- --- TT. ... ... T.. ..A ..G ..C ... ... ... ... Oenothera --- --- --- --- --- --- --- ... CC. ... ..T .AA A.. --- --- .T. ... ..C ... ... ..G ..T .T. C.G ... ... Ranunculus --- --- --- --- --- --- --- ... .A. .G. ... .AA A.C --- --- T.. ... ..G ... ... ..T ..T ... ..C ..T ... Calycanthus --- --- --- --- --- --- --- ... CAG .GA ..T .AA .A. --- --- .T. GG. C.G ... ... ..G ..T ... ..G ..A ... Drimys --- --- --- --- --- --- --- ... CA. .G. ... .AA ... --- --- .TG ... ..G T.. ... ... ..T ... ..C ..A ... Piper --- --- --- --- --- --- --- ... CA. CGA A.. .C. ... --- --- ATG C.. ..G ... ... ... ..T ..G ..T ..A ... Liriodendron --- --- --- --- --- --- --- ... C.G .G. ... .AA ... --- --- .TG ..C ..G ... ... ..G ..T ..C ..G ..A ... Populus --- --- --- --- --- --- --- ... .AG ... ... GAA ... --- --- TT. ... ... ... ... ..C ..T ... ..C ..T ... Nuphar --- --- --- --- --- --- --- ... .A. .G. ... .AA ... --- --- ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ..A ... Nymphaea --- --- --- --- --- --- --- ... .A. .G. ... .AA ... --- --- ... ... ..A ... ... ..G ..T ... ..G ..A ... Amborella --- --- --- --- --- --- --- ... .A. ..C ... .AA A.. --- --- ..G ... ..A ... ... ..G ..T ..G ... ..A ... Ginkgo --- --- --- --- --- --- --- ... .A. GG. .G. .AA ... --- --- .AG ..A C.G ... ... .CG ..T ... C.. ..A ... Pinus --- --- --- --- --- --- --- ... .AG GG. .G. .A. ... --- --- .AG G.A C.G ... ... ..G ..T ... T.. ..A ... Acorus --- --- --- --- --- --- --- ... CAT .G. ... .AA ... --- --- ..G ... ..G ... ... ..G ..T ... ..C ..A ... Typha --- --- --- --- --- --- --- ... CA. ... .G. AAA ..C --- --- A.G ... ..G ... C.. ..G ..T ... ... ..A ... Phalaenopsis --- --- --- --- --- --- --- ... TC. ..A ... .AA .A. CAA GTT A.G ... ..G ... T.. ... ..T ... ... ..A ... Yucca --- --- --- --- --- --- --- ... CA. .G. ... .AA ... --- --- A.. ... ..G ... C.. ... ..T ... ... ..A ... Saccharum --- --- --- --- --- --- --- ... CC. ... .G. AA. ... --- --- A.G ... ..C ... C.. ... ..T ..G ... ..A ... Zea --- --- --- --- --- --- --- ... CC. ... .G. AA. ... --- --- A.G ... ..C ... C.. ... ..T ..G ... ..A ... Oryza --- --- --- --- --- --- --- ... CC. ... .G. AA. ... --- --- A.G ..G ..A ... T.. ... ..T ..C ... ..A ... Triticum --- --- --- --- --- --- --- C.. CC. ... .G. AA. ... --- --- A.G ... ..C ... C.. A.. ..T ..G ... ..A ... agrostis --- --- --- --- --- --- --- ... CA. ... .G. AA. ... --- --- A.. ... ..G ... C.. ... ..T ..G ... ..A ... Sorghum --- --- --- --- --- --- --- ... CC. ... .G. AA. ... --- --- A.G ... ..C ... C.. ... ..T ..G ... ..A ... Barley --- --- --- --- --- --- --- ... CC. ... .G. AA. ... --- --- A.G ... ... ... C.. A.. ..T ..G ... ..A ... Nicotiana CTT ATA ATT TGG ATA TGC TAT TTT GGG GTC AAT CTT TTA GGA ATA GGG TTA CAT AGT TAT GGT TCT TTT CCA TCA ACA Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..A ... A.. .TT T.. Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... T.A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... AAT .T. CAT Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... T.A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... AAT .T. CAT Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... ... ..A C.. ..C ... ... ... ..A ... A.G .T. ..G Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..A ... A.. .T. ..G Arabidopsis A.. T.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... A.. ..G .AT Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... A.. .T. .AT Citrus ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... AAT --- --- Medicago ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... A.. ... ..A ... ... ... ..A C.. ... ... ... ... ..A ... A.. ..T .AT Soybean ... ... ... ... G.. ..T ... ..A ..T A.A ... ... ... ... ... ..A C.. ... ... ... ... ..A ... A.. C.T .AT Lotus ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A C.. ... .A. ... ... ..G ... A.. ..T .AT Oenothera A.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... T.A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... AAT .T. CAT Ranunculus T.. ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ..A ... ... ... ... C.G ... ... ... ... ..A ... G.. AT. ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A C.. ... ... ... ... ..A ..C G.. .T. ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..A ..C A.. .T. ... Piper ... ..T ... ... ... ..T ... ..C ..A ..A ... ..A ... ... ... ... C.. ... ... ... ... G.A ..C A.C ..T .AT Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A C.. ... ... ... ... ..A ..C A.. .T. ... Populus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... T.A ... ... ... ..A C.. ... ... ... ... ..A ... A.. .T. .T. Nuphar ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ..T ... ..A ... ... .G. ... C.. ... ... ... ... ..A ..C A.. .T. .AC Nymphaea ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .G. ... C.. ... ... ... ... ..A ..C A.. .T. .AC Amborella ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C C.. ... ..C ... ... ..A ..C G.. .T. .GG Ginkgo T.. ... ... ... ..C ..T ... ..G ... ... G.. ..A ... ... ... ..T ..G ..C ..C ... ..A .GG ..G --- --- --- Pinus T.. ... G.. ... ..C C.T ... ..G ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..C ..C ... ..A .GG ..G GA. C.. --- Acorus ... ... ... ... ... ..T ... ... ..A ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..C --- --- --- Typha ... ... ... ... ... ... ... ... ..T A.. ... T.A ... ... ... ..T C.. ... ... ... ... ..A ..C A.. .T. ... Phalaenopsis ..C C.. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... ... ..T ... ..C ... ... ... ..C ..A ..C .A. --- --- Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Saccharum ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T A.. ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ..A ... A.. .T. C.. Zea ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T A.. ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ..A ... A.. .T. C.. Oryza ... ... ... ... ..C ..T ... ... ..T A.. ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... A.. .T. C.C Triticum ... ... ... ... ..T ..T ... ... ..T A.A ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... A.. .T. ... agrostis ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T A.. ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..G ... A.. .T. --- Sorghum ... ... ... ... ..C ... ... ... ..T A.. ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ..C ... ..A ... A.. .T. C.. Barley ... ... ... ... ..T ..T ... ... ..T A.. ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..G ... A.. .T. ... Nicotiana TTT AAT --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Grape .C. ..C --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Tomato ... ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Cucumis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Eucalyptus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Panax .C. ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Atropa ... ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Potato ... ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Spinacia C.. ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Arabidopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Cotton --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Citrus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Medicago --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Soybean --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Lotus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Oenothera --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Ranunculus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Calycanthus .C. ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Drimys GCG --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Piper --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Liriodendron .C. ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Populus .C. ... --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Nuphar A.C --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Nymphaea A.C --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Amborella --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Ginkgo --- --- ATA GGT CCC ATA CCT CGT TCT ATA ACT CGT ACT TTA TCC AGA TTT CGG ACA GAG CTG ACG AGT GAA TCA AGT Pinus --- --- ATG GAT CCC ATA CCT CAT TCT ATC ACT CGT ACT TTG TCT AGA TTT CGG ACA GAA CTG ACA AGT GAA TCA GGT Acorus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Typha .C. --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Phalaenopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Yucca --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Saccharum .C. ..A --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Zea .C. ..A --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Oryza A.C --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Triticum CC. ..A --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- agrostis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Sorghum .C. --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Barley CC. ..A --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Nicotiana --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ATG GCA AAA AAG AAA --- GCA TTC ACT CCT CTT TTC TAT CTT GCA TCT Grape --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... A.. ... ... ... --- ... ... ... ..C ... C.A ... ... ... ... Tomato --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... .T. ... ... ... --- ... ..T CT. ... ... C.A ... ... A.. ... Eucalyptus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... .T. ... ... ... --- ... ..T CT. ... ... C.A ... ... A.. ... Panax --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... Atropa --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... .A. ... ... ... --- .T. ..T .T. ... T.. C.A ... ... AT. ... Arabidopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... --- ... ... .T. ... T.. ..T ... T.. CT. ... Cotton --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... --- ... ... ... ..C ... C.A ... ... ... ... Citrus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- A.. ... ... ..C --- ... .C. .T. ..C ... AGA ... ... T.. ... Medicago --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ..A ... --- ... ... .T. ..C ... C.A .G. ... A.. ... Soybean --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... A.. ... ... ... --- A.. ... .T. ..C ... C.A ... ... A.. ... Lotus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... --- ... .CT .T. ..C T.. C.A .C. ..C A.. ... Oenothera --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... AA. ... ..A ..G --- AA. ... CT. ..G ... C.A ... ... A.. G.. Ranunculus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... CA. ... ..A ... --- ... ..T .AC ..C ... C.A ..C ... A.. ... Calycanthus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- G.. C.. ... ... ... --- ... ..G ... ..C T.C CCA ... ... ... ... Drimys --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- G.. C.. ... ... ... AAA ... ..G ... ..C ..C CCA ... ... ... ... Piper --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- G.. C.G ... ... ... --- ... ..G G.C ..G .CC CCA ... ... .T. ... Liriodendron --- --- --- --- --- --- --- --- --- AAA G.. C.. ... ... ... --- ... ..G ... ..C ..C CCA ... ... ... ... Populus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ATG G.. ..A ... --- ... ... .T. ..C ... C.A ... ... A.G ... Nuphar --- --- --- --- --- --- --- --- --- GAA G.. A.G ... ... ... --- ... ..G .A. ..C ..A CCA ... ... ... ... Nymphaea --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- G.. A.G ... ... ... --- ... ..G .A. ..C ..A CCA ... ... ... ... Amborella --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- G.. T.C ... ... ... --- ... ..G ... T.C ..G CCA ... ... ... ... Ginkgo CCG TTA GTG ATT CAC GAA --- --- TTG AAA G.. ..C ... T.T ... --- .T. .CA G.. T.C ..A CAA ... ..C ... .T. Pinus TCG TTA GCG ATT CAC GAA --- --- TTG GAA G.. T.C G.. T.T ... --- ... .CA G.. T.C ..A CGA ... ..C ... .G. Acorus --- --- --- --- --- --- --- --- --- AAA G.. C.. ... ... ... --- .G. ..T ... ..C ..C CCA ... ... ... ... Typha --- --- --- --- --- --- --- --- --- AAA ... AA. ... ... ... --- ... ..G C.. T.. T.C CCA ... ... ... ... Phalaenopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... AA. ... ... ... --- ... ..G G.. T.C ..C CCA ... ... .TG ... Yucca --- --- --- --- --- --- --- --- AAA AAT GAA AA. ... ... ... --- ... ..G ... T.C ..C CCA ... ... ... ... Saccharum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... AA. ... ... ... --- ... ..G C.. T.. T.C ..A ... ... .T. .T. Zea --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... AA. ... ... ... --- ... ..G C.. T.. T.C ..A ... ... .T. .T. Oryza --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... AA. ... ... ... --- ... ..G C.. T.. T.C C.A ... ... .T. .T. Triticum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... AA. ... ... ... --- ... ..G C.. T.. T.A C.A ... ... .T. .T. agrostis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... AA. ... ... ... --- ... ..G C.. T.. T.A C.A ... ... .T. .T. Sorghum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... AA. ... ... ... --- ... ..G C.. T.. T.C ..A ... ... .T. .T. Barley --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... AA. ... ... ... --- ... ..G C.. T.. T.A C.A ... ... .T. .T. Nicotiana ATA GTA TTT --- --- --- TTG CCC TGG TGG ATT TCT TTC TCA GTT AAT AAA TGT CTG GAA TCT TGG GTT ACC AAT TGG Grape ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ..C ... C.A ... C.. ... ... A.. ... ... ... ... ... ..T ... ... Tomato ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... Cucumis ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ..C ... C.. ... T.. ... ... A.. ..T ... .T. ... A.. ..T ... ... Eucalyptus ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ..C ... C.. ... T.. ... ... A.. ..T ... .T. ... A.. ..T ... ... Panax C.. ... ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... C.T ... T.. ... ... A.. ... ... ... ... ... ..T ... ... Atropa ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Potato ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Spinacia ... ... ... --- --- --- ..A ... ... ... ..C .A. C.A ... T.. C.A ... A.. ... ... ... ... ... ..T .C. ... Arabidopsis ... ..C ... --- --- --- ... ... ... .T. ..C ... C.. .GC TG. ... ... A.. T.. A.. A.. ... A.. ..T ... ... Cotton ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ..C ... C.. ... T.. ... ... A.. ... A.. ... ... A.. ..T ... ... Citrus ... ... ... --- --- --- G.A GTA .TT .T. CCC .GG .GG ATC CC. CTC TC. .T. AAT A.. AG. CT. .AA T.. TGG GTT Medicago ... ..C ... --- --- --- ... ... ... ..C ..C ... ..T A.. T.. ..G ... A.. ... ... ... ... A.. ..T ... ... Soybean ... ..C ... --- --- --- ... ... ... ..T ..C ... ... A.. T.. ..G ... A.. ..C ... ... ... T.. .TT G.. ... Lotus ... ..C ... --- --- --- ... ... ... ..C ..C ... ..T A.. TG. ..G ... G.. A.. ... .A. ... ... ..T ... ... Oenothera ... ..C ... --- --- --- ..T ... ... ... ..C ..C C.. .T. T.. ... ... G.. ..T ... ... ... ... ..T ... ... Ranunculus ... ..C ... --- --- --- ... T.. ... .C. ... ... ... ... T.. ..A ... A.. A.. ... ... .T. ... .TT C.. ... Calycanthus ... ..T ... --- --- --- ... ... ... ... ..C ... C.. ... T.. .CC ... A.. ... ... C.. ... ... ..T ... ... Drimys ... ..C ... --- --- --- ... ... ... ... ..C ... C.. ... T.. ... ... A.. ... ... C.. ... ... ..T C.. ... Piper ... ..T ... --- --- --- ..A ..G ... ... ..C ... C.T ... T.. C.A ... A.. ... ... C.. ... A.. ..T ... ... Liriodendron ... ..C ... --- --- --- ... ... ... ... ..C ... A.. ... T.. ... ... A.. ... ... C.. ... ... ..T ... ... Populus ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... G.C ... ..T ... T.. ... ... A.. ... .G. ... ... A.. .TT ... ... Nuphar ..C ... ... --- --- --- C.. ... ... G.A ... ... C.. ... T.. ... ... A.. A.. ... C.. ... ..G ..T ... ... Nymphaea ..C ... ... --- --- --- C.. ..T ... G.A ... ... C.. ... T.. ... ... A.. A.. ... C.. ... ..G ..T ... ... Amborella ... ..T ... --- --- --- C.. ... ... G.A ... ... C.A ... T.. ... ... A.. ... ... C.. ... ... ..A ... ... Ginkgo T.. ... ..C --- --- --- C.. ... ... G.. ..C ..G A.T ... T.C C.G G.. G.. T.. .G. C.. ... ... ..G ... ... Pinus T.. ... G.A --- --- --- C.. ..T ... GTA ... C.. A.T ... T.A CGG ... G.. T.. ..G C.. ... ... ..A ... ... Acorus ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... G.C ... C.. ... T.. ... ..G A.. ... ... C.. ... ... ... ... ... Typha ... ..T ... --- --- --- ... ... ... ... G.C ... ... ... T.. ... ... ... ... ... CT. ... ... ... .C. ... Phalaenopsis ... A.C ... --- --- --- ... ... ... ... G.. ... C.. ... T.. ... ... ... ..A ... A.. ... ... .TT ... ... Yucca ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... G.C ... C.. ... T.. C.A ... A.. ... ... C.. ... A.. .TT ... ... Saccharum ..C ... C.. --- --- --- ... ... ... G.A G.C ... ... ..T T.. ..C ... ... ... ... CT. ... A.. .AG ... ... Zea ..C ... C.. --- --- --- ... ... ... G.A G.C ... ... ..T T.. ..C ... ... ... ... CT. ... A.. .AG ... ... Oryza ..C ... C.. --- --- --- ... ..T ... G.A G.C ... ... ..T T.. ..C ... ... ... ... CT. ... A.. .AG ... ... Triticum ..C ... C.. --- --- --- ... ..T ... G.. G.C ... .C. ... T.. ..C ... ... ... ... CT. ... A.. .AG ... ... agrostis ..C ... C.. --- --- --- ... ... ... G.. G.A ... ... ... T.. ..C ... ... ..T ... CT. ... A.. .AG ... ... Sorghum ..C ... C.. --- --- --- ... ... ... G.A G.C ... ... ..T T.. ..C ... ... ... ... CT. ... A.. .AG ... ... Barley ..C ... C.. --- --- --- ... ..T ... G.. G.C ... .C. ... T.. ..C ... ... ... ... CT. ... A.. .AG ... ... Nicotiana TGG AAT ACT GGG CAA TCC GAA ATT --- --- --- TTT TTG AAT AAT ATT CAA GAA AAG AGT CTT CTA GAA AAA TTC ATA Grape ... ... ... A.. ... ..T ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... C.. ... --- --- --- G.C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. Cucumis ... ... ... A.. ... ... ... .C. --- --- --- ... ... .C. G.. ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ..C Eucalyptus ... ... ... A.. ... ... ... .C. --- --- --- ... ... .C. G.. ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ..C Panax ... ... ... A.. ... ... ... ... --- --- --- ... ... ... GG. ... ... ... ... .A. A.. ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... C.. ... --- --- --- G.C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. Spinacia ... ... ... AA. ... ..T ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ... ..A .AG ... ..C ... ... ... ..C Arabidopsis ... ... ... A.A ... .G. ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ... ..A ... T.. ... ... ... ... ... Cotton ... G.. ... A.. ... ... ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ... ... ... A.. ... ... C.. ... ... Citrus ACT ... TGG T.. A.T A.T AGT CAA TCC GAA ACC ... ... ... G.. ... ... ... ... GC. A.. ... ... ... ... ... Medicago ... ... ..G AAA ... ... ... ... --- --- --- ..C ... ... .T. ... ... ... ..A .CG A.. T.. A.G ... ..G ... Soybean ... ... ... A.. ... ... ... ... --- --- --- ..C ... ... G.. ... A.. ... ... ... A.. ... A.. ... ... ... Lotus ... ... ... AA. ... ... ... ... --- --- --- ..C ... ... .TC ... ... ... ... ..C A.. ... A.. ... ... ..G Oenothera ... ... ... AC. ..C ..G ... .C. --- --- --- ... ... .C. G.. ..G ... ... ... ... A.. ... ..C ... ... ... Ranunculus ... ... G.A .A. ... ... ... G.. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ... ..A ..C GCC ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ..C ... ... ... A.. .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ..G ... .AC G.. ..G ... .G. ... ... Drimys ... ... ..C A.. ... ... ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ... ..T .AC G.. ... ... .G. ... ... Piper ... ... .GC A.. A.. ... ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ... ... G.C G.. ... ... ... ... ... Liriodendron ... ... ..C A.. ... ... ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ..G ... .AC G.. ... ... .G. ... ... Populus ... ... ... A.T A.. ... ... .C. --- --- --- ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ..A ... Nuphar ... ... ..C A.C ... ... ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ... ... .AC A.. ... ... GG. ... ... Nymphaea ... ... ..C A.C ... ... ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ... ... .AC A.. ... ... GG. ... ... Amborella ... ... ..C A.C ... .A. ... .C. --- --- --- C.. ... ... G.A ... ... ... ..T .AC G.. ..T ... .G. ... ... Ginkgo ... ... ... ..T ..G ..A A.. ... --- --- --- ... ..T TC. T.. C.. ... ..G G.A .A. GCC ... ... .G. ... GG. Pinus ... ... ..G .TT A.. ..T C.G .AA --- --- --- A.. ..T G.. T.. C.C ..G ... C.A .A. GC. ..G .G. .G. ..T GAG Acorus ... ... ..C A.A ... ..T ... .CC --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ..G .G. .AC G.. ... ... .G. ... ..C Typha ... ... ... A.. ... ... ... .C. --- --- --- C.C ..C ... G.. ... ... ..G ..A .AC ... ... ... .G. ... ... Phalaenopsis ... ... ... A.. ... ... ... ..C --- --- --- CC. ... ... G.. ... ... ..T ..A .A. G.. ... ... ... ..T ..G Yucca ... ... ... A.. ... ... ... .C. --- --- --- ... ... ... G.. ... ... ..G ..A .A. G.. ... ... ... ... C.. Saccharum ... ... ..C A.. ... ... ... .C. --- --- --- ..C ..A .C. G.. ... ... ..G ..A ..G A.. ... ... GG. ... ... Zea ... ... ..C A.. ... ... ... .C. --- --- --- ..C ..A .C. G.. ... ... ..G ..A ..G A.. ... ... GG. ... ... Oryza ... ... ..C A.. ... ... C.. .C. --- --- --- C.C ..A .C. GC. ... ... ..G ..A ..A G.. ... ... .G. ... ..G Triticum ... ... ..C A.. ... ... ... .C. --- --- --- C.C ..A .C. G.. ... ... ..G ..A ..G A.. ... ... .G. ... ... agrostis ... ... ..C A.. ... ... ... .C. --- --- --- C.C ..A .C. G.. ... ... ..G ..A ..G A.. ... ... .G. ... ... Sorghum ... ... ..C A.. ... ... ... .C. --- --- --- ..C ..A .C. G.. ... ... ..G ..A ..G A.. ... ... GG. ... ... Barley ... ... ..C A.. ... ... ... .C. --- --- --- C.C ..A .C. G.. ... ... ..G ..A ..G A.. ... ... .G. ... ... Nicotiana GAA TTA GAG GAA CTC CTC TTC TTG GAC GAA ATG ATC AAG --- --- --- --- --- --- GAA TAC TCG GAA ACA CAT CTC Grape ... ... ... ... ... T.. ..G ... ... ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ... .G. C.. ... ... ... ..A Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ..G ..A ... ... T.A C.. ... ... ... ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ... ... C.. ... ... ... ..A Eucalyptus ... ..G ..A ... ... T.A C.. ... ... ... ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ... ... C.. ... ... ... ..A Panax ... ... ... ... A.. ..T C.. ... ..G ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ..G ... ... ..A Atropa ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ..G ... .G. ..G ... ... ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ... ..T C.A ... ... ..G T.A Arabidopsis C.. ... ... ... ..A T.. CAG C.C ..T ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ... ... C.A ... ..C A.. T.A Cotton ... G.. ... ... ... T.. C.G ... ... ... ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ... ... C.. ... ... ... ..A Citrus ... ... ... ... T.A T.T C.. ... ... ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ... .TT C.. ... .G. .G. ..A Medicago ..G ..C ... ... ..G T.. C.. ... ..T ... ... C.A ... --- --- --- --- --- --- ... ..T C.. ... ... ... T.T Soybean ... ..T ..A ... ..G T.T ... ..A ..T ..C ... T.A ... --- --- --- --- --- --- ... .GT C.. ... ... ... ..A Lotus ... ... ... ... ..G T.. ... ... ..T ... C.. C.A ... --- --- --- --- --- --- ... ..T ... ... ... .G. ..T Oenothera ... ... ..A ... ... T.A C.. ..A ... ... ... ..A ..C --- --- --- --- --- --- ... ... C.. ... ... ... ... Ranunculus ... ... ..A ... ... ... ..T ... ..T ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ..G .C. C.. ..T .T. ... A.A Calycanthus ... ... ..A C.. ..A T.. C.G ... ... ... ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ..G ..T C.C ..G ... ..G A.A Drimys ... ... ..A ... ..A T.. C.G ... ... ... ... ..A ... TTG GAC GAA ATG ATA AAG ..C ... C.. ..G ... ..G A.A Piper ... ... ... ... ..A ..T C.G C.A ... ... ..A .CA ..A --- --- --- --- --- --- ..G .G. C.C ... ... ..G A.A Liriodendron ... ... ..A C.. ..A T.. C.G ... ... ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ..G ... C.. .GG ... ..G A.A Populus ... ..T ... ... ... T.. C.G ... ... ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ... ... C.C ... ... ... ..A Nuphar A.. ... ..A ... ..G T.. ..G ... ... ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ..G ..T C.. ..G ... ... A.A Nymphaea A.. ... ..A ... ..G T.. ..G ... ... ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ..G ..T C.. ..G ... ... A.A Amborella ... ... ..A ... ..A T.. ..G ... ... ... ... ..A .G. --- --- --- --- --- --- ..T ..T C.. ..G ... ... A.A Ginkgo ..G A.. ..A ... ..A T.. C.A ... ..A AG. ... G.G G.A --- --- --- --- --- --- ..T .CT ... ... ... ... TCA Pinus A.. A.. ..A ... ..A T.. ..G ..A ..A AG. ... G.G G.A --- --- --- --- --- --- ..T .CT .T. .G. ... ... TCA Acorus ... ... ..A ... ..A T.. C.G ... ... ... ... C.A ... --- --- --- --- --- --- ..G A.. C.. ..G ... .G. A.G Typha ... ... ..A ... ... T.T C.G ... ... ... ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ..G ... C.. ..G ... ... A.A Phalaenopsis ... ... ..A ... ..A T.. C.G ... ... ..G ... ..A ... --- --- --- --- --- --- ..G ... ... ... ... ... A.G Yucca ... ... ..A ... ... T.. ..G ... ... ... ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ... ... C.. ..G ... ... A.A Saccharum ... ... ..A ... ..T T.T C.. ... ... ... ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ..G A.A C.. A.G ... ... G.A Zea ... ... ... ... ..T T.T C.. ... ... ... ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ..G A.A C.. A.G ... ... G.A Oryza ... ... ..A ..C ..T T.T A.. ... ... ... ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ..G A.A C.. A.T ... ... G.A Triticum ... ... ..A ... ..T TCT C.. ... ... ..G ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- .GG A.A CTA A.G ... ... G.A agrostis ... ... ..A ... ..T TCT C.. ... ... ..G ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ..G A.A CTA A.G ... ... G.A Sorghum ... ... ..A ... ..T T.T C.. ... ... ... ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- ..G A.A C.. A.G ... ... G.A Barley ... ... ..A ... ..T TCT C.. ... ... ..G ... ..A ..A --- --- --- --- --- --- .GG A.A CTA A.G ... ... G.A Nicotiana GAA GAG TTT GGG ATA GGA ATC CAT AAA GAA ACG ATC CAA TTA ATC AAG ATA CAA AAT GAG AAT CGT ATC CAT ACG ATT Grape C.. A.. C.. C.T ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G T.C ... ... G.. .C. ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ..G G.. ... ... Cucumis C.. ACA C.. C.T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ..C ... ... G.. .A. ... ... .T. ... Eucalyptus C.. ACA C.. C.T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ..C ... ... G.. .A. ... ... .T. ... Panax C.. A.C C.. C.T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... G.. ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ..G G.. ... ... Spinacia C.. A.A C.C ..T ... ... ... ..C ..T ... ... ..T ... ..G ... ... ..G ..C ... ... G.. T.. ... ... .T. ... Arabidopsis C.. C.A ... C.T C.. ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... T.. AA. ... ... ..A ..C Cotton C.. A.. C.. C.T ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..G ... ... C.G ..C ... ... G.. .A. ... ... ... ... Citrus ... A.. C.. C.T ... ..G C.. ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ..G ..C G.. ... G.. .A. ... ... ... ... Medicago C.. A.T C.. C.T ..G .A. ... T.C ... ... ..C ... ... ..G ... G.. .CG A.C ..C C.A G.C ... ... ... ... ... Soybean C.. A.C C.G C.T .CT ... ... T.. ... ... ..A ... ... ... ... ..A .CG ..C ..C ..A G.. ... ..G A.. ... ... Lotus C.. ATC C.C C.T .CC ... ... ..C ... ... ..A ..T ... ..G ... ... .CG ..C ..C ..A G.. ... ... T.. ..A ... Oenothera C.. ACA C.. ..T ... ... ... ..C ... ... .T. G.. .GC ..G ..T ... ..G .GC ..C ... G.. .A. ... ... ..A ... Ranunculus C.. A.A C.. C.C ... ... ..A ..C ... ... ... ..A ... ..G G.. ..A ..G T.C ... ... GGC .A. ... ... ..C ... Calycanthus C.. A.. ... CAT ... ... ... ..C ... ..G ... C.. ... ..G G.. ..A ..G ..C ... ..A G.. .A. ... ... .TC G.. Drimys C.. A.. ... C.T ... ... ... ..C ... ... ... ..A ... ..G ... ..A ..G ..C ... ..A G.. .A. ... ... .TC ... Piper C.. A.. C.. TAT ... ... ..A T.C ... ... ... ..T ... ..G G.G ..A ..T A.. ... ..A G.G .A. ... ... .TT ... Liriodendron C.. A.. C.. C.T ... ... ... ..C ... ... ..A ..A ... ..G G.. ..A ..G ..C ... ..A G.. .A. ... ... .TC ... Populus C.. A.. ... C.T ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ..C ..C .CA G.. ... ..A G.. ... ... Nuphar C.. A.. C.. C.T ... ... ... ..C ... ... ... ..A ..G ..G G.A .GA ..G ..C ... C.A G.. .A. ..A ... .TC ... Nymphaea C.. A.. C.. C.T ... ... ... ..C ... ... ... ..A ... ..G G.A .GA ..G ..C ... C.A G.. .A. ..A ... .TT ... Amborella C.. A.. C.. C.T ... ... ... ..C ... ... ... ..A G.. ..G G.G ..A ..G T.C ... C.A G.. TA. ... ... .TA ... Ginkgo C.. ..T C.. C.T ... .AG ..T ..C .G. A.. ..A ... ... ... G.G ..A ..G T.C ... A.A G.. T.. ... ..G .TC ..C Pinus C.. TCT A.. C.T ... .AG ..T ..C ... ... ... ... ... ..G G.. G.A ..G T.C ... ..A G.. T.. ... ..G .TA ..A Acorus A.. A.T C.. C.T ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ..G G.. ..A .C. G.C ... ... T.. .A. C.. ... ..C ... Typha C.. A.A C.. C.. ... ... ..A ..C ..G ... ... ..A ... ..G G.. ..A .C. ..T ... ..A T.C .A. C.G ..G .TC ... Phalaenopsis C.. AG. C.. CAT ... ... ..G ..C ..G ... ..A ..A ... ..G G.. C.A .G. ... ... ..A TC. .A. T.. ... .TC ... Yucca C.. A.. ... C.T ... ... ..A ..C ..G ... ... ..A ... ..G G.. ..A .C. ..C ... ..A T.. AA. C.. ... .TT ... Saccharum C.. A.A C.. CCT ... ... ..A ..C ..G ... .TA ..A ... ..G GC. ..A ... G.T ... ... G.. .A. C.. ... .TC ... Zea C.. A.A C.. CCT ... ... ..A ..C ..G ... .TA ..A ... ..G GC. ..A ... G.T ... ... G.. .A. C.. ... .TC ... Oryza C.. A.C CCC CCT ... ... ..A .GC ..G ... .TA ..A ... ..G GC. ..A ... G.T ... ... GG. .A. C.. ... .TC ... Triticum C.. A.A CC. CCT .C. ... ..A ..C ..G ... .TA ..A ... .GG G.. ..A ... A.T ... ... G.. .A. C.. ... ..C ... agrostis C.. A.A CC. CCT ... ... ..A ..C ..G C.. .TA ..A ... ..G G.. ..A ... G.T ... ... G.. .A. C.. ... .TC ... Sorghum C.. A.A C.. CCT ... ... ..A ..C ..G ... .TA ..A ... ..G GC. ..A ... G.T ... ... G.. .A. C.. ... .TC ... Barley C.. A.A CC. CCT .C. ... ..A ..C ..G ... .TA ..A ... .GG G.. ..A ... A.T ... ... G.. .A. C.. ... .TC ... Nicotiana TTG CAC TTC TCG ACA AAT ATC ATC TGT TTT ATT ATT CTA AGC GGG TAT TCA ATT TTG GGT AAT GAA AAA CTT GTT ATT Grape ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C G.. ... ... ..T ..T ... ..T ... C.. ... ... ... G.. ... C.. ... Tomato ... ... ... ..A ... ... ..A ... ..G ... GG. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ..A ... ... ... ..A .C. .C. ..C ... ... T.. ..T ..T ... ..T ... C.. ... ... ... G.. ... .C. ... Eucalyptus ... ... ..A ... ... ... ..A .C. .C. ..C ... ... T.. ..T ..T ... ..T ... C.. ... ... ... G.. ... .C. ... Panax ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C G.. ... ... ..T ..T ... ..T ... .G. ... ... ... G.. ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... GG. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... T.A ... ... ..C C.. ... ... G.. ..T ... ..C ... C.. ..A ... A.. G.. ... A.. C.. Arabidopsis ... ... ... ... ... ... C.A ..A .C. ..C G.. ... ... ..T ..T ... ..C T.. .G. ... ..G ... ..G ... T.. ... Cotton ... ... ... ... ..C ... C.A ... ... ..C G.. ... ... ..T ..T ... ..T ... ... ..G ... ... G.. ... C.. ... Citrus ..T ... ..T ... ... ... .CA ... ..C ..C G.. ... ... ..T ..T ... ..T ... ... T.. ... ... G.. ... T.. ... Medicago ..A ..T ... .GT ... ... ..A ..A ... ..C C.. ... ... ..T ..T ... ..T ... AG. ... ... C.. G.. ..C A.. ... Soybean ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ..C T.. ... ... ... ..T ... ..T ... C.T ... ... C.. G.. ... ... C.. Lotus ... ... ... ... ... ... ..A ... .A. ..C ... ... ... ..T ..T ... ..T ... C.A ... ... C.. G.. ... A.. ... Oenothera ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ..C ... ... T.C C.. ..T ... ..T ... C.. ... ... A.. G.. ... C.C ... Ranunculus ..A A.. ..T .T. ... ... ..A ..A A.. ..C GC. ... ... ... .TT .T. .AT ... C.. ... ... ... C.. ... ... ... Calycanthus ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... GC. ... ... ..T ..T ... .AT T.. C.. ... ... ... G.. ... ... ... Drimys ... ..T ... ... G.. ... ..A ... ... ..C GC. ... T.T ... ..T ... ..T ... C.. ... ... ... G.. ... ..C ... Piper ..A ..G A.T ... G.G ... ..A ... ... ... GC. .C. ... ..T ..C ... G.T ... C.A T.. ... ... G.. ... ..G ... Liriodendron ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... GC. ... ... ..T ..T ... ..T ... C.. ... ... ... G.. ... ..C ... Populus ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C G.. ... ... ..T ..T ... ..T T.. ..A .T. ... ... G.. ... T.. ... Nuphar ... ..T ... ... ... ... ..A .C. ... ..C GC. ... ... ..T .CT ... ..T ... C.. ... ... ... G.. ... A.C GC. Nymphaea ... ..T ... ... ... ... ..A .C. ... ..C GC. ... ... ..T .CT ... ..T ... C.. ... ... ... G.. ... A.C .C. Amborella .C. ..T ... ... ... ... ..A ..G A.. ..C GC. ... ... ..T .CT ... ..T ... C.. ... ... ... G.. ... ..C .C. Ginkgo .C. ..T ..A .T. ... ... ..G ..A ... ..C GC. ... TC. ..T .CT ... .TC ... A.. A.. ..G A.. ... ... ACC G.. Pinus .CA ..T ..A .TA ... ... C.A ..A G.. ... GC. T.. A.. ..T .CT ... ATC ... C.. ... ..G A.T ... ..C .C. ... Acorus ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ..C GC. ... ... ..T .TT ... ..T ... C.. ... ... ... G.. ... ..C ... Typha ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ..C GC. ... ... ..T ..T ... .TT ... C.. ... ... ..G G.. ... ..C ... Phalaenopsis ... ..T ... ..T ... ... C.A ... ... ..C GC. ... ... ..T ..T ... .TT T.. C.. ... ... A.. G.. ... T.C ... Yucca ... ..T ..T ... ... ... ..A ... ... ..C GC. ... ... ..T ..T ... .TT ... C.. ... ... ... ..G ... ..C ... Saccharum ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ..G GC. ... ... ..T ..T .C. .TT T.. C.. ... ..A ... G.. ... ..C ... Zea ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ..G GC. ... ... ..T ..T .C. .TT T.. C.. ... ..A ... G.. ... ..C ... Oryza ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ..G GC. ... ... ..T ..T .C. .TT T.. C.. ... ..A ..G G.. ... ... ... Triticum ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ..G GC. ... ... ..T ..T .C. .TT T.. C.. ... ..A ..G G.. ... ..C ... agrostis ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ..G GC. ... ... ..T ..T .C. .TT T.. C.. A.. ..A A.G G.. ... ..C ... Sorghum ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ..G GC. ... ... ..T ..T .C. .TT T.. C.. ... ..A ... G.. ... ..C ... Barley ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ..G GC. ... ... ..T ..T .C. .TT T.. C.. ... ..A ..G G.. ... ..C ... Nicotiana CTT AAC TCT TGG GCT CAG GAA TTC CTA TAT AAC TTA AGT GAC ACA GTA AAA GCT TTT TCT ATT CTT TTA TTA ACT GAT Grape ... ... ... ... AT. ... C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ..G .G. ... ... C.. G.. .G. ..G Cucumis ... ... ... ... .T. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... .T. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ..G .G. C.. ... C.. G.. ... ..G Spinacia ... ..T ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... G.. ..C ... Arabidopsis ..G ..T ... ... .T. ..A ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... A.T ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Cotton ... ... ... ... .T. ..A ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... Citrus ... ... ... ... .T. ..A ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... A.. ... ..C ... ..G ... ... ..C G.. ... ... Medicago ... ... ... ... .T. ..A ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... A.. ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... ... Soybean A.. ... ... .T. .T. .GA ... ..T A.. ... ..T ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... Lotus ... ... ... ... .T. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... Oenothera ... ... ... ... ATG ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... Ranunculus T.A ..T ... ... .T. .GT ... ..T A.. ... ... ... ... ..T ... A.. ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ..T ... ... .T. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ..G ... ... ..G ... ... ... G.. ... ... Drimys T.G ..T ... ... .T. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Piper G.G ..T ... ... AT. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... A.. ..G ... ... ... ... ... ... G.. ..G ..C Liriodendron ... ..T ... ... .T. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ..T ... ... .T. ..A ... ... A.. ... ... ... ..C ... ..G A.. ... ..C C.. ... ... ... ... ... ..C ..C Nuphar ... ..T ... ... .T. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... Nymphaea ... ..T ... ... .T. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... A.. ... ... ... ..C ... ..C ... ... ..C ... Amborella ... ..T ... ... .T. ... ... ... T.C ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... C.. ..C ... Ginkgo ..C ..T ... ... ATC ..A ... ..A T.C ... .G. C.G ..C ..T ..G A.G ... ... ... ... ... A.. .C. G.C ..C ... Pinus A.C ..T ... ... ATC ..A ... ... T.C ... .GT C.G ..C ..T ... A.G ... ... ... CTA ... ... ... GC. ..C ... Acorus ... ..T ... ... .T. ... ... ..T ..T ... ... ... ..C ... ... A.. ... ... ... ..G ... ... ... G.T ... ... Typha ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... A.. ... ... ... ..G ... ... ... ..T ... ... Phalaenopsis T.C ..T ... ... AT. ... ... ..T ..C ... ... ... ... ..T ... A.C ... ... ... ..G ... ... ... G.T ... ... Yucca ... ..T ... ... .T. ... ... ... T.C ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ..G ... ... ... G.T ... ... Saccharum T.G ..T ... ... .T. ... ... ..T T.C ... ... ... .A. ..T T.. A.. ... ... ... .T. ... ... ... G.T ... ... Zea T.G ..T ... ... .T. ... ... ..T T.C ... ... ... .A. ..T T.. A.. ... ... ... .T. ... ... ... G.T ... ... Oryza T.G ..T ... ... .T. ... ... ... T.C ... ... ... .A. ... T.. ... ... ... ... .T. ... ... ... G.T ... ... Triticum T.G ..T ... ... .T. ... ... ... T.C ... ..T ... .A. ... T.. A.. ... ... ... .T. ... ... ... G.T ... ... agrostis T.. ..T ... ... .T. ... ... ... T.T ... ... ... .A. ... T.. A.. ... ... ... .T. ... ... ... G.T ... ... Sorghum T.G ..T ... ... .T. ... ... ..T T.C ... ... ... .A. ..T T.. A.. ... ... ... .T. ... ... ... G.T ... ... Barley T.G ..T ... ... .T. ... ... ... T.C ... ..T ... .A. ... T.. A.. ... ... ... .T. ... ... ... G.T ... ... Nicotiana TTA TGT ATC GGA TTC CAT TCA CCC CAC GGT TGG GAA TTA ATG ATT GGC TCT ATC TAT AAA GAT TTT GGA TTT GTT CAT Grape ... ... ... ... ... ..C ..G ... ..T ... ... ... C.G ... ... ... ... G.. ..C ... ... ... ... ... .C. ... Tomato ..T .T. C.. ... .AT ... ... ... .CA ... ... ... ..C G.T ..A C.. ... ... ... ..C ..G G.. ... G.. ... GCG Cucumis ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ... ... C.. ... ... ... .A. G.. ..C ... ... ... ... ... .C. ..C Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ... ... C.. ... ... ... .A. G.. ..C ... ... ... ... ... .C. ..C Panax ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ... ... C.. ..T ... ... ... G.. ..C ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ..T .T. C.. ... .AT ... ... ... .CA ... ... ... ..C GCT ..A C.. ... ... ... ..C ..G G.. ... G.. ... GCG Spinacia ... ... ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... C.. C.A ... .AA ... ... ..C ... ... ... ... ... .CC G.. Arabidopsis ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... ... C.. ... ... ..T .A. ..T ..C ... ... ... ..G ... .C. ... Cotton ... ... ..A ... ..T ... ..G ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... .C. ... Citrus ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... C.. C.. ... ... .A. G.. ..C ..C ..C ... ..G C.. .C. ... Medicago ... ... ..A ... ... ... ... A.T ..T ... ... ... C.. ..C ... ..G ... G.. ... ... ... ... ... ... AC. ..G Soybean ... ... ..A ... ... ... ... A.. ..T ... ... ... C.. G.. ... ..T .TC G.. ... ... ... ... ... ... .C. ..A Lotus ... ... ..A ..G ... ... ..G A.T ..T ... ... ... C.. C.. ... ..G ..C G.. ... ... ... ... ... ... A.. ..G Oenothera ..T ... ... ... ... ..C ..G ... ..T ... ... ... C.. ... ... .CT .A. G.. ..C ... ... ... ... ... .C. ..G Ranunculus ... ... ..T ... ... ..C ..G ..T ..T ... ... ... C.. ... ..C ..T ... G.. ..C ..G ... ... ... ... TC. ... Calycanthus ... ... ... ... ... ..C ... ... .GT ... ... ... C.. ... ... ..T ..G G.. ..C ... ... ... ... ... .C. ... Drimys ... ... ... ... ... ..C ..G ..T TTT ... ... ... C.. ... ... ... ..G G.. ..C ... ... ... ... ... .CC ... Piper ... ... ..T ... ... ..C ... ... ..T ... ... ..G C.. ... ... ..T ..G G.. ..C ... ... ... ... ... .C. ... Liriodendron ... ... ... ... ... ..C ..G ... ..T ... ... ... C.. ... ... ..T ..G G.. ..C ... ... ... ... ... .C. ... Populus ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... A.. ... T.. ..C ..G ... ... ... ... .C. ... Nuphar ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... .C. ... ... C.. ... ... ..T ..G T.. ..C ... ... ... ... ... ... ..G Nymphaea ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... .C. ... ... C.. ... ... ..T ..G T.. ..C ... ... ... ... ... ... ..G Amborella .C. ... ... ... ..T ... ..G ... ..T ... ... ... C.C ... ... ..T ..G G.. ..C ... ... ... ... ... AG. ... Ginkgo C.. ... ..T ..G ..T ... ..G A.T ..T ... ... ... C.G ... ..C .AT ..G ... .C. G.. A.. .A. ... ... ..C ... Pinus C.. ... ..T ..G ..T ... ... ... ..T ... ... ... C.G ... ..C .AT ..G ... .CC G.. AG. .A. ... ... .CC ... Acorus ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ..T ..G G.. ..C ..T ... ... ... ..A .C. ... Typha ... ..G ..T ... ..T ..C ..G A.. ..T ... ... ... C.C ..A ..A ..T ..G G.. ..C ..C ... ... ... ..G .C. ... Phalaenopsis ... ..G ... ... ..T ..C ..G A.. ..T ... ... ... C.. ... ... ..T ..G ... ..C ..T ... ... ... ..G .C. ..G Yucca ... ..G ... ... ..T ..C ..G A.. ... ... ... ... C.. ... ... ..T ..G ... ..C ..T ... ... ... ..G .C. ... Saccharum ..T .T. G.T ... ..T ..C ..C A.. .G. ... ... ... C.. C.A ... C.T .GG G.. ..C ..C A.. C.. ... .GG .C. .C. Zea ..T .T. G.T ... ..T ..C ..T A.. .G. ... ... ... C.. C.A ... C.T .GG G.. ..C ..C A.. C.. ... .GG .C. .C. Oryza ..T .T. G.T ... ..T ..C ..C A.. .G. ... ... ... C.. C.A ... C.T .GG G.. ... ..C ... C.. ... .GG ... .C. Triticum ..T .T. G.T ... ..T ..C ..C A.. .GT ... ... ... C.. G.A ... C.T .GG G.. ..C ..C ... ... ... .GG .C. .C. agrostis ..T .T. G.T ... ..T ..C ..C A.. .GG ... ... ... C.. G.A ... C.T .GG G.. ..C ..C ... C.. ... .GG .C. .C. Sorghum ..T .T. G.T ... ..T ..C ..C A.. .G. ... ... ... C.. C.A ... C.T .GG G.. ..C ..C A.. C.. ... .GG .C. .C. Barley ..T .T. G.T ... ..T ..C ..C A.. .GT ... ... ... C.. G.A ... C.T .GG G.. ... ..C ... ... ... .GG .C. .C. Nicotiana AAT GAT CAA ATC ATA TCT GGT CTT GTT TCC ACC TTT CCA GTC ATT CTC GAT ACA ATT TTT AAA TAT TGG ATT TTC CGT Grape ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ..G Tomato ... ..G ... .CT ... A.. AT. ... ... .G. .T. C.. ... ..A ... T.T ... ... TG. ... ... ... ... C.. ... ... Cucumis ..C ... ... ..T ... ..G ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C Eucalyptus ..C ... ... ..T ... ..G ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C Panax ... ... ... ..T T.. ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..A ... ... C.. ... ... .T. ... ... ... ... Atropa ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ..G ... .CT ... A.. AT. ... ... .G. .T. C.. ... ..A ... T.T ... ... TG. ... ... ... ... C.. ... ... Spinacia ..C ... ... ..T ... ..G A.. ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... Arabidopsis T.. ..G ... ..T T.. ... ... ..A ... ..T ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Cotton ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... Citrus ... ... A.T GAT ..T AT. CTA TC. ... CTT GTT .CC A.T T.T CCA G.. .T. CT. GA. ACA TTT .T. AAA TA. .GG .T. Medicago ... A.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... T.A ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... Soybean ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... T.A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... Lotus ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ..T ... ... ..G ... T.A ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... Oenothera ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... Ranunculus ... A.. ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... .TA ..C ... ... Calycanthus ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... .A. Drimys ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... .A. Piper ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ..C ..T .A. Liriodendron ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... .A. Populus ... ... ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Nuphar ... ... A.. ..T ... ..C ... ..C ... ..T ..T ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ..C ..T .A. Nymphaea ... ..G A.. ..T ... ..C ... ..C ... ..T ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ..C ..T .A. Amborella ..C ... ... ..T ... ..C ... ..C ... ... ..T ... ..G ..T ... ..A ... ..T ... ..G ... ... ... ..C ... .A. Ginkgo ..C ..A ... ..A ... ... ... ... ... C.A ..T ... ... ... ..C TCA ... ..G ... ..C ... ... ... ..C ... ... Pinus ... ..A .G. ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ..C T.A ... ..G ... C.. ... ... ... ..C ... ... Acorus ..C ..A ... ..T ... ... ..G ... ... ... ..T ... ... ..T ... ..A ... ..G ... G.G ... ... ... ..C ... .A. Typha ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ..A ... ... ... G.G ... ... ... ..C ... .A. Phalaenopsis ... ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ..A ... ... ... G.G ... ... ... ..C ... .A. Yucca ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ..A ... ... ... G.G ... ... ... ..C ... ... Saccharum ..C ..G .T. ..T T.C A.. AT. T.. ... .GT .GT ... ..T ..G ... ..A ..C ..G TG. ..G ... .T. ... G.C ..T TT. Zea ..C ..G .T. ..T T.C A.. AT. T.. ... .GT .GT ... ..T ..G ... ..A ..C ..G TG. ..G ... .T. ... G.C ..T TT. Oryza ..C ..G .T. ..T T.C A.. AT. T.. ... .GT .GT ... ..T ..G ... ..A ... ... TG. ..G ... .T. ... G.C ..T TT. Triticum ..C ..G .TT ..T T.C A.. AT. T.. ... .GT .GT ... ... ..A ... ..A ... ... TG. ..G ... .T. ... G.C ..T TT. agrostis ... ..G .T. ..T T.C A.. AT. T.. ... .GT .GT ... ... ..A ... ..A ... ... TG. ..G ... .T. ... G.C ..T TT. Sorghum ..C ..G .T. ..T T.C A.. AT. T.. ... .GT .GT ... ..T ..G ... ..A ..C ..G TG. ..G ... .T. ... G.C ..T TT. Barley ... ..G .TT ..T T.C A.. AT. T.. ... .GT .GT ... ... ..A ... ..A ... ... TG. ..G ... .T. ... G.C ..T TT. Nicotiana TAT TTA AAT CGT CTG TCT CCG TCA CTT GTA GTT ATT TAT CAT TCA ATG AAT GAC --- --- ATG CCT ATT GGT GTT CCA Grape ... ... ... ... G.A ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... .C. A.. ... ... ... ... A.. T.. C.G C.. ... G.. ... ..A .C. ..A --- --- ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... A.A ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... A.A ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ... G.T ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T --- --- ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... Potato ... ... .C. A.. ... ... ... ... A.. T.. C.G ... ... G.. ... ..A .C. ..A --- --- ... ... ... ... ... ... Spinacia .C. ... ... ... G.A ..C ..A ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... G.A ... ... ... ... ... ..G ... ... ... G.. ..A ..C ... --- --- ... ... ... ..C ... ... Cotton ... ... ... ... G.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... Citrus .T. .CT T.. TTA AAT CG. GTA ..T .CG TC. C.. G.A GTG AT. .AT CAT TCA ATG ACT GAG ... ... ... ... ... ... Medicago ... ... ... ... G.A ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ..A ... ... ... ... Soybean ... ... ... ..C G.A ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T --- --- ... ..C ... ... ... ... Lotus ... ... ... ... G.A ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ..C ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ... G.A ..A ..C ... ... ... ..G ... ... G.. ... ... ... ... --- --- ... ..G ... ... A.G ..T Ranunculus ... ... ... ... G.A ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..A ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... G.A ..C ..T ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A --- --- ... ..C ... ... ... ... Drimys ... ... ... G.. G.A ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A --- --- ... ..C ... ... ... ... Piper ... ... ... ... G.A ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A --- --- ... ..C ... ... ... ... Liriodendron ... ... ... ... G.A ... ..T ... ... ... ..G G.. ... ... ... ... ... ..A --- --- ... ..C ... ... ... ... Populus ... ... ... ... G.A ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... Nuphar ... ... ... ... G.A ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... ... C.. ... ..G --- --- ... ..C ... ... ... ... Nymphaea ... ... ..C ... G.A ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... ... C.. ... ..G --- --- ... ..C ... ... ... ... Amborella C.. ... ... ... A.A ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A --- --- ... ..C G.. ... ... ... Ginkgo C.. ..C ... ... A.A ..C ..T C.. ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..A --- --- ... ..C ... ... ... ... Pinus CG. ..C ... ... A.A ... ..T ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..A --- --- ... ..C G.. ... ... ... Acorus ... ... ... ... G.C ... ..T ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ..C ... ... ... ... Typha ... ... ..C ... G.A ... ..T ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A --- --- ... ..C ... ... ... ... Phalaenopsis .T. ... ... ... G.A ... ..T ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A --- --- ... ..C ... ... ... ... Yucca .T. ... ... ..C G.A ... ..T ..G ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A --- --- ... ... ... ... ... ... Saccharum .G. ... ..C ... ..A ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T .G. ..A GCA --- ... ..C ... ... ... ... Zea .G. ... ..C ... ..A ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T .G. ..A GCA --- ... ..C ... ... ... ... Oryza .G. ... ..C ..C ..A ... ..T ..G ... ... ..C ... ... ... ... ..T .G. ..A GCA --- ... ..C ... ... ... ... Triticum .G. ... ..C ... ..A ... ..T ..G ... ... ..C ... ... ... ... ..T .G. ..A GCA --- ... ..C ... ... ... ... agrostis .G. ... ..C ..C ..A ... ..T ..G ... ... ..C ... ... ... ... ..T .G. ..A GCA --- ... ..C ... ... ... ... Sorghum .G. ... ..C ... ..A ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T .G. ..A GCA --- ... ..C ... ... ... ... Barley .G. ... ..C ... ..A ... ..T ..G ... ... ..C ... ... ... ... ..T .G. ..A GCA --- ... ..C ... ... ... ... Nicotiana AAA GTC CCT TTC CGA AGT CCT GGA GAG GAA --- --- --- --- --- --- GAT GCA TCT TGG GTT GAC GTA TAC --- AAC Grape ... ..G ... ..T ... .A. ... ... ... ..C --- --- --- --- --- --- ... AT. ... ... A.. ... ... ... --- ... Tomato .G. ..T GTA ... ... .A. ... ... ..T CC. --- --- --- --- --- --- AT. T.. ... ... ... ... A.. ... --- ... Cucumis ... ..A ..C ..T ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ..C ... ... ... ... ... A.. --- --- Eucalyptus ... ..A ..C ..T ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ..C ... ... ... ... ... A.. --- --- Panax ... ..A ..C ..T ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... .A. ... ... ... A.. ... --- ... Atropa ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... Potato ... ..T .TA ... ... .A. ... ... ..T CC. --- --- --- --- --- --- AT. T.. ... ... ... ... ... ... --- ... Spinacia ... ..T ..C ..T ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... Arabidopsis ... ..A ... ..T ... ... ... ... ..A .G. --- --- --- --- --- --- ... A.. ... ... ... ... A.. ... --- ... Cotton ... ..T ... ..T ... .A. ..G ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... GT. ... ... ... ... AT. --- ... Citrus ... ..A ... .AT ... ... ..C ..G ..C A.G --- --- --- --- --- --- C.. C.. ... ... ... ... A.. A.. --- --- Medicago ... ..A ..C ..T .A. CT. ... .A. ..A ..T --- --- --- --- --- --- ..G ... ... ... ... ..T T.. ... --- ..T Soybean .G. ..A ..C ..T ... ..C ... ..G ..A ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ..T A.. ... --- ..T Lotus ... ..G ..C ..T ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... A.. ... --- ..T Oenothera ... A.. ... ... .TG CT. GAC ... ..C ... GAA GAT GAA GAG GAA GAC ..C ..G A.. ... ... ... C.G ..T --- ... Ranunculus ... ..A ... ..T ..G .T. ..C ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... GT. ... ... ... ... A.. --- --- Calycanthus ... ..A ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ..C ..G GT. ... ... ... ... ... --- ... Drimys ... ..A ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... GT. ... ... ... ... ... --- ... Piper ... ..A ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ..C ..G G.. ... ... ... ... ... --- ... Liriodendron ... ..A ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... AT. ... ... ... ... A.. --- --- Populus ... ... ... ..T ... .A. ..C ... ... ..T --- --- --- --- --- --- AG. T.. AA. ... A.. ... ... ... --- ... Nuphar ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... GT. ... ... ... A.. A.. --- --- Nymphaea ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... GT. ... ... ... A.. ... --- ... Amborella ... ..A ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ..C ... A.. ... ... ... A.. ... --- ... Ginkgo ... ..T ... ..T ..G .TC ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... GT. ... ..C ... ... A.. --- --- Pinus ... ..G ... ... ... GCC ... ... ..T ... --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ..C ... T.. ... --- ... Acorus ... ..A ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... G.. ... ... ... A.. A.. --- --- Typha ... ..A ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ..G GT. ... ... ... ... A.. --- --- Phalaenopsis ... ..G ... ..T ..G .A. ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... GT. ... ... ... ... ... --- ... Yucca ... ..A ... ..T ..G ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- ... ... GT. ... ... ... ... A.. --- --- Saccharum ... ..A ... .A. ..G .T. ..C ... ..T ... --- --- --- --- --- --- ..A ..G A.. ... ... ... T.. ... --- ..T Zea ... ..A ... .A. ..G .T. ..C ... ..T ... --- --- --- --- --- --- ..A ..G A.. ... ... ... T.. ... --- ..T Oryza ... ..A ... .A. ..G .T. ..C ... ..T ... --- --- --- --- --- --- ..A ..G A.. ... ... ... T.. ... --- ..T Triticum ... ..A ... .A. ..G .T. ... ... ..T ... --- --- --- --- --- --- ..A ..G A.. ... ... ... T.. ... --- ..T agrostis ... ..A ... .A. ..G .T. ..C ... ..T ... --- --- --- --- --- --- ..A ..G A.. ... ... ... T.. ... --- ..T Sorghum ... ..A ... .A. ..G .T. ..C ... ..T ... --- --- --- --- --- --- ..A ..G A.. ... ... ... T.. ... --- ..T Barley ... ..A ... .A. ..G .T. ... ... ..T ... --- --- --- --- --- --- ..A ..G A.. ... ... ... T.. ... --- ..T Nicotiana CGA CTT TAT CGA GAA AGA --- TTA CTT TTT TTA GGC CAA GAG GTT GAT AGC GAG ATT TCG AAT CAA CTT ATT GGT CTT Grape ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... .G. A.. .G. .C. ... C.. ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ... ... ... ... ... C.. --- ... ... ... ... ... ... CC. ... .C. ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... .G. A.. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... .G. A.. AG. .C. ..T C.. ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... ... ... ... ... ... --- ... T.. ... ... ... ... ... ... ... .C. ..A ..C ... ... ... ... ... A.. ... Cotton ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ..T ... AT. ... ..G ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... A.. Medicago ... ... .T. .A. ... ... --- ... ... ... ... ..T ... ... ..C A.C .CT ..A ..A ..A ... ... ... G.. ... ..A Soybean ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T ..A ..A ... ... ... ..A ... A.. ... Lotus ... ... ... A.. ... ... --- C.G ... ... ... ... ..G ..A ... A.. ..T ..A ..A ..A ... ... ... ... ... ... Oenothera GT. ... ... ... ACC ... --- .CC A.C ... ... ... G.C .CA A.. C.C TT. ... G.C G.. ... ..C A.. GC. ..G ..G Ranunculus ... ... C.. ... ... ... --- ... ... ... ... ..A ... .G. ... ... ... ... ..C ..A ..C ... ... ..C ... ..G Calycanthus ... ... C.. ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... G.. ... ..C Drimys ... ... C.. ... ... ... --- ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... G.. ... ..C Piper ... ... C.. ... ... ... --- ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..T ... ..C ... ... ... A.. G.. ... T.G Liriodendron ... ... ... ... ... ... TTA C.T T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... G.. ... ..C Populus ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ..T ... ..T A.. ... ..T ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... Nuphar ... ... C.. ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... .GT ... ... ... ... ..C ... ... ... ... G.. ... ..C Nymphaea ... ... C.. ... ... ... --- ... ... ... C.. ... ... .GC ... ... ... ... ..C ... ... ... ... G.. ... ..C Amborella ... ... C.. ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ..A G.T ... ..A ... ... ... A.. G.. ... ..C Ginkgo ... ... C.. ..G ..G ... --- ... ... ... C.G ..T ..G C.. ..C ... GA. ... ..C G.. ... ... ..C ... ... A.C Pinus ... ... ... ... ..G ... --- ... ... ... ..G .CT ..G ..T A.C A.. CA. ... ... G.A ... ... ..C ..G ... ..C Acorus ... ... C.. ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ..A ..C ... ... ... ... G.. ... ..C Typha ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... G.. ... ..C Phalaenopsis ... ... C.. ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.. G.. ... ..C Yucca ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... G.. ... ..C Saccharum GTT A.G ... ... ... ..G --- AC. ... ... ... ..T ... ... A.. CG. T.. ... ..C A.. ... ..T A.. .CA ... ..G Zea GTT A.G ... ... ... ..G --- AC. ... ... ... ..T ... ... A.. CG. T.. ... ..C A.A ... ..T A.. .CA ... ..G Oryza GTT A.G ... ... ... ..G --- AC. ... ... ... ..T ... ... A.. CG. T.. ... G.C A.. ... ..T A.. .CA ... ..C Triticum GTT A.G ... ... ... ..G --- AC. ... ... ... ..T ... ... A.. CG. T.. ... ..C A.. ... ..T A.. .CA ... ..C agrostis GTT A.G ... ... ... ..G --- AC. ... ... ... ..T ... ... A.. CG. T.. ... ..C A.. ... ..T A.. .CA ... ..C Sorghum GTT A.G ... ... ... ..G --- AC. ... ... ... ..T ... ... A.. CG. T.. ... ..C A.. ... ..T A.. .CA ... ..G Barley GTT A.G ... ... ... ..G --- AC. ... ... ... ..T ... ... A.. CG. T.. ... ..C A.. ... ..T A.. .CA ... ..C Nicotiana ATG GTA TAT CTC AGT ATC GAG GAT GAG ACC AAA GAT CTG TAT TTG TTT ATA AAC TCT CCT GGG GGC TGG GTA ATA CCT Grape ... A.. ... ... ... ..A ... ... ..A .A. ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... ..C ..A ... ... C.. ..C Tomato ... T.G ... ... ... ..G ... ... ... .A. ... ..C ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ..A ... A.. ..T .A. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..C ..C Eucalyptus ... ... ... ... ... ..A ... A.. ..T .A. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..C ..C Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..A ... ... C.C ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... A.G ... ... ... ..G ... ... ... .A. ... ..G ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... T.. ... ... ... ... ..T ... ... ..C ..A ... ... ... ..A Arabidopsis ... A.. ... ... ... ..A ..A A.G ..T ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A ... ... ... T.. Cotton ... ... ... ... ... ..A ... A.. ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ..C Citrus ... ... ... ... ... ..A ... A.C ... ... ..G ... T.. ... ..A ... ..C ... ... ... ..C ..A ... ... ... ..C Medicago ... ... ... ... ... T.A ... ..C A.. ... .G. ... T.. ... ... ... ... ..T ... ..G ..C ..A GA. ... ... T.. Soybean ... ... ... ..T ... ..A ..A ..A ... .AT ... ... T.. ... C.. ... ... ..T ... ..G ... ..G ... ... ... ..C Lotus ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T .AG ... ... T.. ... C.. ... ..T ..T ... ..G ..A ..A ... ... ..C ..C Oenothera ... A.. .T. ... .CC ..A C.. ... .C. ..T C.. A.. ..T ... ..C ... ... ... ... ..C ..C ..G CT. .C. G.. G.C Ranunculus ... ... ... ... ... C.A ... ..C ..A ... CGG ... ..T .T. ... ... ... ... ..G ..C ..C ..G ... ... G.C ..C Calycanthus ... ... ... ... .CC ..A ... ... ..T ... ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..C ..A Drimys ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... .GG ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ..A Piper ... ... ... ... ... ..A ... ... .GT ..T CGG ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..G ... ... ..C ..G Liriodendron ... ... ... ... ..C ..A ... ... ..T ... .GG ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ..A Populus ... ... ... ... ... .CA ..A AG. ... .T. ... ... T.. ... ... ... ..C ... ... ... ..C ..A ... ... ... ..C Nuphar ... ... ... ... ... ..G ..A ... A.T ... .GG ... ..C ... ... ... ... ..T ... ..C ..C ..A ... ... ... ..G Nymphaea ... ... ... ... ... ..G ..A ... A.T ... .GG ... ..C ... ... ... ... ..T ... ..C ..C ..A ... ... ... ..G Amborella ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... .GG ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ... ... ... ..A Ginkgo ... A.G ... .CG .A. GGA ..A ... ... .AT ... ... A.A ... ACA .A. ..T ..T ... ..C ..T ..A ACA ... ... ..G Pinus ... ... ... T.G ... GCA ..A ... TCA .AT ... ... A.T .TC .CA ... ..C ... .G. ..C ..T ..A .CA ... ... ..A Acorus ... ... ... ... ... ..A ... ... A.. ... .GG ... T.T .T. ... ... ... ..T ... ..C ..C ..A ... ... ..T ..G Typha ... ... ... ... ... ..A ..A ... ..T ..T .GG ... ..T ... ... ... ... ..T ... ..C ..C ..A ... ... ... ..A Phalaenopsis ... ... ... ... ..C ..A ..A ... ..T ..T .GG ... ..T ... ... ... ... ..T ... ..A ..T ..A ... ... ... ..A Yucca ... ... ... ... ... ..A ..A ... ..T ..T ..G ... ..T ... ... ... ... ... ..C ..C ..C ..A ... ... ... ..A Saccharum ... ... ... ... ... ..A ..A ... .GA .AT .GC ... A.T .T. ... ... ... ... ..C ... ..C ..G ... C.. ..C T.A Zea ... ... ... ... ... ..A ..A ... .GA .AT .GC ... A.T .T. ... ... ... ..T ..C .T. ..C ..T ... C.. ..C T.A Oryza ... ... ... ... ... ..A ..A ... .GA .GT .GC ... A.T .T. ... ... ... ... ..C ..C ..C ..T ... T.. ..C T.A Triticum ... ... ... ..G ... ..A ..A ... .GA .TT .GT ... A.T .T. ... ... ... ... ..C ..C ..C ..G ... C.. ..C T.A agrostis ... ... ... ... ... ..A ..A ... .GA .TT .GT ..C A.T .T. ..A ... ... ... ..C ..C ..C ..G ... C.. ..C T.A Sorghum ... ... ... ... ... ..A ..A ... .GA .AT .GC ... A.T .T. ... ... ... ... ..C ... ..C ..G ... C.. ..C T.A Barley ... ... ... ..G ... ..A ..A ... .GA .TT .GT ... A.T .T. ... ... ... ... ..C ..A ..C ..T ... C.. ..C T.A Nicotiana GGG GTG GCT ATT TAT GAT ACT ATG CAA TTT GTG CGA CCA GAT GTC CAT ACA ATA TGC ATG GGA TTA GCC GCT TCA ATG Grape ..A A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ..G ..A ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... Tomato ... A.C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... C.A ... ... ..T ... ... ... Cucumis ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax ..A A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... Atropa ... A.C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... A.C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ... ... Spinacia ..A ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ... ... Arabidopsis ..A A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..A Cotton ..A ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..G ..T ... ... ... Citrus ... A.A ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ..G ... ... ... ... ... ..G ... ..C ..C ... Medicago ..A A.. ... ..A .T. ... .T. ... ... G.. ..A GA. G.. ..A ..A ... ... G.. ... G.A ... C.. ... ... ... ... Soybean ..A A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .A. ... ... ..A ..G ... G.. ..T ... ... ... ... ... ... ... Lotus ..A A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .A. ..G ... ..A ..G ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... Oenothera ..A T.A CTC ... ... ... G.. ... ... .AC ..A GC. ..T CC. ..G T.. ... C.. G.. C.. ..G G.. CT. ..C ... ... Ranunculus ..A ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Calycanthus ..A A.A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... TC. ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys ..A A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Piper ..A A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... TC. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... Liriodendron ..A A.A T.. ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Populus ..A A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar ..A A.A ... ... ... ... G.. ... ... A.. ..T .C. ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... Nymphaea ..A A.A ... ... ... ... G.. ... ... A.. ..T .C. ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Amborella ..A A.A ... ... ... ..C G.. ... ... ... ..A .CG ... ..C ..A ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo ..A A.C T.. C.. ... ... G.. ... ... ... ..A GT. ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ..G ... Pinus ... ..A .G. C.. .TC ... .TG ... ... GCA A.A GT. ... ... ..A ... ... ... ... ... ..G G.. ..T ... ... ... Acorus ..A A.A .G. C.. ... ..C ... ... ... ... ... .C. ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... Typha ..A A.A ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... .C. ..T ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Phalaenopsis ..A A.A ..C ... ... ... ... ... ... ... ... TT. ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... Yucca ..A A.A ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T TCG ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Saccharum ..A A.. ..G ... .T. ... ..G ... ... ACG ... AC. ..T ... A.A T.. ... ... ... C.C ... A.. ... ..G ..C ... Zea ..A A.. ..G ... .T. ... ..G ... ... ACG ... AC. ..T ... A.A T.. ... ... ... C.C ... A.. ... ..G ..C ... Oryza ..A A.. ..G ... .T. ... ..G ... ... ACG ..A AC. ... A.. A.A T.. ... .C. ... C.A ... A.. ... ..G ..C ... Triticum ..A A.. ... ... .T. ... ..G ... ... ACG ... AC. ... ... A.A T.. ... ... ... C.C ... A.. ... ..C ..C ... agrostis ..A A.. ... ... .T. ... ..G ... ... ACG ... AC. ... ... A.A T.. ... ... ... C.T ... G.. ... ..G ..C ... Sorghum ..A A.. ..G ... .T. ... ..G ... ... ACG ... AC. ..T ... A.A T.. ... ... ... C.C ... A.. ... ..G ..C ... Barley ..A A.. ... ... .T. ... ..G ... ... ACG ... AC. ... ... A.A T.. ... ... ... C.C ... A.. ... ..G ..C ... Nicotiana GGA TCT TTT ATC CTG GTC GGA GGA GAA ATT ACC AAA CGT CTA GCA TTC CCT CAC GCT --- AGG --- GTA ATG ATC CAT Grape ... ... ... ... ... ... ... ... AC. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... .C. ... ... C.. C.. ... ... ... A.. ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ..A ... Cucumis ... ... ... G.. ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ..A ... Eucalyptus ... ... ... G.. ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ..A ... Panax ... ... ... ... T.. .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ..G ... Potato ... ... ... ... ... .C. ... ... C.. C.. ... ... ... A.. ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ..A ... Spinacia ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ..T ... Arabidopsis .C. ..C ... ... ..A ... ... ... .C. ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ... ... Cotton ... ... ... C.. ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ... ... Citrus ..G ... ... C.. ... .C. .CC ... .C. .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..C ... ... ... Medicago ... ... C.. C.T T.. ... ... ..G ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ... ... Soybean ... ..C ... C.T T.. .CA ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ... ..C Lotus ... ... ... G.T T.. .CA ..C ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ... ... Oenothera .C. ..C ... C.A ... ... ..C ... ... .CG T.. ... ..C ... ATG GG. ... A.. .G. --- ... --- ... ... ..A ... Ranunculus ... ... ..C C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ... ..C Calycanthus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..T ... ... ..C Drimys ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..T ... ... ..C Piper ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- T.. --- ..T ... ... ..C Liriodendron ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..T ... ... ..C Populus ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ... ... ... ... Nuphar ... ... ..C ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- C.. AGG ..T ... ... ..C Nymphaea ... ... ..C ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..T ... ... ..C Amborella ... ... ..C G.. ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..T ... ... ..C Ginkgo ... ... .C. G.. TCA ACT ... ..G ... ... ..T ... ... A.. ... ..A ... ... ... --- ... --- ..T ... ... ..C Pinus ... ... ..C ... ..A A.. ..G ... ... ..G C.T ... ... A.. ... ..A ... ... ... --- ... --- A.T ... ... ..C Acorus ... ... ..C ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..T ... ... ..C Typha ... ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..T ... ..T ..C Phalaenopsis ... ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..T ... ..T ..C Yucca ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... --- ..T ... ..T ..C Saccharum .CC ..C ..C ..T ... C.T ... ... ... CCC ... ..G ... A.. ... ... ... ... ... --- ... --- A.T ... C.T ..C Zea .CC ..C ..C ..T ... C.T ... ... ... CCC ... ..G ... A.. ... ... ... ... ... --- ... --- A.T ... C.T ..C Oryza CCG ..C ..C ..T ... C.T ... ... ... CCC ... ..G ... A.. ... ... ..C ... ..G --- ... --- A.T ... C.T ..C Triticum .C. ..C ..C ..T ... C.T ... ... ... CCC ... ..G ... A.. ... ... ... ... ..G --- ... --- A.T ... C.T ..C agrostis .CG ..C ..C G.T ..A A.T ... ... ... CCC ... ..G ... A.. ... ... ... ... ..G --- ... --- A.T ... C.T ..C Sorghum .CC ..C ..C ..T ... C.T ... ... ... CCC ... ..G ... A.. ... ... ... ... ... --- ... --- A.T ... C.T ..C Barley .CG ..C ..C ..T ... C.T ... ... ... CCC G.. ..G ... A.. ... ... ... ... ..G --- ... --- A.T ... C.T ..C Nicotiana CAA CCT GCT AGT TCT TTT --- TAT GAG GCA CAA ACA GGC GAA TTT GTC CTG GAA GCG GAA GAA CTG CTG AAA CTG CGT Grape ... ..G ... GCC G.. ... --- ... ... ... ... G.C ..A ... ... ... A.. ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C Tomato G.. ... TA. ... GG. ... --- ... AT. ... ... GT. ... ... ... ... ... ... ... AT. ... A.. GC. ... ... ... Cucumis ... ... ..G ... ... ... --- ... ... ... ... ..G ..A ... ... A.. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C Eucalyptus ... ... ..G ... ... ... --- ... ... ... ... ..G ..A ... ... A.. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C Panax ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... GG. .A. --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... Potato G.. ... TA. ... G.. ... --- ... AT. ... ... GT. ... ... ... ... A.. ... ... .T. ... ... A.. ... ... ... Spinacia ... ..C ..A ..C ... ..C --- ... ..A ..C ... ..G ..A ..G ... C.. ... ... ... ... ... ..T T.. ... T.. ..C Arabidopsis ... ..C ... ... ..G ... --- ... ... ... ... ..G ..A ... ... A.. T.. ... ... ... ... T.A ..T ... ..T ..C Cotton ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ..A ... ... A.. ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ..C Citrus ... ... AT. G.C G.. ... --- ... .G. ... ... ..G ..A ... ... A.. ... ..T A.. ... ... ..A ... .G. ... ..C Medicago ... ... ... .C. ... ..G --- ... ... .G. ... GT. ..A ... .G. A.G ... ... ... ..G ... T.A ... ... A.. ..A Soybean ... ..C ... ... ... ... --- ... ... ... ... ..G ..A ... ... A.. ... ... ... ... ..G ..A ... ... A.. ... Lotus ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ..G ..A ... ... A.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ..C Oenothera ..G ..C .AG TCC GA. .A. --- AC. C.C AA. G.C CA. TCG CT. GAG ..A .AA CTG .AC TC. .GG GAA G.A G.. GAC AT. Ranunculus ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ..C ..C Calycanthus ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... .CC ... ..A ... ... A.. ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ..C Drimys ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... .CC ... ..A ... ... A.. ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ..C Piper ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... .CT ... ..A ... ... A.. ... ... ... ... ... T.A ... ... ..C ..C Liriodendron ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... .CC ... ..A ... ... A.. ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C ..C Populus ... ... TT. GC. G.. ... --- ... ..A ... ... .T. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C Nuphar ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... G.. ..A ... ... A.. ... ... ..A ... ... ... T.. ... ..T ..C Nymphaea ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... G.. ..A ... ... A.. ... ... ... ... ... ... T.. ... ..T ..C Amborella ... ..C ... ... ... ... --- ... ... ... .C. G.. ..A ... ... A.. ... ... ... .GG ..G ..A ... ... ..T ..C Ginkgo ... ... ... ... ... .A. --- ... ..C .G. ... G.. ..A ... .G. A.. A.. ... ..A ... ..G G.A T.. ... ..T ..C Pinus ... ... ... ... ..C .A. --- ... ..C .G. TCG G.T .CA ..T ... CAT AAC ... T.. A.. C.C G.A AC. .TG ..T ..C Acorus ... ... ..C ... ... ... --- ... ... ... ... G.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..A T.. ... ..T ..C Typha ... ... ... ... ... ... --- ... ..A ... ... G.. ..G ... ... A.. ... ... ... ... ... T.A ... ... ..T ..C Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... --- ..C ... ... ... G.. A.G ..T ... A.. ... ... ..A ... ... ..A T.. ..G ..T ..C Yucca ..G ... ... ... ... ... --- ... ... ..G ... G.. ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ..C Saccharum ... ... ... ... G.. .A. --- ... CG. ... AGG ... CCA ... ... T.A ..A ... .T. ... ..G T.A .AC ... G.T ..C Zea ... ... ... ... G.. .A. --- ... CG. ... AGG ... CCA ... ... T.A ..A ... .T. ... ..G T.A .AC ... G.T ..C Oryza ... ... ... ... G.. .A. --- ... CG. ... AG. ... CCA ... ... T.A ..A ... .T. ... ..G T.A .AC ... G.T ..C Triticum ... ... ... ... G.. .A. --- ... CG. ... AGG ... CCA ... ... T.A ..A ... .TA ... ..G T.A .AC ... G.T ..C agrostis ... ... ... ... G.. .A. --- ... CG. ... AGG ... CC. ... ... T.A ..A ... .TA ... ..G T.A .AC ... G.T ..C Sorghum ... ... ... ... G.. .A. --- ... CG. ... AGG ... CCA ... ... T.A ..A ... .T. ... ..G T.A .AC ... G.T ..C Barley ... ... ... ... G.. .A. --- ... CG. ... AGG ... CCA ... ... T.A ..A ... .TA ... ..G T.A .AC ... G.T ..C Nicotiana GAA ACC CTC ACA AGG GTT TAT GTA CAA AGA ACG GGG AAA CCC TTA TGG GTT GTA TCC GAA GAT ATG GAA AGA GAT GTT Grape ... .T. A.. ... .A. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..C C.. ... ..G ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... .C. G.. .A. ... ..C C.. ... G.G ... ... A.. CA. ... ... ... ... ... ... A.. Cucumis ... ... A.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Eucalyptus ... ... A.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Panax ... ... A.. ... ... ... ... ... ... .A. ... ..C ... ... ..T ... ... ..C ..G ... ..C C.. ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... .C. G.. ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... CA. ... ... ... ... ... ... A.. Spinacia ... ... ... ... .A. ... ... .G. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Arabidopsis ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T A.. ... ... A.. ... ... ..C ... ... C.G ... ... Cotton ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Citrus ... .T. ..T ... .T. ... ... ... ... ... T.. ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... AC. Medicago A.. ..T A.. ... .AT A.. ... .C. ... ... ..A ..C ... G.T .CC ... CAG A.. .A. AG. ..C ... ..G C.G ... C.. Soybean ... ..T A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... A.. ... ... ..C ... ... ..G ... ... Lotus ... ..T A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... C.. ... ..A ... ..C ... ... ..G ... ... Oenothera CGC .AA A.G GTC .TA AGG GT. TAT .T. GA. .GA ACA .GG .TA CCC C.. .AG ..T CTA A.C ..C CAT TTG GA. AGA AA. Ranunculus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ..T ..G ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..C ..T ... ... ... A.. ... ... ..C ... ... ..G ... ... Piper ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ..C ..T ... ... ... ... ..T ..G ..C C.. ... ..G ... ..C Liriodendron ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Populus ... .T. ... ... ... ... ... .C. ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ..G ... ... Nuphar ... .TA ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ..G ... ... Nymphaea ... .TA ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ..G ... ... Amborella ... ... A.. ... ..C ... ... ... ... ... ..A ..C ..C ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... Ginkgo ..T .G. A.T ..G .AT ... ... ... ... ... ..A ..C ... ..T ... ... ..C A.T ... ..G ..C ... ... ... ... A.. Pinus ..T TA. A.A ..C ..A TG. ... A.. G.. ... ... .AC C.. ... GG. GA. ..A A.T CAA CGG ..C C.. A.C ... ... ... Acorus ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ..T ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... Typha ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..T ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... Phalaenopsis ... ..T ... ... .AA ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..T ... ... ... A.. ..T ... ... ... ... ..G ... ... Yucca ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..T ... ... ... A.. ... ... ..C ... ... ..G ... ... Saccharum ... .TG A.. ... ... ... ... .C. .T. ... ..A ..C ..G ..T ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... Zea ... .TG A.. ... ... ... ... .C. .T. ... ..A ..C ..G ..T ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... Oryza ... .TG A.. ... ... ... ... .C. .T. ... ..A ..C ..G ..T ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... Triticum ... .TG A.. ... ... ... ... .C. GT. ... ..A ..C ..G ..T ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... agrostis ... .TG A.. ... .A. ... ... .C. .T. ... ..A ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... Sorghum ... .TG A.. ... ... ... ... .C. .T. ... ..A ..C ..G ..T ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... Barley ... .TG A.. ... ... ... ... .C. .T. ... ..A ..C ..G ..T ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ..G ... ... Nicotiana TTT ATG TCA GCA ACA GAA GCC CAA GCT TAT GGA ATT GTT GAT CTT GTA GCG GTT GAA --- --- --- --- --- --- --- Grape ... ... ... ... ... ... ... ... A.. C.. ... ... ... ... ... ... ... ... C.. --- --- --- --- --- --- --- Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... C.. GGA AAA GAA CAT GGA TTT --- Cucumis ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... --- --- --- --- --- --- --- Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... --- --- --- --- --- --- --- Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G --- --- --- --- --- --- --- Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- --- Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... C.. GGA AAA --- --- --- --- --- Spinacia ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... A.. ... ... ..C ... ..C ... --- --- --- --- --- --- --- Arabidopsis ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... C.. --- --- --- --- --- --- --- Cotton ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ..G ... ... ... ... ... A.. --- --- --- --- --- --- --- Citrus ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... C.. ... ... ... ... ... ... .G. --- --- --- --- --- --- --- Medicago ... ... ... ... GA. ... ..T G.. ..C C.C ... ... ... ... ACG ..C ..A .C. --- --- --- --- --- --- --- --- Soybean ... ... ... ... G.. ... ... ... ... C.C ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... --- --- --- --- --- --- --- Lotus ... ... ... ... G.. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- --- Oenothera .A. T.T ATG A.. G.. ACC .AA GCC AAA ... TAT GGA A.. .T. GA. .AT ATA .GG ATT CAA AAT CTT CTT GCT CGT CTA Ranunculus ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... T.. ... ... ..C ... --- --- --- --- --- --- --- Calycanthus ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.C ..C ... ... ... ... ... ... A.C ... AAT ACC GGG GAT TCC GCA --- Drimys ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ..C ... ... ... G.. ..T ... ..C --- --- --- --- --- --- --- --- Piper ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ..C ... ... ... ... ... ..C ..C ... AAT AGC GGG AAT TTT ACA --- Liriodendron ... ... ... ... G.. ... ... ... ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... --- --- --- --- --- --- --- Populus ... ... ... ... G.. ... ... ... .T. C.. ... ... ... ... ... ... ..A ... .C. --- --- --- --- --- --- --- Nuphar ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... --- --- --- --- --- --- --- Nymphaea ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ..C ... ... ... ... ... ..A ..C ... AAT AGC GCG GAT TTT GTG --- Amborella ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ..C ... ... ... ... A.. ..A ..C ... AAT ACC TGG GAT TTC CCG --- Ginkgo ... ... ... ..G G.. ... ... ... ..C ... ..C ... ... ... ..C ... ... ..A ..T AAT ACT GAA GAT CTC TTG --- Pinus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... G.C ... ... .AA .GT --- --- --- --- --- --- --- Acorus ... C.. ... ... ... ... ... ... ... C.. ..T ... ... ... ... ... .G. .AC ... --- --- --- --- --- --- --- Typha ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... --- --- --- --- --- --- --- Phalaenopsis ... ... ... ... ... ... ..T ... ... C.. ..C ..C ... ... ... ..C ... A.C ... AAT GAA AAT ACT GGG AAT TCC Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... --- --- --- --- --- --- --- Saccharum ... ... ... ... GAC ... ... A.. ... ... ... C.. ..C ... A.. ... .G. .A. ... --- --- --- --- --- --- --- Zea ... ... ... ... GAC ... ... A.. ... ... ... C.. ..C ... A.. ... .G. .A. ... --- --- --- --- --- --- --- Oryza ... ... ... ... GAC ... ... A.. ... ... ... C.. ..C ... A.. ... .G. .A. ... --- --- --- --- --- --- --- Triticum ... ... ... ... GAC ... ... A.. ... ... ... C.. ..C ... A.. ... .G. .A. ... --- --- --- --- --- --- --- agrostis ... ... ... ... GAC ... ... A.. ... ... ... C.. ..C ... A.. ... .G. .A. ... --- --- --- --- --- --- --- Sorghum ... ... ... ... GAC ... ... A.. ... ... ... C.. ..C ... A.. ... .G. .A. ... --- --- --- --- --- --- --- Barley ... ... ... ... GAC ... ... A.. ... ... ... C.. ..C ... A.. ... .G. .A. ... --- --- --- --- --- --- --- Nicotiana --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Grape --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Tomato --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Cucumis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Eucalyptus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Panax --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Atropa --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Potato --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Spinacia --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Arabidopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Cotton --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Citrus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Medicago --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Soybean --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Lotus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Oenothera CGG GCT GAA AGT GCT AGT CAG GAC AAT TCT CTC GAC CCC GAC GCA CCG GAT GAA AGT GCT AGT CAG GAC AAT TCG CTC Ranunculus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Calycanthus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Drimys --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Piper --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Liriodendron --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Populus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Nuphar --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Nymphaea --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Amborella --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Ginkgo --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Pinus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Acorus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Typha --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Phalaenopsis ATA --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Yucca --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Saccharum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Zea --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Oryza --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Triticum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- agrostis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Sorghum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Barley --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Nicotiana --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ATG ACT CTT GCT TTC CAA TTG GCT GTT TTT GCA TTA Grape --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tomato --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Eucalyptus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Panax --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Atropa --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... Arabidopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ..A ... ... ... ... Cotton --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Citrus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Medicago --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... Soybean --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Lotus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.C ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Oenothera GAC CCC GAC GCA CCG GAT GAA ACC AGA CCC CCA AAA TTG CGA ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ranunculus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Calycanthus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... .T. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Drimys --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ..T ... ... ... C.. ... ... ... Piper --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Populus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nuphar --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Nymphaea --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Amborella --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... Ginkgo --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... .C. ... ..G ... ... ... Pinus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... .C. ... ..G ... ... ... Acorus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ..T ... ... ... A.. ... ... ... Typha --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Phalaenopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Yucca --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Saccharum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Zea --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... .A. A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Oryza --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Triticum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... agrostis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Sorghum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Barley --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... A.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... Nicotiana ATT GCT ACT TCA TTA ATC TTA TTG ATT AGC GTA CCC GTT GTA TTT GCT TCT CCT GAT GGC TGG TCA AGT AAC AAA AAT Grape ... ... ... ... .C. ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..G ... ... ... ... Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..G ... ... ... ... Panax ... ... ..G ... .C. ... ... ..A ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ..C ... ... .C. ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..T ... ... ... ... ... ... Arabidopsis ... AT. ... ... .C. ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..T ... ..G ... ... ... ... Cotton ... ... ... ..G .C. ... ... C.. ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... .TG ... ... ... ... Citrus ... ... ... ... .C. ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ... ..G ... ... ... ... Medicago ... .T. ... ... .CC ..T ... ... ... G.T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..T ... ... Soybean ... ... .T. ... ..T ..T ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ..G .A. ... ... ... Lotus ... ... ... ... .CC ..T ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ..T ... ... Oenothera ... ... ... ... .C. C.T ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ..T ... ... ... ... ... ... Ranunculus ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... T.. ..C ..T ... ... ... ... ... ... Calycanthus ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... .A. ..T ... ... Drimys ... ... ... ... .C. ... ... C.. ... ..T ... ..T A.. ... ... ... ... T.C ... ..T ... ... ... ... ... ... Piper ... ..A ... ..G ... ... ... G.A ... G.T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..T ... ... Liriodendron ... ... ... ... .C. ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ..T ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... ..G .C. ... ... ..A ... ..T ... ..T ... ..T ... T.. ... ... ..C ..T ... ... ..C ... ... ... Nuphar ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ..T ... ... ... ..T ... ... Nymphaea ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ..G ... ... Amborella ... ... ... ... .C. ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ..T ... ... ... ... ... ... Ginkgo ... ... .T. ... ..T C.. C.G G.. ... G.T ... ..T ..C ... C.. ..C ... ... ... ..T ... ... ... .G. ... ... Pinus ... ... .T. ... ..T T.A C.. G.. ... G.T ... ..T ... .C. C.. ..C ... ..C ... ..T ... ... ... .G. ... ... Acorus ... ..G ... ... .CG ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Typha ... ..G ... ... .C. G.. ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... Phalaenopsis ... ..A ... ... ... ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ..T ... ... ... ... ... ... Yucca ... ..G ... ... .C. ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ..T ... ... ... ... ... ... Saccharum ... ..G ... ..C .C. G.T ... G.A ... ..T ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .A. ..T ... ..C Zea ... ..G ... ..C .C. G.T ... G.A ... ..A .G. .A. C.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .A. ..T ... ..C Oryza ... .TG ... ..C .C. G.. ... G.C ... ..T ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .AC ..T ... ..C Triticum ... ..G ... ..C .C. G.. ... G.A ... ..T ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .A. ..T ... ... agrostis ... ..G ... ..C .C. G.. ... G.A ... ..T ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..T ... ..C Sorghum ... ..G ... ..C .C. G.T ... G.A ... ..T ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .A. ..T ... ..C Barley ... ..G ... ..C .C. G.. ... G.A ... ..T ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .A. ..T ... ... Nicotiana GTT GTA TTT TCT GGT ACA TCC TTA TGG ATT GGA TTA GTC TTT CTG GTG GGT ATC CTT AAT TCT CTC ATC TCT --- --- Grape A.. ..T ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... --- --- Tomato ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Cucumis ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Eucalyptus ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Panax ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Spinacia A.. ... ... ..C ... ... ..A ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Arabidopsis ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C T.. ... ... ... ... ... ... ..T ... ... --- --- Cotton A.. ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... --- --- Citrus ..C ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... --- --- Medicago ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... --- --- Soybean ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ..T ... --- --- Lotus ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... .C. ... ..A ..C ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C --- --- Oenothera ... ... ... ..C ..C ... ..A ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Ranunculus T.. ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A .C. ... ... ... ... ... ... ... --- --- Calycanthus ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A .C. ... ... ... ... ... ... ... --- --- Drimys ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ... ... ... ... ... ... ... --- --- Piper A.. ... ... ..G ... ... ..A ..G ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Liriodendron ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ... ... ... ... ... ... ... --- --- Populus ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... ... --- --- Nuphar ... T.. ... ..C ... ..G ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ..T ... ... ..G ... ... .A. --- --- Nymphaea ... ... ... ..C ... ..G ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ..T ... ... ..G ... ... .A. --- --- Amborella A.. ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... T.. ..A .C. ... ... ... ... ... ... ... --- --- Ginkgo ... ... ... ..G ... G.. ..A ... ... ..C ... .C. ..T C.. T.. ..A ... ... ... ... ... T.A ... ... --- --- Pinus ... ... ... ..G ... GT. ..A ... ... ..C ... .C. ... C.. T.T ..A ... ... ... ... ... T.. ..A ... --- --- Acorus ... ... ... ..C ... ..C ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... --- --- Typha ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ..T ... ... ..A T.A ..T ... --- --- Phalaenopsis A.. ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ... ... ... ... ..A ... ... --- --- Yucca ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ... ... ... ... ... ... ... --- --- Saccharum ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ..T ..G ... ... ..T ..T ... --- --- Zea ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ..T ..G ... ... ..T ..T ... ATG CAA Oryza ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... C.G ... ... ... ..A .C. ..T ..A ... ... ... ..T ... ATG CAA Triticum ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... C.. ... ... ..C ..A .C. ..T ..G ... ... ... ..T ... ATG CAA agrostis ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... C.. ... ... ..C ..A .C. ..T ..G ... ... ... ..T ... --- --- Sorghum ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ..T ..G ... ... ..T ..T ... ATG CAA Barley ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... C.. ... ... ..C ..A .C. ..T ..G ... ... ... ..T ... ATG CAA Nicotiana --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Grape --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Tomato --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Cucumis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Eucalyptus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Panax --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Atropa --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Potato --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Spinacia --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Arabidopsis --- --- --- --- --- --- --- ATG TGT CAT TTC AGA ACT CAA GAA AAT AAA GAC TTT ACC TTC AGT TCA AAT CGA ATT Cotton --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Citrus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Medicago --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Soybean --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Lotus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Oenothera --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Ranunculus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Calycanthus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Drimys --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Piper --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Liriodendron --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Populus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Nuphar --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ATG Nymphaea --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ATG CGG TTC AAG TTT CAT TGC AAA CAA ATG Amborella --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Ginkgo --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Pinus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Acorus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Typha --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Phalaenopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Yucca --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Saccharum --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Zea CAC CTT GTT CTG ACC ATA TTG CAC TAT GTA TCA TCA TTT GAT AAA CCG AGA AAT GGC TTT TTT TCT CTA TTT CAA GTA Oryza CAC CCT GTT CTG ACC ATA TTG TAC TAT GTA TCA CCA TTT GAT AAA CCG AGA AAT ATT TCT CTC TCT CTG ATT CAA GTA Triticum CAC CCT GTT CTG ACC ATA TTG CAC TAT GTA TCA TCA TTC GAT AAA CCG AGA AAT GCT TCT CTC TCT CTG ATT CAA GTA agrostis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- TCT CTG ATT CAA GTA Sorghum CAC CTT GTT CTG ACC ATA TTG CAC TAT GTA TCA TCA TTT GAT AAA CCG AGA AAT GCT TTT TTC TCT CTG ATT CAA GTA Barley CAC CCT GTT CTG ACC ATA TTG CAC TAT GTA TCA TCA TTC GAT AAA CCG AGA AAT GCT TCT GTC TCT CTG ATT CAA GTA Nicotiana --- --- --- ATG GAA GAA ATC CAA AGA TAT TTA CAG CCA GAT AGA TCG CAA CAA CAC AAC TTC CTA TAT CCA CTT ATC Grape --- --- --- ... ... .G. G.T ... ... ... ..T A.A .T. ... ..G ..T .GT ... G.T G.. ... ... ... ... ... ... Tomato --- --- --- ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis --- --- --- ... ..G ... T.T ... G.. ... ... G.A .TT ..G .A. ..T .GG ... .GT G.. ... ... ..C ... ... ... Eucalyptus --- --- --- ... ..G ... T.T ... G.. ... ..C G.A .T. ... ... ..T AG. ... ..T G.. ... ... ..C ... ... C.T Panax --- --- --- ... ..G ... T.. ... ... ... ... G.. .T. ... ... ..T ... ... ... T.. ... T.. ... ... ... ... Atropa --- --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato --- --- --- ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia --- --- --- ... ... ... T.. ... ... C.. A.. G.A .T. ..C ..G ..T TGG ... ..T ..T ..T T.. ... ... ... ... Arabidopsis TCA ATC CAA ... ..T A.. T.T ... G.. ... ... G.. TTC ... G.G G.T .GG ... ..G .GT ..T ... ... ... ... T.T Cotton --- --- --- ... ..G ... T.T ... GT. ... ... G.A .T. A.. ... ..C .GC .G. ... G.T ... ... ..C ... ... ..T Citrus --- --- --- ... ..G ... T.T ... GT. ... ... G.A .T. ... ... ..T ... ... ... G.. ... ... ..C ... ... C.T Medicago --- --- --- ... A.G ... TAT ... GT. ... ... G.A .G. .C. ... ..T .GC ... ..G G.. ... ... ..C ... ... ..T Soybean --- --- --- ... ..G ... TCT .G. GC. ... ... G.A .TC C.. ... ..T .G. ..C ..G G.. AC. ... ..C ..T ... T.T Lotus --- --- --- ... ..G ... TAT ..G TT. ... ..G G.A .TG ... ... ..T .GT ... ..G G.. ... ... ..C ... ... G.T Oenothera --- --- --- ... ..G ... T.. .CG G.. ... ..C G.A .T. ... ... ..T .G. ... ... G.. ... ... ..C ..C ..A ..T Ranunculus --- --- --- ... ..G ... T.A ... ... ... ... A.A ATG ... ... ..T .G. G.. .GA G.. ... ... ... T.. ... C.. Calycanthus --- --- --- ... ..G ... T.A ... G.. ... ... G.A AT. ... G.. .TT .GG ... ... C.. ... ... ... ..G ... C.A Drimys --- --- --- ... ..G ... T.A ... G.. ... ... G.A AT. ..C G.. ..T .G. ... ..A TG. ... ... ... ... ... T.. Piper --- --- --- ... ... A.. T.. A.. ... ... ... G.A A.. TT. ... ..T G.G ... A.G T.. ... ..G ... ... ... C.T Liriodendron --- --- --- ... ..G ... T.A ... G.. ... ... G.A AT. ... ... ..T AGG ... ..A C.. ... ... ... ..G ... C.A Populus --- ATG AAA ..A ..G A.. TCT ... ... A.. ... G.A AT. ... ... ..T .G. A.. A.T G.. ... ... ..C ... ... ... Nuphar GAG AAA TTG CAA T.C ... T.G ... G.C ... ... G.A AT. ... ... .AC .GG A.. ..G CG. ... ... ... ... ... C.T Nymphaea GAA AAA TTG CAA T.C ... T.G ... G.C ... ... G.A AT. ... ... .AC .GG A.. ..G CG. ... T.. ... ... ... C.T Amborella --- --- --- ... ..G ... T.A .G. G.. ... ... G.A AT. ... ... C.C ..T ... ..A CG. ... ... ... ..G ... C.A Ginkgo --- --- --- ... ..T A.G T.. A.. ... G.C GG. G.A GA. T.. .T. ..C T.T ... .GA CGT ..T T.. ... ... ..C C.T Pinus --- --- --- ... ..T ..G T.. ..T ... .GC GG. A.. GA. ... ..C .TT TGG ... ..A TG. ..T T.. ... ... ..C T.T Acorus --- --- --- ... ... ... T.. A.. GTC ... ..C G.A AA. ... G.G ..T .GT ... ..A T.. ... ... ... ... ... C.. Typha --- ATG AAA CAA TT. C.T G.A ... .A. ... ... G.A AA. .T. ... ..T .GG A.. ..A C.. ... ... ... ..G ... C.T Phalaenopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Yucca --- --- --- ... ... ... T.A ... G.. ... ... G.A AAG ... .A. ..T .GG ... ..A C.. ... ... ... ..G ..A C.. Saccharum --- --- --- ... C.. A.. T.. G.. G.G ... .C. G.A AA. C.G .A. ..T .GT ... ... T.. ... G.C ..C ... ... C.. Zea GAA ATA CAA ... ... A.. T.. G.. G.G ... .C. G.A AA. C.G .A. ..T .GT ... ... T.. ... G.C ..C ... ... C.. Oryza GAA ATA CAA ... ... A.. T.. G.G G.T ... .C. G.A AA. CT. .A. .TT .CT AG. ..A T.T ... G.C ..C ... ..A C.. Triticum GAA ATA CAA ... ... A.. T.. G.. G.G ... .C. G.A AA. C.. .A. ..T .GT ... ..A T.. ... G.C ..C ... ... C.. agrostis GAA ATA CAA ... ... A.. T.T ... G.G ... .C. G.A AA. C.. .A. ..T .GT ... ..A T.. ..T G.C ..C ... ... C.. Sorghum GAA ATA CAA ... ... A.. T.. G.. G.G ... .C. G.A AA. C.G .A. ..T .GT ... ... T.. ... G.C ..C ... ... C.. Barley GAA ATA CAA ... ... A.. T.. G.. G.G ... .C. G.A AA. C.G .A. ..T .GT ... ..A T.. ..T G.C ..C ... ... C.. Nicotiana TTT CAG GAG TAT ATT TAT GCA CTT GCT CAT GAT CAT GGT TTA AAT AGA AAT --- --- --- AGG TCG ATT TTG TTG GAA Grape ... ... ... ... ... ... ... ... T.. T.. ... ... ... ... ..C --- --- --- --- --- ..A ..T ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... Cucumis ... .G. ... ... ... ..C ... T.. T.. ... ... ... TT. ... ... --- --- --- --- --- G.A ..C ... ... ... ... Eucalyptus ... .GA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G .A. --- --- --- --- TC. ATT T.G ..C GAA A.T Panax ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... --- --- --- ..A ..C ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ..A ... ... ... ... T.. ..A T.. ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- .AA ... ... ... ... ... Arabidopsis ... .G. ... ... ... ... .T. ... ... T.. ... ... ... ... ... ... TTA AAT AGA AAT C.C .AT ... ..C ... ... Cotton ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... .A. --- --- --- --- TC. AT. ... ..T ..T ... Citrus ... .G. ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ..C --- --- --- --- TC. AT. ..G .CA ... ... Medicago ... .G. ... ... ... ... .G. ... ... T.. AG. ... AA. ..T ... --- --- --- --- --- ..A ..C G.. ..T C.. ... Soybean ..C .G. ..A .C. ... ..C .G. ..A ... TG. .G. ... ..G --- --- --- --- --- --- --- --- ..C ... ..T G.A ... Lotus ... ..C ..A ... ... ..C .G. ..C ... T.. AG. ... .A. ... ... --- --- --- --- --- ..A ..A ... ..T G.A ... Oenothera ... .G. ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- AGA TCT A.T T.G ..C GAA A.T Ranunculus ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... TT. ..G ... .C. .A. TCG ATT --- --- CCT .AT GAG .CT A.. C.. Calycanthus C.. ... ..A ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. TCG ATT --- --- CTT ..C GAA CAC A.. ..G Drimys ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. TCG ATT --- --- CTT .AC .AA CCC A.. ... Piper ... ... ..A ... ..C ..C ... ..C .GC ... ... ... ... ... ... G.. CCG ATT --- --- CCT .AC GAA .CC A.A ... Liriodendron ... ... ... ... ..C ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... ... G.. TCG --- --- ATT TTT .AC GAA CCT A.. ... Populus ... .G. ... ... ... ... A.. T.. ... ... ... .G. .AC ... ... --- --- --- --- --- ..A ..T ... ... ..A ... Nuphar ... .G. ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T TCG ATT --- --- TTT .AT GAA CCC AC. ... Nymphaea ... .G. ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T TCG ATT --- --- TTT .AT GAA CCC AC. ... Amborella ..C ... ... .C. ..C ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... G.. TCA ATT --- --- CTT .AC GAA CCC A.. ... Ginkgo ... ... ... G.. C.. ..C ... A.. ... T.. ... ... TA. ..C ... ... TCG AGT --- --- T.C .TC GAA CC. A.. ... Pinus ... ... ..A G.. C.. ..C ... A.. T.. ... ... ... TA. ..G G.. GT. TCA AGT --- --- TCC ..C .GA CC. A.. ... Acorus ... ... ... ..C ..C ..C ... ... ... ... A.. ... .T. ... ... G.. TTG ATT --- --- TTT .AC GAA .CC .C. ... Typha ... A.. ... ... ... ... ... T.. ... ... ... T.. ... ... ... G.T TCG ATT --- --- TTT .AC GAA CCC AC. ... Phalaenopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- Yucca ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.T TCG ATT --- --- TTT .AC GAA CCT G.C ... Saccharum ... ... ..A ... ... ... ... T.. ... ... ... T.. ..A ... ... G.T TCC --- --- --- --- --- GAA CCT G.. ... Zea ... ... ..A ... ... ... ... T.. ... ... ... T.. ..A ... ... G.T TCC --- --- --- --- --- GAA CCC G.. ... Oryza ... ... ... ..C ... ... .TG T.. ..C ... ... T.. ..A ... ... G.T TCC --- --- --- --- --- GAA C.T G.C ... Triticum ... ... ..A ... ... ... ... T.. ..C .C. ... T.. ..A ... ... G.T TC. --- --- --- --- --- GAA CCT G.. ... agrostis ... ... ... ... ... ... ... T.. ..C ... ... T.. ..A ... ... GA- --- --- --- --- --T ..A GAA CCT G.. ... Sorghum ... ... ..A ... ... ... ... T.. ... ... ... T.. ..A ... ... G.- --- --- --- --- --T ..C GAA CCC G.. ... Barley ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... T.. ..A ... ..C G.- --- --- --- --- --T ..T GAA CCT G.. ... Nicotiana AAT CCA GGT TAT AAC AAT --- --- AAA TTA AGT TTC CTA ATT GTG AAA CGT TTA ATT ACT CGA ATG TAT CAA --- --- Grape ... GTG ... ... G.. ... --- --- ... .CC ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... --- --- Tomato ... T.. ... ... ... ... --- --- ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... G.. ... --- --- Cucumis ... T.T ... ... G.. ..A --- --- ... .CC ... ..A ... ..G ..A ... .A. ... ... ... ... ... ... ..C --- --- Eucalyptus --- G.. ... ... G.. ... --- --- ... .CT ... .CA A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Panax ... G.G ... ... G.. ... --- --- ... ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... --- --- Atropa ... ... ... ... ... ... --- --- C.. ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Potato ... T.. ... ... ... ... --- --- ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... --- --- Spinacia ... T.. ..C A.C .GT --- --- --- ... .AC ... ..A ..G C.. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Arabidopsis ... G.G .A. ... G.. ..A --- --- ... .AT ... .CA ... ... AC. ... ..C ... ... TTG ... ... ... G.. --- --- Cotton ... .AG ... ... GGT ... --- --- ... ..C ... .CA ... ... ... ... ... ... ... CT. ... ... G.. ... --- --- Citrus GG. GGG TT. ... G.. ... --- --- ... .CT ... .CA ... .G. ... ... ..G ... ... ... A.. ... ... ... --- --- Medicago ... GT. ... .C. G.. .G. --- --- ... .AT ... ..A ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Soybean ... GTC ... ... ... ... --- --- ... ..T ... ..A ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Lotus ... TTT ... ... G.T ... --- --- ... .AT ... ..A ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Oenothera G.A GTT .A. ... G.. ..A --- --- ... .AT ... ..A A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Ranunculus .T. TT. A.. ... G.. ... --- --- ... .AT ... .CA ... ... ..T ... ... ... ... .T. ... ... ... ... --- --- Calycanthus ... TTG A.. C.. G.. ... --- --- ... .CC ... .CA ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... C.. ... --- --- Drimys .T. TTC ... ... G.. ... --- --- ... ..C ... .CA ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... C.. ... --- --- Piper ... TT. ... ... GG. G.. --- --- ... .CT ... .CA ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... C.. A.. --- --- Liriodendron ... TT. ... ... G.. ... --- --- ... .CC ... .CA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... --- --- Populus ... GT. ... ... G.. ... --- --- ... .AT ... ..A ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- Nuphar ... TT. ... ... G.. ... GAC AAT ... .CT ... .CA ... ... ... ... ..C ... ... ... ... C.. C.. ... --- --- Nymphaea ... TT. ... ... G.. ... GAC AAT ... .CT ... .CA ... ... ... ... ..C ... ... ... ... C.. C.. ... --- --- Amborella G.. TT. ... C.. G.. ..G --- --- ... .CC ... .CA ... .A. ..A ... ... ... ... .T. .A. ... ... ... --- --- Ginkgo ... T.. A.. .CC ... G.. --- --- CG. ..T ... ... ... .C. ..A ... ... ..G ... .G. ... ..A C.. ... --- --- Pinus C.. TT. A.. .CC ..T G.. --- --- C.. ... ... ... ... .C. ..A ... ... ..G ... GG. .A. ..A CG. ... --- --- Acorus ... TTC .T. ... G.T ... --- --- ... ..T ... ..A A.. ... ..A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... --- --- Typha .T. TTG ... A.. G.. ... --- --- ... .CT ... .CA G.. C.. ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... --- --- Phalaenopsis --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... ... ... --- --- Yucca GT. TTT ... ... G.. ... --- --- ... .CT ... ..A GC. C.. ..A ... ..C C.. ... ... ... ..C ... ... --- --- Saccharum .T. TTT ... .G. ..T ..C --- AAG ... ..T ... .CA A.. C.. ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ..G --- --- Zea .T. TTT ... .G. ..T ..C --- AAG ... ..T ... .CA ... C.. ... ..C ... ... ... .TC ... ... ... ..G --- --- Oryza .T. ATT ... .C. ..T ..C --- AAG ... ..T ... .CA ... C.. ... ... ..G ... ..G .T. ... ... ... ..G --- --- Triticum .TA GTT ... .G. ..T ..C --- AAG ... ..T ... .CA ... C.. ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ..G --- --- agrostis .T. GTT A.. .G. ..T ..C --- AAG ... ..T ... .CA ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G --- --- Sorghum .T. TTT ... .G. ..T ..C --- AAG ... ..T ... .CA A.. C.. ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ..G --- --- Barley .TA GTT A.. .GG ..T ..C --- AAG ... ..T ... .CA ... C.. ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ..G --- --- Nicotiana CAG AAT CAT TTT CTT ATT TCT ACT --- --- AAT GAT TCT AAC AAA AAT TCA TTT TTG GGG TGC AAC --- --- --- --- Grape ... ... ... ..G A.. T.. ... --- --- --- --- ... ... ..T C.. ... C.. ... ..T ..A CA. ..T --- --- --- --- Tomato ... ... ... ..G A.. ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... C.G ... ... ... ... ... --- --- --- --- Cucumis ... ... ... ... T.. T.. .TC ... --- --- ... T.. .A. ... ... ... C.T ... .G. ... .A. ... --- --- --- --- Eucalyptus ... ... .C. ..G A.. T.. ..A G.. --- --- ... ... ... .T. C.. ... C.. ... ..T ... CAA ... --- --- --- --- Panax ... ... ... ..G A.. C.. ... ... --- --- ... ... ... ... C.. ... AG. ... ... A.. C.. ... --- --- --- --- Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... --- --- --- --- Potato ... ... ... ... A.. ... ..G ... --- --- ... ... ... ... ... ... C.G ... ... ... ... ... --- --- --- --- Spinacia ... ... ... ..G A.. C.. ... G.. --- --- ... ... ..G ..T C.. ... GT. A.. ... ... CA. ..G --- --- CAC AAA Arabidopsis ... ... .G. ..G A.. ... C.C ... --- --- ..G ... GTG ... C.. ... ..C ... ... ... CAT .C. --- --- --- --- Cotton ... ... .G. ..G A.. .G. ... G.. --- --- ... ... ..C ... C.. ... C.G G.. ..T ... CA. ... --- --- --- --- Citrus .G. .T. A.. ..G AG. ... G.. G.. --- --- ... ... ..G ..T C.. ... C.G A.. ..T ... CA. ... --- --- --- --- Medicago ... ... ... ..A A.C ... ..G G.. --- --- ... ... ... ... ... ... C.. ... .G. ..C .AT ..T --- --- --- --- Soybean ... .C. ... ..C A.C ... .T. ... --- --- ..C ... ... ... ... ... C.T ... A.. ..T .AT ... --- --- --- --- Lotus ... ... ... ..G A.. ... ..G G.. --- --- ... ... ... ... ... ... CG. ... ... A.. .AT ..T --- --- --- --- Oenothera .G. ... ... ..G A.. ... ..G G.. --- --- ... .G. ... GTT C.. ... C.. ... .G. ..C CA. ..T --- --- --- --- Ranunculus ... ..G ... ..G A.. ... .TG GA. --- --- ... ... ..G ..A ..C ..A AAT ... C.T ... CAT ..T --- --- --- --- Calycanthus ... ... ... ... A.. ... ..G GT. --- --- ... ... ... ... C.. ..A GG. ..C G.T ... CA. ... --- --- --- --- Drimys ... ... ... ..G A.. C.. ..G GT. --- --- ..A ... ... ..A C.. ... CT. ... G.T .TT CC. ... --- --- --- --- Piper ... ... ... ... ... ... ... TG. AAT GAA ... ... .T. C.A C.. ... CG. ..G ... ... C.A ..A --- --- --- --- Liriodendron ... ... ... ..G A.. ... ..G GT. --- --- ... ... ..C ... G.. ... GG. ..C G.T ... CA. ... --- --- --- --- Populus ... ... ... ..G A.. ... ... G.. --- --- ... ... ... ... C.. ... A.. ... ..T A.. .AT ... --- --- --- --- Nuphar ... ... ... ..A A.C ... ..G GT. --- --- ... ... ... --- --- --- AGG ..C G.C ... CC. ... --- --- --- --- Nymphaea ... ... ... ..G ACC ... ..G GT. --- --- ... ... ... --- --- --- AGG ..C G.T ... CC. ... --- --- --- --- Amborella ... ... ... ..C A.C ... ..A TT. --- --- ... ... ... ... C.. ... AG. ... C.T ... CAT .G. --- --- --- --- Ginkgo ... ... G.. ..A A.C ... ..A TT. --- --- TTG A.. .GC G.T C.. ... C.. ... G.T ..T CA. ... --- --- --- --- Pinus ..A ... ... .CA A.. G.. .TA TTC --- --- GTG A.. .GC G.T CC. ... C.. ..A GCT .AT C.. ..G --- --- --- --- Acorus ... ... TC. ..G AG. .A. .TG GT. --- --- ... ... ... ... CG. ... CG. ..A G.T C.. CAA ... --- --- --- --- Typha ... ... TT. ..G A.. .A. ..G ... --- --- ... C.. ... ... C.. ... CG. ..C A.T ... CA. ... AAT TAT TTT TAT Phalaenopsis ... ..A T.. ..G A.. TC. ..G GTG --- --- .G. ... ... ... C.. ... GG. ... .C. CT. CA. ..G AAT TCT TTT TCT Yucca ... ... T.. ..G A.. TC. ..G GT. --- --- ... ... ... ... C.. ..G AGG C.C G.T ... CAT ... AAT TTT TTT TAT Saccharum ... ... TT. ..G A.. .A. ..G GT. --- --- ... T.. C.. ... C.. G.. CG. ..G ..T .AT CA. CG. AAT TAT TTT TAT Zea ... ... TT. ..A A.. .A. ..G GT. --- --- ... T.. C.. ... C.. G.. CG. ..G ... .AT CA. CGT AAT TAT TTT TAT Oryza ... ... TT. .GG A.. .A. .TG GT. --- --- ... C.. C.. ... C.. G.. CG. ..A ... .AT .A. ... AAT TTT TTT TAT Triticum ... ... TT. ..G GA. .AC ..G GT. --- --- ... C.. C.. ... C.. G.. CG. ..A ... .AT .A. ..A AAT TAT TTT TAT agrostis ... ... TT. .GG A.. .AC ..G GT. --- --- ... C.. C.. ... C.. G.. CA. ..G ... .AT .A. ..A ATT GGT TTT TAT Sorghum ... ... TT. .GG A.. .A. ..G GT. --- --- ... T.. C.. ... C.. G.. CG. ..G ..T .AT CA. CG. AAT TAT TTT TAT Barley ... ... TT. ..G GA. .AC ..G GT. --- --- ... C.. C.. ..T C.. G.. CG. ..A ... .AT .A. ..A ATT TTT TTT TAT Nicotiana AAG AGT TTG TAT TCT CAA ATG ATA TCA GAG GGA TTT GCG TTT ATT GTG GAA ATT CCG TTT TCT CTA CGA TTA ATA --- Grape ... .A. ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... .GA G.C ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... G.C --- Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .G. ... ..A ... ... ... ... ... A.. ... ... ... --- Cucumis ..C .A. ... ... ... ... ... T.. ... ..A ..G ... ..A G.C ... ... ... ... ..A C.. ..C ... ... ... G.. --- Eucalyptus ... .A. ..T ... ... ... ..T ..C ..C ... ... ... ..A G.C ... ... ... ... ..A ... ..C ... A.. ... G.. --- Panax ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..A G.C ... ... ... ... ..A ... .A. ... .A. ... .A. --- Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... --- Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..A .G. ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... --- Spinacia ... .A. ... ... ..A ... ... ... A.. ..A ..G ... ..C G.C ... ... ... G.. ..A ... ..C ... .T. ... ... --- Arabidopsis .GT CT. ..C ... .A. ... ... ... ..T .TT TT. ... ..A G.G ... ..C ... ... ..A ... ..C ... A.. ... GG. --- Cotton ..T .A. ... ... ... ... ... ... G.G .TA ... ... ..A G.C ... ... ... ... ..A ... ..C T.. ... ... ... --- Citrus ..T .AG ..A ... ... ... ..T ... ... ... .T. ... ..T GC. G.G ... ... ... ..A ... ..C ... ..G ..G G.G --- Medicago ..T .A. ..T ... ... ... ..A ... ... ... ..T ... ..C A.C G.G ... ... ... ..A ... .TC ... GA. ... .GC --- Soybean ..T CA. ..T ... ... ... ..A ... .T. ..A ..T ... .TT G.C G.C ... ..G ... .TA ... ..C ... .A. ..T TGT ATA Lotus ... .A. ..T ... ... ... ..A ... ... ... ..T ... ..C A.C ..C ... ... ... .T. ... ... T.. .A. ... .GC --- Oenothera C.. .A. ... ... ..G A.. ..T C.. ... ..A ..G ... ..A G.C ... ... ... ... ..A ... ..G ... ... G.T T.. --- Ranunculus ..A .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T G.C ... ..A ... ... ..A ... G.A T.G ... ... G.. --- Calycanthus ... .A. ..T C.. ... ... .A. ... ..G ..A ..T ... ..C G.C ... ... ... ... ..A ... ..A ..G .A. ... G.. --- Drimys ..A TA. ..T G.. ... ... ... ..G ... ... .TT ... ..A G.C ... ... ... ... ..A ..C ..A ... ... ... G.. --- Piper ..C .A. ... G.. ..G A.. ..T ... ..G ... .CT ... T.A A.. ... ... ... ... ..A ..C ..C T.C .A. ... G.G --- Liriodendron ... ... ..T ... ... ... ... G.. ... ... ..T ... ..A G.C ... A.. ... ... ..A ..C ..G ..G ... ... G.. --- Populus ..A .A. ... ... .T. ... ... ... ..G ... ..G ... ..A G.. ... ... ... ... ..A ... ..C T.. ... ... G.. --- Nuphar .G. ... ..T ... ... ... .C. ... ... ... ..T ... ..A GGA ... A.. ... ... ..A ..C ..G A.G ... ... G.. --- Nymphaea .G. ... ..T ... ... ... .C. ... C.. ... ..T ... ..A GGA ... A.. ... ... ..A ..C ..G G.G ... ... G.. --- Amborella .G. .A. .CT ... .T. ... ... G.. ... ... ..T ... ..A G.A ... ... ... ... ..A ..C ..G A.G ... ... G.. --- Ginkgo .GC ... ..C ... ... G.. T.. G.. CT. ..A ..T CCG A.A G.G G.. C.. ... G.. ... ..C .TG A.G ... .CG .A. --- Pinus ... ... ..C ... ... G.. TC. G.. CT. ..A .C. C.. A.A ..G G.C C.. ... G.. ... ..C ... A.. T.G .C. .A. --- Acorus ... .A. ..T ... .A. ... .C. ... .T. ... ..T ... T.A G.C ... A.. ... ... ..A ..C ..C A.. AT. ..T T.. --- Typha TCT C.. ..T .T. ... ..G ... ... ... ..A A.T ... ..A G.C ... A.. ... ... .GA ... ..G ..G ... ... G.. --- Phalaenopsis T.T CA. ..T ... ... ... ... G.. ... ..A ..T ... .GA G.C ... C.. ... ... T.A ..C ..G TCG ... ... G.. --- Yucca TCT CA. ..T ... ... ... ... ... ... ..A A.T ... ..A A.. ... ..A ... ... ... ..C ..G ..G .T. ... G.. --- Saccharum TCT GAG ..T ... ... ..G ..T C.. ..T ... ..G ... .G. A.. G.. ..A ... ..C ..A C.C ..G ... G.G CA. C.. --- Zea TCT GAG ..T ... ... ..G ..T C.. ..T ... ..G ... ... A.C G.. ..A ... ..C ..A C.C ..G ... G.G CA. C.. --- Oryza TCT GAG ..T ... ... ..G ..T C.. ..T ... ..G ... ... A.C G.. ..A ... ..C ..A ..C ..G ... ... GA. CAG --- Triticum TCT GAG ..T ... ... ..G ..T C.. ..T ..A ..G ... ... A.C G.. ... ... ..C ..A ..C ..G ... ..G GA. T.. --- agrostis TCT GAG ..T ... ... ..G ..T C.. C.T ... ..G ... ... A.C G.. ..A ... ..C ..A ..C ..G ... ... GA. T.. --- Sorghum TCT GAG ..T ... ... ..G ..T C.. ..T ... ..G ... .G. A.. G.. ..A ... ... ..A C.C ..G ... G.G CA. C.. --- Barley TCT GAG ..T ... ... ..G ..T C.. ..T ... ..G ... ... A.. G.. ... ... ..C ..A ..C ..G ... ..G GA. T.. --- Nicotiana TCT TCT TTA TCT TCT TTC GAA GGC AAA AAG ATT TTT AAA TCT TAT --- --- AAT TTA CGA TCA ATT CAT TCA ACA TTT Grape ... ... C.. --- --- --- ... ..T ... G.A ..A GCA ... ... C.. --- --- ... ... ... ... ... ... ... .T. ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... C.. --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ..C ... --- --- --- ... .AA G.. G.A ..C GCA ... ... ... --- --- ... ... ... ... .G. ... ... .T. ... Eucalyptus ... ..C ... --- --- --- ... A.G ... G.A ..A GCA ... ... C.. --- --- ..A ... ... G.. ... ... ..C .T. ... Panax ... ..C C.. --- --- --- ... A.. ... GG. ..A G.C ... ... C.. --- --- ... ... ... ... ... ... ... .T. ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... C.. --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... C.. --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ..C C.. --- --- --- .GG .AA ... G.A ..A G.A ... ... C.. --- --- ... ..G ... ... ... ... ... .T. ... Arabidopsis ..C ... ..T --- --- --- C.. ..A ... C.A T.A AAA ... ... ... --- --- ... ... .A. ... ... ... ... .T. ... Cotton ... .AC .C. --- --- --- C.. ..G GC. G.A G.C GCA ... ... C.. --- --- ... ... .A. ... ... ... ... .T. ... Citrus G.. .T. ... --- --- --- ... ..G ... G.A ... GAA ... ..G CC. --- --- ... ..C .A. ... ... ... ... .T. ... Medicago ... ..C ... --- --- --- ..G .AG GC. G.A ..C A.A ... ... ... AAA --- ... ..G A.. ... ... ... ..C .TT ... Soybean ... ..C ... --- --- --- AGG .AA TTC G.A ..C G.A ... ... ... AAT --- ... ..G ... ... ... ... ..C .TT ... Lotus ..G ..C ... --- --- --- ..G .AG GC. G.A ..C A.A ... ... ... AAA --- ... C.G ... ... ... ... ..T .TT ... Oenothera ... ..C ..T --- --- --- ... A.G ... G.. .AA GA. .T. G.A A.A TCT CCT .C. ... ... ... ... ... ... .T. ... Ranunculus ..C ..C .AC --- --- --- C.. ..T ... G.A ..A GAA ... ..G AT. --- --- ... ... G.. ..C ... ... ..T ... ... Calycanthus ... ... C.. --- --- --- ... .AA ... G.A ..A GCA ... .T. C.. --- --- ... .C. ... ..T ... ... ... .T. ... Drimys ... ..C C.. --- --- --- ... .AA ... ..A ..A GCA ... ... C.. ATA CGA TC. A.T .A. ..T ... ... ... .T. ... Piper ... .GC C.. GAA --- --- A.. AAA .G. G.A ..A GCA ... ... C.. --- --- ... ... ... ..T ..C ... ... .T. ... Liriodendron ... ..C C.. --- --- --- ... .AA ... G.A ..A GCA ... ... C.. --- --- ... ... ... ..T ... ... ... .T. ... Populus ..C ... ... --- --- --- ... A.. TC. G.A ..A G.A ... ... C.. --- --- ... ... ... ... ... ... ... .T. ... Nuphar C.. ..C C.. --- --- --- ... A.A --- --- ..A GCA ... .A. C.G --- --- ... ... ... ..T ... ... ... .T. ... Nymphaea ... ..C ... --- --- --- ... A.A G.. .GA ..A GCA ... .A. C.. --- --- ... ... ... ..T ... ... ... .T. ... Amborella ... ..C C.. --- --- --- ... AAA GG. --- --- .C. G.. ... C.. --- --- ... ..C .A. ..T ..C ... ... .T. ... Ginkgo CA. ... C.. --- --- --- ... AAA ..G ..T GAA .GG ..G --- --- --- --- .G. ..C ... ..T ... ... ..G .T. ... Pinus ... ... G.G --- --- --- ... ..G .TG ..T GAA .G. ..G --- --- --- --- .G. ..C ..G ..G ..C ... ... .T. ... Acorus ... ..C G.T --- --- --- ... .AA ... ..A GCA AAA .T. C.A A.A ATT CAG ... ... ... ..T ... ... G.. ... ... Typha ... ..C .CC --- --- --- ... AAA ... G.A ..A CCA C.. .T. C.. --- --- ... ... ... ..T ... ... ... .T. ... Phalaenopsis ..C ..C C.T --- --- --- ... .AA ... .GA ..A CCA ... ... C.G --- --- ... ... ... ..T ... ... ... .T. ... Yucca ... .T. ..C GGA --- --- ... AAA ... G.A ..A CCA ... .A. C.. --- --- ... ... ... ... ... ... ..C .TT ... Saccharum ... .G. CC. --- --- --- ... .AA ... G.A ..A CCA ..G .T. C.A --- --- ... ... .A. ..T ... ... ... .T. ... Zea ... .G. CCG --- --- --- ... .AA ... G.A ..A CCA ..T .T. C.A --- --- ... ... .A. ..T ... ... ... .T. ... Oryza ... .G. CCG --- --- --- ... .AA ... G.A ..A CCA ..G .T. C.G --- --- ... ... ... ..T ... ... ... .T. ... Triticum .T. .G. CCG --- --- --- A.. .AA ... G.A ..A CCA ..G .T. C.G --- --- ... ... ..C ..T ... ... ... .T. ... agrostis .T. .G. CCG --- --- --- A.. .AA ... G.A ..A CCA ..G .T. C.G --- --- ... ... ..C ..T ... ... ... .T. ... Sorghum ... .G. CC. --- --- --- ... .AA ... G.A ..A CCA ..G .T. C.A --- --- ... ... .A. ..T ... ... ... .T. ... Barley ... .G. CCG --- --- --- A.. .AA ... G.A ..A CCA ..G .T. C.G --- --- ... ... ..C ..T ... ... ... .T. ... Nicotiana CCT TTT TTA GAG GAC AAT TTT TCA CAT CTA AAT TAT GTA TTA GAT ATA CTA ATA CCC TAC CCT GTT CAT CTG GAA ATC Grape ... ... ... ... ... ..A ..C C.. ... T.. ..G ... ..G .C. ... ... ... ... ... C.. ..C A.C ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... ..T ..A ..C C.. ... T.. ... ... ..G .C. ... G.. T.. ... ... ..T ..G C.C ... ... ... ..T Eucalyptus ... ... ... ... ... ..A ... ... ... T.. G.. ... ..G .CG ... G.. ... ... ... ..T .AC A.C ... ..A ... ... Panax ... ... ... ... ... ..A A.. ... ... T.. .T. ... .GT ... ..G ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... Spinacia ..C ... ... ... ... ..A ..A .T. ... T.. ... ... ..G ... ... ... T.. ... A.T ... ..C .CC ... ..C ... ... Arabidopsis ..C ... ... ..A ... ..A ..A GG. ... T.T ... ... ..G ... ... G.. ... ... ..T ... ..C A.C ... ..A ... ... Cotton ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... T.. ... ... ..G ... ..G GC. ... ... ..T C.T ..C A.C ... ..A ... ... Citrus ... ... ..C ... ..T ..A ..G ..C ... T.. ... ... ..G ... ... G.. .G. ... ... ... ..C A.. TG. .CC ... ... Medicago ..C ... ..G ... ..T ..A ... A.. T.. T.C ... ... ..G .C. ... ... .G. ... ..A ..T ... A.C ... ... ... ..T Soybean ..C ... ..C ..A ..T ..A C.G AT. T.. T.. ... C.. .AG .C. ... ... .G. ... ... ..T ... A.C ..C ... ... ... Lotus ..C ... ..C ... ..T ..A G.. A.. T.. T.. ... ... A.. .C. ... ... .G. G.C ..T ..T ... A.C ... ... ... ... Oenothera ... ... ... ... ... C.A ... ... ... T.. G.. ... T.G .C. C.. G.. ... ... ... ..T ..C A.C ... T.. ... ... Ranunculus ..A ... ... ... ..T ..A ... GT. ... T.. ... C.. ... ... A.. ... ... ... ... ..T ..G A.C ... T.T ... C.A Calycanthus ..C ... ..C ... ... ..A ..A ... ... T.. ... C.. ..G .C. ... ... ... ... ... ... ..C A.C ... ... ... ... Drimys .T. ... ..C ... ... ..A ... ... ... T.. ... C.. ..G .C. ... ... ... ... ... C.. ... A.A ... ... ... ... Piper ..C ... ..T ... ... ... A.A .TC T.. T.. T.. C.. A.. .CG ... G.. T.. ... ..G ... ... A.. ... .CA ... ..T Liriodendron ..C ... ..C ... ... ..A ..A ... ... T.. ... C.. ..G .C. ... ... ... ... ..T C.T ..C A.C ... ... ... ... Populus ... ... ... ... .G. ..A ..C C.. ... T.. ... ... C.G .C. ..G GG. ... ... ..G ... ..C A.C ... ..A ... .AA Nuphar ..C ... ... ... ... ..A ..A ... ... T.. T.. ... ..G .C. ... ... ... ... ... C.. ..A A.C ... ... ... ... Nymphaea ..C ... ... ... ... ..A ..A ... ... T.. T.. ... ..T .C. ... ... ... ... ... ... ..A A.C ... ... ... ... Amborella ..G ... C.. ... ... ..A C.. ... T.. T.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... C.. ..A A.C ... ... ... ... Ginkgo T.C ... A.G ... ... ..A ... C.. ... .CC ... .CG A.C .CG ... ..G .G. ... ... C.. T.. A.. ... TC. ... ..T Pinus ..C ..C ... ... ..T ..A ..C C.G ... TC. ... .C. A.. ... ... GC. .G. ... ... ..T T.. A.. ... .C. ... ..T Acorus ..C ... ... ..A ... ..A ..A ... ... T.. ... C.. ... .C. ... ... T.. ... ... ..T ..C A.C ... ..C ... ... Typha ..C ... ... ... ... ..A ..C ... ... T.. ..C .C. A.C .CG ... ... ... ... ... C.T ... A.C ... T.. ... ... Phalaenopsis ..C ... ... ... ..T ..A ..A ... ... T.. ... ... ..G .CG ... C.. ... ... ... ..T ... A.C ... A.. ... ... Yucca ..C ... ... ... ... ..A ..A ..G ... T.. ... ... ..C .C. ... ... ... ... ..T C.T ..C A.C ... A.. ... ... Saccharum ..C ... ... ..A ... ..A ... .TG ... T.. C.. ... C.. .C. C.. ... GA. ... ... ..T ... A.C ... T.A ... ... Zea ..C ... ... ..A ... ..A ... .TG ... T.. C.. ... C.. .C. C.. ... AA. ... ... ..T ... A.C ... T.A ... ... Oryza ... ... ... ..A ... ..A ... .TG ..C T.. C.. ... C.. GC. C.. ... GA. ... ... ..T ... A.C ... T.. ..T ... Triticum ..C ... ..T ..A ... ..A ... .TG ... T.G G.. ... C.. .C. C.. ... GA. ... ... ..T ... A.C ... T.. ... ... agrostis ..C ... ... ..A ... ..A ... .TG ... T.G G.. ... C.T .C. C.. ... GA. ... ... ..T ... A.C ... T.T ... ... Sorghum ..C ... ... ..A ... ..A ... .TG ... T.. C.. ... C.. .C. C.. ... GA. ... ... ..T ... A.C ... T.A ... ... Barley ..C ... ... ..A ... ..A ... .TG ... T.G G.. ... C.. .C. C.. ... GA. ... ... ..T ... A.C ... T.. ... ... Nicotiana TTG GTT CAA ACT CTT CGC TAT TGG GTA AAA GAT GCC TCT TCT TTA CAT TTA TTA CGA TTC TTT CTC CAT GAA TTT TGG Grape ... ... ... G.C ... ..T ..C ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..A ..C ..G .A. CAT Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .A. ..T Cucumis ..A ... ... .TC ... ... .CC ... ..G ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..G ... ... T.T ..C ..G .A. ..T Eucalyptus ... ... ... ..C ... ... ..C ... ..G ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ..C ..G .A. ... Panax ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G .A. ..T Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .A. ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .A. ..T Spinacia ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... ..T T.. ..G .A. C.T Arabidopsis ... ... ... ..C ..A ..T ..C C.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T ..T ..G ... .G. T.A T.C ..G .A. ..T Cotton ..A ... ... G.C ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ..G ... .C. ... T.C ..G .A. ..T Citrus ... ... ... ..C ... ... G.A ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ..G .A. .TT Medicago ..A ... ... .TC ... ..A ..C ... ..G ... ... ... C.. .T. ..T ... ... ... ... ..G ... ..T T.. A.T ... A.T Soybean ... ... ... .TC ... ..A ... ... A.. ... ... .T. ... .TC ..T ... ... ... A.G ..T ... T.T TC. T.T .A. .AT Lotus ..A ..C ... .TC ... ..A ..C ... ..G ... ... ... C.. .TG ..T ... ... ... A.. C.G ... ..T T.. ..T .A. ..T Oenothera GC. ... ... ..C ... ... ..C ... ..G ..G ... ... ... ... ..G ... ... ... ..T A.. ... ..A ..C ..G .A. ... Ranunculus A.A ... ... .AC ... ..T .G. ... A.. C.. ... ... ..C .T. ..G ..C ... ..G A.. ... ... ... T.. ..G .A. CAT Calycanthus ... ... ... ..C ... ... .GC ... A.. C.G ... ... C.C ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G .A. ... Drimys ... ... ... ..C ... ... .GC ... A.. C.. ... ..T C.C ... ..G ... ... ..G A.. ..T ... ... T.C ..G .C. C.T Piper ..A ... ... ..C ... ..T ..C ... A.. C.. ..C .TT C.C ... ..G ... ... ..G ... A.. ... T.A T.C ..G .A. ..T Liriodendron ... ... ... ..C ... .A. .GC ... A.. C.. ... ... C.C ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ..C ..G .A. C.T Populus ... ... ... .TC ... ... ... ... ..G ... ... C.. ..C ... ..G ... ... ... ... C.. ... ..T ..C ..G .A. ... Nuphar ... C.. ... ... ... ... ACC C.. A.. CG. ... ..T C.. ... ..G ... ... ..G A.. .G. ... ..A ..C ..G CA. CAT Nymphaea ... C.. ... ... ... ... AC. C.. A.. CG. ... ..T C.. ... ..G ... ... ..G A.. .GT ... ..A ..C ..G CA. CAT Amborella ... ... ... .GC ... ... C.A ... A.. CG. ..C CTT C.. ... ..G ... ... ..G ..G ..T ... ... ..C ... CA. CA. Ginkgo ..T A.. .G. ..C T.. ..T CGC ... ..T CG. ... ..T C.. ... ... ..C ... .C. ... .CT G.. ... ..C ... CA. C.. Pinus ... ... .G. ..C T.. ..T CGC ... A.C CG. ... ..T C.C ..C ..G ..C CC. ... ... .CT G.. ... T.. ..C .A. A.A Acorus C.. ... ... GT. ..G .AA GGC ... A.. C.. ... .TT C.G ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... ... ..G ... CAT Typha ... ... ... .TC ... .AA .G. C.. A.C C.. ... .TT C.A ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... .A. CAT Phalaenopsis ... ... ... .TC ... .AA .GC ... A.C ... ... .TT C.. ... ..G ... ... ..G ... ..T A.. T.. ..C ... .A. CAT Yucca ... ... ... .T. ... .AA .GC ... A.T C.. ... .TT C.. .T. ..G ... .C. ..G ... ... ... ..T ..C ... .A. CAT Saccharum C.. ... ... CTC ... GAA ..C C.. A.T C.. ... .TT C.C ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ..C T.T .A. .C. Zea C.. ... ... CTC ... GAA ..C C.. AGT C.. ... .TT C.C ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... T.C T.T .A. .C. Oryza ... C.. ... CTC ... .AA ..C C.. A.C C.. ... .TT C.A ..C ..G ... ... ..G ... ... ... ... A.C T.C .AC .C. Triticum C.. ... ... CTC ... .AA ..C C.T A.C C.. ... .TT C.A ..C ..G ... ... ..G ... ..T C.. ... A.C T.C .A. .C. agrostis ... ..G ... CTC ... .AA ..C C.T A.C ... ... .TT C.A ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... A.C T.C .A. .CA Sorghum C.. ... ... CTC ... GAA ..C C.. A.T C.. ... .TT C.C ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ..C T.T .A. .C. Barley ... ... ... CTC ... .AA ..C C.T A.C C.. ... .TT C.A ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... A.C T.C .A. .C. Nicotiana AAT TTG AAT AGT --- CTT ATT ACT TCA AAG AAG CCC GGT TAC TCC TTT TCA --- AAA AAA AAT CAA AGA TTC TTC TTC Grape ... .G. ... ... --- A.G ... ... C.. ... ..A T.A AT. .C. ATT ... ... --- ... .GG ... ... ... ..T ... ..A Tomato ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... ... ... --- ... .G. ... ... ..A ..A TTG AT. .CT .TT ... ... --- ... .G. ... .G. ... ..A G.. ..G Eucalyptus ... AGT --- --- --- ... ... ... CA. ... ..C .AT AT. AC. ATT ... ... --- ... GGT ... .C. ... ..A ... ..G Panax ... .G. ... .C. --- --- --- --- C.. ..T ..A G.. ... .CT ..T ... ... --- ... .G. ... ... ... C.A ... ... Atropa ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... A.. ... ... ... ..T Potato ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... --- ... ... ... C.. ... G.A TTG AT. .C. .TT ..G AA. --- ... .GG ... ... ... ..A ... ..A Arabidopsis ... .G. ..G .A. --- T.. TA. .T. AA. ..A ..A --- --- .CA ATT ..G AAT --- --- --- --- .C. ... ..T ... ..G Cotton ... ... ..G ... --- T.. ... ... C.. ... ..A T.T AT. .CG ATT ... AAT --- --- --- --- .C. ... ..A ... ..G Citrus ... .C. ..C ... --- ... ... ... C.. ... ..C T.T AT. .CT GTT ... .T. --- ... .GT ... .C. ... ..G ..A ..G Medicago ... .G. ... ... --- T.. ... ... A.C ..A ..C T.G AT. .CT A.T ... ... --- ... .GT ... .CG ... ..A ... ..G Soybean ... .G. ... ... --- A.. T.. ... C.. ..A ..A TGG AT. .CT A.T ... .TT TCA ... .GT ... .C. ... ..T ..T ..G Lotus ... .G. ... ... --- A.. T.. .T. C.C C.A ..A T.G AT. ..T A.T ... ... --- ... ..G ... .C. ... ..T ... ... Oenothera ... AGT --- --- --- T.. .G. ... C.. ..A ... .AT AT. AC. CTT ... .T. --- ... GGG ... TC. ... ... ... ..G Ranunculus ... .G. ... ... --- T.. .C. ... CA. ..A .T. AAA CAG A.. ..T C.. .TT TTA ... G.G ... .G. ... ... ... ..G Calycanthus ... .CA ... ... --- ..C ... ... C.. ... ..A --- TCC ATT ... ... .TT TCA ... G.G ... ... ... ..A ... ..G Drimys ... .C. ... ... --- ..C ... .T. C.. ... ..A --- TCC ATT ... ... .TT TCA ... .GG ... ... ... ... ... ..G Piper C.. .C. GGC ... --- T.C ... .GC AA. ..A ..A --- TTC .TT ..T ... ... AAA ... G.. ... G.. ... ..A .C. ..A Liriodendron ... .C. ... ... --- ..C ... ... C.. ... ..A --- TCC ATT ..T C.. .TT TCA ... G.G ... ... ... ... ... ..G Populus ... ... ..C ... --- ... ... .T. C.. ... ..A --- TC. ATT ... ... .TT GTA ... ..G ... ... ... ... ... ..G Nuphar ... .G. ... ..C --- ... ... ... C.. ... ..A --- TCC ACT ..A A.. .TT TCA ..G G.. ... ... ... ..A ... ..G Nymphaea ... .G. ... ..C --- ... ... ... ... ..T ..A --- TCC ATT ... A.. .TT TCA ..G G.. ... ... ... ..A ... ..G Amborella ... .G. ... ... TTC A.. .C. ..A AAT .CA ... AAA T.C AGT ..T ... .TT TCA .G. G.G ... ... ... ..G ..T ..G Ginkgo ... AGT TCG GAG --- --- --- --- AAT TT. T.T AAA TCG ATT CT. A.C G.T CCG G.. GG. ... AC. .AG ... ..T C.G Pinus ... AGT CCA GAG --- --- --- --- AAT TTA C.A AGA TCA ATT ATT G.C GTC CCA .G. GT. ... ACG ... ... ... C.G Acorus ... .G. ... ... --- ..C ... ... C.. ... ..A T.. AT. .CT .TT C.. .TT TCA ..G GGG ... ... ... C.. ... ..G Typha ... .G. ... ... --- ..C ... ... ..G ... ..A --- TCG ATT .A. G.. .TT TCA ... G.. ... A.. ... C.A ..T AGA Phalaenopsis ... ... ... ... --- ..C ... ... ... ..A ..A --- TCC ATT .A. G.C .TT TCA ... .G. ..G A.. ... ... C.T .GG Yucca ... .G. ... ... --- ... C.C .T. A.T C.T ..A AAA TC. ATT .GT G.. .TT TCA ... G.. ... A.. ... C.A ..T AGG Saccharum ... .G. ... ... --- ... ... ... ... .T. ..A --- TCC ATT .TT C.. .TG AAA ... G.. ... ... ... C.A ..T CGA Zea ... .G. ... ... --- T.. ... ... ... .T. ..A --- TCC ATT .TT C.. .TG AAA ... G.. ... A.. ... C.A ..T CGA Oryza ... .G. ... ... --- T.. ... ... ... .T. ..A --- TCC ATT .TT A.. .TG AAA ... G.. ... A.. ... C.A ..T CGG Triticum ... .G. ... ... --- T.. ... ... ... .T. ..A --- TCC ATT .TT A.. .TC AAA ... G.. ... A.. ... C.A ..T CGA agrostis ... .G. ... ... --- T.. ... ... ... .T. ..A --- TCC ATT .TT C.. .TT AAA ... G.. ... A.. ... C.T ..T CGA Sorghum ... .G. ... ... --- ... ... ... ... .T. ..A --- TCC ATT .TT C.. .TG AAA ... G.. ... A.. ... C.A ..T CGA Barley ... .G. ... ... --- T.. ... ... ... .T. ..A --- TCC ATT CTT ... .TT CAA ... G.. ... A.. ... C.A G.T AAA Nicotiana TTC TTA TAT AAT TCT TAT GTA TAT GAA TGC GAA TCC ACT TTC GTC TTT CTA CGG AAC CAA TCT TCT CAT TTA CGA TCA Grape ... C.. ... ... .T. C.. ... .G. ... .A. ..C ..T .TC ... A.T ... A.C ..C ..T ... ... .A. ... ... ... ... Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ..G C.. ..C ... ... ... ... .G. ... .A. ... ... .T. ... C.T ... ... ..T ... ... ... ... ... A.. ... .T. Eucalyptus ... C.. ... ... ... C.. A.. .G. ... .A. ... .A. TTC ..T C.T ... ..C ..T ..T ... ... ... ... ... ..G ... Panax ..A C.. ... ... ... C.. C.. .G. ... .A. ... ... .TC ... A.. ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... C.. ... ... .TG C.. ... .G. ... .A. ... ... CT. ..T ..T ... ..C T.C ... ... ..C ... T.. ... ... C.. Arabidopsis ... ... ... ... ... C.. ... .G. ... .A. ... ... .TC ..T T.T ... ... ..C ..G .GG ... ..G ... ... ... ..G Cotton ... C.. ... ... ... C.. AC. .G. ... .A. ... ... .T. ... C.T ... ..C ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... Citrus ..T C.. ... ... ... C.. ... ... ... .AT ... ... .TC C.. T.T ... ..C T.T ... ... ..G ... ... ... .A. ... Medicago ... C.C ... ... .T. ... ... .G. ... .AT ... ..T .TC ... C.T ... ... ..T ..T A.. ..C ... ... ... ... .T. Soybean ... C.. ... ... .TA ... ... .GG ... .AT ... ..T .TC ..T C.T ... ... ..T ... A.. ..C ... A.G ... ... .T. Lotus ... C.. ... ... .T. ... ... .G. ... .AT ... ..T .TC ..T T.T ... ... ..T .C. A.. ... .T. ... ... ... .T. Oenothera ... C.C ... ... ... ... ... .G. ... .A. ... ..T .TC ... C.T ... A.C ..C ..T ... ... ..G ... ..C .AG ... Ranunculus ... C.. ... ... .T. C.. ... ... ... .CG ... ... .TA ..T C.T ... ... ..T ..A A.. ... .A. ... ... ... ... Calycanthus ... C.. ... ... ..G C.. ... ... ... ... ... ... GTA ... A.T ... ..C ..T ..A ... ... ..C ... ... ... ..T Drimys ... C.. ... ... ... C.. A.. ... .G. ... ... ... .TA ... ..T ... ..C ..T ..A ... ..C ... ... ... ... ... Piper ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... .TA ..T C.T ... A.C ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... C.. ... ... ... C.. ... ... ... ..T ... ... GTA ..A ..G ... ..C ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... Populus ... ... ... ... ... C.. ... ... ... .A. ..G ... GT. ... T.T ... ..T T.T ..G ... ..C .T. ... ..C ... .T. Nuphar ... ..G ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... GTA ..A ..T ..C ..T ..T ..A ... ..C ... ... ... ..G ... Nymphaea ... ..G ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... GTA ..A ..T ..C ..T ..T ..A ... ..C ... ... ... ..G ... Amborella ... C.G ..C ... .T. C.. ... ... C.. .TT ... ... CT. ... ..T ..C ... ..T ..A ... .T. .T. ... ... ..G ..G Ginkgo ..T C.G .GG ... .A. ... .CT ... ... ..T ... ..T CTC C.A ..T CCC ..T ... ..A .G. ... ... ... .C. ... .TG Pinus ... C.G .TG ... .A. ... ..C .G. ... ... ... ... .T. ..A T.T .CC .GT .TT ..A .G. ..C ... ... .C. ... ..G Acorus ... ... ... ... ... ... ... .T. ..G ..T ... ... G.A ..A ... ... ..C ..T ..A ... ..C .T. T.. ... ... ... Typha ..A C.. ... ... .T. ... ... .TC ... ..T ... .TT GTA ... ..T ... ..T ..T ..A ... ... ... T.. ... .A. .T. Phalaenopsis ... C.. C.. ... .T. ... ... ... ... ... ... .AT .TA ... C.T ... ..T ..T ..A ..G ... ... T.. ... ... ... Yucca ... C.. ..C ... ... ... A.. .T. ... ..T ... .TT TTA ... ..T ... T.T ..T ..A ... ... ... T.. ... ... .T. Saccharum ... C.. ... ..C ... ... ... .CA ... .AT ... .TT TTC ..G T.G ... ..T ..T ..A ... ... ... TGC ... ... .T. Zea ... C.. ... ..C ... ... ... .CA ... .AT ... .TT TTC ..G T.G ... ..T .AT ..A ... ... ... TGC ... ... .T. Oryza ... C.. ... ..C ... ... ... .CA ... .AT ... .TT TTC ..G T.G ... ..T ..T ..A ... ... ... TGC ..G ... .T. Triticum ... C.. ... ..C ... ... ... .CA ... .AT ... .TT TT. ..G T.G ... ..T ..T ..A ... ... ... TGC ... .C. .T. agrostis ... ... ... ... ... ... ... .CA ... .AT ... .TT TTC ..G T.G ... ..T ..T ..A ... ... ... TCC ... .C. .T. Sorghum ... C.. ... ..C ... ... ... .CA ... .AT ... .TT TTC ..G T.G ... ..T ..T ..A ... ... ... TGC ... ... .T. Barley ... C.. ... ..C ... ... ... .CA ... .AT ... .TT TTC ..G T.G ... ..T ..T ..A ... ... ... TGC ... .C. .T. Nicotiana ACA TCT TTT GGA GCC CTT CTT GAA CGA ATA TAT TTC TAT GGA AAA ATA GAA CGT --- --- --- --- --- --- --- CTT Grape ... ... .A. ... ... ... ... .GG ... ... .T. ... ... ... ... ... ..G .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- --- ... Cucumis ..T ... .A. AAG .G. ... T.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ..C ... .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Eucalyptus ... ... .C. ... AT. T.. T.. ..G ... ... ... ... ... .T. ... ... ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Panax ... ... .C. ... A.. ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... A.. TA. --- --- --- --- --- --- --- ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- --- ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- --- --- --- --- --- ... Spinacia ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ..C ... ... .GC ... ..G C.. A.. TA. --- --- --- --- --- --- --- ..A Arabidopsis ... ... .A. .A. .T. ... T.. ..G ... ..T GTA ... ... ... ... ... C.C .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Cotton ... ... .C. ..G .T. T.. ... ... ... ..T .T. ... ... ... ... ... A.G TA. --- --- --- --- --- --- --- ... Citrus ... ..C ... CA. .T. ..C G.. ..G ... .CG ... ... ... ... ... G.C ... .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Medicago .A. ... ... AAC .TT T.. T.. ... ... ..T .T. .GT ... .C. ... .G. ... .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Soybean .A. .A. ... C.C .TT T.. T.. ..G ... ..T .T. ... ... .A. ... ... ... .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Lotus .A. ... ... A.. .TT T.. T.. ..G ... ..C .T. ... ... .C. ... .A. .G. .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Oenothera ... ... .C. ... .T. T.. T.. ..G ... ..C CT. ... ... .T. ... ... ..C .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Ranunculus ... ... .C. AT. ..T T.. ... ..T ... .C. C.. ..T .T. ... ... ... ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.G Calycanthus ... ... ... ... T.T T.. ... ..G ... .C. C.. ... ... ... ... ... ..G .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Drimys ... ... .CG A.. A.. ... ... ..G ... .C. C.. ..A ... ... ... ... ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Piper .T. ..C .GG .A. ... ... ... ... ... G.C C.. ... ... ..G ... ... ... .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Liriodendron ... ..C .C. ... A.T T.. ... ..G ... .C. C.. ... ... ... ... ... ... .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Populus ... .T. .A. CAG .T. T.. ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Nuphar .T. ... .C. CT. ... T.. ... ..G A.. .C. C.. ... ... ... ... ... A.. .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Nymphaea .T. ... .C. CT. ... T.. ... ..G A.. .C. C.. ..T ... ... ... ... A.. .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Amborella .T. ... ... ... T.T T.. ... ... ... .C. C.. ... ... ... ... ... ... AA. --- --- --- --- --- --- --- T.. Ginkgo TTG ..C .A. ... ..T T.. ..C ..G .A. ..T C.. .CT ... C.. ..G ..C ... .A. --- --- --- --- --- --- --- A.. Pinus TTG ... CA. ... T.T T.C .C. C.G ... .CT C.. ..T C.. C.. ..G ... A.. .A. --- --- --- --- --- --- --- A.. Acorus ... ... ... ... A.. T.. G.. ..G ... .C. C.. ... ... ... ... ... ..G .A. --- --- --- --- --- --- --- A.. Typha ... ... ... ... A.T T.. ... ..G ... ... C.. ... ... ... ... ... ... .A. --- --- --- --- --- --- --- ... Phalaenopsis .T. ... .C. ... .T. T.. ... ..G ... .CG C.. ..T ... ... ... ... ... TA. --- --- --- --- --- --- --- ... Yucca ... ... .C. ... A.T T.. ... ..G ... .C. C.. ... ... ... ... ... ... .A. TTT CAA ATA AAA CAT TTG CAT T.. Saccharum ... ... .C. ... A.. T.. ..G ... ... ..C ATC ..T .C. ..G ..G ..G ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Zea ... ... .C. ... A.. T.. ..G ... ... ..C ATC ..T .C. ..G ..G ..G ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Oryza ..T ... .CC ... A.. T.. ..G ... ... ..C ATC ..T .C. A.G ..G ..G ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Triticum G.. ... .C. ... A.T T.. ..G ... ... ..C C.C ..T .C. A.G ..G ..G ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. agrostis TT. ... .C. ... A.T T.. ..G ... ... ..C ATC ..T .C. A.G ..G ..G ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Sorghum ... ... .C. ... A.. T.. ..G ... ... ..C ATC ..T .C. ..G ..G ..G ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Barley G.. .A. .C. ... A.T T.. ..G ... ... ..C C.C ..T .C. A.G ..G ..G ... .A. --- --- --- --- --- --- --- T.. Nicotiana GTA GAA GTC TTT GCT AAG GAT TTT CAG GTT ACC --- --- CTA TGG TTA TTC AAG GAT CCT TTC ATG CAT TAT GTT AGG Grape ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ACA .T. --- --- T.. ... ..G ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... Tomato ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... Cucumis ..C A.. ..G ... ... ..T T.. ... TC. .C. .T. --- --- T.. C.. G.C ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ..A Eucalyptus ..C A.. ... ..C TA. G.T A.. GA. TTT CAG TG. ATC --- ... ... ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... C.A Panax ... A.. ... ... .T. ... .C. ... ..A ..C .AT --- --- ... .T. ..G ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... A.. ..T ... A.. ... ... ... GGA ... .T. --- --- ... ... A.T ... .GA ..A ... ... CCA ... ... ... ... Arabidopsis T.C A.. ..T ... .T. ..T A.. ... .C. .CA .T. --- --- ... G.. ..G C.. ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A Cotton .GC ... ... ... TA. ..T ... ... ... AAC .A. --- --- ... ... ..G ... ..A ..C ... ... ..A ... .T. A.. ... Citrus ..C ... ... ... ... ..A ... ... ... .AC .T. --- --- T.. G.. ..G G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..A Medicago ... ... ..T ... ... ... ... ... TC. TA. ..T --- --- T.. ACA ..C ... ... ... ... C.. ..T ... ... ... ..A Soybean ... ... ..A .C. .T. ... ... .G. TCA TA. ... --- --- T.. .CA ..C ..T ... ... A.. ... ... ... ... ... ..A Lotus ... ... ..A ... .T. ... ... ... TTT TC. ... --- --- T.. ACA ..C ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... ..A Oenothera ..T ... ..T ... .T. GG. AC. GA. TTT C.G GA. ATC --- .G. .CC ..C ... ... ... ..G AAT ... ... ... ... ..A Ranunculus AA. .TC ..T ... CG. ..T ... ... ..T ACC .TG --- --- ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ..C ... T.C C.A Calycanthus ... .T. ..G C.. .GG ..T ... ... .C. AAG ... --- --- T.. ... ..G ... ..A ... ... ... G.. ... ... ..C ..A Drimys T.. .T. ..G C.. CG. ..T ... ... ... AGG ..A --- --- ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A Piper ... .T. ..G C.. TG. ..T ... ... ... AAG G.T --- --- T.G ... G.. ... ..A ... TG. ... ... ... ... ... ... Liriodendron ... .T. ..G C.. CG. ..T ... ... ... AAG ... --- --- ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ..A Populus ... ... ... ... A.. ... ... .GG GG. .AC .G. --- --- ... ..C ..G C.. ... ... ... ... ..A ... ... A.. ..A Nuphar ... .TG .CA CC. CG. ..T ... .C. ..A AGG ... CTG CCC ..C ... ..C ... ... ..A ..C ..G ... ... ... ... ... Nymphaea ... .TG ACG CC. CG. ..T ... .C. ..A AGG ... CTG CCC ..C ... ..C ... ... ..A ... ..G ... ... ... ... ... Amborella ... .T. TC. A.G CG. ..T C.. .C. ... AA. .TT --- --- T.. ... ..G ... ... ..C .T. ... ... ... ... ... ..A Ginkgo ..C AT. T.T .CC CG. CGT A.. ..A GCA AAA .GT --- --- A.C ... .CT ..G ... ... T.. .C. ..T TC. ... ..A ... Pinus A.C ATT T.T .C. CG. CGA A.. .CA .T. AAA .GT --- --- A.C ... .CG ..G ... ... ... AAA ..T ..C ... ... ..A Acorus ... .T. ..G CG. AGG ... A.. ... ..A AAG G.. --- --- T.. .CT ..G ... ..A ... ... ... ..C ... ... A.C C.A Typha C.. .T. ..G .A. CG. ..T TT. ... A.T AAA ... --- --- T.. ... ..C ... .CA ... ... ... ... ... ... ... C.A Phalaenopsis AG. .TC A.G .C. TG. ..T TC. ... ... AGG .T. --- --- ... ... ..C C.. ..A ... AT. ... ..A ... ... ... C.A Yucca A.. .T. ..A .G. C.. ..C T.. ... T.T AAG --- --- ACC ... ... .CC ... ..A ..A ... ... ... ... ... ... C.A Saccharum .GT .T. A.G .AC C.G GG. TT. ... .G. AAA ... --- --- A.. ... ..C ..T .T. ... ... C.T ... ... ... ... C.A Zea .GT .T. A.G .AC C.G GG. TT. ... .G. AAA ... --- --- A.. ... ..C ..T .T. ... ... C.T ... ... ... ... C.A Oryza .GG TT. A.G .AC C.. GCT TT. ... .G. AAA ... --- --- A.. ... ..C G.T .T. ... ..C C.T ... ... ... ... C.A Triticum .GG AT. A.G .AC C.. GGT TT. .C. .G. AAA ... --- --- ... ... ..C ..T .T. ... ... C.T ... ... ... ... C.A agrostis .GG AT. A.G .AC C.G GGT TT. ... .G. AAA ... --- --- A.. ... ..C ..T .T. ... ... C.G ... ... ... ... C.C Sorghum .GT .T. A.G .AC C.G GG. TT. ... .G. AAA ... --- --- A.. ... ..C ..T .T. ... ... C.T ... ... ... ... C.A Barley .GG AT. A.G .AC C.. GGT TT. .C. .G. AAA ... --- --- T.. ... ..C ..T .T. ... ... C.T ..A ... ... ... C.A Nicotiana TAT CAA GGA AAA TCC ATT CTG GCT TCA AAA GGG ACG TTT CTT TTG ATG AAT AAA TGG AAA TTT TAC CTT GTC AAT TTT Grape ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. CC. ... C.. ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ..C Tomato ... G.. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... .C. .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... .C. ... ..T ... ... .T. ... ..G .AT ... CCA ... C.. ..T ... ..G ... ... .A. ... ... ... ... ..A Eucalyptus ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... .AT ... CC. ... C.. ... ..G ... ... ... .A. ... ... ..T ... ..A Panax ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... CCC T.. ... ... ..A ... ... .C. .A. ... T.. ..T ... ..A Atropa ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... G.. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A .C. ... C.. ... C.. ... ... ... .A. ... ... A.. T.. ..C Arabidopsis ... ..C ... .G. .G. ... ... ..A A.. ..G .AT ... CCG ... C.. ... ... ... ... ... .A. ..T T.. ..T ... ..A Cotton ... ... ... ..G ..A ... ... ..C ... ..G .AT ... .C. ... C.. ..C ... ..G ... ... .A. ... T.. ... G.. ..A Citrus ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ..G .AT ... CC. ... C.. ... ... ... ... ... .A. ... ... ... GG. ..A Medicago ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ..G AAT T.. CC. T.. ... ... ... ... ... ... CA. ..T T.. A.T C.. ..A Soybean ... ... ... ... ... ... T.. .T. ... ..G AAT ..T CC. ... ... ..A ... ... ... ... .AC ..T T.. A.. T.. ..A Lotus ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ..G AAT TT. CC. A.. ..A ... ... ... ... ... .AC ..T T.. A.. C.. ..A Oenothera ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ..G .AT ..A CC. ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ..A Ranunculus ... ... ... ... ..A ... A.. T.. ... ... ..A ..T CC. ... C.. ... ..G ... ... ... .A. ... ... ..A ..C ..A Calycanthus ... ... ... ... ... ... ..A ... ... .GG ... ..T CAG T.. C.. ..A ..G ... ... ... .A. C.. ... ... ..C ..C Drimys ... ... ... ... G.G ... A.. ... ... ... ... ..T CA. T.. C.. ... ..G ... ... ... .A. C.. ... ... ... ..A Piper ... ..G ... ... ... C.. T.. AT. ... ..G ..A ..T GA. ... ... ... ..G ... ... ... .A. C.. T.. A.. T.. ..A Liriodendron ... ... ... ... .A. ... ..A ... ... ..G ... ..T CA. ... C.. ... ..G ... ... ... .C. C.. ... ... ... ... Populus ... ... ... ... ... ... T.T .TC ... ..G .AT ... CC. ... C.. ... ..A ... ... ... .A. ... ... ... ... ..A Nuphar ... ... ... ... ..A ... A.. ... ... .GG T.T ..T AA. T.A C.. ... ..G ... ... ... .A. ... ... ..T ... ..C Nymphaea ... ... ... ... ..A ... A.. ... ... .GG T.T ..T AA. T.A C.. ... ..G ... ... ... .A. ... ... ... ... ..C Amborella ... A.. ... ... ..A ... A.. ... ... .GG ..T ..T .A. ..C C.T ... ... ... ... ... .C. C.. ... ... ... ..C Ginkgo ... GGG .A. .G. ..T ... A.. ... CTG ..G ..T G.T CAC TCC CCA G.C .GG .G. ... .G. .A. ..T ... TCA .T. ... Pinus ... GGC .A. .G. C.T ... A.A ... AT. ..G ..T G.T GA. ..C C.A G.T ..A ... ..T .G. .A. ..T ... C.A .T. ... Acorus ... A.. ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ..T CA. T.. C.. ... ..G ... ... ... .A. C.. ... C.A ... ..C Typha ... ... ... ... G.A ... ... ..A ... ... ... ..T CA. ... ..T ... ..G ... ... ... .G. ... ... ... ... ..C Phalaenopsis ... ... ... ... G.T ... ... .T. ... ... ..A ..T C.. A.. C.. ... ... ... ... ... ... C.T T.. ..G ... ... Yucca ... ... ... ... G.A ... ..T ... ... ..G ... ..T CA. ... G.A ... ..G ... ... ... .A. C.T T.. ... ... C.. Saccharum ... ... ... ..G G.A ... ..T ..A ... ... ..C ..T C.. ... ... .A. ..G ... ... ... .C. ... ... ... ... ..C Zea ... ... ... ..G G.A ... ..T ..A ... ... ..C ..T C.. ... ... .A. ..G ... ... ... .C. ... ... ... ... ..C Oryza ... ... ... ..G G.A ... ..T ..A ... ... ..A ..T C.. ... ... .A. ..G ... ... ... .G. ... ... ... CG. ..G Triticum ... ... ... ..G G.A ... ..T ..A ... ... ..C ..T ... ... ... .A. ..G ... ... ... .GC ... ... A.. ... ..A agrostis ... ... ... ..G G.A ... ..T .GA ... ... ..A ..T CA. T.. ... .AC ..G ... ... ... .GG ... ... A.. ... ... Sorghum ... ... ... ..G G.A ... ..T ..A ... ... ..C ..T C.. ... ... .A. ..G ... ... ... .C. ... ... ... ... ..C Barley ... ... ... ..G G.A ... ..T ..A ... ... ..C .GT ... T.. ... .AA ..G ... ... ... .GC ... ... A.. ... ..C Nicotiana TGG CAA TGT CAT TGT TCT CTG TGC TTT CAC ACA GGA AGG ATC CAT ATA AAC --- --- CAA TTA TCC AAT CAT TCC CGT Grape ... ... ... ... .T. .AC G.. ..G .C. ..A C.. .T. ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ..G ... ... .TC Tomato ... ... ... ... .T. ... A.. .A. ... A.. ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ..C ... ... ... Cucumis ... ... ... ... .T. .A. G.. ..G .CA ..A C.. .A. ... ... T.. ... ... --- --- ... ... ... ..G .G. ..T .T. Eucalyptus ... ... .A. ... .T. .AC GCC ..G ... ..A C.. ... ... ... G.. ... ... --- --- ... ... .G. ..G T.. ..T .T. Panax ... ... ... ... .T. .AC ... ..G .C. ..A C.G ... ... ... TG. ... ... --- --- ... ... .A. ... ... ... .TC Atropa ... ... ... ... .T. ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ..C ... ... ... Potato ... ... ... ... .T. ... A.. .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ..C ... ... ... Spinacia G.. ... ... ... .T. ... G.. ..G .C. ..A C.. AA. ..A C.. T.. ..C ..T --- --- .G. ... ..A ..C ... ... .TA Arabidopsis ... ... ... T.. .T. ..G G.A ..G ... ..A T.G CA. .A. G.. A.. ... ..T --- --- ... ... ..T ..A G.. AAT TTA Cotton ... ... .A. T.. .T. .AC ... ..G .C. ..A T.. ... ..A G.. .G. ... ..T --- --- ... ... ..T ..A T.. ..T .TC Citrus ... ... ..G ... .T. CAC GC. .CT .C. ..A C.. ... ... G.T ..G C.. ... CAC TTA T.C ... GG. ..G T.C G.T AT. Medicago ... ... G.. TT. .T. .A. G.T ..G .C. ..A C.. A.. .C. ..G A.. ... ... --- --- ... ... ... G.A ... ..A TT. Soybean ... ... ... ... .T. GA. A.T ..G .C. .GA C.. ... .C. ... ... ... ... --- --- ... ... ... C.A ... ..A TT. Lotus ... ... ... T.. .T. GA. G.T ..G .C. ..A C.G C.. .CA ... .G. ... ... --- --- ... ... ... G.A T.. ..A TT. Oenothera ... ... .A. ... .T. ..G G.C ..G .C. ..A C.C ... ... ... A.C ... ... --- --- ... ... GGT ..G T.. ..T .T. Ranunculus ... G.. ... ... .T. .A. T.T ..G .C. ..G C.G AAT ... ..T ... ... ... --- --- ... ... ... ... AT. .TT .TC Calycanthus ... ... ... ... .T. .AC T.. ..G .C. ..A C.. .AC ... ..T ... C.. ... --- --- ... C.. .G. ... ... ... TTC Drimys ... ... ... ... .T. .AC T.. ..G .C. ..A C.T .AC ..T ... ... ... ... --- --- ... ... .A. ... ... ..T TTC Piper ... ... ... A.. .T. CAC T.. ..G .C. ..A C.G CAC ... ... ... ... ... --- --- ... ... GAT ... .G. ... TT. Liriodendron ... ... ... ... .T. .AC T.. ..G .C. .GA C.G .AC ... ... ... ... ... --- --- ... ... .A. ... ... ... TTC Populus ..T ... ... ... .T. GA. G.. ... ... ..A C.C CA. .A. ... ... ... ... CCA TTT TC. ... .A. ..G ... ..T TTC Nuphar ... ... ... ... .T. CAC T.A ..G .C. ..A C.G ..T G.. ... ... ... ..T --- --- G.. ... ... ... ... ..T TTC Nymphaea ... ... ... ... .T. CAC T.A ..G .C. ..A C.G ..T ... ... ... ... ..T --- --- G.. ... ... ... ... ..T TTC Amborella ... ... .TC .G. .T. .AC T.C ..G .C. ..A C.G ..C ..A ... ... ... ..T --- --- G.. ... ... ... ... ... TTC Ginkgo ... .G. ... T.. .TC CA. T.C ..G .CC ..A C.G TAT ... ..A .GG ..C G.T --- --- G.. ... ... ... A.. .GT TC. Pinus C.. ... .T. T.. .TC CA. ..T ..G .CC G.A C.G TAT ... G.. TG. TCT C.T --- --- ... ... ... ..G A.. .GT TC. Acorus ... ... ... ... .T. GAC T.T ..G .C. ..A C.G CAT ... ..T ... ... ... --- --- ... ... ..A ... ... ..T TTC Typha ... ... .A. T.. .T. CA. T.T ..G .C. ..A C.G CAC ... ... ... ... ... --- --- ... ... ..A ..C T.. ... TTC Phalaenopsis ... ... .T. T.. .T. CAC T.T ..G ... ..A C.T TAT ... ... .G. ... ..G --- --- ... ... C.. ..C T.. ..T TTC Yucca ... ... .A. T.. .T. CAC T.T ..G .C. ..A C.G TAC ... ... ... ... ..T --- --- ... ... ..A ..C T.. ..T TTC Saccharum .C. ... .A. TT. .TC .A. T.T ..G AC. ..A C.. CA. ... ..T .G. C.. ... --- --- ... ... A.A ..C TC. .G. TTC Zea .C. ... .A. TT. .TC ... T.T ..G AC. ..A C.. CA. ... ..T .G. C.. ... --- --- ... ... A.A ..C TC. .G. TTC Oryza ... ... .A. TC. .TC ... T.T ..G AC. ..A C.G CA. ... ... ... C.. ... --- --- ... ... GAA ..C TC. .G. TTC Triticum ... ... .A. T.. .TC .G. T.T ..G AC. ..G C.G C.. ..A ... ... ... ... --- --- ... ... G.A ..C TC. .G. TTC agrostis ... ... .A. TT. .TC ... T.T ..G AC. ..G C.G C.. ... ... ... C.. ... --- --- ... ... G.A ..C TC. .G. TTC Sorghum .C. ... .A. TT. .TC ... T.T ..G AC. ..A C.. CA. ... ..T .G. C.. ... --- --- ... ... A.A ..C TC. .G. TTC Barley ... ... .A. T.. .TC .T. T.T ..G AC. ..G C.G C.. ..A ... ... ... ... --- --- ... ... G.A ..C TC. .G. TTC Nicotiana GAC TTT ATG GGC TAT CTT TCA AGT --- --- GTG CGA CTA AAT CCT TCA ATG GTA CGT AGT CAA ATG TTA GAA AAT TCA Grape ... ... C.. ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... G.. ... ..G ... ... ... C.. ... ... G.. Tomato ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Cucumis ... ... T.. ... ... A.. ... ... --- --- ... ... T.. ... ... ... G.. ... T.G .C. ..G ... ... ... ... ... Eucalyptus T.. ... T.. ... ... .G. ... ..C --- --- ... ... ... ... ... ... G.. ... ..A ... ... ... C.. ... ... ... Panax ... A.. C.. ... ... ..A ... ... --- --- .C. ..G ... ..C ... ... ... ... ..C G.. ... ... C.. ... ... ... Atropa ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Potato ... ... ... ... ... ... ... ... --- --- ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Spinacia ... ... ... ..T .T. ... ... ..G --- --- ... ... ..C ... T.. ... G.A A.. ..G ... ... ... ... A.. ... ... Arabidopsis ..G ... C.. ..T ... ..G ... ... --- --- T.. ... T.. ..C ... .T. G.. ... ... ... ... ... C.. ... ..C ... Cotton ... ... C.. ... ... ... ... ... --- --- ... ... T.. ... ... ... G.. ... ..G ... ... ... C.. ... ... ... Citrus A.. ... C.. ... ... ... ..C G.. --- --- ... ... ... ... T.. .TG T.. ... ..G ... ... ... C.. ... ... ... Medicago C.G C.. T.A ... ... T.. .T. .A. --- --- ... ..G G.. ... .G. ... G.. ... ..G ... ... ... C.G C.. ... A.. Soybean C.. ... T.. ... ... T.. .T. ... --- --- A.T ..G .CC ... .T. ... G.. ... ..A .A. ..G ... ..G C.. ... ... Lotus C.. ... T.. ... ... T.. .T. .AG --- --- ... G.G ..G ..G .A. ... G.A ... ..G G.. ... ... C.G C.. ... GG. Oenothera ... ... T.. ..A ... T.. ... .AC --- --- ... .A. ... ..G T.. ... G.. ... ..A .A. ... .C. C.. ..G ... ... Ranunculus A.T ... T.. ..T ... ... ... ... --- --- ..A ... .C. ... ... ..G G.. ... A.G .A. ... ... ... ... ... G.. Calycanthus T.T ... C.. ..T ... ... ... ... --- --- ... .A. ... ..C T.. ..G G.. ... A.G ... ... ... C.. ... ... G.. Drimys T.. ... C.. ... ... ... ... C.. --- --- ..A .A. ... ..C ... ..G G.A ... A.G ... ... ... C.. ..G ... .T. Piper C.T ... T.. ..T ... GC. ... ... --- --- ..A ... A.. ... .T. ..G G.. ... AAA ... ... ..T C.. ..G ... ... Liriodendron T.T ... C.. ... ... ... ... ... --- --- ..A ... ... ..C A.. ..G GC. ... A.G .T. ... ... C.. ..G ... ... Populus .C. ..A T.A ..T ... ... ... ... TCA AGT ..A ... ... ..C .T. ... G.. ... ..G ... ... ... C.. ... ... G.. Nuphar T.T ... C.. ... ... ... ... G.. --- --- ..A ... ... .TG ... .GG G.. A.. A.G ... ... ... C.. ..G ... ... Nymphaea T.T ... C.. ... ... ... ... G.. --- ---